Chapitre 2 Flashcards
Quelles sont les 4 raisons pour lesquelles il faut compacter l’ADN ?
1) le milieu cellulaire est un milieu sensible et instable pour l’ADN double hélice
2)Organisation chromosomique permet la recombinaison entre les chromosomes parentaux (diversité)
3) Compactage est un facteur important dans la transmission efficace du patrimoine génétique aux cellules filles
4) Le compactage doit être maximum pour se séparer correctement
Quelles solutions utilisent (les bactéries, les archées, les eucaryotes) pour compacter leur ADN ?
1) Bactérie : Protéine associées aux nucléoides
2) Protéine Hmf, homologue des histones eucaryotes
3) Eucaryotes: Octamères d’histones et autres protéines
Jusqu’à l’anaphase, comment s’appelle la protéine qui maintient les deux chromatides soeurs ensemble ?
La cohésine
Que se passe-t-il pour la cohésine au moment de l’anaphase ? (moment où les chromatides sœurs migrent aux deux pôles )
Les cohésines sont clivées
->supprime les tensions des microtubules
->permet une migration lente
Quelles types de protéines permettent cohésion et condensation des chromosomes ?
Les protéines MSC (MAINTENANCE STRUCTURALE DES CHROMOSOMES)
Vrai ou Faux: les MSC sont des ATPases
Vrai
LES MSC SONT DES ATPases, ELLES SONT CONSERVÉES DES BACTÉRIES AUX HUMAINS ! !
- AVEC DES PROTÉINES non-MSC, LES MSC FORMENT DES COMPLEXES MULTIPROTÉIQUES
Quelles sont les ATPases ? et leur fonction ?
TOPOISOMERASE II, FACTEURS DE REMODELAGE
DE LA CHROMATINE, CHROMOKINÉSINE
CES MOLÉCULES DOIVENT CERTAINEMENT COLLABORER AVEC LES CONDENSINES POUR REPRODUIRE EXACTEMENT LES STRUCTURES
DE CHROMOSOMES MITOTIQUES À CHAQUE DIVISION CELLULAIRE
Avec qui les ATPases collaborent et pourquoi ?
Avec les CONDENSINES POUR REPRODUIRE EXACTEMENT LES STRUCTURES DE CHROMOSOMES MITOTIQUES À CHAQUE DIVISION CELLULAIRE
Vrai ou faux : la COHÉSINE a une activité intramoléculaire et la CONDENSINE activité intermoléculaire
Faux, c’est l’inverse
A quels moments cohésine et condensine sont utilisés ?
Cohésine:RÉPLICATION JUSQU’À L’INTERPHASE
Condensine:APRES INTERPHASE PUIS COMPLETE LA MITOSE
A quels moments l’ADN est moins compacté ?
entre les mitoses
Quels sont les deux rôles de la condensine ?
- ON RETROUVE DIFFÉRENTES CONDENSINES SELON LES ESPÈCES.
- RÔLE ÉGALEMENT DANS LA RÉGULATION DE L’EXPRESSION DES GÈNES
- RÔLE DANS LA RÉPARATION DE L’ADN
A quel moment la cohesine est resynthétisé ?
INTERPHASE :
SYNTHÈSE COHÉSINE
+RÉPLICATION DE L’ADN
Comment se nomme les deux formes d’ADN compacté/décompacté ?
Compacté=euchromatine
décompacté=hétérochromatine
Vrai ou faux: la forme compacté inhibe la transcription des gènes
Vrai
Qu’est ce que l’hétérochromatine constitutive ? donne un exemple et précise quel groupe est englobé
Hetérochromatine possédant des gènes n’ayant pas besoin d’être transcrit.
Chromosome Y contient de grandes régions d’hétérochromatine constitutive (souvent entourant le centromère + télomère)
pour une espèce
Même question pour l’hétérochromatine facultative
RÉGIONS VARIABLES SUIVANT LE TYPE CELLULAIRE (POUR UNE ESPÈCE DONNÉE)
Le chromosome X chez la femme, un des deux X est sous forme d’hétérochromatine facultative
Quel est la longueur des fibres d’ADN compacté chez les EUCARYOTES
30 nm
Qu’est ce que désigne le NUCLÉOSOME ?
Association d’ADN autour d’un Octamère (8) d’histones
Vrai ou Faux : la formation du nucléosome est la 3ème étape du processus de compaction jusqu’à la phase mitotique ?
