Chapitre 8, 9, 10 Flashcards
Quelles sont les caractéristiques du plan entièrement aléatoire
Dispositif/plan de base
0 Restriction à la randomisation: traitements attribuées aléatoirement à l’ensemble du matériel exp
Variation faible du matériel exp, ou espace exp
Fichiers de données équilibrés ou non
Quels sont les avantages et désavantages du plan entièrement aléatoire ?
Avantages:
Construction du plan facile
dl max à l’erreur (bon pour petites exp)
Analyse stats simple
Flexible:
- Données manquantes = ok
- nb rep peut varier selon traitements
- limite = nb U.E. dispo
Désavantages:
Inefficace si
- nb trait élevé
- variabilité matériel (ou espace) exp est élevé
Exemple de décomposition des degrés de liberté (PEA)
Source de var simple
1. Trait (inter)
2. Erreur exp. (intra)
Total U.E.
Source de var avec plusieurs U.échant
1. Trait (inter)
2. Erreur exp. (intra)
Total U.E
3. Erreur échant
Total échant
Source de var avec plusieurs études
1. (expériences)
2. Trait (inter)
3. Exp. * Trait
4. Erreur exp (intra)
Total U.E.
Quelle est la différence entre le modèle type 1 et type 2 (PEA)
Type 1: effets fixes des traitements
Type 2: Effet traitements et termes d’erreurs sont des var indépendantes aléatoires distribuées autour de 0 avec variance.
Interpréter tableau ANOVA (PEA)
Comme d’hab,
P<alpha = significatif
F = variabilité inter X fois plus élevé que intra (erreur)
Qu’est ce que l’erreur d’échantillonage et l’erreur expérimentale. Quelle devrait être supérieure.
Erreur échantillonnage: variation entre les U.Ech traitées de la même façon
Erreur exp.: variation entre les U.E. traitées de façon similaire
L’erreur échantillonnage devrait toujours être inférieure à l’erreur exp.
Quelles sont les caractéristiques du plan en blocs complets aléatoires
Matériel/espace ou temps expérimental non homogène.
Donc formation de blocs pour regrouper les U.E. en sous-groupes homogènes
Chaque bloc contient tous trait.
But:
- Augmenter variation inter blocs. Cette variation est soustraite du terme d’erreur
- Diminuer variation intra blocs.
Quels sont les avantages et désavantages du plan en blocs complets aléatoires ?
Avantages
Précision:
- souvent plus précis
- bloc diminue le carré moyen de l’erreur
Flexibilité:
- 0 restriction nb trait, répétitions
- traitement témoin ou autre peut être inclus plus d’une fois dans chaque bloc
Facilité d’analyse:
- Analyse stats simple et rapide
- Retrait traitement ou bloc sans trop de complications
Désavantages
Mal adapté lorsque:
- nb trait élevé = grands blocs, donc moins homogènes
- Variabilité importante intra blocs
Quels situations seraient-ils préférables d’utiliser un plan en blocs complets aléatoires vs un plan entièrement aléatoire ?
Lorsqu’il y a présence d’un gradiant environnemental externe au projet. Ceci permet de réduire la variabilité intra bloc et d’augmenter celle-ci inter bloc
Analyse statistique plan entièrement aléatoire (en fonction du nb de rep par traitements)
Nb égale rep = normal
Nb différents de rep
- Pondération des comparaisons entre traitements en fonction du nb observations
- Calculs légèrement plus complexes
Comment élaborer un plan en bloc complets aléatoires
Définir le gradient
Répartir des blocs perpendiculaires au gradient
Répartir de façon aléatoire les traitements à l’intérieur de chaque bloc
Effectuer la décomposition des dl (PBCA)
Source variation Simple
1. Blocs
2. Traits
3. Erreur exp
Total U.E.
Source variation avec U.éch
1. Blocs
2. Traits
3. Erreur exp
Total U.E
Erreur Échant
Total Échant
Source var plusieurs exp
1. (exp)
2. blocs intra sites (addition dl des diff études) (total de:)
- dl de 1 exp
- exp x dl de 1 exp
3. Traits
4. Exp. * trait
5. Erreur exp
Total U.E.
Quel est l’impact de données manquantes ? (PBCA)
Coût de 1 dl à l’erreur par donnée manquante
Modification des stats, souvent en pondérant
Quelle est la différence entre une données manquante et une donnée nulle ?
Données manquantes: aucune données disponible ou valable
Cause:
- Maladie, mort
- Erreur accident
- Erreur transcription
- Variabilité externe imprévue (rongeurs, etc)
Une valeur 0 quand le résultat est attribuable au traitement plutôt qu’à un effet externe de l’expérience. Exemple un cultivar ne pousse pas ou meurt au complet.
Chaque donnée manquante coûte 1 dl à l’erreur (et au total)
Comment calculer l’efficacité relative de l’utilisation des blocs par rapport à un plan entièrement aléatoire?
Voir formule chapitre 10 ppt.
Les formules incluent les carrés moyens de l’erreur, des rangés, des colonnes et le nb de répétitions
Essentiellement, calculer un % avec les résultats de l’ANOVA qui donne un approximatif. En haut de 100% plan utilisé est meilleur, en bas = autre plan plus efficace
Quelles sont les caractéristiques du plan en carré latin?
Double restriction à la randomisation: colonnes x rangées
Chaque traitement apparait 1 fois dans colonne et rangée
Le plus commun 4-8 traitements
Nb traitements = nb répétitions
Quels sont les avantages et désavantages du plan en carré latin?
Avantages
Classification à 2 voies, meilleur contrôle variation externe
Analyse relativement simple, même en présence de données manquantes
Possibilité de retirer traitements, rangées ou colonnes
Désavantages
Nb traitement limité par le nb de rangées et colonnes
Nb répétitions = nb traitements
Rarement utilisé pour plus de 10 traitements
Moins 4 traitements peu adaptés
Comment élaborer un plan en carré latin et la distribution des traitements aux U.E.
Matrice symétrique (ou nimporte quel matrice carré latin)
Randomiser rangée
Randomiser colonnes
Quelles sont les sources de variations du plan en carré latin? décompose les dl
Var simple
1. Rangées
2. Colonnes
3. Trait (inter)
4. Erreur (intra)
Total U.E
Var avec U.Écha
1. Rangées
2. Colonnes
3. Trait (inter)
4. Erreur (intra)
Total U.E
5. Erreur échant
Total Échant
Var deux expériences
1. (exp)
2. Rangées (somme dl 2 exp)
3. Colonnes (somme dl 2 exp)
4. Trait (inter)
5. exp * trait
6. Erreur (intra)
Total U.E
Quels sont les différents facteurs de blocage
Temps: jours, semaines, mois..
Personnes: observateurs, techniciens
Lot de matériel: semences, portées d’animaux, etx
Espace: ferme de production, parquets d’étable, planches de terrain
Appareils: fours robotisés, incubateurs, etc
Qu’est ce que le carré latin double
Exemple doubler nb de ligne
Permet d’avoir plus de dl à l’erreur
