Chapitre 1. Exigence de la croissance bactérienne Flashcards
Quels sont les éléments majeurs nécessaire à la vie?
CHNOPS, K, Ca, Mg et Fe
Sous quelles formes sont les 6 éléments majeurs (CHNOPS)?
Sous forme de lipides, protéines et acides nucléiques
Sous quelles formes forme sont les éléments majeurs Mg, K, Fe et Ca?
Sous forme de cation
Quelles est la différence entre macronutriment et micronutriment?
Les macrionutriments sont présent en quantité importante dans la cellule et les micronutriments y sont en quantité traces (ils sont donc nécessaire mais en très petites quantités)
Quelles sont les molécules qui peuvent être utilisées comme source de carbone?
Elles sont très variées et peuvent aller du CO2 de l’air à la molécule de pesticide extrêmement complexe.
Vrai ou faux? Les sources de carbones sont aussi souvent source d’hydrogène et carbones.
Oui, étant donné que le carbone est majoritairement présent dans des molécules organiques.
Toutes les bactéries ont-elles besoin d’oxygène et d’hydrogène pour vivre?
Oui, sous forme d’oxygène et d’hydrogène lié du moins (ex. dans molécules organiques ou CO2 ou H2O).
Que permettent l’azote, le phosphore et le soufre chez les microorganismes?
La synthèse de macromolécules (acides nucléiques, a.a., lipides, glucides)
Vrai ou faux? Seulement certaines bactéries sont capable d’utiliser l’azote gazeux de l’air.
Oui, il s’agit des bactéries fixatrices d’azote.
Comment la plupart des bactéries obtiennent-elles leur azote?
Sous forme de sel inorganique (ex. NH4Cl, (NH4)2SO4, NaNO3)
Pourquoi le soufre est-il nécessaire aux microorganismes?
Pour la synthèse de substances comme cystéine, méthionine, quelques glucides, biotine et thiamine, entre autres. Il y en a aussi dans les centre FeS et dans certains cofacteurs (ex. CoA, du cycle de Krebs)
Sous quelle forme les bactéries assimilent généralement le soufre dans la nature?
Sous la forme de sulfates, qu’elles réduisent en sulfure. D’autres peuvent aussi assimiler le soufre élémentaire.
Comment le phosphore est-il assimilé par la plupart des bactéries?
En Pi
Quel est le rôle des macronutriments minéraux?
Ils jouent un rôle dans la biosynthèse de plusieurs molécules abondantes et importante dans la cellule et un rôle d’activateur/cofacteur chez plusieurs enzymes.
Quel rôle jouent les micronutriments minéraux?
Ils participent à la structure fonctionnelle d’enzymes particulières.
Pourquoi certaines souches de bactéries peuvent croître sans que des micronutriments soient rajoutés au milieu de culture?
Car elle sont présente dans les impuretés de l’eau, dans la verrerie, etc.
Vrai ou faux? Les micronutriments peuvent être présents en grandes concentations dans le milieux sans affecter négativement la croissance.
Faux. À trop forte concentration, les micronutriments minéraux sont toxiques.
Comment appelle-t-on les bactéries possédant les enzymes et voies métaboliques nécessaires à la synthèse de tous les composants cellulaires à partir d’éléments minéraux? (Type trophique)
Les prototrophes
Si un microorganisme ne possède pas l’enzyme pour synthétiser un composant cellulaire à partir d’éléments minéraux, à quel type trophique correspond-il?
Auxotrophe
Qu’est-ce qu’un facteur de croissance?
Les constituants cellulaires essentiels qui ne peuvent pas être synthétisés par les auxotrophes
Quelles sont les trois classes de facteurs de croissance?
acides aminés (nécessaires à la synthèse protéique), purines et pyrimidines (nécessaires à la synthèse d’acides nucléiques), et les vitamines (forment des cofacteurs/en font partie)
Quels sont les deux types trophiques en fonction de leur source de carbone?
Hétérotrophes : utilisent des molécules organiques préformées comme source de carbone
Autotrophes : utilisent le CO2 comme source de carbone unique
Quels sont les types trophiques en fonction de leur source d’énergie (tranport d’électrons)?
Chimiotrophes : source d’énergie chimique (2 types de source d’électrons)
Phototrophes : source d’énergie provenant de la lumière.
Quelle est la particularité chez les phototrophes?
Les phototrophes ont une source d’électrons différente de leur source d’énergie étant donné que la lumière ne peut pas leur donner d’électrons)
Quelles sont les différents types trophiques associé à la source d’électrons d’un organisme (en lien avec la source d’énergie)?
Organotrophes : obtiennent leurs électrons de composés organiques
Litotrophes : obtiennent leurs électrons de composés inorganiques
Quels facteurs physico-chimiques peuvent influencer la croissance d’un microorganisme?
Le pH, l’activité de l’eau (aw), l’oxygène, la pression osmotique, la température, la lumière, la pression hydrostatique, le potentiel d’oxydoréduction
Quels facteurs physico-chimiques peuvent influencer la croissance d’un microorganisme?