FAUX c’est la première grosse conne
Une fois compacté quelles actions NE PEUVENT PLUS avoir lieu sur l’ADN ?
réplication, réparation,recombinaison, transcription
Quelle est l’utilisation positive des mécanismes inhibition de transcription ?
Les cellules eucaryotes régulent l’expression des gènes
Comment se fait la régulation de l’expression génétique ?
-> Alteration locale des nucléosomes.
Lorsque les nucléosomes sont modifiés, certaines régions de l’ADN deviennent plus accessibles. Cela permet aux enzymes et autres facteurs impliqués dans la transcription (la machinerie transcriptionnelle) de se lier à ces régions et de démarrer la transcription des gènes situés dans ces zones
Quels ont été les résultats de l’expérience de Hewish et Burgoyne ?
1) la chromatine est organisée en unités répétitives appelées nucléosomes
2) Un nucléosome est composé ~146 paires de bases d’ADN enroulées autour d’un octamère d’histones (deux copies chacune des histones H2A, H2B, H3 et H4)
3) Les nucléosomes sont reliés entre eux par des segments d’ADN appelés ADN linker, qui peuvent varier en longueur mais ~ 50 paires de bases
Quel est le degré de compaction du nucléosome comparé au plus gros degré de compactage de l’ADN ?
2.5
10000
Quelle est la taille d’un chromosome d’ADN nu et du collier de perle dépliés ?
5 cm
~ 1,5 À 2 cm
Quelles sont les 4 paires d’histones constituant l’octamère du nucléosome ?
H2A, H2B, H3 et H4
Quelle est la fonction de la protéine H1 ?
1 MOLÉCULE D’HISTONE H1 EST LIÉE À L’ADN DE LIAISON = 1 HISTONE DE LIAISON PAR NUCLÉOSOME
Décris moi le collier de perles
1 perle= octamère d’histone enroulé par 147 pb d’ADN + H1
un fil d’ADN de liaison de 20 à 70 pb aussi lié à H1
VRAI ou FAUX :LA LONGUEUR DE L’ENROULEMENT DE 147 PB D’ADN AUTOUR DES NUCLÉOSOMES EST VARIABLE CHEZ TOUS LES EUCARYOTES.
Faux elle est invariable
Vrai ou faux: DES DIFFÉRENCES DE LONGUEUR DE L’ADN DE LIAISON (LINÉAIRE) S’OBSERVENT ENTRE LES DIFFÉRENTS ORGANISMES
VRAI
DES DIFFÉRENCES DE LONGUEUR DE L’ADN DE LIAISON (LINÉAIRE) QUI S’OBSERVENT ENTRE LES DIFFÉRENTS ORGANISMES REFLèTENT:
1)DES DIFFÉRENCES DE CONFORMATION DE
LA CHROMATINE PAR L’ARRANGEMENT
DES NUCLÉOSOMES
2)DES DIFFÉRENCES DES NUCLÉOSOMES EUX-MÊMES
1
Pour les Histones, comment appelle-t-on la région très conservée qu’ils possèdent ?
LE DOMAINE DE REPLIEMENT
SI tu dois me décrire au mieux le structures des histones, comment tu le ferais ?
Une queue N-terminale de 11 à 37 aa
un domaine de repliement
une queue C-terminale
Décris pour les domaines de repliement des histones:
leur composition + leur fonction
3 hélices Alpha séparé de boucles courtes
responsable de l’assemblage des octamères
Vrai ou faux: les histones sont très conservés chez les eucaryotes ?
Vrai
Car ils ont un rôle universel et précis
Dis moi les 3 étapes de l’assemblage des histones
1) Initiation par formation d’un tétramère [H3-H4] x2
2) Liaison de ce tétramère à l’ADN double brin
3) Recrutement de deux dimère H2A-HB
Que se passe t-il pour le nucléosome si il n’y a pas d’ADN ?
LA structure en octamère ne se forme pas seul les dimères [H2A-H2B] et les tétramères [H3-H4] seforment
Pourquoi un fort pourcentage des Acides aminés sont chargés + ?
Parce que l’ADN est chargé -
Vrai ou Faux : 20% des a.a de chaque histones sont des arginines et des lysines
Vrai
Pourquoi 20% des a.a de chaque histones sont des arginines et des lysines ?
