biomol Flashcards
comment se lie une chaine de desoxyribonucleotide
liaison phosphodiester
comment se lie deux brins complementaire
liaison hydrogene
VRAI OU FAUX L’adn n’est pas toujour bicatenaire
Faux
VRAI OU FAUX
les 2 brins sont parallel l’un par rapport a l’autre
Faux, il sont antiparallele
que permet la forme de double helice
minimisé l’exposition des bases au milieu aqueu
qui contribuent a la stabilite des double helice
1- les force d’empilement
2- les liaison hydrogene
de quoi est compose le dNTP
sucre
phosphate
baze azoté
VRAI OU FAUX
LE dNTP est un polymere
Faux c un monomere qui constitue l’ADN qui est le polymere
quel est la particularité d’un desoxyribose
l’absence de l’oxygene sur le carbone 2 ‘
ou se trouve les liaoson hydrogene
entre 2 bazes azoté de 2 brin complementaire
ou se trouve les liaison phosphodiestere
entre un grpment phosphate d’un nucleotide et le carbone des deux sucre voisins C5’ et C3’
De quel type sont les liaison phosphodiester
liaison covalente
quel est la liaison la plus forte
liaison covalente
VRAI OU FAUX
la liaison covalente est le partage d’un seul electron entre deux atomes
FAUX
c le partage d’une ou plusieur PAIRES d’electron
difference entre liaison covalente polaire et non polaire
non polaire: partage les electron egalement
polaire: inegal, un est plus attire autour de l’un des deux atome cette atome a une charge partiellemnt negative
kesk une liaison ionique
perte ou gain d’ un electron (l’atome le plus electro - attire si fortement l’e- qu.il le capture
de combien de fois la liaison hydrogene est plus faible que la covalente
20 fois plus
Vrai ou faux
plus il ya de liaison hydrogene plus la molecule est stable
vrai
c quoi la liaison hydrogene
un atome H deja liee par une liaison covalente a un atome plus electronegatif il va etre donc attire par un autre atome electronegatif O ou N
que designe la fonction ester dans la liaison phosphodiester
liaison d’un atome lie stimultanement a un atome d’oxygene par une double liaison covalente et a un grpmenr alcoxyle du type O-R’
VRAI OU FAUX
la fonction ester c un grpment forme par un atome lie stimultanement a un atome d’oxygene par une
liaison simple covalente et a un grpment alcoxyle du type O-R’
FAUX
atome lie stimultanement a un atome d’oxygene par une DOUBLE liaison covalente et a un grpmenr alcoxyle du type O-R’
que necessite les liaison hydrogene qui relie les nucleotide
un grpment donneurs (avec un H) et accepteur
quel atome la liaisom osidique lie
une baze azoté au C1’ du sucre dans un meme nucleotide
combien de liaison H entre le T et A
2
combien de liaison H entre le C et G
3
VRAI OU FAUX
La liaison entre C ET G est plus faible que la liaison entre A et T
FAUX
c l’inverse
kel sont les purine
adenine et guanine
kel sont les pyrimidine
cytosine et thymidine
combien de cycle pour pyrimidine et purine
pyrimidine : 1
purine : 2
kel sont les deux regle de chargaff
1ère règle : Peu importe la source, la composition de l’ADN double brin comporte une
égalité entre les résidus adénine (A) et les résidus thymine (T), ainsi
qu’entre les résidus guanine (G) et les résidus cytosine (C).
%A = %T et %G = %C.
