Biyokimya 6. Komite Flashcards
Adenin Nükleotit Translokaz Sistemi
Adenin Nükleotit Taşıyıcı
ATP, ADP ve Pi mitokondri membranından geçemez
Mitokondride ADP girişini ve ATP çıkışını sağlayan taşıyıcı sistemdir
Mitokondri iç membranında bulunur
Antiport (zıt yön)
Yüksek enerji gerektiren bir işlemdir
Atraktilozid ve bongrekik asit ile inhibe olur
Fosfat Translokaz Sistemi
Fosfat Taşıyıcısı
Pi (H₂PO₄−) ve protonu (H+) mitokondri matriksine taşır
Simport (aynı yön)
Mitokondri iç membranında bulunur
Malat - Aspartat Şantı
Karaciğer, böbrek ve kalpte bulunur
Sitoplazmadaki NADH’ları mitokondriye taşır
Taşıma sırasında NAD+ kullanır
Mitokondri iç membranında bulunur
1- Sitoplazmada malat, dehidrogenaz enzimi ile oksaloasetat malata dönüşür
2- Malat kendi taşıyıcı sistemiyle mitokondri iç membranından geçer
3- Malatla mitokondri içine taşınan protonlar (H) NAD’lara aktarılarak NADH oluşturulur
4- Matriksteki mitokondrial malat dehidrogenaz ile malat, oksaloasetata ardından aspartata dönüşür ve mitokondri dışına atılır
NADH’ların taşıdığı elektronlar Kompleks I’e aktarılır
Gliserol - Fosfat Şantı
Beyin ve iskelet kasında bulunur
Mitokondri iç membranında bulunur
1- Sitoplazmik gliserol 3-fosfat dehidrogenaz enzimi ile Dihidroksi aseton fosfat, Gliserol 3-fosfata dönüşür
2- Reaksiyon sırasında gliserol 3-fosfat dehidrogenaz vasıtasıyla NADH’ların elektronları Gliserol 3-fosfata aktarılır
3- Gliserol 3-fosfat mitokondri intermembran aralığa geçerek iç zarın dış tarafında bulunan gliserol 3-fosfat dehidrogenaz ile dihidroksi aseton fosfata dönüşürken elektronlarını FAD’a aktarır ve FADH2 oluşturur
4- FADH2 elektronları Koenzim Q’ya aktarır ve elektronlar ETZ’ye katılmış olur
Elektronlar Kompleks 1 veya 2’ye uğramadan direk koenzim Q üzerinden ETZ’ye dahil olur
Kreatin - Fosfat Taşıyıcısı
Mitokondri dış membranda bulunur
ATP matriksten intermembran aralığa Adenin nükleotit taşıyıcısı ile burada sitoplazmaya ise Kreatin - Fosfat şantı ile geçer
Termodinamiğin sıfırıncı kanunu
İki cisim üçüncü bir cisimle aynı sıcaklıktaysa bu iki cismin sıcaklıkları eşittir
Termodinamiğin birinci kanunu
Enerji korunur
1 cal kaç joule’a eşittir
1 cal = 4,187 j
Termodinamiğin ikinci kanunu
Kendiliğinden gerçekleşen süreçlerde sistem ve çevrenin toplam entropisi artar
ΔS > 0 ise kendiliğinden gerçekleşir
Evren daima düzensiz duruma gider
Bir sistem min entalpi, max entropiye sahip olma eğilimindedir
Isı transferi yüksek sıcaklıktan düşük sıcaklığa doğrudur
Termodinamiğin üçüncü kanunu
Mutlak sıfırda (-273 santigrat) entropi sıfırdır
Serbest enerji (G)
Sistemde yararlı olan enerjidir
ΔG Pozitif ise endergonik
Negatif ise ekzergonik
Entalpi (H)
Reaksiyon sisteminin ısı değeri
Reaktant ve ürünlerin kimyasal bağlarının sayı ve türünü yansıtır
ΔH pozitif ise endotermik
negatif ise ekzotermik
Entropi (S)
Düzensizlik
Entropi artıyorsa kendiliğinden
Dengeye yaklaşıldıkça entropi max olur
Entropi kapalı sistemlerde incelenir
İç Enerji (E)
Çekirdek içi enerji Elektronik enerji Öteleme enerjisi Dönme enerjisi Titreşim enerjisinden oluşmaktadır
Moleküllerin en redükte hallerinden, en okside hallerine doğru sıralanması
Alkan > Alkol > Aldehid/Keton > Karboksilli Asit > Karbondioksit
Nükleofiller
Çekirdek seven Elektronca zengindirler ve bu elektronları verme eğilimleri vardır Oksijen radikalleri Sülfür iyonu Karbanyon Yüksüz amino grubu İmidazol Hidroksil iyonu
Elektrofiller
Elektron seven Elektronca fakirdirler ve elektron elde etmeye çalışırlar Karboksil grubu karbon atomu Protone imino grubu Fosfat grubundaki fosfor Proton
Sitrik asit siklusuna katılan molekül
Asetil Coa
Yağ asitleri hangi olayla Asetil Coa’ya dönüşür
B-oksidasyon
ATP’nin işe karıştığı reaksiyonları hangi enzimler katalizler
Kinaz enzimleri
Kofaktörü Mg+2
Yüksek enerjili bileşikler
Pirofosfatlar Enolfosfatlar Acilfosfatlar Tiyolfosfatlar Guanido fosfatlar veya fosfojenler
Pirofosfatlar
Enerjili bağ “asit anhidrit bağı”dır
Asit gruplarının (genelde fosforik asit) birleşmesiyle oluşurlar
ATP ve pirofosfat
Enolfosfatlar
Enolfosfat bağı taşır
Hem OH- grubu hem de çift bağ taşır
Fosfoenolpiruvat
ATPden daha yüksek enerji
Acilfosfatlar
Karboksil grubuna fosfat bağlanmasıyla oluşur
Glikoliz ara ürünleri 1,3 bifosfogliserat
Üre siklusundaki karbamoil fosfat
ATPden daha yüksek enerji