chap 9 le dernier Flashcards
a kel etape la transcription peut etre reguler
initiation elongation terminaison et maturation
chz les eucaryote de quel sorte sont les proteine regulatrice
ce sont des activateur et des represseur de la transcription
c koi le nucleosomepar koi sont complexifier les action des proteine regulatrice chz les eukaryote
LES NUCLÉOSOMES ET LES
MODIFICATEURS DE LA
CHROMATINE
PLUS DE RÉGULATEURS ET
DE PLUS GRANDES
SÉQUENCES RÉGULATRICES
VASTE INTÉGRATION DE
SIGNAUX
v ou f
un enhancer est une séquence d’ADN qui fixe des facteurs régulateurs de
transcription, ce qui a pour conséquence d’augmenter la transcription de gènes situés uniquementen amont.
f
en amont et en aval
v ou f
pour que le enhancer fonctionne il faut kil soit pres du gene a transcrire
f
il peut agir a une tres grande distance
c quoi un isolateur
: élément spécifique d’ADN contrôlant l’action des activateurs. il inhibe l’activation du gene induite par l’activateur
ou est situe l’isolateur sur l’adn
entre un enhancer et un promoteur
c koi les gene rapporteur et pourkoi il sont utiliser
Afin de pouvoir étudier les séquences régulatrices, on utilise les gènes
rapporteurs. Il s’agit de gènes qui codent des protéines dont la présence se
mesure facilement.
kel sont les caracteristique que doit avoir une gene rapporteur
Doit être étranger au génome de l’organisme modifié.
Doit permettre une visualisation précise de l’expression dans les tissus.
Le résultat doit être quantifiable afin de mesurer l’activité du promoteur.
de koi sont composer les activateur et represseur
composés d’un domaine liant
l’ADN et d’un domaine d’activation ou
d’inhibition.
kel est le role de gal4
active la transcription des enzymes
nécessaire au métabolisme du galactose chez la
levure.
ke se passe til si on exprime seulement le 1/3 Nterminal de gal 4
la protéine produite lie
normalement l’ADN mais n’active pas la
transcription.
v ou f
Le domaine de liaison à l’ADN de gal 4 permet
simplement de cibler la région activatrice
de la protéine sur le promoteur
v
c koi un homeodomaine
Est constitué de plusieurs hélices :
une reconnait la séquence d’ADN
dans le sillon majeur et les autres
servent au bon positionnement sur la
charpente.
v ou f
un homeodoamine forme souvent un heterodimaire
v
de koi est composer une proteine regulatrice
doignt de zinc
a koi sert l’atome de zinc chz la prot regulatrice
Utilise un atome de zinc pour stabiliser l’hélice alpha qui s’insère dans le
sillon majeur de l’ADN (zinc fait des liaisons avec les a.a. cystéine et histidine
et ainsi modifie la structure 3D de la protéine régulatrice).
v ou f
Une protéine
régulatrice peut contenir plusieurs doigts de zinc les unes à la suite des
autres, allongeant d’autant la
séquence d’ADN
reconnue.
v
de koi est forme l’agraf a leucine
2 longeu helice alpha
pourkoi le zinc est important pour plusieur proteine
il leur permet de stabiliser leur structure
kel est le role des helice alpha dans l’agraf a leucine
elle s’insere dans le sillion majeur voisin
comment se fait la dimerisation des leucine zipper
La dimérisation est induite par une autre
région au sein de ces mêmes hélices : dans
cette région, elles forment des courts tronçons
bispiralés, au sein desquels les deux hélices
restent associées par des interactions
hydrophobes entre des résidus leucine (ou
autres résidus hydrophobes) espacés de
façon approprié
les helice de leucine zipper peuvent uniquement former des heterodimere
f
elle peuvent fair des homodimere
kel est le pt commun entre l’helice boucle helice et la leucine zipper
elle possede des chaine alpha
de combien d’helice alpha l helice boucle helice est fomer et par koi elle sont liee
4 liee par une region relacher (la boucle
v ou f
l’association entre les 2 sousunités de l’helice boucle helice se fait par des régions
riches en leucines présentes sur
les deux hélices (celle qui lie
l’ADN et la 2e plus petite).
