Chapitre 3 Flashcards

(64 cards)

1
Q

Vrai ou faux

Toutes les cellules du corps humain proviennent d’une seule cellule

A

Vrai, gamète mâle + femelle

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Q

Réplication ADN nécessite 3 éléments

A
  • dNTP (nucléotides)
  • Jonction amorce:matrice
  • ADN polymérase
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Q

3 sections ADN polymérase - main

A
  • Paume
  • Doigts
  • Pouce
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4
Q

Rôle paume (2 ions métalliques -> première fonction paume)

A
  • 1 réduit le 3’OH en 3’O-
  • l’autre stabilise phosphates beta et gamma
    DONC modifient environnement chimique OH’ et dNTP = + efficace
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5
Q

Quels est habituellement l’ion dans la paume

A

Mg2+

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6
Q

2e fonction paume

A

Exonucléase

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7
Q

Conséquences des mésappariements

Fonction exonucléase

A

Ralentissent catalyse et diminue affinité de ADN pour jonction amorce-matrice DONC amorce se lie à exonucléase et ADN mésapparié est enlevé

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8
Q

Rôle doigts ADN pol et ses 2 conséquences

A

Quand appariement correct, doigts se referment

  • Rapproche nucléotide des ions métalliques
  • Augmente vitesse catalyse
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9
Q

Comment les doigts fonctionnent-ils

Conséquence

A

Induisent rotation 90 degré entre 1re et 2e base matrice -> empêche appariement dNTP avec 2e base (car le sort du site catalytique)

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10
Q

Qui aide à la catalyse

a) paume
b) doigts
c) pouce

A

a) paume

b) doigts

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11
Q

Rôle pouce ADN pol

A

Maintient amorce et site actif de paume en position optimale -> association forte entre ADN pol et substrat DONC stabilisateur

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12
Q

Nommer étape limitante à réaction de catalyse

A

Liaison polymérase à jonction amorce:matrice

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13
Q

Vrai ou faux

ADN pol est processive et définition de ce mot

A

Vrai

Lie substrat, mais catalyse plusieurs réactions avant de se détacher

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14
Q

Vrai ou faux
Dans cellule, les 2 brins d’ADN sont répliqués simultanément
Pourquoi

A

Vrai

Sinon dégradation du second brin

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15
Q

Définir fourche de réplication

A

Endroit où ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaires

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16
Q

Réplication se fait

a) 3’ à 5’
b) 5’ à 3’

A

b) 5’ à 3’

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17
Q

Comment appelle t’on réplication d’un brin 3’ à 5’ (sens inverse de réplication)

A

Brin discontinu -> fragments d’Okazaki

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18
Q

Mécanisme action réplication brin discontinu (fragments okazaki)

A

Petit bout -> retour en arrière -> fourche s’ouvre -> petit bout

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19
Q

Rôle primase (une ARN pol)

A

Fabrique amorces courtes sur matrice brin (discontinu) qui serviront jonction amorce-matrice -> ADN pol peut s’asseoir

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20
Q

Comment on se débarrasse des ARN fait par primase

A

RNase H

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21
Q

Rôle RNase H

A

Dégrade spécifiquement les ARN appariés à ADN

Enlève tout sauf dernier nucléotide

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22
Q

Qui enlève le dernier nucléotide des ARN qui ont servis de jonction amorce-matrice pour brin discontinu (fait par primase)

A

Exonucléase 5’