2erègle : Le rapport de purines sur pyrimidines est toujours approximativement égal à
1, dans chacun des brins
DS UN SEUL BRIN
V ou F
le rapport des pyrimidine sur les purine doit etre egal a 1
Faux
le raport des purine sur les pyrimidine
entre kel phosphate l’hydrolyse est faite
entre beta et alpha
V ou F
l’hydrolyse des grpment phosphate consomme de l’energie
F
elle libère
ke se libere lors de la polymerisation d’un brin d’ADN
pyrophashate
pourkoi l’ADN est charge negativement en solution a PH de la cellule
car il ya une charge negative sur le grpment phosphate qui donne la charge globqal
comment le P devient negatif
il donne des proton pour devenir negatif
kel sont les autre fonction des nucleotide(autre que ADN)
- source d’energie(liaison grpmnent phosphate facilement hudrolisable) ATP GTP
- coenzyme
3.molecule de signalisation
AMP cyqulic
kel est la condition pour que les lien H se forme
l’orientation des nucleotide doivent etre antiparallele
que veut dire polarité inversé
chaine antiparallele
ou se trouve les baze azoté dans la mol d’ADN
a l’interieur
comment on peut avoir acce au bases azoté
- en ouvrant l’ADNEn ouvrant l’ADN (dénaturation) : réplication,
transcription
Il faut ouvrir la molécule en détachant les liens H entre
les bases.
Sans ouvrir l’ADN : régulation de la compaction de
l’ADN, réparation…
ds kel direction l’helice d’ADN tourne
vers la droite
ou est formé les sillion majeur et mineur
suite a l’angle entre les 2 liens glycosidique d’un couple de nucleotide
a kel angle o les baze azote et le sucre sont liee
a 120 ou 240 pour permettre la formation des sillion
combien de pb ds un tour
10 pb
entre 2 nucleotide d’une meme chaine combien de degree il ya
36degre
kel sillion fourni plus d’info
sillion majeur
kel paire le sillion mineur peut distinguer
A:T (AHA) C:G (ADA)
kel paire de base l’enzyme peut distinguer ds le d’ilion majeur
A:T (ADAM), T:A
(MADA), C:G (HDAA) et G:C (AADH).
kel sont les differente forme de double helice
ADN-A/B/Z
V ou F
la forme A de l’ADN a une helice qui tourne a droite
V
kel forme d’ADN est la plus compact
ADN-A
kel forme d’ADN est la plus allonge
Z
V ou F
plus le brin est compacte plus c facil de le liee
f
V ou F
ds un meme brin d’ADN on peut avoir les 3 formes
A/Z et B
V
kel caracteristique physique permet a l’ADN detre la base de l’info genetique et de pouvoir etre transmi de gene en gene cellulaire
complementarite des brins
chaine anti
helicoidale
kes k’un denaturation
Dénaturation : perte de la structure quaternaire, tertiaire ou secondaire
présente dans la forme « native » de la molécule.
ds kel situation les ion hydrogene seront brisé
en haussant la T ou en modifiant le Ph vers une solution plus alcaline
Selon quoi la température de dénaturation varie
no elle varie selon
la qt des nucleotide
longueur des amorce
type des paire de base
V ou F
la T de renaturation doit etre proche de celle de denaturation
V
pourquoi on utilise l’hybridation in situ (a linterieur du tissu
detecté la presence dune sequence ou dun gene specifique ds un echantillion
comment est utilisé l’imunohistochimie
peut etre utilisé en cytogenetique pour visualise des gene sur les chrs condense ou ds un genome
V ou F
l’immunohistovchimie est une technique indirecte pour visualisé l’ADN
F
direct
V ou F
la methode de FISH ressemble a l’immunoistochimie
v
kel sont les etape d’hybridation de l’adn
1.extraction
2.digestion par les enzyme
3.migration sur gel
4.transfere sur membrane
5. lavage
kel etape ds l’hybridation de l’ARN est presente ds l’hybridation de l’Adn et pourquoi
la digestion car l’AN est pt
il existe uniquement de l adn nuclaire (eucaryote)
f il ya adn mito et chloro
V ou F
la taille du genome grandi avec le nbr de gene
F c pas liee au nbr de gene mais c une corelation positive
kel est le % des gene codant ds un genome
1.5%
V ou F
les bacterie porte plusieur chrms
F
il on un chrs circulaire
c koi les plasmide
pt mol d adn circulaire independante du chrs
V ou F
le plasmide des bac est dependant du chrs et peut etre transmi d un individu a un autre
F il est INDEPANDANT