Le pH, l’activité de l’eau (aw), l’oxygène, la pression osmotique, la température, la lumière, la pression hydrostatique, le potentiel d’oxydoréduction
Nommez chacun des types de microorganismes associés à leur croissance dans un intervalle de pH.
Acidophiles : entre 1 et 5.5
Neutrophiles : entre 5.5 et 8.5
Alcalophiles : entre 8.5 et 11.5
Quels sont les différents types de microorganismes associés à leur croissance dans une intervalle de température
Psychrophiles : 0 à 20
Mésophiles : 20 à 45
Thermophiles et thermophiles extrêmes : >45
Pourquoi les thermophiles et thermophiles extrêmes résistent-ils mieux à la chaleur?
Leurs enzymes sont beaucoup plus stables, leur synthèse protéique est plus adaptée, et leurs lipides membranaires sont plus saturés (rend leur dénaturation plus difficile).
Quels sont les 5 grands groupes reliés à l’utilisation de l’oxygène?
Aérobie strict : nécessite de l’O2 car il s’agit de leur accepteur final d’électrons
Anaérobie strict : incapables de croître en présence d’oxygène, car ils ne sont pas capables de se débarasser des produits toxiques produits par l’oxygènes.
Anérobies facultatifs : Utilisent l’oxygène lorsqu’il est présent mais possèdent une voie métabolique alternative s’il n’y en a pas (fermentation ou respiration anaérobie)
Microaérophiles : Incapables de croître au niveau atmosphérique normal d’oxygène, mais requièrent quand même l’oxygène pour croitre (entre 2 et 10%)
Anaérobies aérotolérants : Oxygène n’est pas toxique mais n’est pas utilisé
Quelle sera l’accepteur final d’électrons préféré pour les anaérobies facultatifs? Pourquoi?
L’O2 car il possède un potentiel REDOX plus grand que la respiration anaérobie et la fermentation (permet de synthétiser plus d’énergie).
Quels sont les facteurs à considérer pour fournjir une concentration correcte d’O2 dans les milieux liquides (pour les aérobies)?
- Ouverture de la fiole suffisament grande et recouverte d’un matériau poreux pour permettre l’échange.
- Rapports surface/vol. maximaux à privilégier dans les cultures statiques
- Agitation : augmente grandement la surface de contact (optimise l’efficacité)
- Si vol > 0,5, nécessaire de forcer l’air dans la solution par bullage sous pression
Qu’est-ce que le potentiel d’oxydoréduction (Eh)?
Système d’évaluation des conditions anaérobies : mesure de la tendance d’une solution à prendre/donner des électrons (oxydée ou réduite)
Comment évaluons-nous le potentiel d’oxydoréduction en microbiologie?
Avec un colorant redox qui deviennent de plus en plus colorés lorsqu’oxydés et incolores lorsque réduits.
Faut-il inclure directement les colorants redox dans la culture?
Non, en fait il sont souvent toxiques, donc il est nécessaire de les inclures dans des fioles contrôles manipulées exactement comme les cultures.
Nommez 4 colorants redox souvent utilisés.
Bleu de méthylène, bleu de toluidine, résorufine, phénosafranine.
Quels composés sont utilisés pour créer des conditions réductrices dans les milieux (rétablir le potentiel d’oxydoréduction)?
Les agents réducteurs : Na-thioglycollate, cystéine-HCl, Dithiothréitol, Na2S * 9H2O
Nommez des méthodes utilisées pour la culture en anaérobies.
- Technique de hungate : Bouchon de caoutchouc sur tube ajouté par presse de hungate qui permet de bloquer l’oxygène de l’air
- Dilution agitation : Diluer suspension bactérienne dans tubes gélosés avec agents réducteurs et conservés sous forme liquide
- Chambre et jarre anaérobie : réaction avec ocxyde de palladium pour exclure l’oxygèene
- Méthode oxyrase : systèeme enzymatique capable de trapper l’oxygèene non-toxique, et boite de pétri modifiée pour permettre un joint étanche et peu de surface entre oxygène et gélose
Qu’est-ce qu’une bactérie capnophile?
Une bactérie qui nécessite un niveau de CO2 supérieur à l’atmosphère poru leur croissance
Quel effet peut produire la lumière lors de la culture de microorganismes?
Chez les photosynthétiques, elle est esentielle à leur croissance, et chez les autres, elle peut moduler la production de pigments et altérer certaines composantes photosensibles du milieu de culture (ex. antibiotique ou colorant inhibiteur)
Qu’est-ce que la pression hydrostatique?
La pression générée par une colonne d’eau, qui peut affecter la croissance et survie des bactéries.
Qu’est-ce qu’une bactérie barophile?
Bactéries capables de se développer à des pressions très élevées (ex. 800 atm pour Moritella yayanosii comme pression optimale, mais incapable de croître à moins de 500 atm)
Quel est le lien entre la pression osmotique et l’activité de l’eau
L’aw est inversement proportionnelle à la pression osmotique
Nommez les intervalles de croissances des différents microorganismes dans l’aw
> 0,9 : bactéries
0,88 : levures
0,8 : moisissures
0,75 : bactéries halophiles
0,6 : levures osmophiles
