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MCB-2000 Isolement et culture des microorganismes > Chapitre 1 - Exigences de la croissance bactérienne > Flashcards

Chapitre 1 - Exigences de la croissance bactérienne Flashcards

1
Q

Plus de _____% du poids sec d’une cellule microbienne provient des éléments majeurs.

A

98%

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2
Q

Quels sont les 6 premiers éléments majeurs et de quoi sont-ils les constituants?

A

CHONPS, constituants des lipides, protéines et acides nucléiques

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3
Q

Quels sont les 3 derniers éléments majeurs existant dans la cellule à l’état de cations?

A

K, Ca et Mg

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4
Q

Quel est l’élément le plus important et quelle poids sec de la cellule représente-il?

A

Carbone, 50%

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5
Q

Si un milieu de culture contient les éléments suivants, est-ce qu’une croissance serait possible?

  • Glucose
  • K2HPO4
  • KH2PO4
  • (NH4)2SO4
  • Eau ultra pure
A

La croissance ne serait pas possible parce qu’il y a absence de minéraux. Ces minéraux ne sont pas retrouvés dans l’eau pure.

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6
Q

Dans un milieu de culture, les macronutriments principaux doivent être ajoutés à l’ordre du ___/___.

A

g/L

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7
Q

Les macronutriments minéraux doivent être ajoutés au milieu de culture à l’ordre du ___/___.

A

mg à g/L

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8
Q

Les micronutriments (oligoéléments) sont ajoutés à l’ordre du ___/___ dans un milieu de culture.

A

mg/L

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9
Q

Les éléments traces et autres ions doivent être ajoutés au milieu de culture à l’ordre du ___/___.

A

ng/L

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10
Q

Dans un milieu de culture, les acides aminés doivent être ajoutés à l’ordre de ___/___.

A

50mg/L

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11
Q

Les purines et pyrimidines doivent être ajoutés au milieu de culture à l’ordre de ___/___.

A

10mg/L

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12
Q

Les vitamines doivent être ajoutés au milieu de culture à l’ordre de ___/___

A

1mg/L

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13
Q

Quels sont les micronutriments (oligoéléments) minéraux?

A

Mn, Zn, Co, Mo, Ni, Cu et Fe

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14
Q

S’il n’y a pas de source de carbone ajouté au milieu de culture, comment est-ce possible d’y avoir croissance?

A

Les organismes utilisent le CO2 de l’air.

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15
Q

Vrai ou faux: certaines bactéries ont besoin d’oxygène gazeux pour leur respiration, mais TOUTES les bactéries ont besoin d’oxygène lié (molécules organiques du CO2).

A

Vrai, il en est de même pour l’hydrogène.

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16
Q

L’azote est nécessaire à la synthèse des acides aminés, de purines et pyrimidines, de certains glucides et lipides, de coenzymes (FAD/FADH2) et d’autres substances mais est-ce un composé essentiel?

A

Absolument. L’azote peut également agir comme agent limitant dans un milieu.

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17
Q

Vrai ou faux: l’utilisation de l’azote gazeux de l’air (N2) est un procédé exclusivement microbien.

A

Vrai, ce sont les bactéries fixatrices d’azote et elles sont cruciales au maintien de la vie sur Terre.

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18
Q

Le _______ est constituant de la cystéine, de la méthionine, de la glutathionne, de la biotine, de la thiamine et de plusieurs coenzymes.

A

Soufre

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19
Q

Qu’est ce que la réduction assimilatrice des sulfates?

A

Ces la réduction préalable des sulfates en sulfure effectuée afin d’assimiler le S des sulfates dans la matière organique vivante.

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20
Q

Vrai ou faux: certains microorganismes peuvent assimiler le soufre élémentaire et d’autres exigent une forme réduite (ex. la cystéine).

A

Vrai

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21
Q

Il y a du _______ dans les acides nucléiques, les phospholipides, les nucléotides, quelques cofacteurs, protéines et d’autres composantes cellulaires.

