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Caractérisation Flashcards

1
Q

Différence entre Taxonomie et taxinomie ?

A

Aucun ca veux dire la même chose.
(préfère taxonomie ?)

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Q

C’Est quoi la taxonomie ?

A

Établissement/arrangement et loi des groupes naturels d’organisme présentant des caractères commun

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3
Q

c’est quoi des groupes taxonomiques ?

A

Taxon ou taxa

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4
Q

Plus on monte dans la hiérarchie et ….

A

moins il y a des points en commun

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5
Q

Est-ce qu’un organisme peut faire partie de plusieurs taxons ?

A

Non. hiérarchie non chevauchante

-> un organisme fait partie d’un seul taxon à un niveau donnée

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6
Q

ordre des hiérarchie des taxons commencant par l’espece

A

Espece
Genre
Famille
Ordre
Classe
Phylum
Domaine

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7
Q

Je veux nommer la dysenteria. c’est quoi sa hiérarchie taxonomique ?

A
  1. dysenteriae
  2. Shigella
  3. Enterobacteriaceae
  4. Enterobacteriales
  5. y-proteobactéria
  6. Proteobactéria
  7. Bactéria
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8
Q

c’est quoi le suffixe dans la famille et l’ordre ?

A

famille: Aceae
ordre: ales

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9
Q

quel taxon est de base et le plus stable

A

espèce

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10
Q

Hiérarchie d’un chat depuis le domaine?

A

Eucaryote (domaine)
Animalia (regne)
Vertebrata (embranchement)
Chordata (sous-embranchement)
Mammalia (classe)
Carnivora (ordre)
Felideae (famille)
Felis (genre)
Catus (espèce)

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11
Q

Dans la taxonomie, c’est quoi à sert l’identification, la nomenclature et la classification?

A

Identification: description + caractérisation

Nomenclature: nom

Classification: systèmatique = arrangement et relations inter-groupes

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12
Q

c’est quoi une culture pure ?

A

culture (population) de m-o ayant tous les même caractéristiques

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13
Q

c’est quoi une souches (isolats)?

A

Tous les descendant (sous culture) d’une culture pure.

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14
Q

C’est quoi un espece ?

A

groupe de souches dont les caractéristique sont PRESQUE identique DE BASE.

-> groupe homogene différent des autres groupes.

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15
Q

c’est quoi une souche-type ?

A

Souche ayant toute les caractéristiques représentative de l’expèce (1er et référence)

=témoin comparatif

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16
Q

C’est quoi les centres de référence ?

A
  1. ATCC (American type and culture collection)
  2. NTCC (National type and culture collection.
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17
Q

C’Est quoi les types de caractères qui sont utiliser pour l’identification?

A
  1. Morphologie
  2. Composition biochimique
  3. Composition physiologique
  4. Métabolique
  5. Génétique
  6. interaction avec l’hôte
  7. Écologie
  8. Moléculaire
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18
Q

Quoi on regarde dans la morphologie. ?

A

Forme
Taille
Arrangement
Structure cellulaire
endospore
Réaction au colorant (Gram)

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19
Q

Quoi on regarde dans la composition biochimique ?

A

membrane cytoplasmique (type de lipide, alcool)
Paroi cellulaire
-> polysacchardie? prot ?

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20
Q

Qu’est-ce que les paroi cellulaire nous dévoilent sur l’identificarion?

A

Peptidoglycane: bactérie
Pseudomureine: archaebactérie
Cellulose: mycete ou algue

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21
Q

quoi on regarde dans la physiologie ?

A

exigence nutritionnelle
milieu de culture
source de carbone
facteur de croissance
Conditions d’incubation
Température
O2
Lumiere

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22
Q

Quoi on regarde dans l’identification métabolique ?

A

Produit finaux de fermentation.
(identification et quantité)

Enzyme extracellulaire
(protéase, exotoxine, hemolysine)

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23
Q

Quoi on regarde dans l’identificaiton génétique ?

A

-> Composition en G+C% (3 lien H)
-> Spectrophotomètre UV (température à combien pour sépare l’ADN en 2)

->température de fusion (Tm)

