BM14 1) Élongation de la traduction Flashcards
Quand se fait la transition initiation-élongation?
Dès que les 2 s.u. du ribosome sont assemblées autour de l’ARNt initiateur chargé au site P
Quelles sont les conditions pour que la synthèse du polypeptide puisse commencer?
1-le bon aminoacyl-ARNt entre au site A (qu’il y ait complémentarité codon-anticodon à ce site)
2-la liaison peptidique doit être formée entre l’aminoacyl-ARNt entrant au site A et l’aminoacyl-ARNt initiateur au site P
3-Translocation du peptidyl-ARNt du site A vers le site P (pour permettre l’Ajout de l’aminoacyl-ARNt suivant au site A)
Un aminoacyl-ARNt entrant peut-il se lier seul au site A du ribosome bactérien?
Non
Qu’Est-ce que ça prend pour qu’un aminoacyl-ARNt entrant puisse se lier seul au site A du ribosome? (bactéries)
EF-Tu-GTP
->permet à l’aminoacyl-ARNt entrant d’être positionné au site A en le guidant
Qu’arrive-t-il lorsque la complémentarité codon-anticodon est correcte? (bactéries)
EF-Tu-GTP interagit avec le centre de liaison EF situé dans la grande s.u. du ribosome
Que provoque l’interaction EF-Tu-GTP avec le centre de liaison EF ? (bactéries)
l’hydrolyse de la GTP de EF-Tu-GTP.
EG-Tu-GFP +pi se détache de l’aminoacyl-ARNt
Qu’arrive-t-il lorsque 2 nucléotides sur 3 sont appariés correctements?
la différence d’énergie avec 3/3 nucléotides corrects est insuffisante pour empêcher un mésappaiement
combien de mécanismes de correction de la traduction y a-t-il?
3
Quel mécanisme de correction se produit en premier?
2 adénines adjacentes de l’ARNr 16s localisées à la base du site A (dans la petite S.U.)
Comment les 2 adénines adjacentes de l’ARNr 16s localisées à la base du site A (dans la petite S.U.) font la correction?
Les résidus des 2 adénines font des ponts hydrogènes avec le sillon mineur entre chaque paire de bases correctement appariées et détectent les mésappariements
Que permet l’appariement correct codon/anticodon ?
permet à EF-Tu-GTP d’interagir avec le centre de liaison EF et provoque l’htdrolyse de la GTP de EF-Tu-GTP
Qu’arrive-t-il si l’appariement codon/anticodon est incorrect?( 2e mécanisme de correction)
1 des 3 bases de l’anticodon est mésapparié.
Cela suffit à perturber le positionnement de EF-Tu-GTP qui ne pourra plus intéragir correctement avec le centre de liaison EF et donc empêche l’hydrolyse de sa GTP
EF-tu-GTP reste donc associé à son aminoacyl-ARNt et est relargué
Que se passe-t-il lors de la relecture après le relargage de EF-Tu-GDP?
l’accomodation
-> rotation de l’ARNt pour présenter son extrémité 3’ terminale porteuse de l’A.A. au site catalytique de la liaison peptidyl-ARNt
Que se passe-t-il lors de la relecture après le relargage de EF-Tu-GDP en cas de mésappariements? (3e mécanisme de correction)
l’aminoacyl-ARNt est relâché par l’action de la rotation car les liaisons ARNt-ARNm trop faibles
De quoi est responsable l’ARN 23s de la grande S.U.?
Responsable de la catalyse de la liaison peptidique grâce à son activité Peptidyl-Transférase
Que fait la protéine L27 de la grande s.u. dont les A.A. terminaux entrent dans le site catalytique?
améliore la cinétique de la réaction de 30 à 50% sans être indispensable
Comment fonctionne l’ARN 23S?
- Il s’Apparie avec les extrémités CCA des 2 ARNts présents aux sites A et P respectivement
- Positionne le alpha-NH2 de l’aminoacyl-ARNt entrant (site A) pour favoriser sont attaque du COO-terminal du polypeptide qui est attaché à l’ARNt du site P
De combien le ribosome augmente la vitesse de la réaction de peptidyl-transférase par rapprot à des aminoacyl-ARNts libres en solution?
10^7 fois plus
Quelles sont les 2 étapes de la translocation?
1) transfert du nouveau peptidyl-ARNt du site A au site P
2) ARNm doit être déplacé de 3 nucléotides en même temps
Comment se fait le transfert du nouveau peptidyl-ARNt du site A au site P?
L’état hybride des 2 ARNt fait que les extrémités 3’ des 2 ARNts sont décalées par rapport aux anticodons.
Conséquence:
libération d’une partie du site A qui devient site de liaison pour EF-g-GTO.
Celle liaison au site A lui permet d’interagir avec le centre de liaison EF, ce qui provoque l’hydrolyse de sa GTP
Ef-g-GFP change de conformation ce qui force la translocation du dernier ARNt (A vers P)
Comment l’ARNm est déplacée de 3 nucléotides en même temps?
L’ARNm se décale passivement d’un codon car la liaison codon-anticodon est encore présente.
Conséquence:
l’ARNt précédent est déplacé au site E
Le changement de conformation du ribosome induit par la translocation des ARNt, favorise le relargage de EF-g-GDP
Quel est le bilan énergétique d’un cycle de l’élongation de la traduction?
2 GTP et 1 ATP
À quoi sert le 1 ATP utilisé dans l’élongation de la traduction?
Énergie de synthèse de la liaison peptidique
À quoi servent le 2 GTP dans l’élongation de la traduction?
Positionnement de l’aminoacyl-ARNt au site A par EF-tu
Translocation de l’Aminoacyl-ARNt du site A vers P par EF-g (précision fidélité et ordre d’ajout des A.A.)
