Chap 2, 13

Question 1

Quel est la meilleure approche pour obtenir une prots avec une nouvelle fonction

Answer 1

Mutation individuelle pas efficace, le domain shuffling est la meilleure technique

• addition ou élimination d’un domaine –> effet important sur la fonction
• combinaison différente de plusieurs domaines–> effet important sur la fonction
• besoin de lier 2 ligands? (utilisation de 2 domaines, un pour chaque ligands)
• prots multifonctionnelles

Question 2

Quels sont les mécanismes possibles pour réguler une rx?

Answer 2

Controle de la quantité d’enzyme disponible ( par synthèse, dégradation ou transport)

• Modification réversible de l’enzyme
  1. Régulation allostérique
  2. Modification covalente (phosphorylation = modif covalente la + utilisée)

Question 3

Qu’est ce que la régulation allostérique

Answer 3

L’allostérie est un mode de régulation de l’activité d’une enzyme par lequel la fixation d’une molécule effectrice en un site modifie les conditions de fixation d’une autre molécule, en un autre site distant, de la protéine
La plupart enzymes allostériques ont plus d’un domaine (plusieurs sont des oligomères)
-approche la plus simple pour contrôle allostérique
1. Site actif à l’interface de 2 domaines
2. Molécule effectrice (effecteur) se lie à un autre endroit, mais également à l’interface des 2 domaines

Question 4

Lequel est plus simple, un changement conformationnel à l’interface de 2 domaines ou un changement conformationnel à l’intérieur d’un domaine?

Answer 4

Changement conformationnel à l’interface de 2 domaines

Question 5

Les prots les plus faciles à replier sont les petites ou les grosses ? et pq?

Answer 5

Petite

• Grosses souvent besoin prots chaperones pour se replier
• petites replient rapidement sans assistance
• compléxité repliement = n^3 où n = nb de résidus