BM12 6) L'épissage alternatif

Question 1

Que permet l’épissage alternatif des ARN pre-messagers?

Answer 1

• maximiser la diversité du protéome

- Rôle essentiel dans la régulation des profils d’expression dans les différents tissus

Question 2

Comment les protéines de liaison à l’ARN modulent l’épissage des transcrit selon le tissu?

Answer 2

Selon leur concentration. les protéines SR et les ribonucléoprotéines nucléaires hétérogènes peuvent contrôler:

• le choix des sites d’épissage
• ratio d’inclusion/exclusion d’exons alternatifs

Question 3

Pourquoi les ribonucléoprotéines nucléaires hétérogènes sont incapable de rectruter l’épissosome quand ils se lient aux sites d’épissage de l’ARN (introns et exons)

Answer 3

ils ne possèdent pas de motif RS

Question 4

Qu’Est-ce que la concentration des ribonucléoprotéines nucléaires hétérogènes influence?

Answer 4

La compétition avec les composants de l’épissosome sera plus ou moins favorable

Question 5

Que permet le mécanisme de compétition ribonucléoprotéines nucléaires hétérogènes/Épissosome

Answer 5

permet de moduler finement l’épissage alternatif selon le type de tissus

Question 6

Quels sont les différentes alternatives d’épissage?

Answer 6

Saut d’exon
Extension d’exon
Rétention d’intron
Exons alternatifs

Question 7

Expliquez le mécanisme des sites alternatifs en utilisant l’exemple de l’Antigène de SV40?

Answer 7

• Utilisation d’un site alternatif d’épissage 5’ sst au lieu de 5’SST
• Utilisation du même site 3’ SST pour les deux transcrits alternatifs
• Les proportions des 2 formes T et t dépend de la concentration d’un régulateur d’épissage de type SR: SF2/ASF
• À forte concentration, SF2/ASF se fixe à proximité du site 5’ sst sur l’exon 2

Question 8

Quels sont les deux mécanismes d’exclusion mutuelle?

Answer 8

• Encombrement stérique des snRNPs

- Combinaisons de sites d’épissage majeurs et mineurs

Question 9

Comment se fait l’exclusion mutuelle par encombrement stérique des snRNPs?

Answer 9

Il faut une distance suffisante entre le site de clivage 5’ (U1) et le site de branchement A (U2)
Exemple: 3 introns.
-> si U1 se lie sur l’intron 2 = exclut U2
-> si U2 se lie sur l’intron 2 = exclut U1

Question 10

Combien d’ARN pm sont épissé par l’épissosome Mineur

Answer 10

1/1000

Question 11

Qu’elles sont les différences entre Épissosome mineur et majeur?

Answer 11

des snRNPs différents
U12 -> U2
U11 -> U1
reconnaissent des séquences différentes 5’Au et AC-‘3 (v.s. 5’-Gu et 3’-AG pour l’épissosome majeur)

(MAIS CHIMIE DE LA RÉACTION EST IDENTIQUE)

Question 12

Les 2 épissosomes peuvent-ils retirer un intron qui contient un site majeur et un site mineur?

Answer 12

Non

Question 13

Qu’Est-ce que Dscam?

Answer 13

une immunoglbuline de la drosophile qui compte 38 016 isoformes

Question 14

Comment se fait la régulation par inhibiteurs?

Answer 14

Les protéines inhibitrices se lient spécifiquement aux sites appelés Répresseurs introniques (RIE) ou Exoniques (REE) d’épissage

Question 15

Comment se fait la régulation par activateurs

Answer 15

Les protéines activatrices se lient spécifiquement aux sites appelés Amplificateurs Introniques (AIE) ou Exoniques (AEE) d’épissage

Question 16

Grâce à quoi les protéines SR se lient à l’ARN?

Answer 16

Grâce à leur motif MRA

Question 17

Que permet le domaine RS proche du COOH terminal des protéines SR?

Answer 17

Interactions protéine-protéine pour le recrutement de l’épissosome au site d’Épissage

Question 18

Les protéines SR sont elles des activateurs ou des inhibiteurs?

Answer 18

les 2

Question 19

Par quoi sont reconnus les sites répresseurs?

Answer 19

Par des ribonucléoprotéines nucléaires hétérogènes qui se lient à l’ARN (avec MRA) mais qui sont incapables de recruter l’épissosome (bloquage des sites d’épissage)