Chapitre 4. Taxonomie bactérienne et diversité Flashcards
Quel est le but de la taxonomie?
Étudier la diversité des organismes et les caractériser et classifier dans un ordre logique est ordonné
Qu’est-ce que la classification?
Le regroupement logique et ordonné des organismes en rangs taxonomiques (taxons) selon les similitudes ou la parenté (la parenté est priorisée).
Quel scientifique a construit la base des théories actuelles de l’évolution des procaryotes? Quelles sont ses recherches?
Carl Woese dans les années 80-90. Ses recherches sur l’ARNr suggère que les groupes de bactéries et d’Archées sont apparus très tôt au cours de l’évolution
Quelles sont les deux hypothèses qui supporte l’idée des cellules eucaryotes qui ont dérivé des procaryotes 1,4 milliards d’années avant?
1 - Hypothèse des fusions des génomes : certains gènes bactériens et archées se sont combinés pour former un seul génome eucaryote (évolution du noyau)
2 - Hypothèse endosymbiotique : endosymbiose serait responsable de l’apparition des organelles cellulaires eucaryotes
Qu’est-ce que la phylogénie
L’étude des relations de parenté entre les êtres vivants
Sur quoi les arbres phylogénétiques étaient-il basés avant l’arrivée des outils moléculaires modernes?
Sur des critères facilement observables
Quels étaient les 5 règnes selon Whittaker?
Monera/procaryota, protista, fungi, animalia, plantae
Quels étaient les 3 critères de classifications des organismes selon Robert H. Whittaker?
Type cellulaire : structure nucléaire, composition de la paroi cellulaire
Niveau d’organisation : solitaire/unicellaire, colonie ou multicellulaire
Type de nutrition
Quels sont les trois domaines obtenues après l’avènement des outil moléculaire permettant de séquencer l’ARN 16S?
Bacteria, archaea et eucarya
Quels sont les deux rangs qui sont la base de l’espèce bactérienne?
Le genre et l’espèce servent à correctement identifier les bactéries
Par quoi est régi le système de nomenclature bactérienne?
PAr le code internationnal de nomenclature bactériene, dont le rôle est d’assurer l’uniformité internationale et l’Efficacité des communications
Si deux laboratoires donnent un nom différent pour une même bactérie, quel nom doit être utilisé par la suite?
La priorité est donnée au premier laboratoire ayant publié selon les règles, d’ans l’International Journal of Systematics and Evolutionary Microbiology (IJSEM)
Qu’est-ce qu’un nom perilleux (Nomen periculosum)?
Dans le cas de bactéries d’intérêt médical/vétérinaire, l’écologie/pouvoir pathogène est prioritaire aux critères génétiques (et les noms sont conservés) pour éviter des problèmes de communication.
Nommez des exemples de noms perilleux.
Shigella et souches coli
Mycobacterium
B. anthracis, cereus, …
C. botulinum