A

Phosphore

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22
Q

Vrai ou faux: très peu de microorganismes utilisent le phosphate inorganique (PO4^2-) comme source de phosphore et l’incorpore directement.

A

Faux, presque tous les microorganismes.

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23
Q

Quelle bactérie forme un long pédoncule servant de tige à crampon, dont la longueur est modulée en fonction de la concentration de phosphate disponible?

A

Caulobacter

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24
Q

Quels sont les macronutriments minéraux?

A

Na, K, Ca, Cl et Mg

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25
Q

Les macronutriments minéraux sont impliqués dans la biosynthèse de plusieurs molécules, jouent un rôle d’_____ ou de _____ de plusieurs enzymes, participent à la régulation de la _____ _____, à la régulation du _____, aux phénomènes associés aux _____ _____ et la la stabilisation et le fonctionnement de plusieurs _____.

A

activateurs, cofacteurs, pression osmotique, pH, gradients transmembranaires, protéines.

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26
Q

Vrai ou faux: il est facile de détecter et de quantifier les micronutriments minéraux?

A

Faux, ils sont indispensables mais ils sont aussi ubiquitaires et il est très difficile d’enlever complètement ces éléments.

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27
Q

Bien qu’il représente une proportion significative du poids sec d’une cellule, cet élément est nécessaire en trais faible concentration.

A

Fe2+, le fer libre est toxique et induit des dommages à l’ADN, aux protéines et aux lipides.

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28
Q

Pourquoi est-ce que la croissance est possible en milieu où des micronutriments minéraux n’ont pas été ajoutés?

A

Ils sont présents en quantités suffisantes à l’état d’impuretés dans l’eau, dans les produits dit “pures” ou adhérents aux parois des récipients - ils sont des contaminants trace.

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29
Q

Vrai ou faux: à trop forte concentration, les micronutriments minéraux sont toxiques.

A

Vrai.

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30
Q

Comment nomme-t-on des substances organiques indispensable à la croissance bactérienne mais que certaines bactéries sont incapables de synthétiser?

A

Des facteurs de croissance

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31
Q

Les microorganismes qui possèdent les enzymes et les voies métaboliques nécessaires à la synthèse de tous les composants cellulaires à partir d’éléments minéraux sont appelés: _______.

A

Prototrophes

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32
Q

Les _____ sont des microorganismes dépourvus d’une ou de plusieurs enzymes essentielles et ne peuvent pas fabriquer tous les constituants indispensables.

A

Auxotrophes, ils doivent les obtenir de leur environnement

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33
Q

Il y a _____ classes principales de facteurs de croissance: _____, _____ et _____.

A

3: les acides aminés, les purines et pyrimidines et les vitamines

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34
Q

Quels sont les deux types trophiques en lien avec l’utilisation des sources de carbone?

A

Les hétérotrophes et les autotrophes

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35
Q

Les hétérotrophes utilisent des _____ comme source de carbone.

A

Molécules organiques préformées

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36
Q

Vrai ou faux: les autotrophes utilisent le CO2 comme unique source de carbone?

A

Vrai

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37
Q

Une source chimique d’énergie peut être une molécule _____ ou _____.

A

organique ou inorganique

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38
Q

Si la bactérie utilise une molécule organique comme source d’énergie, elle est dite _____.

A

Chimioorganotrophe

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39
Q

Vrai ou faux: une bactérie utilisant une molécule inorganique comme source d’énergie est appelée chimioorganotrophe.

A

Faux, c’est une bactérie chimiolithotrophe

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40
Q

Quelle est l’exception à l’utilisation d’une source d’énergie chimique?

A

La phototrophie

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41
Q

Les microorganismes phototrophes utilisent la _____ comme source d’énergie.

A

Lumière

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42
Q

Vrai ou faux: dans le cas des phototrophes, la source d’énergie et la source d’électrons est pareille.

A

Faux, l’énergie de peut pas procurer d’électrons directement donc dans ce cas la source de lumière (énergie) et la source d’électrons (eau ou autre composé) sont différentes.

