Biyokimya Flashcards

1
Q

Lipid oranı en yüksek, protein oranı en düşük lipoprotein

A

Şilomikron

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Lipid oranı en düşük, protein oranı en yüksek lipoprotein

A

HDL

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Karbonhidratların suda çözünme yeteneği hangi grubun varlığına bağlıdır?

A

Hidroksil

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Mitokondri iç zarında en çok bulunan lipid sınıfı

A

Fosfolipidler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Karbonhidrat sağlayıcı

A

Üridin difosfat şeker

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Kemikte en fazla bulunan kollajen tipi

A

Tip I

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

En küçük hücre

A

Mikroglia

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

En büyük hücre

A

Ovum (yumurta)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Protoplazma

A

Hücre zarı içindeki her şey

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Lipofuksin

A

Hücre içi artıkların kahverengi pigment halinde birikmesi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

İnkluzyon

A

Çeşitli maddelerin hücre içindeki depoları
Glikojen
Yağ damlacıklar
Endojen ve Eksojen pigmentler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Glikokaliks

A

Glikoprotein ve glikolipitten oluşur

Her hücre için özeldir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hücre zarı

A

Asimetriktir

Kolestrol arttıkça akışkanlık azalır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Nükleostemin proteini

A

Çekirdekçikte bulunur

p53 proteinine bağlanarak hücre siklusunun düzenlenmesinde görev alır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Golgi

A

Asimetriktir (cis(giriş)-medial-trans(çıkış))
GER’de sentezlenen proteinler COP-2 (Coatomer-2) ile golgiye gider
Golgideki proteinler COP-1 ile GER’e gider
Mukus salgılayan hücrelerde (goblet) çok bulunur
Glikolizasyon gerçekleşir (Glikozil transferaz vs)
Sülfasyon: Sülfat grubu eklenmesi gerçekleşir
Proteinler seçilerek paketlenir
GER’de yapılan lizozomal enzimler golgide M6P ile işaretlenir ve lizozoma gönderilir
Lizozomu oluşturur
MARKER ENZİM α-Mannozidaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Lizozom

A

pH çok düşük
Enzimleri ER’deki ribozomlarda sentezlenir. Golgide M6P ile işaretlenip lizozoma gönderilir
Golgiden boğumlanarak oluşur
Lipaz, fosfataz, proteaz nükleaz vs.
Primer lizozomda sadece enzim var
Sperm-yumurta birleşmesinde rol oynar
Lizozomun zarı delinirse hücreyi sindirmeye başlar
Otoliz
MARKER ENZİM β-Galaktozidaz ve β-N-Asetilheksozaminidaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Peroksizom

A
Uzun zincirli yağ asitlerinin metabolizması
Kolesterol ve safra asidi sentezi
Hidrojen peroksidin su ve oksijene indirgenmesi
Ürik asit ve amino asitlerin işlenmesi
Proteinleri ER'da sentezlenir
Termojenin molekülü ile ısı üretimi
B-oksidasyon 
Karaciğer ve böbrekte bol bulunur
Oksijen kullanır, ATP üretmez
Safra asitleri, safra tuzlarına çevrilir
Enzimlerini serbest ribozomlar sentezler
Oksidaz enzimleri içerir
Ürat oksidaz, katalaz, D-aminoasit oksidaz, Hidroksi yağ asidi oksidaz
MARKER ENZİM Katalaz
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Ribozom

A

Svedberg ünitesi
Serbest ribozomlar yapısal proteinleri üretir
MARKER ENZİM rRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Mitokondri

A

Kalp, böbrek tübül, spermde bol bulunur
İç zarda fosforilasyon ve ETZ enzimleri bulunur
Yapısında en çok protein bulunan membran mitokondri iç zarıdır (NADH dehidrogenaz, süksinat dehidrogenaz, sitokrom b, c ve sitokrom oksidaz)
Matrikste Ca içeren yoğun matriks granülleri var
Matrikste Trikarboksilik asit siklusu, beta oksidasyon, porfirin, ve üre metabolizmasına ait enzimler var
TCA siklusu enzimlerinden sadece süksinat dehidrogenaz iç zarda yerleşmiştir
Yağ asitleri iç zardan karnitin proteini ile geçerler
MARKER ENZİM Süksinat Dehidrogenaz ve Sitokrom-c Oksidaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Granüllü ER

A

Çekirdek zarı ile devamlılık gösterir
Hücre dışına verilecek proteinler
Lizozomal enzimler
Kollajen, pıhtılaşma proteinleri, albumin, immunoglobülin
Pankreas asinus (sindirim enzimi), Fibroblast (kollajen), plazma (immünoglobülin) hücrelerinde bol bulunur
Proteinlerin üç boyutlu yapı kazanması burada olur
Glikozillenme, disülfür köprüleri, lipid eklenmesi
MARKER ENZİM Glukoz-6-fosfataz ve RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Düz ER

