Caractérisation Flashcards

1
Q

Différence entre Taxonomie et taxinomie ?

A

Aucun ca veux dire la même chose.
(préfère taxonomie ?)

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2
Q

C’Est quoi la taxonomie ?

A

Établissement/arrangement et loi des groupes naturels d’organisme présentant des caractères commun

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3
Q

c’est quoi des groupes taxonomiques ?

A

Taxon ou taxa

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4
Q

Plus on monte dans la hiérarchie et ….

A

moins il y a des points en commun

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5
Q

Est-ce qu’un organisme peut faire partie de plusieurs taxons ?

A

Non. hiérarchie non chevauchante

-> un organisme fait partie d’un seul taxon à un niveau donnée

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6
Q

ordre des hiérarchie des taxons commencant par l’espece

A

Espece
Genre
Famille
Ordre
Classe
Phylum
Domaine

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7
Q

Je veux nommer la dysenteria. c’est quoi sa hiérarchie taxonomique ?

A
  1. dysenteriae
  2. Shigella
  3. Enterobacteriaceae
  4. Enterobacteriales
  5. y-proteobactéria
  6. Proteobactéria
  7. Bactéria
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8
Q

c’est quoi le suffixe dans la famille et l’ordre ?

A

famille: Aceae
ordre: ales

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9
Q

quel taxon est de base et le plus stable

A

espèce

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10
Q

Hiérarchie d’un chat depuis le domaine?

A

Eucaryote (domaine)
Animalia (regne)
Vertebrata (embranchement)
Chordata (sous-embranchement)
Mammalia (classe)
Carnivora (ordre)
Felideae (famille)
Felis (genre)
Catus (espèce)

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11
Q

Dans la taxonomie, c’est quoi à sert l’identification, la nomenclature et la classification?

A

Identification: description + caractérisation

Nomenclature: nom

Classification: systèmatique = arrangement et relations inter-groupes

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12
Q

c’est quoi une culture pure ?

A

culture (population) de m-o ayant tous les même caractéristiques

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13
Q

c’est quoi une souches (isolats)?

A

Tous les descendant (sous culture) d’une culture pure.

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14
Q

C’est quoi un espece ?

A

groupe de souches dont les caractéristique sont PRESQUE identique DE BASE.

-> groupe homogene différent des autres groupes.

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15
Q

c’est quoi une souche-type ?

A

Souche ayant toute les caractéristiques représentative de l’expèce (1er et référence)

=témoin comparatif

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16
Q

C’est quoi les centres de référence ?

A
  1. ATCC (American type and culture collection)
  2. NTCC (National type and culture collection.
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17
Q

C’Est quoi les types de caractères qui sont utiliser pour l’identification?

A
  1. Morphologie
  2. Composition biochimique
  3. Composition physiologique
  4. Métabolique
  5. Génétique
  6. interaction avec l’hôte
  7. Écologie
  8. Moléculaire
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18
Q

Quoi on regarde dans la morphologie. ?

A

Forme
Taille
Arrangement
Structure cellulaire
endospore
Réaction au colorant (Gram)

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19
Q

Quoi on regarde dans la composition biochimique ?

A

membrane cytoplasmique (type de lipide, alcool)
Paroi cellulaire
-> polysacchardie? prot ?

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20
Q

Qu’est-ce que les paroi cellulaire nous dévoilent sur l’identificarion?

A

Peptidoglycane: bactérie
Pseudomureine: archaebactérie
Cellulose: mycete ou algue

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21
Q

quoi on regarde dans la physiologie ?

A

exigence nutritionnelle
milieu de culture
source de carbone
facteur de croissance
Conditions d’incubation
Température
O2
Lumiere

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22
Q

Quoi on regarde dans l’identification métabolique ?

A

Produit finaux de fermentation.
(identification et quantité)

Enzyme extracellulaire
(protéase, exotoxine, hemolysine)

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23
Q

Quoi on regarde dans l’identificaiton génétique ?

A

-> Composition en G+C% (3 lien H)
-> Spectrophotomètre UV (température à combien pour sépare l’ADN en 2)

->température de fusion (Tm)

-> nombre de chromosome chez eucaryote

-> plasmide, nb, taille, gene plasmidique

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24
Q

plus que G+C% est grand et plus que

A

La température de fusion est grande

25
Q

C’est quoi G+C% des plante/animaux vs m-o ?

A

animaux/plante G+C%: 30-50%
m-o G+C%: 25-80%

26
Q

La valeur G+C% intragenre est…

A

très similaire

27
Q

La valeur G+C% typique de l’espace est exclusive ou pas

A

non.

28
Q

dans l’identification, on regarde quoi dans l’interaction avec l’hôte

A

Pathogénicité
Capacité à provoquer des maladies chez différent hote
- spécificité de lhote
- symbiose..

29
Q

Dans l’identification, on regarde quoi dans l’écologique ?

A

habitat
niche écologique, role cycle de la matière

30
Q

On regarde quoi au niveau moléculaire ?

A
  1. comparaison de séquence
    quel gène conservé, prot conservé, séquence signature, homologie des séquence
  2. Hybridation ADN-ADN
31
Q

Organisme apparenté ont quoi au niveau moléculaire ?