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43
Q

Quels sont les 4 principaux types trophiques?

A

Autotrophes chimiolithotrophes
Hétérotrophes chimioorganotrophes
Autotrophes photolithotrophes
Hétérotrophes photoorganotrophes

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44
Q

Quels sont les facteurs physico-chimiques contrôlés par les constituants du milieu de culture?

A

pH, activité en eau, oxygène et pression osmotique

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45
Q

Quels sont les facteurs physico-chimiques contrôlés par l’environnement externe?

A

Température, oxygène, lumière et pression hydrostatique

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46
Q

Vrai ou faux: le potentiel d’oxydoréduction est contrôlé à la fois par le milieu et l’environnement.

A

Vrai

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47
Q

Les facteurs physico-chimiques peuvent influencer le _____, le _____, le _____ et la _____ des bactéries.

A

Taux de croissance, rendement cellulaire, métabolisme et composition chimique

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48
Q

Le contrôle de quels trois facteurs est critique pour TOUTES les cultures bactériennes?

A

Le pH, la température et l’apport en oxygène.

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49
Q

Le contrôle du potentiel d’oxydoréduction est d’une importance majeure dans la culture de quelles bactéries?

A

Les bactéries anaérobies strictes.

50
Q

Les acidophiles ont leur optimum de croissance entre pH _____.

A

1 et 5,5

51
Q

Un pH entre 5,5 et 8,5 est optimal pour les _____.

A

Neutrophiles

52
Q

Les alcalophiles ont leur optimum de croissance entre pH _____.

A

8,5 et 11,5

53
Q

Vrai ou faux: la grande variabilité des pH dans les habitats fait en sorte que les microorganismes ont des pH interne variés.

A

Faux, le pH interne de la majorité des microorganismes est proche de la neutralité.

54
Q

Pour quelle raison la température d’incubation affecte dramatiquement le taux de croissance des bactéries?

A

Parce qu’elle a un effet direct sur la vitesse de toutes les réactions cellulaires.

55
Q

Une bactérie qui se développe bien à 0°C et a une température optimale de croissance de 20°C ou moins est dite _____.

A

Psychrophile

56
Q

Les _____ se développent à des températures optimales situées entre 20 et 45°C. Leur température minimale se situe entre _____ °C et leur température maximale est inférieure ou égale à _____ °C.

A

Mésophiles, 15 et 20, 45

57
Q

Comment nomme-t-on des bactéries qui peuvent se développer à des températures de 55°C ou plus? Quelles sont leur températures minimum et optimum.

A

Thermophiles ou thermophiles extrêmes, minimum 45°C, optimum 55 à 121°C

58
Q

La température permissive _____ n’est habituellement supérieure que de _____ degrés à la température optimale.

A

Maximale, quelques

59
Q

La température permissive _____ est habituellement inférieure à la température optimale par _____ degrés.

A

Minimale, 20 à 30

60
Q

Vrai ou faux: la croissance d’un microorganisme s’étend généralement sur un intervalle de 25 à 30°C pour un organisme donné.

A

Vrai

61
Q

Un organisme dont sa température varie avec celle du milieu extérieur est appelé _____.

A

Poikilothermes

62
Q

Vrai ou faux: la température d’une cellule reflète directement celle de son environnement.

A

Vrai

63
Q

À chaque augmentation de ___°C, la vitesse de réaction catalysée par une enzyme doublera.

A

10

64
Q

Des températures suffisamment seront létales puisqu’elles endommagent les microorganismes en dénaturant les _____, les _____ et d’autres _____.

A

Enzymes, systèmes de transport, protéines

65
Q

Pourquoi est-ce que les thermophiles peuvent résister à des températures très élevées?

A

Ils possèdent des enzymes beaucoup plus stables, des systèmes de synthèse protéiques capables de fonctionner à haute température et des lipides membranaires plus saturés ayant des points de fusion beaucoup plus élevés.

