Biyokimya 6. Komite Flashcards

1
Q

Adenin Nükleotit Translokaz Sistemi

Adenin Nükleotit Taşıyıcı

A

ATP, ADP ve Pi mitokondri membranından geçemez
Mitokondride ADP girişini ve ATP çıkışını sağlayan taşıyıcı sistemdir
Mitokondri iç membranında bulunur
Antiport (zıt yön)
Yüksek enerji gerektiren bir işlemdir
Atraktilozid ve bongrekik asit ile inhibe olur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Fosfat Translokaz Sistemi

Fosfat Taşıyıcısı

A

Pi (H₂PO₄−) ve protonu (H+) mitokondri matriksine taşır
Simport (aynı yön)
Mitokondri iç membranında bulunur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Malat - Aspartat Şantı

A

Karaciğer, böbrek ve kalpte bulunur
Sitoplazmadaki NADH’ları mitokondriye taşır
Taşıma sırasında NAD+ kullanır
Mitokondri iç membranında bulunur
1- Sitoplazmada malat, dehidrogenaz enzimi ile oksaloasetat malata dönüşür
2- Malat kendi taşıyıcı sistemiyle mitokondri iç membranından geçer
3- Malatla mitokondri içine taşınan protonlar (H) NAD’lara aktarılarak NADH oluşturulur
4- Matriksteki mitokondrial malat dehidrogenaz ile malat, oksaloasetata ardından aspartata dönüşür ve mitokondri dışına atılır
NADH’ların taşıdığı elektronlar Kompleks I’e aktarılır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Gliserol - Fosfat Şantı

A

Beyin ve iskelet kasında bulunur
Mitokondri iç membranında bulunur
1- Sitoplazmik gliserol 3-fosfat dehidrogenaz enzimi ile Dihidroksi aseton fosfat, Gliserol 3-fosfata dönüşür
2- Reaksiyon sırasında gliserol 3-fosfat dehidrogenaz vasıtasıyla NADH’ların elektronları Gliserol 3-fosfata aktarılır
3- Gliserol 3-fosfat mitokondri intermembran aralığa geçerek iç zarın dış tarafında bulunan gliserol 3-fosfat dehidrogenaz ile dihidroksi aseton fosfata dönüşürken elektronlarını FAD’a aktarır ve FADH2 oluşturur
4- FADH2 elektronları Koenzim Q’ya aktarır ve elektronlar ETZ’ye katılmış olur
Elektronlar Kompleks 1 veya 2’ye uğramadan direk koenzim Q üzerinden ETZ’ye dahil olur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Kreatin - Fosfat Taşıyıcısı

A

Mitokondri dış membranda bulunur
ATP matriksten intermembran aralığa Adenin nükleotit taşıyıcısı ile burada sitoplazmaya ise Kreatin - Fosfat şantı ile geçer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Termodinamiğin sıfırıncı kanunu

A

İki cisim üçüncü bir cisimle aynı sıcaklıktaysa bu iki cismin sıcaklıkları eşittir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Termodinamiğin birinci kanunu

A

Enerji korunur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

1 cal kaç joule’a eşittir

A

1 cal = 4,187 j

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Termodinamiğin ikinci kanunu

A

Kendiliğinden gerçekleşen süreçlerde sistem ve çevrenin toplam entropisi artar
ΔS > 0 ise kendiliğinden gerçekleşir
Evren daima düzensiz duruma gider
Bir sistem min entalpi, max entropiye sahip olma eğilimindedir
Isı transferi yüksek sıcaklıktan düşük sıcaklığa doğrudur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Termodinamiğin üçüncü kanunu

A

Mutlak sıfırda (-273 santigrat) entropi sıfırdır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Serbest enerji (G)

A

Sistemde yararlı olan enerjidir
ΔG Pozitif ise endergonik
Negatif ise ekzergonik

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Entalpi (H)

A

Reaksiyon sisteminin ısı değeri
Reaktant ve ürünlerin kimyasal bağlarının sayı ve türünü yansıtır
ΔH pozitif ise endotermik
negatif ise ekzotermik

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Entropi (S)

