Chapitre 5 Flashcards
Nommer la technique de répression de transcription
Encombrement
Décrire mode d’action de l’encombrement
Répresseur se lie sur site recouvrant en partie le promoteur ce qui empêche ARN pol de se lier et réprime la transcription
Comment nomme t’on le site où se lie le répresseur sur l’ADN
Opérateur
Nommer 2 techniques de l’activation de transcription
Recrutement et allostérie
Décrire mode d’action recrutement (activation transcription)
Activateur aide ARNpol à se fixer sur promoteur
Mode action du recrutement (activation de transcription)
Activateur se lie sur site proche promoteur (site liaison activateur)
Interagit avec ARN pol pour le rapprocher promoteur
Mécanisme de recrutement est-il coopératif?
Oui
Nommer étape limitante de activation transcription par allostérie
Transition de fermé vers ouvert
Décrire mode action activation transcription allostérie
Change structure de protéine après liaison ligand sur site régulateur
Nommer source primaire d’énergie pour procaryotes
Glucose (monosaccharide)
Nommer l’autre source d’énergie pour procaryotes si manque de gluchose
Lactose qu’il convertit en glucose et galactose
Décrire opéron lac
Série de gènes nécessaire à l’importation lactose et conversion lactose
Nommer site d’activation de l’opéron lac
CAP site
Nommer les 3 gènes lac adjacents sur le génome d’E coli
lacZ, lacY et lacA
Transcription des 3 gènes lac du génome d’E coli donne combien d’ARN
a) 1
b) 3
1 ARN qui contient les 3 gènes
LacZ code pour quelle protéine
B-galactosidase
LacY code pour quelle protéine
Lactose perméase
LacA code pour quelle protéine
Thiogalactoside transacétylase
Rôle lacZ
Enzyme qui coupe le lactose en galactose et glucose
Clive lactose en 2 sucres
Rôle lacY
Protéine transmembranaire qui importe le lactose dans cellule
Fait trou dans membrane
Rôle lacA
Débarrasse cellule des thiogalactoside toxiques qui sont importés avec lactose par la lactose perméase
Comment le thiogalactoside entre dans cellule
Pores font pas juste entrer lactose, mais aussi thiogalactoside (toxique) (ressemble lactose)
Dans quelles conditions la cellule a-t-elle besoin de produire les gènes lac
Quand lactose et quand pas glucose
Les protéines lac sont produites sous quelles 2 conditions dans milieu extracellulaire
- Carence glucose
- Présence lactose
Nommer les 2 protéines régulatrices impliquées dans production protéines lac
- CAP
- Répresseur lac
CAP
a) activateur
b) répresseur
a) activateur
Où se lie l’activateur CAP
Site CAP
Rôle activateur CAP
Transmet signal du glucose
Par qui est codé répresseur lac
LacI
Où se lie répresseur lac
Opérateur
Rôle répresseur lac
Transmet signal lactose
Que se passe t’il en absence de CAP
ARN pol se lie faiblement sur promoteur lac
Région -35 du promoteur non optimale
Que se passe t’il si élément UP absent, mais qu’il y a CAP
CAP remplace éléments UP absent et agit comme élément UP
- Typique des promoteurs contrôlés par activateurs
Que se passe t’il se présence CAP
Se lie 60pb en amont du site initiation
Recrute ARN pol sur promoteur
CAP est-il mécanisme coopératif?
Oui
Que CAP produit dans ADN qui s’enveloppe autour d’elle
Torsion
Glucose augmente/diminue [AMPc]
Diminue
Opérateur lac est site de liaison de qui
Répresseur lac
Opérateur lac est reconnu par combien de sous-unités du répresseur lac
2
Comment le répresseur lac (lié à opérateur lac) réprime la transcription
- Recouvre une partie du promoteur
- Empêche physiquement ARN pol d’interagir avec promoteur
Les régulateurs bactériens (en général) se lie sous forme
a) homodimère
b) dimère
c) tétramère
a) homodimère
La reconnaissance des séquences spécifiques d’ADN se fait par quelle structure?
Hélice-coude-hélice
Répresseur lac est
a) monomère
b) dimère
c) tétramère
c) tétramère
Chaque opérateur lac est en contact avec combien de sous-unité du répresseur
2 sous-unités
Que se passent t’il avec les 2 monomères restants du répresseur lac qui ne sont en contact avec les 2 sous-unités de opérateur lac
Vont lier l’un des 2 autres opérateurs distants
400 pb en aval et 90 pb en amont de opérateur primaire
Lactose se lie où
Répresseur lac
Que se passe t’il quand lactose se lie au répresseur lac
Induit changement conformation -> ne peut plus lier ADN, ne se lie plus à l’opérateur
À quel moment les gènes gal (de l’opéron gal) sont-ils exprimés
Quand galactose est présent et glucose est absent
Que se passe t’il quand il y a un choc thermique chez E coli
Augmentation facteur transcription sigma 32
Nommer 2 mécanismes qui augmentent sigma 32
Stimulation traduction
Stabilisation transitoire protéine
Nommer 2 régulateurs qui provoquent l’allostérie
NtrC et MerR
Nommer un exemple d’antiactivation
araBAD
Définir araBAD
Promoteur qui dirige l’expression des gènes pour métabolisme de l’arabinose
À quel moment exprime t’on araBAD
Présence arabinose et absence glucose
Nommer les 2 activateurs de araBAD
CAP et AraC
Synonyme régulateurs positifs
Activateurs
Synonyme régulateurs négatifs
Répresseurs
Définir régulateurs
Protéines qui reconnaissent sites et s’y lient pour contrôler leur expression
Nommer étape à laquelle on fait principalement la régulation
Initiation de transcription
Niveau basal de transcription est-il différent ou pareil d’un gène à l’autre
Différent
Quel phénomène induit réponse SOS chez E.coli (bactéries)
Accumulation dommages ou cassures monocaténaire
Quand intégrité bactérie est affecté
Réponses SOS va produire quoi
Production de protéines de réparation qui ne sont pas présentes normalement (économie énergie)
Les lésions vont provoquer quoi
mécanisme général réponse SOS
Destruction d’un répresseur de transcription (LexA)
Rôle LexA
Réprime gènes impliqués dans réponse SOS
Que va produire disparition LexA (causé par dommage et cassures)
Active réponse SOS
Qui va dégrader LeXa (nom de la protéase)
RecA
À quel moment RecA est activé
Quand dommages induits à ADN
Pourquoi le répresseur lambda est clivé quand la réponse SOS est activé
Lambda ressemble à LexA
RecA dégrade LexA et lambda
Régulation répresseur lambda quand qtité trop faible
Induction spontanée sans réponse SOS
Régulation répresseur lambda quand qtiti trop élevée
Manque RecA pour inactiver répresseurs lambda
Qu’est-ce qui détermine choix lytique et lysogène
Évenements précoces de l’infection
-> choix de cII ou cIII
cI peut être transcrit à partir de quel promoteur
a) PL
b) PRM
c) P R
d) PRE
b) PRM
d) PRE
