Chapitre 3 Flashcards
Vrai ou faux
Toutes les cellules du corps humain proviennent d’une seule cellule
Vrai, gamète mâle + femelle
Réplication ADN nécessite 3 éléments
- dNTP (nucléotides)
- Jonction amorce:matrice
- ADN polymérase
3 sections ADN polymérase - main
- Paume
- Doigts
- Pouce
Rôle paume (2 ions métalliques -> première fonction paume)
- 1 réduit le 3’OH en 3’O-
- l’autre stabilise phosphates beta et gamma
DONC modifient environnement chimique OH’ et dNTP = + efficace
Quels est habituellement l’ion dans la paume
Mg2+
2e fonction paume
Exonucléase
Conséquences des mésappariements
Fonction exonucléase
Ralentissent catalyse et diminue affinité de ADN pour jonction amorce-matrice DONC amorce se lie à exonucléase et ADN mésapparié est enlevé
Rôle doigts ADN pol et ses 2 conséquences
Quand appariement correct, doigts se referment
- Rapproche nucléotide des ions métalliques
- Augmente vitesse catalyse
Comment les doigts fonctionnent-ils
Conséquence
Induisent rotation 90 degré entre 1re et 2e base matrice -> empêche appariement dNTP avec 2e base (car le sort du site catalytique)
Qui aide à la catalyse
a) paume
b) doigts
c) pouce
a) paume
b) doigts
Rôle pouce ADN pol
Maintient amorce et site actif de paume en position optimale -> association forte entre ADN pol et substrat DONC stabilisateur
Nommer étape limitante à réaction de catalyse
Liaison polymérase à jonction amorce:matrice
Vrai ou faux
ADN pol est processive et définition de ce mot
Vrai
Lie substrat, mais catalyse plusieurs réactions avant de se détacher
Vrai ou faux
Dans cellule, les 2 brins d’ADN sont répliqués simultanément
Pourquoi
Vrai
Sinon dégradation du second brin
Définir fourche de réplication
Endroit où ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaires
Réplication se fait
a) 3’ à 5’
b) 5’ à 3’
b) 5’ à 3’
Comment appelle t’on réplication d’un brin 3’ à 5’ (sens inverse de réplication)
Brin discontinu -> fragments d’Okazaki
Mécanisme action réplication brin discontinu (fragments okazaki)
Petit bout -> retour en arrière -> fourche s’ouvre -> petit bout
Rôle primase (une ARN pol)
Fabrique amorces courtes sur matrice brin (discontinu) qui serviront jonction amorce-matrice -> ADN pol peut s’asseoir
Comment on se débarrasse des ARN fait par primase
RNase H
Rôle RNase H
Dégrade spécifiquement les ARN appariés à ADN
Enlève tout sauf dernier nucléotide
Qui enlève le dernier nucléotide des ARN qui ont servis de jonction amorce-matrice pour brin discontinu (fait par primase)
Exonucléase 5’
Qui remplit le trou créé par l’exonucléase 5’ et RNase H
Qui répare la cassure
ADN polymérase
ADN ligase
Rôle hélicase
Défont double hélice ADN en utilisant ATP
Vrai ou faux
Hélicases sont processives
Vrai
Polarité hélicase
a) 3’ à 5’
b) 5’ à 3’
a) 3’ à 5’
b) 5’ à 3’
Varie selon l’hélicase
Forme/configuration hélicase
Hexamère sous forme anneau
Qu’est-ce que des SSB
Single strain binding protein
Rôle SSB
Protéines liant ADNsb pour la stabiliser
-> Empêche réappariement, dégradation et formation boucles
Vrai ou faux
Liaison SSB est coopérative
Expliquer
Vrai
Liaison SSB facilite liaison d’une autre SSB
Pourquoi SSB lie l’ADNsb (pourquoi c’est un besoin)
ADNsb très instables
Plusieurs nucléases ont pour rôle de dégrader ADNsb
Nommer les 5 protéines de la fourche
- Hélicase
- SSB
- Primase
- ADN pol