Toute les bac porte un seul plasmide
F
il ya des bac avec un plusieur ou pas de plasmide
V ou F
les plasmide porte des gene important pour la croissance
F mais il on un caractere avantageux comme la resistance a un antibio
kes ke la ploidie
le nbr de copie de chrs ds une cellule donne
kel est la ploidie des gamete
haploide
kel est la ploidie de la majorite des organisme
diploide
Une cellule ne peu pas etre polyploide
F
il s agit d une amplification complete du gemome
pourquoi ds l agriculture on selectionne des espece vege polyploide
- permet de surmonte le prob de sterilite des hybride
- ou cree des espece sans graine
la replication de l adn mito et chloro est depandante de la cellule
F
elle est independante
kel forme a le genome mito et chloro
circulaire
il existe une copie du genome par mito et chloro
f plusieur copies
a koi ressemble le genome des mito et chloro
ay genome bacterien
comment sont organisé les genes procaryote
en operon transcrit polycistronique
que veut dire transcription polycistronique
1 ARN qui code pour plusieur prot
c koi la densité genique
le nbr de gene par megabase d’ADN
comment est organisé les gene eucaryote
monocistronique (arn qui code pour 1 prot) avec des nuage discontinus
kel sont les sequence non codante
a l’interieur des gene (intron)
ADN intergenique ( sequence unique et repetée)
v ou f
chez les eucaryote la majorité du genome est codante
f
elle est non codante
v ou f
chez les procaryote la majorité du genome est codante
v
le reste constitue les sequence non codante regulatrice
pourkoi il ya une correlation negative ds le genome eukaryote
car plus l’organisme est complexe moin il ya de gene par Mb
c koi les introns
c la portion non codante d’adn situee ds un gene et transcrit puis elimunée par epissage pendant la maturation des ARN
a koi servent les intron
a augmenter la taille du genome
comment sont eliminé les intron
par epissage
siter les sequence unique
sequence regulatrice
arn regulateur (long ARN et pt ARN)
les origine de replicarion
pseudogene
kel est le role de l’arn regulateur
role ds
la transcription
traduction
formation heterochromatine
kel sont les sequence repetée
transposon
telomere
centromere
microsatelite
c koi un transmosons
sequence d’adn capable de se deplacer de manier autonome ds le genome ( elle se replique et se deplace par un autre endroit)
kel est la portion de proteine codant ds le genome humain
1.5%
kel sont les 2 gene present ds le plasmide des bac
gene codant pour prot sur le brin positif et le brin negatif
v ou f
ds un plasmide il ya principalement des sequences repeté codanre pour les prot
f
secance unique
c koi un nucleoide
c le package de l’adn/arn/proteine chz les procaryote
il est situer ds le cytoplasme
v ou f
le nucleoide est dynamique
v
c koi les deux format de condensation
chromosome mitotique
chromatine
kel forma de chromosome est le plus condensé
le chromosome mitotique
v ou f
l’etat de condensation de l,adn est la meme peut importe la phase du cycle cellulaire
f
sa depent
v ou f
les proteine represente la moitier de la masse moleculaire d’un chrs
v
v ou f
c pendant la mitose que la transcription a lieu
f
il nya pas de transcription
kel est le role des chrs mitotique
transmission efficase des gene au celluel fille
structure stable
taille compacte
protection de l’info
c koi la chromatine
ensemble d’adn et de prot
kel sont des prot ds une chromatine
les histones
kel sont les proteine non histone ds la chromatine
prot de transcription
replication
reparation
recombinaison de l’adn
qd le chrs est sous sa forme chromatine c facile de lui acceder
faut
l’accessibilite est qd meme condense
v ou f
il est pas possible de module la structure de la chromatine
f on peut
kel sont les deux forme de chromatine
heterochromatine
euchromatine
v ou f
l’eucromatine est plus condensé que l,heterochromatine
f
c l’inverse
kel proteine controle le passage de l’euchromatine a l’heterochrmatine (vice versa
les histone
de koi est formé un nucleosome
8 histones
kel sont les type d’histone qui forme le nucleosome a l’interieur
H2A
H2B
H3
H4
kel histone forme l’exterieur du nucleosome
