BM14 1) Élongation de la traduction

Question 1

Quand se fait la transition initiation-élongation?

Answer 1

Dès que les 2 s.u. du ribosome sont assemblées autour de l’ARNt initiateur chargé au site P

Question 2

Quelles sont les conditions pour que la synthèse du polypeptide puisse commencer?

Answer 2

1-le bon aminoacyl-ARNt entre au site A (qu’il y ait complémentarité codon-anticodon à ce site)
2-la liaison peptidique doit être formée entre l’aminoacyl-ARNt entrant au site A et l’aminoacyl-ARNt initiateur au site P
3-Translocation du peptidyl-ARNt du site A vers le site P (pour permettre l’Ajout de l’aminoacyl-ARNt suivant au site A)

Question 3

Un aminoacyl-ARNt entrant peut-il se lier seul au site A du ribosome bactérien?

Answer 3

Non

Question 4

Qu’Est-ce que ça prend pour qu’un aminoacyl-ARNt entrant puisse se lier seul au site A du ribosome? (bactéries)

Answer 4

EF-Tu-GTP

->permet à l’aminoacyl-ARNt entrant d’être positionné au site A en le guidant

Question 5

Qu’arrive-t-il lorsque la complémentarité codon-anticodon est correcte? (bactéries)

Answer 5

EF-Tu-GTP interagit avec le centre de liaison EF situé dans la grande s.u. du ribosome

Question 6

Que provoque l’interaction EF-Tu-GTP avec le centre de liaison EF ? (bactéries)

Answer 6

l’hydrolyse de la GTP de EF-Tu-GTP.

EG-Tu-GFP +pi se détache de l’aminoacyl-ARNt

Question 7

Qu’arrive-t-il lorsque 2 nucléotides sur 3 sont appariés correctements?

Answer 7

la différence d’énergie avec 3/3 nucléotides corrects est insuffisante pour empêcher un mésappaiement

Question 8

combien de mécanismes de correction de la traduction y a-t-il?

Answer 8

3

Question 9

Quel mécanisme de correction se produit en premier?

Answer 9

2 adénines adjacentes de l’ARNr 16s localisées à la base du site A (dans la petite S.U.)

Question 10

Comment les 2 adénines adjacentes de l’ARNr 16s localisées à la base du site A (dans la petite S.U.) font la correction?

Answer 10

Les résidus des 2 adénines font des ponts hydrogènes avec le sillon mineur entre chaque paire de bases correctement appariées et détectent les mésappariements

Question 11

Que permet l’appariement correct codon/anticodon ?

Answer 11

permet à EF-Tu-GTP d’interagir avec le centre de liaison EF et provoque l’htdrolyse de la GTP de EF-Tu-GTP

Question 12

Qu’arrive-t-il si l’appariement codon/anticodon est incorrect?( 2e mécanisme de correction)

Answer 12

1 des 3 bases de l’anticodon est mésapparié.
Cela suffit à perturber le positionnement de EF-Tu-GTP qui ne pourra plus intéragir correctement avec le centre de liaison EF et donc empêche l’hydrolyse de sa GTP
EF-tu-GTP reste donc associé à son aminoacyl-ARNt et est relargué

Question 13

Que se passe-t-il lors de la relecture après le relargage de EF-Tu-GDP?

Answer 13

l’accomodation
-> rotation de l’ARNt pour présenter son extrémité 3’ terminale porteuse de l’A.A. au site catalytique de la liaison peptidyl-ARNt

Question 14

Que se passe-t-il lors de la relecture après le relargage de EF-Tu-GDP en cas de mésappariements? (3e mécanisme de correction)

Answer 14

l’aminoacyl-ARNt est relâché par l’action de la rotation car les liaisons ARNt-ARNm trop faibles

Question 15

De quoi est responsable l’ARN 23s de la grande S.U.?

Answer 15

Responsable de la catalyse de la liaison peptidique grâce à son activité Peptidyl-Transférase

Question 16

Que fait la protéine L27 de la grande s.u. dont les A.A. terminaux entrent dans le site catalytique?

Answer 16

améliore la cinétique de la réaction de 30 à 50% sans être indispensable

Question 17

Comment fonctionne l’ARN 23S?

Answer 17

• Il s’Apparie avec les extrémités CCA des 2 ARNts présents aux sites A et P respectivement
• Positionne le alpha-NH2 de l’aminoacyl-ARNt entrant (site A) pour favoriser sont attaque du COO-terminal du polypeptide qui est attaché à l’ARNt du site P

Question 18

De combien le ribosome augmente la vitesse de la réaction de peptidyl-transférase par rapprot à des aminoacyl-ARNts libres en solution?

Answer 18

10^7 fois plus

Question 19

Quelles sont les 2 étapes de la translocation?

Answer 19

1) transfert du nouveau peptidyl-ARNt du site A au site P

2) ARNm doit être déplacé de 3 nucléotides en même temps

Question 20

Comment se fait le transfert du nouveau peptidyl-ARNt du site A au site P?

Answer 20

L’état hybride des 2 ARNt fait que les extrémités 3’ des 2 ARNts sont décalées par rapport aux anticodons.
Conséquence:
libération d’une partie du site A qui devient site de liaison pour EF-g-GTO.
Celle liaison au site A lui permet d’interagir avec le centre de liaison EF, ce qui provoque l’hydrolyse de sa GTP
Ef-g-GFP change de conformation ce qui force la translocation du dernier ARNt (A vers P)

Question 21

Comment l’ARNm est déplacée de 3 nucléotides en même temps?

Answer 21

L’ARNm se décale passivement d’un codon car la liaison codon-anticodon est encore présente.
Conséquence:
l’ARNt précédent est déplacé au site E
Le changement de conformation du ribosome induit par la translocation des ARNt, favorise le relargage de EF-g-GDP

Question 22

Quel est le bilan énergétique d’un cycle de l’élongation de la traduction?

Answer 22

2 GTP et 1 ATP

Question 23

À quoi sert le 1 ATP utilisé dans l’élongation de la traduction?

Answer 23

Énergie de synthèse de la liaison peptidique

Question 24

À quoi servent le 2 GTP dans l’élongation de la traduction?

Answer 24

Positionnement de l’aminoacyl-ARNt au site A par EF-tu

Translocation de l’Aminoacyl-ARNt du site A vers P par EF-g (précision fidélité et ordre d’ajout des A.A.)