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Génétique moléculaire > Chapitre 3 > Flashcards

Chapitre 3 Flashcards

1
Q

Vrai ou faux

Toutes les cellules du corps humain proviennent d’une seule cellule

A

Vrai, gamète mâle + femelle

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Q

Réplication ADN nécessite 3 éléments

A
  • dNTP (nucléotides)
  • Jonction amorce:matrice
  • ADN polymérase
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Q

3 sections ADN polymérase - main

A
  • Paume
  • Doigts
  • Pouce
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4
Q

Rôle paume (2 ions métalliques -> première fonction paume)

A
  • 1 réduit le 3’OH en 3’O-
  • l’autre stabilise phosphates beta et gamma
    DONC modifient environnement chimique OH’ et dNTP = + efficace
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5
Q

Quels est habituellement l’ion dans la paume

A

Mg2+

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6
Q

2e fonction paume

A

Exonucléase

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7
Q

Conséquences des mésappariements

Fonction exonucléase

A

Ralentissent catalyse et diminue affinité de ADN pour jonction amorce-matrice DONC amorce se lie à exonucléase et ADN mésapparié est enlevé

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8
Q

Rôle doigts ADN pol et ses 2 conséquences

A

Quand appariement correct, doigts se referment

  • Rapproche nucléotide des ions métalliques
  • Augmente vitesse catalyse
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9
Q

Comment les doigts fonctionnent-ils

Conséquence

A

Induisent rotation 90 degré entre 1re et 2e base matrice -> empêche appariement dNTP avec 2e base (car le sort du site catalytique)

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10
Q

Qui aide à la catalyse

a) paume
b) doigts
c) pouce

A

a) paume

b) doigts

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11
Q

Rôle pouce ADN pol

A

Maintient amorce et site actif de paume en position optimale -> association forte entre ADN pol et substrat DONC stabilisateur

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12
Q

Nommer étape limitante à réaction de catalyse

A

Liaison polymérase à jonction amorce:matrice

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13
Q

Vrai ou faux

ADN pol est processive et définition de ce mot

A

Vrai

Lie substrat, mais catalyse plusieurs réactions avant de se détacher

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14
Q

Vrai ou faux
Dans cellule, les 2 brins d’ADN sont répliqués simultanément
Pourquoi

A

Vrai

Sinon dégradation du second brin

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15
Q

Définir fourche de réplication

A

Endroit où ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaires

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16
Q

Réplication se fait

a) 3’ à 5’
b) 5’ à 3’

A

b) 5’ à 3’

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17
Q

Comment appelle t’on réplication d’un brin 3’ à 5’ (sens inverse de réplication)

A

Brin discontinu -> fragments d’Okazaki

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18
Q

Mécanisme action réplication brin discontinu (fragments okazaki)

A

Petit bout -> retour en arrière -> fourche s’ouvre -> petit bout

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19
Q

Rôle primase (une ARN pol)

A

Fabrique amorces courtes sur matrice brin (discontinu) qui serviront jonction amorce-matrice -> ADN pol peut s’asseoir

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20
Q

Comment on se débarrasse des ARN fait par primase

A

RNase H

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21
Q

Rôle RNase H

A

Dégrade spécifiquement les ARN appariés à ADN

Enlève tout sauf dernier nucléotide

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22
Q

Qui enlève le dernier nucléotide des ARN qui ont servis de jonction amorce-matrice pour brin discontinu (fait par primase)

A

Exonucléase 5’

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23
Q

Qui remplit le trou créé par l’exonucléase 5’ et RNase H

Qui répare la cassure

A

ADN polymérase

ADN ligase

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24
Q

Rôle hélicase

A

Défont double hélice ADN en utilisant ATP

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25
Q

Vrai ou faux

Hélicases sont processives

A

Vrai

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26
Q

Polarité hélicase

a) 3’ à 5’
b) 5’ à 3’

A

a) 3’ à 5’
b) 5’ à 3’
Varie selon l’hélicase

27
Q

Forme/configuration hélicase

A

Hexamère sous forme anneau

28
Q

Qu’est-ce que des SSB

A

Single strain binding protein

29
Q

Rôle SSB

A

Protéines liant ADNsb pour la stabiliser

-> Empêche réappariement, dégradation et formation boucles

30
Q

Vrai ou faux
Liaison SSB est coopérative
Expliquer

A

Vrai

Liaison SSB facilite liaison d’une autre SSB

31
Q

Pourquoi SSB lie l’ADNsb (pourquoi c’est un besoin)