-> nombre de chromosome chez eucaryote

-> plasmide, nb, taille, gene plasmidique

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24
Q

plus que G+C% est grand et plus que

A

La température de fusion est grande

25
C'est quoi G+C% des plante/animaux vs m-o ?
animaux/plante G+C%: 30-50% m-o G+C%: 25-80%
26
La valeur G+C% intragenre est...
très similaire
27
La valeur G+C% typique de l'espace est exclusive ou pas
non.
28
dans l'identification, on regarde quoi dans l'interaction avec l'hôte
Pathogénicité Capacité à provoquer des maladies chez différent hote - spécificité de lhote - symbiose..
29
Dans l'identification, on regarde quoi dans l'écologique ?
habitat niche écologique, role cycle de la matière
30
On regarde quoi au niveau moléculaire ?
1. comparaison de séquence quel gène conservé, prot conservé, séquence signature, homologie des séquence 3. Hybridation ADN-ADN
31
Organisme apparenté ont quoi au niveau moléculaire ?
homologie des séquences
32
Comment fonctionne l'hybridation ADN-ADN ?
- on prend 2 ADN de 2 espèces. - On marque un seul espèce - on chauffe - les deux brin des différentes espèce s'associent ensemble et on voit ou il y a un no match
33
Pour qu'une espèce est apparentée, elle doit avoir plus que combien en % d'hybridation ADN-ADN ?
80%
34
c'est quoi la clé d'identification ?
compilation des caractère et comparaison avec espèce connu
35
C'est quoi le Bergeys Manual of Determinative Bacteriology?
manuel identification pour m-o eucaryote. /
36
C'est quoi les site internet pour comparer les séquences ?
NCBI Genbank EMBL
37
Comment on sait si on a trouvé une nouvelle espece ?
nombre élevé de caractéristique différent des autres espèce connu.
38
À qui le nom doit être approuvé
Comité international de systèmatique des procaryotes/m-o eucaryote
39
Carl von Linné il a fait quoi?
Nomenclature linnéenne de tous les organisme
40
comment fonctionne la nomenclature ?
elle est binomiale en italique ou souligné les deux -> genre = 1er lettre majuscule en latin ou grec = descriptif ex. Bacillus Lactococcus Pyrococcus Ou historique des découvreur (pu maintenant) Pasteurella Neisseria -> Espèce (minuscule en latin ou grec) descriptif encore une fois)
41
comment on fait la classification ?
arrangement en groupe et relation intergroupe selon les caractères commun et lien évolutif
42
C'est quoi les type de classification?
1. Naturelle (biologique des organisme ex. anatomie) 2. phénétique (similarité des caractère phénotypique) morphologie... métabolique génétique.. ) 3. classification numérique 4. Phylogénétique
43
c'Est quoi la classification numérique ?
comparaison de plusieurs organismes 2 par 2 -> caractère minimum : 50+
44
c'Est quoi le coefficien d'appariement ?
pourcentge de similarité %S
45
c'Est quoi le % de similarité
nb caractere similaire/nb caractère totaux x 100
46
c'est quoi un dendrogramme
classification numérique 2 par 2 pour représenter le % de similarité
47
c'est quoi les limites de la classification numérique ?
+/- pertinence biologique... ex. présence de capsule vs similarité fonctionnelle de l'ADN polymérase
48
c'est quoi la classification phylogénétique ?
relation évolutive probable - ancètre commun - comparaison d'espece distance - comparaison de séquence conservé (chronomètre moléculaire) = mesure les effets neutres ou positif qui sont les mutations conservée évalue les gènes ARN ribosomal et vérifie les région variable qui n'altère pas es fonction = évalue nb différence entre temp depuis la divergence de l'ancetre commun
49
c'est quoi la classification par noeud et branche ?
Évenement de divergence et la longueur des branche et le nombre de changement moléculaire
50
c'Est quoi les classifications contemporaines ?
Polyphasique: infor phénétique et phylogénétique. -> plus compelxe. ex. % identité des séquences génomique pasm parfait pcq nous et singe = 99%
51
Linnaeus a fait quoi et en quelle année pour la classification?
1753 -> selon anatomie, fié 2 règnes. Animaux et plantes
52
Haeckel a fait quoi et en quelle année pour la classification?
1865 3 règnes (animaux, plante et protiste) protiste comprend: bactérie, levure, protozoaire et algue)
53
Whiitaker fait quoi et en quelle année sur la classification?
Basé sur nutrition et organisation ellulaire Eucaryote et procaryote unicellulaire/pluricellulaire photosynthèse absorption solube et ingestion de solide dit quil y a 5 règne. - animaux -plantes -champignon -protiste -bactérie
54
Whittaker il dit quoi sur l'évolution?
Évolution d'origine unidirectionnelle Bactérie -> protiste -> plante, champi et animaux
55
Woese il dit quoi et quand sur la classification des m-o
1977 Pionier travaux archée basé sur l'approche phylogénétique des ARNr 3 domaines - eucaryote - bactérie (procaryote) - archée (procaryote)
56
Woese il dit quoi sur la l'évolutiont ?
voie évolutive convergente = ancètre commun = LUCA last universal commun ancestor confirmation par étude biochimique
57
c'Est quoi la théorie de l'endosymbiose ?
mitochondrie et chloroplaste = autoreplicative, chromosome circulaire, genere ARNr apparenté eubactérie
58
Les mitochondire viendrait de quel ancètre
Rickettsia (bactérie)
59
Les chloroplaste viendrait de quel ancètre
Prochloron (cyanobactérie)

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