66
Q

Selon leur relation avec l’oxygène, les bactéries sont divisés en _____ grands groupes, lesquels?

A 
5
Aérobie strict
Anaérobie strict
Anaérobie facultatif
Microaérophile
Anaérobie aérotolérant
67
Q

Un organisme _____ nécessite la présence d’oxygène atmosphérique et l’utilise comme accepteur final d’électrons.

A

Aérobie strict

68
Q

Je suis incapable de me multiplier en présence d’oxygène, qui suis-je?

A

Anaérobie strict

69
Q

Un organisme qui utilise l’oxygène dans son processus métabolique lorsqu’il est présent mais possède également une voie métabolique alternative qui permet sa croissance en absence d’oxygène est appelé _____.

A

Anaérobie facultatif

70
Q

Quelles sont les deux voies alternatives possibles chez les anaérobie facultatifs?

A

La fermentation ou la respiration anaérobie

71
Q

Vrai ou faux: dans la respiration anaérobie, l’oxygène gazeux est remplacé par un ion organique comme accepteur final d’électrons.

A

Faux, ion inorganique (NO3-, SO4^2-, CO2)

72
Q

Est-ce que la croissance est plus rapide en respiration anaérobie ou en fermentation et pourquoi?

A

En respiration anaérobie, le rendement ATP est supérieur lors de la respiration.

73
Q

En respiration aérobie la différence de potentiel _____ entre le donneur comme le NADH et l’accepteur est plus _____ que la différence entre le NADH et _____, donc le rendement en ATP est _____ à la respiration anaérobie.

A

REDOX, petite, l’oxygène, supérieur

74
Q

Si une bactérie est incapable de croitre au niveau atmosphérique normal d’oxygène mais requière tout de même l’oxygène entre 2 et 10% pour sa croissance elle est dite _____.

A

Microaérophile

75
Q

Vrai ou faux: les bactéries anaérobies aérotolérants sont des bactéries anaérobies qui tolèrent la présence d’oxygène et ont également deux voies métaboliques alternatives.

A

Faux, elles sont fermentaires obligatoires

76
Q

Vrai ou faux: l’oxygène est relativement insoluble dans l’eau (<10mg/L)

A

Vrai

77
Q

Quels sont les principaux facteurs à considérer pour fournir une concentration correcte d’oxygène dans les milieux de culture?

A
  1. Ouverture de la fiole suffisament grand et recouverte de matériel poreux pour permettre l’échange gazeux
  2. Rapport surface/volume maximal dans les cultures statiques - seule façon est d’utiliser de très faible épaisseur de milieu dans des fioles à large base
  3. Agitation: augmente grandement la surface de contact
  4. Bullage dans des solutions ayant un volume supérieur à 0,5L
78
Q

Quel est le meilleur système d’évaluation des conditions anaérobies?

A

Le potentiel d’oxydoréduction (Eh)

79
Q

Le potentiel d’oxydoréduction est une mesure de la tendance d’une solution à _____ ou à _____ des _____ et est exprimé en _____. Plus ce chiffre est _____ plus la concentration d’oxydants est élevée. Inversément, plus il est _____, plus grande est la concentration _____ _____.

A

prendre (être oxydé), donner (être réduite), électrons, millivolts, positif, négatif, d’agents réducteurs

80
Q

Vrai ou faux: les colorants redox peuvent être réversiblement oxydés et réduits en plus d’être incolores lorsqu’oxydés et colorés lorsque réduits.

A

Faux, ils sont colorés lorsqu’oxydés et incolores lorsque réduits

81
Q

Nommer 4 colorants redox.

A

Bleu de méthylène
Bleu de toluidine
Résorufine (résazurine)
Phénosafranine

82
Q

Pour passer d’un état complètement oxydé à un état complètement réduit, un indicateur, possédant une charge de deux électrons, couvre un écart de Eh de _____mV.

A

120

83
Q

Puisque les indicateurs redox peuvent être toxiques pour les bactéries, que devons nous faire afin de les utiliser?

