Chapitre 2 Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’une cellule ?

A

Un d’ensemble de molécules et macromolécules associes les unes aux autres dans un réseaux complexe et formant des interactions

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Q

De quoi dépend la cellule ?

A

D’un flux continuel d’énergie et de l’émission de chaleur

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3
Q

À quelles lois de thermodynamiques la cellule obéit-elle ?

A

Lors d’une transformation, l’énergie est toujours conservée
Pendant une transformation, l’énergie entropique (désordre) d’un système isolé ne peut que croître ou rester constante

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4
Q

Qu’est-ce que l’entropie ?

A

Le degré de désordre d’une molécule
Plus le temps passe, plus il est probable que l’entropie d’un système augmente (de plus en plus en désordre)

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5
Q

A-t-on besoin d’énergie pour combattre l’entropie ?

A

OUI, énergie nécessaire

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6
Q

Qui contrôle le sac de réactions chimiques d’une cellule ?

A

Les enzymes

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7
Q

Que doivent faire les cellules pour rester en vie ?

A

Se créer de l’ordre dans cet univers si désordonné
En effectuant un flux constant de réaction chimiques (métabolisme)
Demande bcp d’énergie

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8
Q

Quelle est la première règle de la thermodynamique?

A

L’énergie dégagée par le catabolisme (dégradation) est conservée, soit dans les molécules nouvellement synthétisées ou dans la chaleur créée par la cellule

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9
Q

Quelle est la deuxième loi de la thermodynamique ?

A

L’énergie dissipée par la cellule sous forme de chaleur augmente l’entropie totale du système, malgré l’ordre établi dans la cellule

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10
Q

Caractéristiques d’une réaction spontanée ?

A

Dans le sens des produits
Libère de l’énergie libre et possède un Delta G négatif (réaction exergonique, catabolisme, libère de chaleur)

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11
Q

Qu’est-ce qu’une réaction non-spontanée ?

A

Demande de l’énergie pour se faire dans le sens des produits
Se fait dans le sens des réactifs
Possède delta G positif (rx exergonqieu anabolisme)

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12
Q

Par quoi se produit une réaction non-spontanée?

A

Par couplage énergétique: rx non-spontanée utilise l’énergie générée par la réaction spontanée

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13
Q

De quoi dépend l’énergie libre d’une réaction (🔺G) ?

A

Énergie intrinsèque des molécule
Concentration des produits et réactifs à un moment précis de la rx

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14
Q

Que va-t-il se produire lorsque les produits s’accumuleront et le réactifs diminueront ?

A

Produits ayant énergie d’activation vont égaler les réactifs ayant l’énergie d’activation et la réaction inverse s’amorcera

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15
Q

Qu’est-ce qu’une macromolécule ?

A

Assemblage de monomère ou de sous unités plus simples solide dont la surface interagissent entre elles ou avec d’autres molécules en formant liaisons chimiques

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16
Q

Qu’est-ce qu’une liaison hydrogène et de quoi a-t-elle besoin pour se produire V

A

Liaison faible entre 2 molécules polaires (permet à l’eau d’être un solvant universel)
À besoin d’un hydrogène en ligne droite entre 2 atomes électronégatif (ex: oxygène et azote)

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17
Q

Les liaison hydrogène de l’eau lui procure :

A

Cohésion
Solvant pratiquement universel (sphère)

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18
Q

Pourquoi certaine molécules ne sont-elles pas polaires ?

A

Car ont déjà la stabilité/équilibre électronique donc pas besoin d’aller le chercher dans d’autres interactions ailleurs pour l’atteindre

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19
Q

Que sont les interactions hydrophobes ?

A

Des interaction Van Der Waals avec une composante d’exclusion d’eau

20
Q

De quoi sont responsables les groupements hydrophobes ?

A

Du repliement des protéines
Sont séquestré à l’intérieur de la molécule par la delta G négative due à l’exclusion de l’eau ???

21
Q

Avec quoi se forment les chaînes carbonées ?

A

Liaisons covalentes non polaires

22
Q

Les atomes de carbones peuvent s’associer entre eux et finissent par former …

A

Des chaînes parfois longues, ramifiées, rectilignes ou cycliques
Ce sont les squelettes des macromolécules biologiques

23
Q

De quoi dépendent les diverses propriétés d’une molécule organique ?