A

Hücresel membran fosfolipitlerinin sentezi
Steroid sentezi, ilaç detoksifikasyonu, glikojen ve lipit metabolizması
Kas hücrelerinde Ca depolanması ve sitoplazmaya salınması
Adrenal korteks, kas, karaciğer, gonad hücrelerinde iyi gelişmiştir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Sitoplazma Marker Enzimi

A

L-Lactat Dehidrogenaz

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Nükleus Marker Enzimi

A

DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Subsellüler Fraksiyonlama

A

Ekstraksiyon (özütleme), Homojenizasyon ve Ultrasantrifügasyon işlemlerinden oluşur
1000g, 10 dakika (Hücre, nükleus, sitoskelet, plazma membran)
20.000g 20 dakika (mitokondri, lizozom, peroksizom)
80.000g 1 saat (Mikrozom(ER fragmanları))
150.000g 3 saat (ribozom ve büyük makromoleküller)
Proteinler jel elektrofez yöntemi ile izole edilir
Lipit yapılı moleküller kromatografik yöntemlerle (gaz ve ince tabaka) izole edilir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Hücre Membran Marker Enzimi
Na-K ATPaz
26
Hidrolitik enzimler nerede bulunur
Lizozomda
27
Otofaji
Hücre organellerinin kendi lizozomu tarafından sindirilmesi
28
İntegral
Zarın içine yerleşmiş
29
Periferal
Hücre yüzeyinde
30
Fosfatidil serin ve fosfatidil etanolamin ve fosfotidil inositol
Hücre zarının iç tabakasında bulunur
31
Fosfotidil kolin ve sfingomiyelin
Hücre zarının dış tabakasında bulunur
32
Lipitler kanda nasıl taşınır
Lipoprotein şeklinde
33
Nötral yağ
Yağ asitlerinin çeşitli alkollerle (gliserol) oluşturdukları esterler Basit lipidler sınıfında
34
Fosforik asit içeren fosfolipitler
``` Azot içeren gliserofosfatitler Lesitin (fosfatidil kolin) Cephalin (fosfatidil etanolamin) Fosfatidil serin Nitrojen olmayan gliserofosfatitler Fosfatidil ilinositol Fosfatidil gliserol Difosfatidil gliserol (karyolipin) Uzun zincirli alkol içeren plazmalojenler Kolin plazmalojen Etanolamin plazmalojen Sfingozin içeren fosfosingositler Sfingomiyelin ```
35
Fosforik asit içermeyen lipidler
``` Glikosfingolipidler (karbonhidrat) Serebrositler (seramid monoheksositler) Globosidler (seramid oligosakkaritler) Ganliositler Sulfolipidler veya sülfatidler Sülfatlanmış serebrositler Sülfatlanmış globosidler Sülfatlanmış gangliosidler ```
36
Yağ asitleri
%95i hücresel yapı elemanı olarak yağ açil esterleri şeklinde %5i serbest halde bulunur Albüminle taşınırlar Alifatik karboksilik asitlerdir 18:2(△9;12) sırayla C sayısı, çift bağ sayısı, çift bağ yerleri Erime noktası çift bağ sayısıyla ters, zincir uzunluğuyla doğru orantılı YA zinciri ER ve mitokondride uzatılır
37
Vücutta sentezlenen ilk yağ asidi
palmitik asit
38
Yağ asidi çözünürlüğü nelere bağlı
Zincir uzunluğu Çift bağ sayısı Esterleşme Doğru orantılı
39
Tek sayıda C'lu YA nerelerde bulunurlar
Hücre duvarları ve sütte
40
8 karbondan kısa doymuş YA hangi halde bulunur
SIVI
41
Vücutta en bol bulunan yağ asitleri
C16 palmitik asit ve C18 stearik asit
42
Doğal olarak meydana gelen YA'leri hangi formda
Cis (translara göre erime noktası daha düşük)
43
Monoansatüre | Poliansatüre
Tek çift bağ | İki veya daha fazla çift bağ
44
Linoleik asit
2 çift bağ içerir Esansiyel YA Omega 6 (araşidonik asit de omega 6)
45
Linolenik asit
3 çift bağ içerir Esansiyel YA Omega 3
46
Memelilerde kaçıncı karbonlara çift bağ eklenebilir
4, 5 , 6 ve 9. çift bağları oluşturan dört çeşit desaturaz enzimi vardır ER'de gerçekleşir
47
Esansiyel YA'leri
Membranda fosfolipitlerin yapısında bulunur
48
PUFA