A

Düzensizlik
Entropi artıyorsa kendiliğinden
Dengeye yaklaşıldıkça entropi max olur
Entropi kapalı sistemlerde incelenir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

İç Enerji (E)

A
Çekirdek içi enerji
Elektronik enerji
Öteleme enerjisi
Dönme enerjisi
Titreşim enerjisinden oluşmaktadır
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Moleküllerin en redükte hallerinden, en okside hallerine doğru sıralanması

A

Alkan > Alkol > Aldehid/Keton > Karboksilli Asit > Karbondioksit

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Nükleofiller

A
Çekirdek seven
Elektronca zengindirler ve bu elektronları verme eğilimleri vardır
Oksijen radikalleri 
Sülfür iyonu
Karbanyon
Yüksüz amino grubu
İmidazol
Hidroksil iyonu
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Elektrofiller

A
Elektron seven
Elektronca fakirdirler ve elektron elde etmeye çalışırlar
Karboksil grubu karbon atomu
Protone imino grubu
Fosfat grubundaki fosfor
Proton
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Sitrik asit siklusuna katılan molekül

A

Asetil Coa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Yağ asitleri hangi olayla Asetil Coa’ya dönüşür

A

B-oksidasyon

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

ATP’nin işe karıştığı reaksiyonları hangi enzimler katalizler

A

Kinaz enzimleri

Kofaktörü Mg+2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Yüksek enerjili bileşikler

A
Pirofosfatlar
Enolfosfatlar
Acilfosfatlar
Tiyolfosfatlar
Guanido fosfatlar veya fosfojenler
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Pirofosfatlar

A

Enerjili bağ “asit anhidrit bağı”dır
Asit gruplarının (genelde fosforik asit) birleşmesiyle oluşurlar
ATP ve pirofosfat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Enolfosfatlar

A

Enolfosfat bağı taşır
Hem OH- grubu hem de çift bağ taşır
Fosfoenolpiruvat
ATPden daha yüksek enerji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Acilfosfatlar