A

De la disposition des C et des autres atomes qui s’y lient

24
Q

Que sont les groupements fonctionnels ?

A

Les groupements de molécules qui participent le plus aux réactions chimiques des molécules organiques

25
Q

Quel est l’avantage des liens covalents polaires plutôt que non polaires ?

A

Solubilité dans l’eau
Capacité à former pont H
Plus de réactivité chimique

26
Q

Par quoi est déterminé la forme d’une macromolécules (structure 3D) ?

A

Par la séquence. Les différents monomères sont liés les uns aux autres par liens covalents

27
Q

Par quoi est stabilisée la structure 3D d’une macromolécule ?

A

Par liens covalents et non covalents

28
Q

Par quel type de lien les molécules d’une cellule interagissent ils ensemble généralement ?

A

Liens non covalents
Plus 2 molécules s’assemblent bien, plus elles vont former des liens non covalents
Sont des liens de faible énergie mais peuvent être nombreuse

29
Q

De quoi dépend la survie d’une cellule ?

A

Nombreuses interactions entre les molécules qui la composent

30
Q

Comment est-ce qu’une réaction entre un anticorps et un antigène peut être forte ?

A

L’anticorps doit avoir une forme rapprochée de l’antigène pour que la réaction soit plus forte

31
Q

Par quoi commence et par quoi se termine une protéine ?

A

Commence par groupement amine (N-terminal) et finit par un groupement carboxyle (C-terminal)

32
Q

En quoi se replient les structures primaires ?

A

En structures secondaires, qui seront le module de construction des structures tertiaires

33
Q

Qu’est-ce qui facilite la formation spontanée des structures secondaires dans l’eau ?

A

Les liens hydrogènes qui se créent facilement entre les aa

34
Q

Vers où est situés les chaînes R des hélices alpha et des feuillets bêta ?

A

Hélice: vers l’extérieur
Feuillet: vers le haut et le bas

35
Q

Qu’est-ce que la structure tertiaire d’une protéine ?

A

Agencement d’hélices et ou de feuillets
Possède des domaines fonctionnels (régions ayant des activités enzymatique et ou des site de liaisons pour d’autres molécules)

36
Q

Qu’est-ce qui détermine la fonction d’une protéine ?

A

La séquence qui détermine la forme (repliement) qui détermine la fonction

37
Q

Qu’est-ce qu’une structure quaternaire ?

A

Assemblement de plusieurs chaînes peptidiques pour former une protéine fonctionnelle

38
Q

Où se conserve l’énergie dégagée par le catabolisme dans une cellule ?

A

Dans la chaleur créée par cellule
Dans molécules nouvellement synthétisée

39
Q

Où se conserve l’énergie dégagée par le catabolisme dans une cellule ?

A

Dans la chaleur créée par cellule
Dans molécules nouvellement synthétisée

40
Q

Plus le delta G est négatif, plus…

A

Plus il faut de produit pour atteindre l’équilibre car delta G négatif veut dire que É des produits est bcp plus basse que celle des réactifs
Donc faut plus de produit pour que ca s’équilibre

41
Q

Principe du gel d’agarophorèse ?

A

Séparation des fragments de l’ADN en utilisant la charge négative des acides nucléiques et le faire migrer sur le gel

42
Q

Principe du gel de polyacrylamide ?

A

Séparé les protéines selon leur taille (poids moléculaire) en les dénaturalisant et en les chargeant négativement donc migrent

43
Q

Principe de purification de protein ?

A

Extraire et séparer une protéine d’un échantillon cellulaire par chromatographie sur colonne
Consiste à faire traverser protéine thru matrice solide poreuse. Chaque type de protéine traversera à sa vitesse selon ses interactions

44
Q

De quoi dépend le passage d’une protéine à travers une colonne (purification) ?

A

Charge
Taille
Capacité à se fixer à d’autres molécules
Hydrophobicité

45
Q

Comment se forment les structures secondaires dans l’eau ?

A

Spontanément grâce aux liens H qui se créent facilement entre les aa