H1
v ou f
l’afiinité des histone pour l’adn est tres grande et specifique a la sequence de base
f
elle est non specifique a la seance
kel est la charge des histone et pourquoi
positive car elle contienne un haut pourcentage d’aa lysine et arginine
au niveau de kel partie de l’adn il ya interaction entre les histone est l’adn
au niveau du sillion mineur
pourquoi les histone se lie au sillion mineur et pas majeur
car les phosphagte du squellette sont plus raproche
L’adn va etre plus facil a deformé
pour laissé les sillion majeur pour les autre prot
sur kel region des sillion majeur les histone vont se liee
region riche en A et T
kel est la composition exacte du noyau de l’histone
2 dimere H2A-H2B et un tetramere H3-H4
v ou f
les dimere et les tetramere sont toujours assemble et attendent l’arrivé d’adn
faut
il s’assemble uniquement en presence d’adn
v ou f
les queu n terminal sont toute les meme chez les differente histone
f
elle sont differente
les queu n terminal des histone se retouve vers l,interieur du nucleosome
f
a l’ixterieur
kel est l,ordre de l,assosiation des histone pour formé le nucleosome
le tetramere H3 et H4 se lie en premier il induit le courbure ds l’adn et l,enroule
les deux dimere H2A et H2B se joignent au complexe ensuite et le stabilise
combie de lien hydrogene sont forme lors de la liaison adn nucleosome
40
combien de pt de contacte aDN-histone a l,interieur du nucleosome
13
1 pour chaque fois que le sillion mineur fait face au noyau
v ou f
les queu n terminal maintienne l’adn enroule
v
kel sont les modif post traductionnel des histone
phosphorilation
acethylation
methylation
comment emerge les queu des histone ( de kel coté)
H2B et H3 emerge entre les 2 brin d’adn ou 2 sillion mineur sont en face
H4 et H2A emere en haur et en bas de deux helice
kel histone emerge des brion d’adn
H2B H2A H3 H4
v ou f
les nucleosome ne sont pas fixéé a leur emplacement
v
kel sont les prot non histone qui se lie a ladn
prot Inhibition de positionnement
et prot assemblage preferentiel
c koi Inhibition de positionnement
prot qui competitionne avec l,histone
inhibe la formation de nucleosome sur l,adn
c koi l’ assemblage preferentiel
interaction entre histone et non histone
stabilise les nucleosome et ou permet l,assemblage d’un nouveau nucleosome
v ou f
il faut obligatoirement des region AT pour ke le nucleosome puisse se liee
f
c pas obligatoire mais c mieu
de koi est contitué l’euchromatine
fibre etendue de 10nm
kel est le role de L’histone 1
interagie avec adn intercalaire entre les nucleosome et avec une partie de l’adn autour du nucleosome
cela a pour effet de resserer les nucleosome entre eux et d’enrouler 20 pb de plus
kel sont les 2 forme des heterochromatine et c koi la diff
solenoide (il ya un espace a l’interieur0
zigzag
comment est composé le modele solenoide
ineteraction entre le nucleosome et son voison contrairement au zigzag interaction entre un nucleosome et le 3mee
kel sont les prot de l’echafaudage nucleaire
les topoisomerase II
les proteine SMC
ke font les topoisomerase II
maintien de la structure et s’assure que les boucle demeur separé l,une de l’autre( coupe les noeud)
kel prot font le remodelage de la chromatine
le complexe remodelant de la chromatine
le complexe de modification post traductionnel es queu d’histone
v ou f
les complexe de remodelage de la chromatine sont atp independant
f
il utilise l’atp
commeent est recruté le Cmplexe remodelant
par les facteur de transcription
queu N terminal des histones
ke font les complexe remodelant
il peuvent faire glissé l’adn
kel sont famille font le transfert et l,ejection des nucleosome
SW1/SNF
kel enzyme modifie la portion N terminal des histones
acetyltransferase (ajout acetyle) ( ajout methyl)
methyltransferase
kinase (phosphate )
qu’induit l’ajout ch3
une repression de la transcription
qu’induit l’ajout d’acetyle ou de P
neutralise la charge de l’histone
elle interagi moin bien avec l’adn
V ou f
Il y’a une corrélation positive entre le nombre de gène codant et la complexité du genome
F
C une corrélation négative