- Topoisomérase
Rôle topoisomérase dans fourche
Éliminer surenroulement positif généré par hélicase
Nommer type d’ADN polymérase des procaryotes (qu’on parle dans ce cours)
Pol III
Nommer type d’ADN polymérase des eucaryotes (qu’on parle dans ce cours)
Pol alpha
Pol delta
Pol epsilon
Mécanisme action réplication par alpha/primase
- Initiations brins neufs
- Primase fait amorce
- Pol alpha commence réplication
- > On a besoin quelques nucléotides ADN pour que delta et epsilon puissent se lier
Pourquoi nous ne faisons pas réplication en utilisant seulement alpha/primase
Processivité faible
Pourquoi nous ne faisons pas réplication en utilisant seulement delta et epsilon
Fonctionnement pas bien quand jonction amorce-matrice est de type ARN-ADN
Rôle anneau coulissant
Augmente bcp processivité
Garde ADN pol près du substrat (l’empêche de s’éloigner)
À quel moment ADN pol se détache de l’anneau coulissant et brin
Quand il n’y a plus de jonction amorce-matrice
On retrouve anneau coulissant chez
a) procaryotes
b) virus
c) eucaryotes
a) procaryotes
b) virus
c) eucaryotes
Qui pose anneaux coulissants sur ADN à chaque jonction amorce-matrice
Poseurs d’anneaux coulissants
Pourquoi faut-il ralentir la réplication du brin continu
Pour synchroniser brin continu et discontinu (+ lent) sinon dégradation sb
Composition holoenzyme ADN pol III
- ADN Pol III
- Protéine Tau
- Complexe gamma (poseur anneau coulissant)
- Domaine flexible
- Anneau coulissant
Qu’est-ce que le réplisome
ADN pol holoenzyme + hélicase + primase
Hélicase du réplisome se lie via quoi
Sous-unités tau
Primase du réplisome se lie…
Faiblement à l’hélicase toutes les secondes
Nommer nom des sites spécifiques où débute la réplication
Origine de réplication
Pourquoi a t’on besoin d’origine de réplication? Pourquoi l’hélicase ne peut pas tout de suite ouvrir la double hélice
Besoin d’ouvrir double hélice pour faire asseoir hélicase qui va continuer à ouvrir double hélice
Nommer les 2 composants de l’initiation
- Réplicateur
- Initiateur
Réplicateur
a) région ADN
b) protéine
a) région ADN
Initiateur
a) région ADN
b) protéine
b) protéine
Rôle réplicateur
Séquences ADN suffisantes pour initiation réplication
Inclus séquences fixation de initiateur et séquences facilement déroulées (AT riche)
Rôle initiateur
Protéine qui reconnait spécifiquement séquence réplicateur
Ouvre double hélice pour qu’hélicase se lie
Recrutent protéines nécessaires initiation réplication
Active initiation réplication
Nommer 4 composants du complexe pré-réplicatif
ORC + Cdc6 + Cdt1 + (2 hélicases Mcm 2-7)
Rôle complexe pré-réplicatif
Recruter ADN hélicase
Étapes (3) formation complexe pré-réplicatif
- Reconnaissance réplicateur par initiateur (ORC)
- ORC recrute 2 poseurs d’hélicases (Cdc6 et Cdt1)
- Ce complexe recrute ADN hélicase
Nommer les 2 poseurs d’hélicases
Cdc6 et Cdt1
Nommer nom de l’initiateur
ORC
Assemblage des fourches se fait à quel phase
G1,S,G2,M
S
Qu’est ce que l’assemblage des fourches
C’est quoi la modification
Phosphorylation (activation) du complexe pré-RC et d’autres protéines par CdK et Ddk
Que sont Cdk et Ddk
a) protéines
b) segments gène
c) kinase
c) kinase
Rôle activation par Cdk et Ddk
Recrutement ADN pol
Que se passe t’il avec Cdc6 et Cdt1 quand on veut activer le pré-RC
Cdc6 est dégradé et Cdt1 est inactivé
