BM13 5) Initiation de la traduction Flashcards

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1
Q

Qu’Est-ce que ça prend pour avoir un bon cadre de lecture?

A

Recrutement du ribosome sur l’ARNm
Un ARNt initiateur au site P
Site P au codon start (AUG)

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Q

Où sont recrutés les ARNm bactériens?

A

Sur la petite S.U. du ribosome

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3
Q

Les ARNm sont recrutés sur la petite s.u. du ribosome par complémentarité de bases avec quoi? (bactéries)

A

L’ARN 16s
et
La région du site de liaison au ribosome de l’ARNm (RBS)

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Q

Qu’Est-ce que le recrutement des ARNm sur la petite s.u. du ribosome par complémentarité de bases avec l’ARN 16s
et la région du site de liaison au ribosome de l’ARNm (RBS) permet? (bactéries)

A

Permet au 1er codon start d’être positionné au site de liaison P du ribosome lorsque la grande s.u. se joindra au complexe juste avant la création de la 1ère liaison peptidique

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5
Q

Faut-il une distance précise entre RBS et le codon start? (bactéries)

A

Oui, au nombre de base près.

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6
Q

Que cause un décalage d’une seule base? (bactéries)

A

change complètement la nature du polypeptide codé

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7
Q

Quel est la différence entre l’ARNt initiateur et les aminoacyl-ARNt suivants? (bactéries)

A

Il est chargé avec un résidu N-formyl-méthionine pour entrer directement au site P et non au site A pour qu’il puisse s’apparier au codon start

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8
Q

Quand le résidu N-formyl-méthionine où même l’a.a. initiateur est il retiré? Par quoi? (bactéries)

A

pendant ou après la traduction. Par une déformylase

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9
Q

Quels sont les 3 facteurs d’initiation qui dirigent l’assemblage du complexe d’initiation? Comment? (bactéries)

A

IF1 IF2 IF3

En se liant à la petite s.u. du ribosome

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10
Q

Que fait IF1? (bactéries)

A

Empêche les ARNts de se lier à la région du futur site A

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11
Q

Que fait IF2? (bactéries)

A

C’est une GTPase qui assure la liaison de l’ARNt initiateur au site P

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12
Q

Que fait IF3? (bactéries)

A

Se lie à la petite s.u. (30s)mplacement du futur site E et empêche la s.u. 30s de se réassocier à la grande s.u. (50s)

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13
Q

quand la grande s.u. peut se réassocier à la petite? (bactéries)

A

lorsque IF3 est expulsé suite à un changement de conformation de la petite s.u.
Cette nouvelle conformation résulte de l’appariement entre le codon start et l’ARNt initiateur

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14
Q

Qu’arrive-t-il quand la grande s.u. arrive? (bactéries)

A

IF2 hydrolyse sa GTP pour donner IF2-GDP + pi et est expulsé car il n’a plus d’affinité avec la petite s.u. et entraîne IF1

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15
Q

Qu’elle étape suit le départ de IF1 et IF2? (bactéries)

A

Formation du complexe 70S

le site A est prêt à recevoir le premier ARNt chargé

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16
Q

Expliquer toutes les étapes d’initiation en gros

A

Voir schéma diapo 47

17
Q

Où se fait le recrutement des ribosomes chez les eucaryotes?

A

sur la coiffe 5’

18
Q

Chez les eucaryotes, que fait l’ARm alors que la petite s.u. du ribosome est déjèa associée avec un ARNt initiateur?

A

L’ARNm est balayé par la petite s.u. associée avec son ARNt initiateur jusqu’au codon START 5’-AUG-3’

19
Q

Quelle est la chronologie de l’initiation de la traduction chez les eucaryotes?

A

1) Petite s.u. du ribosome est liée avec un ARNt initiateur avant de s’associer èa l’ARNm
2) une ensemble de facteurs auxiliaires distincts assure la reconnaissance de l’ARNm
3) la petite s.u. balaie l’ARNm jusqu’au premier codon start 5’-AUG-3’
4) Recrutement de la grande s.u. juste aprèes l’appariement de l’ARNt initiateur au codon START

20
Q

Quels sont les 4 facteurs d’initiation du ribosome eucaryote qui se lient à la petite s.u.?

A

eIF1
eIF1A
eIF3
eIF5

21
Q

quels sont les rôles des facteurs d’initiation eucaryotes qui se lient à la petite s.u.?

A

1) empêchent les ARNts de se lier à la région du futur site A
2) Empêchent la petite s.u. de se réassocier à la grande

22
Q

quel est le rôle de eFI2? (eucaryotes)

A

une GTPase qui assure la liaison de l’ARNt initiateur au site P (complexe ternaire)

23
Q

avec quoi eIF2-GTP-ARNtmet se lie pour former le comlpexe de pré-initiation 43s? (eucaryotes)

A

à la petite sous-unité du ribosome

24
Q

Qu’Est-ce qui se fait en parallèle à la formation du complexe de pré-initiation? (eucaryotes)

A

l’ARNm est préparé pour permettre sa reconnaissance par le complexe 43S

la coiffe 5’ est reconnue par eIF4E

eIF4G se lie à eIF4E et l’ARNm

eIF4A se lie à eIF4G et l’ARNm

25
Q

Quelle liaison est capitale dans la régulation de la traduction? (eucaryotes)

A

eIF4G- eIF4E

26
Q

que fait eIF4B? (eucaryotes)

A

active l’Activité hélicase à ARN de eIF4A ce qui a pour effet de supprimer les structures secondaires

27
Q

Grâce à quoi la petite s.u. balaie l’ARNm jusqu’au premier codon 5’-AUG-3’? (eucaryotes)

A

grâce à l’hélicase eIF4A/B

28
Q

comment est reconnu le codon start? (eucaryotes)

A

par appariement de bases avec l’ARNt initiateur, engendrant un changement de configuration du complexe 48S

29
Q

Qu’arrive-t-il suite au changement de configuration du complexe 48S? (eucaryotes)

A

eIF2 hydrolyse sa GTP et est relâchée

cela permet à eIF5B-GTP de se lier à l’ARNt initiateur et stimuler l’association avec la grande S.U.

30
Q

Pourquoi l’Association 40S/60S est possible? (eucaryotes)

A
car
eIF1
eIF3
eIF5 
ont étés relâchés
31
Q

Que permet l’association avec la grande s.u.? (eucaryotes)

A

permet le relargage des 2 derniers facteurs d’initiation par hydrolyse de GTP

32
Q

grâce à quoi y a-t-il le relargage des 2 derniers facteurs d’initiation par hydrolyse de GTP? (eucaryotes)

A

grâce au changement de conformation de la s.u. 40s induit par l’association 40s/60s

33
Q

Comment s’appelle le complexe d’initiation eucaryote?

A

CI 80S

34
Q

à quoi eIF4G est aussi associé? (eucaryotes)

A

à l’extrémité 3’ de l’ARNm soit la queue poly-A

35
Q

Pourquoi eIF4G est associé à la queue poly-a de l’ARNm?

A

pour favoriser l’interaction des autres eIFs avec la queue poly-A et permettre aux ribosomes de bien se positionner pou la réaction suivante