v
les 2 su de l’helice boucle helice non pas deja des motif dimerique et c dernier doivent etre former
f Ces deux motifs ont une unité structurale déjà dimérique. Ils combinent l
v ou f
les domaine activateur des proteine regulatrice sont bien structure
f il sont peu structure
v ou f
les domaine regulateur des prot regulatrice forme des structure adhesive mais cela ne leur permet pas d’interagir avec plusier autre prot
Ils sont relativement peu structurés. On pense qu’ils forment plutôt des
surfaces adhésives capables d’interagir avec plusieurs autres protéines
v ou f
les activateur agisse le plut souvent directement sur l’arn pol
Les activateurs agissent rarement directement sur l’ARN pol.
Ils peuvent recruter indirectement
la polymérase à travers le complexe
médiateur ou des facteurs
généraux de la transcription.
Ils peuvent recruter des facteurs
modificateurs des histones qui
altèrent la chromatine pour
permettre l’accès à des sites de
liaison spécifiques sur l’ADN.
kel sont les facon dont un represseur peut agir
Ils peuvent agir de plusieurs façons :
Interférer avec les activateurs
(compétition pour le site de liaison ou
blocage)
Interagir avec le complexe
d’initiation (à travers le complexe
médiateur) et inhiber la transcription
Compacter la chromatine et rendre
les gènes inaccessibles (recrutement
des protéines capables de modifier la
chromatine)
v ou f
L’ajout du CH3 provoque une répression de la transcription. La queue
méthylée recrute des protéines responsables de la formation
eucromatine
f
L’ajout du CH3 provoque une répression de la transcription. La queue
méthylée recrute des protéines responsables de la formation
d’hétérochromatine
ke se passe til si on ajout de l’acetyle ou du P
neutralise la charge (+) de l’histone et elle
R
interagit moins bien avec l’ADN → l’ADN peut être déroulé plus facilement
par ki sont recrutées le histone acetyle transferase
par des activateur
ke font les histone acetyle transferase
Les histone acétyl transférases sont recrutées par des
activateurs sur des régions précises de l’ADN. Une fois
la chromatine déroulée, le promoteur devient accessible
et la transcription peut débuter.
c koi un bromodomaine
Un bromodomaine est un motif de 4
hélices α capable de s’attacher sur les
histones acétylées
kel facteur de transcription a u bromodomaine et peu donc se lier sur un nucleosome acetylé
TFIID
par ki sont recruter les complexe remodelant de la chromatine
les facteurs de transcription
les queues N-terminales des histone
kel region de l’adn est souvant methyle
region heterochromatine
v ou f
Certains gènes sont maintenus
silencieux par méthylation de
l’ADN de leur région promotrice
v
par ki sont reconnu les sequence methyle et ke se passe til
Les séquences méthylées sont
reconnues par des protéines spécifiques.
Ces protéines recrutent des histones
désacétylases et des histones
méthylases qui modifient la chromatine
(formation de l’hétérochromatine) et
rendent la région impossible à transcrire.
c koi le controle combinatoire et donner un exemple
plusieurs gènes sous le contrôle d’un même facteur. En absence du glucose,
les opérons Lac et Gal sont activés par CAP.
c koi l’integration du signal+ exemple
deux conditions sont nécessaires pour obtenir la pleine expression des opérons
Lac (présence lactose et absence glucose) ou Gal (présence de galactose et
absence de glucose).
es que c possible qu’un groupes de gènes peut être sous le contrôle d’un même élément en
plus d’avoir une régulation spécifique pour chacun d’entre eux.
oui
donner un exemple de controle combinatoire via les locci
ex. Les gènes de la globine
Regroupés dans le génome.
Chaque gène n’est exprimé qu’à un
moment précis du développement. Tous
cependant sont sous le contrôle de la
région LCR (locus control region), qui
contient des éléments activateurs,
inhibiteurs et même isolateurs.