Polyunsaturated Fatty Acids | Çoklu doymamış yağ asitleri
49
Oleik asit
Omega 9
50
Hidrojenizasyon
Çift bağlı yağ asitlerinin hidrojenlenerek doyurulması
51
Halojenlenme
Çift bağlı yağ asitlerinin çift bağlarına klor, brom, iyot gibi halojenler katılabilir
52
Doymamış YA erime noktası Doymuş YA'lerinden
Daha düşüktür
53
Doymamış YA arttıkça membran akışkanlığı
Artar
54
YA tepkimeleri
``` Hidrojenizasyon Halojenlenme Tuz oluşumu (sabun) Ester oluşumu Oksidasyon (enerji vermek için, özellikle beta oksidasyon) ```
55
YA'lerinde ester oluşumu
Gliserol + YA = Monoasilgliserol Monogliserid + YA = Diaçilgliserol Digliserid + YA = Trigliserid veya triasilgliserol
56
Beyin glikolipitlerinde bulunan YA'leri
Hidroksi YA
57
Eikozanoidler
``` 20Clu G proteinleri ile lokal hormon olarak kabul edilir Prostanoidler Otokrin ve parakrin etki Lökotrienler LTA4, LTB4, LTC4, LTD4, LTE4 Lipoksinler Araşidonik asidin trihidroksi türevleridirler ```
58
Nötr Yağlar (Triaçilgliserol (TAG) veya Trigliserid (TG) olarak adlandırılır)
Gliserol C atomları 1, 2, 3 olarak isimlendirilir 2. C'a doymamış YA 1 ve 3. C'lara doymuş veya doymamış YA eklenir Hidrofobik
59
Gliserol
Asimetrik C yok | Gliserol ile esterleşen 3 YA aynı ise basit yağ, farklı ise miks yağ denir
60
Sabunlaşma
Triasilgliseroller alkali (KOH ve NaOH) ile hidrolize edildiğinde gliserol ve sabunlar oluşur
61
YA genel sınıflandırma
Triaçilgliseroller - Gliserolipitler Gliserofosfolipitler - Gliserolipitler ve Fosfolipitler Eter Gliserolipitler - Gliserolipitler ve Fosfolipitler Spingofosfolipitler - Fosfolipitler ve Spingolipitler Glikolipitler - Spingolipitler
62
Fosfolipitler (Gliserofosfolipitler)
Gliserol, YA ve azotlu bir baz içerirler Fosfatidik asit türevleridir Membranın temel bileşimi Safra salgısı, akciğer surfaktanı ve lipoproteinlerin temel bileşenidirler
63
Lesitin (Fosfatidilkolin) Cephalin (Fosfatidiletanolamin) Fosfatidilserin
Azot içeren gliserofosfatitler
64
Fosfatidilinositol Fosfatidilgliserol Difosfatidilgliserol (Kardiyolipin)
Azot içermeyen gliserofosfatitler
65
Kolin plazmalojen | Etanolamin plazmalojen
Uzun zincirli alkol içeren plazmalojenler, Eter glikolipidler Gliserofosfolipit
66
Sfingomiyelin (sfingozin içeren fosfosfingositler)
Gliserofosfolipitlerden farklı olarak gliserol yerine sfingozin (amino alkol) bulunur Seramide (Sfingozin + YA)
67
Lipozom
Lipit tabakanın kapanarak bir küre oluşturması | Kemoterapi, antimikrobiyal tedavi, gen terapisi, aşı
68
Fosfotidilkolin (Lesitin)
Nitrojen içerir Kolin hücre zarında ve safrada bol bulunur Kolin sinir iletiminde önemlidir (asetilkolin deposu)
69
Fosfolipaz A1
Gliserolün 1. C'u ile YA'nin oluşturduğu bağı kırar
70
Fosfolipaz A2
Gliserolün 2. C'u ile YA'nin oluşturduğu bağı kırar | Araşidonik asidin salınımına neden olur
71
Fosfolipaz C
Gliserol ile fosfat arasındaki bağı kırar | Fosfatidil inozitoldifosfatı yıkar ve 2. habercileri oluşturur
72
Fosfotidil inositol
2. haberci olarak görev yaparfmem
73
Fetal olgunluk indeksi olan ve akciğerlerin tam olgunluğunu gösteren oran
Amniyotik sıvıdaki Lesin/Sfingomiyelin oranının 2 olması
74
Akciğer sürfaktanları
Akciğer tabakasının yüzey gerilimini azaltır Alveollerin çökmesi önler Yüzey aktif maddeleri Fosfatidil gliserol
75
Fosfatidiletanolamin (Cephalin) | Fosfatidil serin
Hücre zarlarında bulunurlar Fosfatidil serin apoptozda rol oynar Fosfatidil kolinin yerini sırasıyla etanolamin ve serin alır
76
Fosfatidil gliserol
Antijenik özelliği olan tek fosfolipit Sifilizin tanı ve takibinde kullanılır Kardiyolipin = Di fosfatidil gliserol