A

homologie des séquences

32
Q

Comment fonctionne l’hybridation ADN-ADN ?

A
  • on prend 2 ADN de 2 espèces.
  • On marque un seul espèce
  • on chauffe
  • les deux brin des différentes espèce s’associent ensemble et on voit ou il y a un no match
33
Q

Pour qu’une espèce est apparentée, elle doit avoir plus que combien en % d’hybridation ADN-ADN ?

A

80%

34
Q

c’est quoi la clé d’identification ?

A

compilation des caractère et comparaison avec espèce connu

35
Q

C’est quoi le Bergeys Manual of Determinative Bacteriology?

A

manuel identification pour m-o eucaryote. /

36
Q

C’est quoi les site internet pour comparer les séquences ?

A

NCBI
Genbank
EMBL

37
Q

Comment on sait si on a trouvé une nouvelle espece ?

A

nombre élevé de caractéristique différent des autres espèce connu.

38
Q

À qui le nom doit être approuvé

A

Comité international de systèmatique des procaryotes/m-o eucaryote

39
Q

Carl von Linné il a fait quoi?

A

Nomenclature linnéenne de tous les organisme

40
Q

comment fonctionne la nomenclature ?

A

elle est binomiale en italique ou souligné les deux

-> genre = 1er lettre majuscule en latin ou grec = descriptif

ex. Bacillus
Lactococcus
Pyrococcus

Ou historique des découvreur (pu maintenant)
Pasteurella
Neisseria

-> Espèce (minuscule en latin ou grec)
descriptif encore une fois)

41
Q

comment on fait la classification ?

A

arrangement en groupe et relation intergroupe selon les caractères commun et lien évolutif

42
Q

C’est quoi les type de classification?

A
  1. Naturelle (biologique des organisme ex. anatomie)
  2. phénétique (similarité des caractère phénotypique) morphologie… métabolique génétique.. )
  3. classification numérique
  4. Phylogénétique
43
Q

c’Est quoi la classification numérique ?

A

comparaison de plusieurs organismes 2 par 2
-> caractère minimum : 50+

44
Q

c’Est quoi le coefficien d’appariement ?

A

pourcentge de similarité %S

45
Q

c’Est quoi le % de similarité

A

nb caractere similaire/nb caractère totaux x 100

46
Q

c’est quoi un dendrogramme

A

classification numérique 2 par 2 pour représenter le % de similarité

47
Q

c’est quoi les limites de la classification numérique ?

A

+/- pertinence biologique…

ex. présence de capsule vs similarité fonctionnelle de l’ADN polymérase

48
Q

c’est quoi la classification phylogénétique ?

A

relation évolutive probable
- ancètre commun
- comparaison d’espece distance
- comparaison de séquence conservé (chronomètre moléculaire)

= mesure les effets neutres ou positif qui sont les mutations conservée

évalue les gènes ARN ribosomal et vérifie les région variable qui n’altère pas es fonction = évalue nb différence entre temp depuis la divergence de l’ancetre commun

49
Q

c’est quoi la classification par noeud et branche ?

A

Évenement de divergence et la longueur des branche et le nombre de changement moléculaire

50
Q

c’Est quoi les classifications contemporaines ?

A

Polyphasique: infor phénétique et phylogénétique.
-> plus compelxe.
ex. % identité des séquences génomique

pasm parfait pcq nous et singe = 99%

51
Q

Linnaeus a fait quoi et en quelle année pour la classification?

A

1753
-> selon anatomie, fié 2 règnes.
Animaux et plantes

52
Q

Haeckel a fait quoi et en quelle année pour la classification?

A

1865
3 règnes (animaux, plante et protiste)

protiste comprend: bactérie, levure, protozoaire et algue)

53
Q

Whiitaker fait quoi et en quelle année sur la classification?

A

Basé sur nutrition et organisation ellulaire

Eucaryote et procaryote
unicellulaire/pluricellulaire
photosynthèse absorption solube et ingestion de solide

dit quil y a 5 règne.
- animaux
-plantes
-champignon
-protiste
-bactérie

54
Q

Whittaker il dit quoi sur l’évolution?

A

Évolution d’origine unidirectionnelle

Bactérie
-> protiste
-> plante, champi et animaux

55
Q

Woese il dit quoi et quand sur la classification des m-o

A

1977

Pionier travaux archée

basé sur l’approche phylogénétique des ARNr

3 domaines

  • eucaryote
  • bactérie (procaryote)
  • archée (procaryote)
56
Q

Woese il dit quoi sur la l’évolutiont ?

A

voie évolutive convergente
= ancètre commun = LUCA
last universal commun ancestor

confirmation par étude biochimique

57
Q

c’Est quoi la théorie de l’endosymbiose ?

A

mitochondrie et chloroplaste = autoreplicative, chromosome circulaire, genere ARNr apparenté eubactérie

58
Q

Les mitochondire viendrait de quel ancètre

A

Rickettsia (bactérie)

59
Q

Les chloroplaste viendrait de quel ancètre

A

Prochloron (cyanobactérie)