La liaison de toutes ces protéines à LCR
aide à dérouler localement la
chromatine pour accéder aux gènes
c koi un locus
Emplacement physique précis et invariable sur un chromosome
c koi un operon
Unité fonctionnelle de gènes qui opèrent sous le signal d’un même promoteur
v ou f
les eukarote possede des operon
f c seulement le pro
v ou f
des type cellulaire diff ne peuvent pas exprimer des gene en commun
f il peuvent
v ou f
Une cellule
spécifique peut donc être définie par l’expression
d’une centaine de gènes “signatures”.
v
v ou f
Les signaux hydrophiles sont interceptés par les
récepteurs nucleaire
f
c des recepteur membranaire
par koi sont interferait les signau hydrophone
recepteur nucleaire
donner des type de recepteur hydrophobe
hormone steroidien
donner des exemple de recepteur membranaire
récepteurs de TGFβ et
récepteurs tyrosine-kinase (RTK)
kel type de ligant le RTK lie
facteur de croissance ou autre pt mol
ke se passe til qd les recepteur RTK lie leur ligant
, ils se dimérisent et activent leurs domaines kinases via la
phosphorylation d’une tyrosine.
La phosphorylation des tyrosines supplémentaires permet la reconnaissance des
RTKs activés par des protéines intracellulaires → activation de la voie de signalisation
Ras-MAPK.
par koi est activer le recepteur rtk
EGF ou insuline
kel domaine de GRB2 lie le recepteur de la rtk activer
SH2
a koi se lie le domaine SH3 de la prot GRB2
prot sos
v ou f
Sos est une GEF (Guanine-nucleotide exchange factor) : elle catalyse
l’échange du GDP pour une GTP, ce qui active Ras.
v
kel est la consequence de l’activation de ras
activation de la voie MAPK
comment se fait l’activation de MAPK par RAS
L’activation de MAPK par Ras s’effectue
par une série de phosphorylations
successives, chacune activant une
kinase capable à son tour de
phosphoryler et activer la suivante dans la
chaîne.
ke se passe a la fin de la voie MAPK
Éventuellement, à la fin, la MAPK activée
se dimérise et passe dans le noyau et
active plusieurs facteurs de transcription.
v ou f
Ces tous les récepteurs
tyrosine-kinase qui déclenchent une
cascade MAPK
f
Ce n’est pas tous les récepteurs
tyrosine-kinase qui déclenchent une
cascade MAPK
c koi la voie natch delta
Influence de l’expression génique des
cellules voisines en produisant des
protéines de signalisation
extracellulaires.
ke devienne les prot de signalisation extracellulaire de la voie notch delta
Synthétisées dans une cellule et puis
elles sont, soit :
* Placées à la membrane plasmique
* sécrétées dans la matrice
extracellulaire.
Reconnues par un récepteur spécifique à
la surface de la cellule cible.
La liaison du signal au récepteur permet la
modification de l’expression des gènes de
réponse dans la cellule cible.
Implique des voies de signalisation
v ou f
Les molécules de signalisation qui restent à la surface de la cellule émettrice peuvent
contrôlent l’expression des gènes des cellules qui sont a distance
Les molécules de signalisation qui restent à la surface de la cellule émettrice
contrôlent uniquement l’expression des gènes des cellules physiquement en
contact direct : contact cellule-à-cellule.
ds le developpement neuroblaste kel cellule exprime delta et lakel exprime notch
les neuroblastes expriment
DELTA
les cellules épidermiques
NOTCH.
v ou f
NOTCH est un récepteur
homodimérique à un passage
transmembranaire.
f c un recepteur heterodimerique
ds kel cas on fait une regulation de la transcription
reponse a des modif envirnnemental
processus developpement de l’organisme
c koi la differentiation cellulaire
processus
permettant à la cellule de devenir hautement
spécialisée.
c kkoi la morphogenese
Processus de
développement des structures d’un
organisme au cours de son embryogenèse
(au niveau tissulaire ou des systèmes).