GROUPES AMINE (Lys) ET GUANIDINIUM (Arg)
IONISÉS EN MILIEU CELLULAIRE sont NH3+ et NH2+
->PARTICIPENT À DES INTERACTIONS IONIQUES
AVEC L’ADN CHARGÉ NÉGATIVEMENT DE L’ESPACEUR
ET DE LA SUPERHÉLICE AUTOUR DES OCTAMÈRES
Vrai ou faux : Tous les histones se lient à des régions au hasard de l’ADN enroulé ?
FAUX: LES HISTONES SE LIENT À DES RÉGIONS DISTINCTES DE L’ADN ENROULÉ
Où se lient les tétramères H3-H4 ?
(1) AUX EXTRÊMITÉS (13 pb)
(2) AU MILIEU (60 pb) DE L’ADN.
= 86 pb / 147
Où se lient les dimères H2A-H2B ?
LES DEUX DIMÈRES H2A - H2B S’ASSOCIENT CHACUN AVEC 30 pb DE CHAQUE CÔTÉ DE LA RÉGION CENTRALE DE 60 pb LIÉE AVEC H3 - H4
Est ce qu’on peut estimer que la configuration des dimères H2A et H2B permet à l’ADN de se lier avec eux ?
NOPE
Combien de paires de liaisons H sont impliquées dans l’association des octamères d’histones ? Combien d’entre elles se font avec le sillon mineur ?
~ 40 LIAISONS HYDROGÈNES
~14
A quel moment et entre quels groupes exacts se font les liaisons H ?
À CHAQUE FOIS QU’IL FAIT FACE À L’OCTAMÈRE D’HISTONES.
( = 147 pb / 10,5 = 14 ! )
CES 14 LIAISONS HYDROGÈNES SE FONT PRÉCISÉMENT ENTRE LES HISTONES ET LES OXYGÈNES (O-) DES LIAISONS PHOSPHODIESTER DU SQUELETTE EXTERNE SUCRE - PHOSPHATE
Combien de LIAISONS HYDROGÈNES RELIENT LES BASES AZOTÉES AUX CHAINES LATÉRALES DES ACIDES AMINÉS DES HISTONES,TOUJOURS DU CÔTÉ DU SILLON MINEUR ?
SEULEMENT 7
Pourquoi ces liaisons se font sur le sillon mineur ?
1) SILLON MINEUR =LIAISONS NON SPÉCIFIQUES ENTRE L’OCTAMÈRE D’HISTONES ET L’ADN
2) LE SILLON MAJEUR RESTE EN GRANDE PARTIE ACCESSIBLE
POUR LA RÉGULATION DE L’EXPRESSION GÉNÉTIQUE
3)LA NATURE DE L’INFORMATION GÉNÉTIQUE
D’UNE SÉQUENCE D’ADN N’INFLUENCE PAS
(OU PEU) SON AFFINITÉ AVEC LES HISTONES
Qu’est ce que confère les 40 liaisons H aux histones ?
LES 40 LIAISONS HYDROGÈNES CONFÈRENT AUX HISTONES UNE GRANDE FORCE DE TORSION
Que provoquent les a.a basique des histones EN MASQUANT LES CHARGES NÉGATIVES DES PHOSPHATES dans les molécules d’ADN ?
FACILITENT L’ENROULEMENT DE L’ADN SUR PLUS D’UN TOUR
Comment LES QUEUES N-TERMINALES DES HISTONES STABILISENT L’ENROULEMENT DE L’ADN AUTOUR DE L’OCTAMÈRE ?
EN FORMANT LE SILLON D’UNE VIS
Où sortent les queues N-terminales de l’octamère d’histones ?
H2B ET H3 : SORTENT AU MILIEU, ENTRE LES DEUX HÉLICES SUPERPOSÉES.
H2A ET H4 : SORTENT AU DESSUS ET EN DESSOUS DES DEUX HÉLICES
On sait que L’ENROULEMENT À GAUCHE (+ 1,2) DE L’ADN AUTOUR DES OCTAMÈRES D’HISTONES INDUIT DES SUPER-TOURS (S) NÉGATIFS, que se passe-t-il quand les histones sont retirés ?
L’ADN UTILISE L’ÉNERGIE DES SUPER-TOURS POUR
FACILITER LA SÉPARATION DES BRINS DE LA DOUBLE HÉLICE (= CONVERTIS EN TORSIONS NÉGATIVES)