A

Karboksil grubuna fosfat bağlanmasıyla oluşur
Glikoliz ara ürünleri 1,3 bifosfogliserat
Üre siklusundaki karbamoil fosfat
ATPden daha yüksek enerji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Tiyolfosfatlar
Yüksek enerjili fosfat bağı yerine tiyoester bağı vardır Bu bağ tiyol (-SH) ile karboksil grubu arasındadır Asetil Coa
26
Guanido Fosfatlar veya Fosfojenler
Guanidofosfat bağı vardır Fosfat grubu guanido grubuna bağlanır Fosfokreatin
27
Yüksek enerjili bileşikler
``` Fosfat bileşikleri Fosfoenolpiruvat Karbamoil fosfat 1,3 bifosfogliserat Kreatin fosfat Kükürtlü bileşikler Coa türevleri ```
28
Düşük enerjili bileşikler
``` Glikoz-1-fosfat Fruktoz-6-fosfat Glukoz-6-fosfat Gliserol-3-fosfat Pirofosfat ```
29
ATPnin kısa süreli depolanmasını sağlayan molekül
Fosfojen Kreatin fosfat Arjinin fosfat (omurgasızlar)
30
Adenilat kinaz (miyokinaz)
Adenin nükleotitleri birbirine dönüştüren enzim | örn. ATP + AMP > 2ADP
31
ATPnin AMPye dönüşümü
Yağ asidinin aktivasyonunda görülür | 2 ATP kullanıldığı kabul edilir
32
Yağ asidi aktivasyonu
2 ATP kullanılır Sitoplazmada gerçekleşir Tiyokinaz enzimi tarafından katalize edilir
33
Nükleozid difosfokinaz
ATP dışındaki nükleozid trifosfatların oluşumunu katalize eder örn. ATP + UDP > ADP + UTP
34
Perimitokondriyel boşluk
Mitokondri membranları arası boşluk | Yüksek proton konsantrasyonuna sahip
35
Mitokondri iç membranı
En yüksek protein oranına sahip membran %70
36
Mitokondri iç membranın geçirgenliğini kısıtlayan molekül
Kardiolipin
37
Mitokondrinin görevleri
Oksidatif fosforilasyon (ATP üretimi) Hücresel solunum (ETZ) Sitrik asit siklusu (TCA) Porfirin metabolizmasının ilk ve son üç tepkimesi Karaciğerde üre siklusunun ilk iki basamağı Yağ asitlerinin başlıca yıkımı olan B-oksidasyon Karaciğerde keton cisim sentezi Karaciğer dışı dokularda keton cisim yıkımı
38
Permeaz
Zarda maddelerin taşınmasını sağlayan transport proteinleri
39
Oksidasyon (Yükseltgenme)
Elektron kaybı Hidrojen kaybı Oksijen ilavesi Dehidrojenasyon da denir
40
Redüksiyon (İndirgenme)
Elektron kazancı
41
Redüktan
Elektron verici | İndirgen
42
Oksidan
Elektron alıcı | Yükseltgen
43
Standart indirgenme potansiyeli
25 derecede pH=7de redoks çiftlerinin 1M konsantrasyonlu çözeltilerinin ölçülen potansiyel farkı Hidrojene göre elektron ilgisi fazla olanların standart indirgenme potansiyeli pozitiftir
44
NADH + H+
1 hidrojeni hidrür olarak alır diğer hidrojeni H+ olarak verir
45
NADH ve NADPH özellikleri
Dehidrojenaz enzimlerinin koenzimleridir Reaktif kısmı nikotinamid kısmıdır Suda çözünür Enzime gevşek bağlıdır Aldıkları iki H atomundan birini Hidrür olarak alır diğerini H+ olarak ortama verir NADH katabolik, NADPH anabolik reaksiyonlarda elektron taşır
46
NAD+ ve NADP+ yı koenzim olarak kullanan enzim
Glutamate dehidrogenaz
47
FMN ve FAD özellikleri
Flavinli dehidrogenazlar tarafından koenzim olarak kullanılırlar Enzime sıkıca bağlıdır Suda çözünürler Reaktif kısmı izoalloksazin halkasıdır H atomu şeklinde bir veya iki elektron transferi yapabilirler
48
Ubikinon (koenzim Q) özellikleri
Yağda çözünür | Küçük ve hidrofobik olduğu için mitokondri membranından kolayca geçebilir
49
Sitokromların özellikleri
Prostetik grup olarak demir-porfirin bileşiği olan hem içeren elektron taşıyıcı proteinlerdir Membranlara ve birbirlerine sıkıca bağlıdırlar Sitokrom C mitokondrial iç membranın dış kısmına gevşek olarak bağlıdır Bir elektron taşırlar Sitokrom oksidaz bakır içerir
50
Antioksidan enzimler
Süperoksit dismutaz Katalaz Glutatyon peroksidaz
51
Oksidoredüktaz enzimler
Oksidazlar Oksijenazlar Dehidrogenazlar Hidroperoksidazlar
52
Hangi maddenin varlığında oksidasyon devam ederken ATP sentezi yavaşlar veya durur
Dinitrofenol
53
Bir hücrede ATP/ADP ve NAHDH/NAD+ oranları yüksek ise hangi olaylar gerçekleşir
ATP sentezi azalır Yağ asitlerinin Asetil-Coa'ya dönüşümü (b-oksidasyon) yavaşlar Piruvatın, oksaloasetata dönüşümü hızlanır İzositratın, a-ketoglutarata dönüşümü yavaşlar
54
Kompleks 1'den Koenzim Q'ya (ubikinon) elektron akışını inhibe eden madde
Rotenon
55
H pompalamayan kompleks hangisi
Kompleks 2
56
Süksinat dehidrogenazın (kompleks 2) yarışmalı inhibitörü
Malonat
57
Kompleks III inhibitörü
BAL, antimisin A
58
Kompleks IV inhibitörü
Siyanür Karbonmonoksit Hidrojen sülfür
59
Kompleks V inhibitörü
Oligomisin
60
Elektron taşıma zinciri sırası
``` NADH Koenzim Q Sitb Sitc Sitaa3 Oksijen ```
61
ΔG < 0 ise
Tepkime kendiliğinden yürür