77
Plazmalojen
Gliserolün ilk hidroksil grubuna alifatik uzun zincirli alkolün eter bağı ile bağlanması ve ikinci OH grubuna ise bir yağ asidinin bağlanması ile oluşur Beyin ve kas hücre membranlarında bulunur
78
PAF
Trombosit Aktifleştirici Faktör | Gliserolün 1. C'una alkil eter bağlanan bir plazmalojen
79
Seramid
Sfingozin + YA Seramidin primer hidroksil grubu fosforilkolin ile esterleşerek sfingomiyelin oluşur Sfingozin = Amino Alkol Tüm membranlarda ama özellikle nöron ve miyelinde çok bulunur
80
Tip I Kollajen
Deri, kemik, tendon, büyük kan damarları (aort), ve korneada bulunur
81
Tip II Kollajen
Kıkırdak, disk ve vitröz cisimde bulunur
82
Tip III Kollajen
Fetal cilt ve kan damarında bulunur
83
Tip IV Kollajen
Bazal membranda bulunur
84
Fibriler yapıdaki kollajenler
Tip I, II, III, V, XI
85
Ağ şeklindeki kollajenler
Tip IV, VIII, X
86
Kollajenlerdeki aminoasitler
%35 glisin %11 alanin %21 prolin ve hidroksiprolin Ayrıca lizin ve hidroksilizin de kollajende bulunan önemli amino asitlerdir
87
Hidroksilasyon
GER'de prokollajendeki prolin ve lizin hidroksilasyon ile OH-Lizin ve OH-Prolin halini alır ``` Prolin, Prolin hidroksilaz, askorbik asit ve Fe+2 aracılığıyla Ketoglutarat ve O+2 kullanılarak Süksinat, CO2 ve H2O açığa çıkarak Hidroksiprolin elde edilir ```
88
Kollajen sentezinde hücre içi olaylar
``` Preprokollajen zincirlerinin sentezi Sinyal peptidin çıkarılması Hidroksilasyon-Glikozilasyon (Glikozilasyonda karbonhidratlar hidroksiliz ve asparaji yan zinciri üzerinden eklenmektedir) Üçlü heliksin oluşumu Uzantılarda disülfit bağların oluşumu ```
89
Kollajen sentezinde hücre dışı olaylar
N-terminal ve C- terminal propeptitlerin kesilerek tropokollajen oluşumu Lizin ve hidroksilizinin oksidatif deaminasyonu ile aldehit formuna dönüşerek (allizin), kovalent çapraz bağların oluşumu (Kollajen fibrilleri arasında kovalent çapraz bağlarda görev alan aminoasitler, Lizin ve hidroksilizindir)
90
Kollajen ve elastinin farkları
``` Kollajen Bir çok farklı genetik tipte Üçlü sarmal Gly-X-Y tekrarlayan yapı Hidroksilizin var Karbonhidrat içerir Molekül içi aldol çapraz bağları Elastin Tek genetik tipte Üçlü sarmal yok, rastgele zemberek konformasyonu (gerilmeye izin verir) Gly-X-Y tekrarlayan yapı yok Hidroksilizin yok Karbonhidrat yok Molekül içi desmozin çapraz bağları ```
91
Bazal laminanın yapı taşları
Laminin Entaktin Tip IV kollajen Perlekan (Heparan Sülfat)
92
Kollajen liflerinde zincir içi ve zincirler arası kovalent çapraz bağları oluşturan enzim
Lizil oksidaz
93
Osteogonozis İmperfect (osteopeni)
``` Kemik kitlesinde azalma Kolayca bükülüp kırılan kemikler Mavis Sklera ve işitme kaybı Yara iyileşmesinde gecikme Diş anormallikleri Tip 1 prokollajeni kodlayan gende (COL1A1) mutasyon sonucu ortaya çıkar ```
94
En bol bulunan Glikozaminoglikan (GAG)
Kondroitin Sülfat
95
Amino şeker
D-Glukozamin ve D-Galaktozamin | GAGlara negatif yük sağlar
96
Asidik şeker
D-Glukuronik Asit veya L-İduronik Asit | GAGlara negatif yük sağlar
97
N-Bağlı Glikoproteinler
Asparajin
98
O-Bağlı Glikoproteinler
Serin Treonin Tirozin
99
Aminoşeker sentezinde hız kısıtlayıcı basamak
Aminotransferaz basamağı
100
Amino şekerlerin prekürsörü (öncül maddesi)
Glukoz
101
İnsanlarda hangi enzimin yokluğu C vitamini sentezlenmesini engeller
L-Glunolakton Oksidaz
102
6 Tip GAG vardır. Bunlar...
``` Hiyalüronik asit Kondroitin sülfat Keratan sülfat Dermatan sülfat Heparin Heparan sülfat ```