Chapitre 3 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que l’électrophorèse?

A

C’est la migration d’ion à travers un champ électrique

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2
Q

VRAI OU FAUX

Pour qu’une molécule puisse migrer, Félectrique > Ffriction

A

VRAI

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3
Q

Donner l’équation de la force électrique.

A

Félectrique = qE

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4
Q

Donner l’équation de la force de friction

A

Ffriction = vf

v= vitesse de migration
f= coefficient de friction

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5
Q

Le coefficient de friction dépende de quoi?

A

De la taille, de la forme de l’ion et de la viscosité de la solution

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6
Q

Comment appelle-t-on la vitesse à laquelle un ion se déplace?

A

La mobilité électrophorétique
u = v / E = q / f

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7
Q

VRAI OU FAUX

Au point isoélectrique, la mobilité électrophorétique est maximale

A

FAUX

Elle est nulle (q=0)

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8
Q

Qu’est-ce que l’électrophorèse en zone?

A

L’échantillon se déplace dans une phase solide comme le papier filtre, la cellulose ou un gel

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9
Q

Quels sont les avantages de cette technique?

A

1- On élimine l’agitation crée par la convection
2- Faible quantité de matériel

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10
Q

De quoi est constitué le gel utilisé pour l’électrophorèse sur gel?

A

L’agarose et le polyacrylamide (constitués de pores)

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11
Q

La séparation des protéines est basée sur quoi?

A

1- La mobilité électrophorétique
2- principe de filtration sur gel (tailles moléculaire)

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12
Q

VRAI OU FAUX

Les protéines les plus grosses migreront en premier dans un gel d’électrophorèse

A

FAUX

Ce sont les plus petites qui passeront en premier

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13
Q

Quel tampon faut-il utiliser afin de procéder au processus d’électrophorèse?

A

Un tampon ayant un pH d’environ 9 afin que toutes les protéines aillent une charge négative.

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14
Q

Par quelles procédures doit-on passer afin d’augmenter la résolution?

A

1- Un gel de séparation (running gel)
2- Un gel de concentration (stacking gel)

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15
Q

Quelle est la particularité du gel de concentration?

A

A une plus grande porosité que le gel de séparation

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16
Q

VRAI OU FAUX

Les Tampons sont pareils dans tous le gel d’électrophorèse

A

FAUX

Le Tampon dans le gel de concentration à un pH d’environ 2 unités de moins

17
Q

VRAI OU FAUX

Les protéines migrent beaucoup plus rapidement dans un gel de concentration

A

VRAI

Puisque le champ électrique est plus important

18
Q

Pourquoi?

A

Les ions rencontrent un pH inférieur à leur pKa, l’acide faible (glycine) devient neutre et immobile. Cela crée une haute résistance électrique (selon la Loi de Ohms E=IR).

19
Q

Par la suite, les protéines ralentissent dans le gel de séparation. Pourquoi?

A

Les anions atteignent le gel de séparation ayant un pH supérieur au pKa de la glycine. Alors, ils retrouvent leurs charges.

20
Q

Que permettent le gel de séparation et de concentration?

A
  • Créer des bandes qui sont minces et ordonnées selon leur mobilité.
  • Minimiser la diffusion dispersive des protéines.
21
Q

Que permet la présence de détergent, comme le SDS, dans un gel d’électrophorèse?

A

Permet de dénaturer la structure des protéines, chaque sous-unité de la protéine va avoir une conformation étendue

22
Q

VRAI OU FAUX

Grâce au SDS le rapport charge/masse sera le même pour toutes les protéines.

A

VRAI

Ce sera uniquement le phénomène gel-filtration qui permettra la séparation

23
Q

Pourquoi est-ce avantageux d’utiliser un gel SDS-PAGE?

A

1- Le SDS dissous les agrégats et les particules insolubles qui peuvent bloquer les pores
2- La mobilité électrophorétique possède une relation directe avec le poids moléculaire

24
Q

Quelles méthodes sont utilisées afin de visualiser la migration des protéines dans le gel?

A

1- Bleu de Coomassie brillant
2- Nitrate d’argent
3- Autoradiagraphie

25
Q

Quelle méthode de coloration est toutefois la plus spécifique?

A

Utilisation du Western Blot (utiliser un anti-corps qui reconnaît la protéine à l’étude)