A

On ne doit que les inclure dans des fioles contrôles manipulées exactement comme les cultures.

84
Q

Les agents réducteurs sont utilisés afin d’obtenir des conditions de Eh optimales mais ils doivent être utilisés dans des _____ _____ et on doit s’assurer de leur _____ avant de les incorporer au milieu de culture.

A

Concentrations faibles, non-toxicité

85
Q

Les agents réducteurs les plus utilisés en microbiologie sont les _____ _____. Qu’est-ce qu’ils ont en particulier qui nous permet de les reconnaître?

A

Composés soufrés, une odeur particulière (œufs pourris)

86
Q

Nommer 4 agents réducteurs.

A

Na-thioglycollate
Cystéine-HCl
Dithiothréitol
Na2S.9H20

87
Q

Quels sont les facteurs principaux à retenir pour la culture de bactéries anaérobies non-stringentes?

A
  1. Faible rapport surface/volume
  2. Regénérer par chauffage à 100°C pendant 10min avant d’utiliser le milieu (chasse l’oxygène)
  3. Bouchon VASPAR
  4. Ne pas entreposer au réfrigérateur (solubilité d’oxygène augmente quand température diminue)
  5. Large inoculum (bactéries au centre sont plus protégées, meilleure chance de survie)
88
Q

Quelles sont les techniques de transport des échantillons anaérobies strictes?

A
  1. Lorsque possible, recueillir avec seringue et injecter directement à travers un bouchon de caoutchouc (dans un milieu préparer selon technique de Hungate)
  2. Milieu de transport RTF à condition qu’il ait été fraichement régénéré (bactéries peuvent vivre pendant quelques heures)
89
Q

Quelles sont les techniques les plus utilisées afin de créer des conditions anaérobies?

A
  1. Technique de Hungate
  2. Dilution-agitation
  3. Chambre anaérobie
  4. Jarre anaérobie
  5. Méthode Oxyrase
90
Q

Un protocole utilisant des tubes à bouchon de caoutchouc contenant du milieu gélosé autoclavé dans un système spécial, gardé en forme liquide, dans lesquels on fait barboter du gaz anoxique et ensuite on roule horizontalement les tubes sous l’eau froide est appelé _____.

A

Technique de Hungate

91
Q

Vrai ou faux: la technique de Hungate a permis pour la première fois une anaérobiose maintenue tout au long des manipulations en utilisant un flux constant de gaz anoxique.

A

Vrai, c’est une méthode toujours utilisée à ce jour

92
Q

VASPAR est un mélange de quel deux mots?

A

Vaseline et parrafine

93
Q

Quelle caractéristique doit être connue des bactéries concernées avant d’employer la méthode de dilution-agitation?

A

Elles doivent tolérer des températures élevées puisqu’elles sont inoculées dans des géloses liquides.

94
Q

Nommer 1 avantage et 1 inconvénient de la dilution-agitation.

A

Avantage: permet une numération des microorganismes présents

Inconvénient: difficile de travailler en absence d’oxygène

95
Q

Quelle est le principe mutuel de la jarre et la chambre anaérobie?

A

L’oxyde de palladium (catalyseur) réagit avec l’oxygène en présence d’hydrogène pour produire de l’eau.

96
Q

Que devons nous ajouter la jarre et la chambre anaérobie pour absorber l’excès d’humidité?

A

Gel de silice

97
Q

Vrai ou faux: le catalyseur peut être inactivé par une exposition prolongée à l’humidité ou par le H2S

A

Vrai, celles-ci sont produites par de nombreuses bactéries anaérobies

98
Q

Nommer deux sortes de jarres anaérobies et leur caractéristiques.

A

GasPak - permettent ou non le processus d’évacuation-remplissage, l’atteinte des conditions peut demander de 60-120min
CampyPak - permet de générer des conditions de microaérophilie

99
Q

La méthode de choix pour le travail en absence complète d’oxygène est la chambre anaérobie parce qu’elle offre ces avantages:

A
  1. Permet l’utilisation de techniques microbiologiques standards
  2. Permet la préparation des milieux de façon standard
  3. Pas de formation particulière
  4. Peut entrer un microscope
100
Q

Quels sont 3 désavantages de la chambre anaérobie?