A

ADNsb très instables

Plusieurs nucléases ont pour rôle de dégrader ADNsb

32
Q

Nommer les 5 protéines de la fourche

A
  • Hélicase
  • SSB
  • Primase
  • ADN pol
  • Topoisomérase
33
Q

Rôle topoisomérase dans fourche

A

Éliminer surenroulement positif généré par hélicase

34
Q

Nommer type d’ADN polymérase des procaryotes (qu’on parle dans ce cours)

A

Pol III

35
Q

Nommer type d’ADN polymérase des eucaryotes (qu’on parle dans ce cours)

A

Pol alpha
Pol delta
Pol epsilon

36
Q

Mécanisme action réplication par alpha/primase

A
  • Initiations brins neufs
  • Primase fait amorce
  • Pol alpha commence réplication
  • > On a besoin quelques nucléotides ADN pour que delta et epsilon puissent se lier
37
Q

Pourquoi nous ne faisons pas réplication en utilisant seulement alpha/primase

A

Processivité faible

38
Q

Pourquoi nous ne faisons pas réplication en utilisant seulement delta et epsilon

A

Fonctionnement pas bien quand jonction amorce-matrice est de type ARN-ADN

39
Q

Rôle anneau coulissant

A

Augmente bcp processivité

Garde ADN pol près du substrat (l’empêche de s’éloigner)

40
Q

À quel moment ADN pol se détache de l’anneau coulissant et brin

A

Quand il n’y a plus de jonction amorce-matrice

41
Q

On retrouve anneau coulissant chez

a) procaryotes
b) virus
c) eucaryotes

A

a) procaryotes
b) virus
c) eucaryotes

42
Q

Qui pose anneaux coulissants sur ADN à chaque jonction amorce-matrice

A

Poseurs d’anneaux coulissants

43
Q

Pourquoi faut-il ralentir la réplication du brin continu

A

Pour synchroniser brin continu et discontinu (+ lent) sinon dégradation sb

44
Q

Composition holoenzyme ADN pol III

A
  • ADN Pol III
  • Protéine Tau
  • Complexe gamma (poseur anneau coulissant)
  • Domaine flexible
  • Anneau coulissant
45
Q

Qu’est-ce que le réplisome

A

ADN pol holoenzyme + hélicase + primase

46
Q

Hélicase du réplisome se lie via quoi

A

Sous-unités tau

47
Q

Primase du réplisome se lie…

A

Faiblement à l’hélicase toutes les secondes

48
Q

Nommer nom des sites spécifiques où débute la réplication

A

Origine de réplication

49
Q

Pourquoi a t’on besoin d’origine de réplication? Pourquoi l’hélicase ne peut pas tout de suite ouvrir la double hélice

A

Besoin d’ouvrir double hélice pour faire asseoir hélicase qui va continuer à ouvrir double hélice

50
Q

Nommer les 2 composants de l’initiation

A
  • Réplicateur

- Initiateur

51
Q

Réplicateur

a) région ADN
b) protéine

A

a) région ADN

52
Q

Initiateur

a) région ADN
b) protéine

A

b) protéine

53
Q

Rôle réplicateur

A

Séquences ADN suffisantes pour initiation réplication

Inclus séquences fixation de initiateur et séquences facilement déroulées (AT riche)

54
Q

Rôle initiateur

A

Protéine qui reconnait spécifiquement séquence réplicateur
Ouvre double hélice pour qu’hélicase se lie
Recrutent protéines nécessaires initiation réplication
Active initiation réplication

55
Q

Nommer 4 composants du complexe pré-réplicatif

A

ORC + Cdc6 + Cdt1 + (2 hélicases Mcm 2-7)

56
Q

Rôle complexe pré-réplicatif

A

Recruter ADN hélicase

57
Q

Étapes (3) formation complexe pré-réplicatif

A
  1. Reconnaissance réplicateur par initiateur (ORC)
  2. ORC recrute 2 poseurs d’hélicases (Cdc6 et Cdt1)
  3. Ce complexe recrute ADN hélicase
58
Q

Nommer les 2 poseurs d’hélicases

A

Cdc6 et Cdt1

59
Q

Nommer nom de l’initiateur

A

ORC

60
Q

Assemblage des fourches se fait à quel phase

G1,S,G2,M

A

S

61
Q

Qu’est ce que l’assemblage des fourches

C’est quoi la modification

A

Phosphorylation (activation) du complexe pré-RC et d’autres protéines par CdK et Ddk

62
Q

Que sont Cdk et Ddk

a) protéines
b) segments gène
c) kinase

A

c) kinase

63
Q

Rôle activation par Cdk et Ddk

A

Recrutement ADN pol

64
Q

Que se passe t’il avec Cdc6 et Cdt1 quand on veut activer le pré-RC

A

Cdc6 est dégradé et Cdt1 est inactivé

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