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23
Q

Qui remplit le trou créé par l’exonucléase 5’ et RNase H

Qui répare la cassure

A

ADN polymérase

ADN ligase

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24
Q

Rôle hélicase

A

Défont double hélice ADN en utilisant ATP

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25
Vrai ou faux | Hélicases sont processives
Vrai
26
Polarité hélicase a) 3' à 5' b) 5' à 3'
a) 3' à 5' b) 5' à 3' Varie selon l'hélicase
27
Forme/configuration hélicase
Hexamère sous forme anneau
28
Qu'est-ce que des SSB
Single strain binding protein
29
Rôle SSB
Protéines liant ADNsb pour la stabiliser | -> Empêche réappariement, dégradation et formation boucles
30
Vrai ou faux Liaison SSB est coopérative Expliquer
Vrai | Liaison SSB facilite liaison d'une autre SSB
31
Pourquoi SSB lie l'ADNsb (pourquoi c'est un besoin)
ADNsb très instables | Plusieurs nucléases ont pour rôle de dégrader ADNsb
32
Nommer les 5 protéines de la fourche
- Hélicase - SSB - Primase - ADN pol - Topoisomérase
33
Rôle topoisomérase dans fourche
Éliminer surenroulement positif généré par hélicase
34
Nommer type d'ADN polymérase des procaryotes (qu'on parle dans ce cours)
Pol III
35
Nommer type d'ADN polymérase des eucaryotes (qu'on parle dans ce cours)
Pol alpha Pol delta Pol epsilon
36
Mécanisme action réplication par alpha/primase
- Initiations brins neufs - Primase fait amorce - Pol alpha commence réplication - > On a besoin quelques nucléotides ADN pour que delta et epsilon puissent se lier
37
Pourquoi nous ne faisons pas réplication en utilisant seulement alpha/primase
Processivité faible
38
Pourquoi nous ne faisons pas réplication en utilisant seulement delta et epsilon
Fonctionnement pas bien quand jonction amorce-matrice est de type ARN-ADN
39
Rôle anneau coulissant
Augmente bcp processivité | Garde ADN pol près du substrat (l'empêche de s'éloigner)
40
À quel moment ADN pol se détache de l'anneau coulissant et brin
Quand il n'y a plus de jonction amorce-matrice
41
On retrouve anneau coulissant chez a) procaryotes b) virus c) eucaryotes
a) procaryotes b) virus c) eucaryotes
42
Qui pose anneaux coulissants sur ADN à chaque jonction amorce-matrice
Poseurs d'anneaux coulissants
43
Pourquoi faut-il ralentir la réplication du brin continu
Pour synchroniser brin continu et discontinu (+ lent) sinon dégradation sb
44
Composition holoenzyme ADN pol III
- ADN Pol III - Protéine Tau - Complexe gamma (poseur anneau coulissant) - Domaine flexible - Anneau coulissant
45
Qu'est-ce que le réplisome
ADN pol holoenzyme + hélicase + primase
46
Hélicase du réplisome se lie via quoi
Sous-unités tau
47
Primase du réplisome se lie...
Faiblement à l'hélicase toutes les secondes
48
Nommer nom des sites spécifiques où débute la réplication
Origine de réplication
49
Pourquoi a t'on besoin d'origine de réplication? Pourquoi l'hélicase ne peut pas tout de suite ouvrir la double hélice
Besoin d'ouvrir double hélice pour faire asseoir hélicase qui va continuer à ouvrir double hélice
50
Nommer les 2 composants de l'initiation
- Réplicateur | - Initiateur
51
Réplicateur a) région ADN b) protéine
a) région ADN
52
Initiateur a) région ADN b) protéine
b) protéine
53
Rôle réplicateur
Séquences ADN suffisantes pour initiation réplication | Inclus séquences fixation de initiateur et séquences facilement déroulées (AT riche)
54
Rôle initiateur
Protéine qui reconnait spécifiquement séquence réplicateur Ouvre double hélice pour qu'hélicase se lie Recrutent protéines nécessaires initiation réplication Active initiation réplication
55
Nommer 4 composants du complexe pré-réplicatif
ORC + Cdc6 + Cdt1 + (2 hélicases Mcm 2-7)
56
Rôle complexe pré-réplicatif
Recruter ADN hélicase
57
Étapes (3) formation complexe pré-réplicatif
1. Reconnaissance réplicateur par initiateur (ORC) 2. ORC recrute 2 poseurs d'hélicases (Cdc6 et Cdt1) 3. Ce complexe recrute ADN hélicase
58
Nommer les 2 poseurs d'hélicases
Cdc6 et Cdt1
59
Nommer nom de l'initiateur
ORC
60
Assemblage des fourches se fait à quel phase | G1,S,G2,M
S
61
Qu'est ce que l'assemblage des fourches | C'est quoi la modification
Phosphorylation (activation) du complexe pré-RC et d'autres protéines par CdK et Ddk
62
Que sont Cdk et Ddk a) protéines b) segments gène c) kinase
c) kinase
63
Rôle activation par Cdk et Ddk
Recrutement ADN pol
64
Que se passe t'il avec Cdc6 et Cdt1 quand on veut activer le pré-RC
Cdc6 est dégradé et Cdt1 est inactivé