A
  1. $$$
  2. Occupe un espace important
  3. Gants de caoutchouc
101
Q

Qui suis-je: un système comprenant 2 composantes - un système enzymatique capable de trapper l’oxygène non toxique et une boite de pétri modifiée qui diminue l’espace entre le couvercle et la surface du milieu.

A

Méthode Oxyrase

102
Q

Quelle est la particularité du milieu de culture préparé selon la recette Oxyrase?

A

Un volume d’eau inférieur de 10% au volume exigé habituellement et remplacé par le réactif Oxyrase

103
Q

Vrai ou faux: le pétri Oxyrase maintien son efficacité même après 5 ouvertures du couvercle

A

Faux, 3 ouvertures du couvercle

104
Q

Comment s’appelle un organisme qui nécessite un niveau de CO2 supérieur à celui retrouvé dans l’atmosphère (0,04%)?

A

Capnophile

105
Q

Vrai ou faux: les bactéries phototrophes absorbent la lumière dans toutes les régions du spectre de la lumière visible (380 à 750) mais non dans le proche infrarouge (>780).

A

Faux, elles absorbent également dans le proche infrarouge

106
Q

Les lumières _____ sont utilisées dans la croissance des phototrophes anoxygéniques et les lumières _____ sont utilisées pour les phototrophes oxygéniques.

A

Incandescentes, fluorescentes

107
Q

Vrai ou faux: la lumière peut moduler la production de pigments chez certaines espèces et altérer certaines composantes photosensibles

A

Vrai, la pigmentation des bactéries sert comme protection contre les rayons lumineux nocifs

108
Q

La pression générée par une colonne d’eau au fond de cette même colonne est appelée ____.

A

Pression hydrostatique

109
Q

Vrai ou faux: une bactérie barophile obligatoire est appelée plézophile

A

Vrai

110
Q

Il a été démontré dans les grands fonds marins que certaines bactéries barophiles sont capables de se développer à des pressions _____ à la pression atmosphérique.

A

Supérieures

111
Q

La pression osmotique peut être définie comme:

A

La pression qu’il faut appliquer pour contrer le passage de molécules d’eau à travers une membrane semi-perméable d’une solutions moins concentrée vers une solution plus concentrée.

112
Q

Les cellules _____ peuvent tolérer des variations importantes de la pression osmotique consécutives en raison de leur _____ rigide. Il y a cependant une exception: _____.

A

Procaryotes, paroi, mycoplasmes

113
Q

Vrai ou faux: l’activité de l’eau (aw) est proportionnelle à la pression osmotique d’un composé.

A

Faux, inversément proportionnelle (ex. plus la pression osmotique est élevée, plus le aw est faible)

114
Q

La quantité d’eau disponible dans un milieu est défini comme _____.

A

L’activité de l’eau (aw)

115
Q

Les valeurs de aw varient entre ___ et ___.

A

0 et 1

116
Q

La majorité des bactéries préfèrent croitre à des valeurs aw supérieures à _____ et la plupart cessent de se développer à des valeurs aw inférieures à _____.

A

0,98, 0,90

117
Q

Vrai ou faux: les bactéries halophiles sont incapables de croitre dans un milieu sans sel.

A

Vrai, conséquemment à pression osmotique élevée

118
Q

L’osmophilie n’est pas synonyme de _____.

A

Halophilie

119
Q

Les bactéries _____ sont capables de se développer dans un milieu à faible valeur aw mais se développent mieux à des valeurs aw plus élevées.

A

Halotolérants

120
Q

La préférence de certaines moisissures à croître à de faibles valeurs de aw est appelée _____.

A

Xérophilie

MCB-2000 Isolement et culture des microorganismes (10 decks)

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