Biyokimya 6. Komite Flashcards

1
Q

Adenin Nükleotit Translokaz Sistemi

Adenin Nükleotit Taşıyıcı

A

ATP, ADP ve Pi mitokondri membranından geçemez
Mitokondride ADP girişini ve ATP çıkışını sağlayan taşıyıcı sistemdir
Mitokondri iç membranında bulunur
Antiport (zıt yön)
Yüksek enerji gerektiren bir işlemdir
Atraktilozid ve bongrekik asit ile inhibe olur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Fosfat Translokaz Sistemi

Fosfat Taşıyıcısı

A

Pi (H₂PO₄−) ve protonu (H+) mitokondri matriksine taşır
Simport (aynı yön)
Mitokondri iç membranında bulunur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Malat - Aspartat Şantı

A

Karaciğer, böbrek ve kalpte bulunur
Sitoplazmadaki NADH’ları mitokondriye taşır
Taşıma sırasında NAD+ kullanır
Mitokondri iç membranında bulunur
1- Sitoplazmada malat, dehidrogenaz enzimi ile oksaloasetat malata dönüşür
2- Malat kendi taşıyıcı sistemiyle mitokondri iç membranından geçer
3- Malatla mitokondri içine taşınan protonlar (H) NAD’lara aktarılarak NADH oluşturulur
4- Matriksteki mitokondrial malat dehidrogenaz ile malat, oksaloasetata ardından aspartata dönüşür ve mitokondri dışına atılır
NADH’ların taşıdığı elektronlar Kompleks I’e aktarılır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Gliserol - Fosfat Şantı

A

Beyin ve iskelet kasında bulunur
Mitokondri iç membranında bulunur
1- Sitoplazmik gliserol 3-fosfat dehidrogenaz enzimi ile Dihidroksi aseton fosfat, Gliserol 3-fosfata dönüşür
2- Reaksiyon sırasında gliserol 3-fosfat dehidrogenaz vasıtasıyla NADH’ların elektronları Gliserol 3-fosfata aktarılır
3- Gliserol 3-fosfat mitokondri intermembran aralığa geçerek iç zarın dış tarafında bulunan gliserol 3-fosfat dehidrogenaz ile dihidroksi aseton fosfata dönüşürken elektronlarını FAD’a aktarır ve FADH2 oluşturur
4- FADH2 elektronları Koenzim Q’ya aktarır ve elektronlar ETZ’ye katılmış olur
Elektronlar Kompleks 1 veya 2’ye uğramadan direk koenzim Q üzerinden ETZ’ye dahil olur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Kreatin - Fosfat Taşıyıcısı

A

Mitokondri dış membranda bulunur
ATP matriksten intermembran aralığa Adenin nükleotit taşıyıcısı ile burada sitoplazmaya ise Kreatin - Fosfat şantı ile geçer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Termodinamiğin sıfırıncı kanunu

A

İki cisim üçüncü bir cisimle aynı sıcaklıktaysa bu iki cismin sıcaklıkları eşittir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Termodinamiğin birinci kanunu

A

Enerji korunur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

1 cal kaç joule’a eşittir

A

1 cal = 4,187 j

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Termodinamiğin ikinci kanunu

A

Kendiliğinden gerçekleşen süreçlerde sistem ve çevrenin toplam entropisi artar
ΔS > 0 ise kendiliğinden gerçekleşir
Evren daima düzensiz duruma gider
Bir sistem min entalpi, max entropiye sahip olma eğilimindedir
Isı transferi yüksek sıcaklıktan düşük sıcaklığa doğrudur

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Termodinamiğin üçüncü kanunu

A

Mutlak sıfırda (-273 santigrat) entropi sıfırdır

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Serbest enerji (G)

A

Sistemde yararlı olan enerjidir
ΔG Pozitif ise endergonik
Negatif ise ekzergonik

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Entalpi (H)

A

Reaksiyon sisteminin ısı değeri
Reaktant ve ürünlerin kimyasal bağlarının sayı ve türünü yansıtır
ΔH pozitif ise endotermik
negatif ise ekzotermik

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Entropi (S)

A

Düzensizlik
Entropi artıyorsa kendiliğinden
Dengeye yaklaşıldıkça entropi max olur
Entropi kapalı sistemlerde incelenir

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

İç Enerji (E)

A
Çekirdek içi enerji
Elektronik enerji
Öteleme enerjisi
Dönme enerjisi
Titreşim enerjisinden oluşmaktadır
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Moleküllerin en redükte hallerinden, en okside hallerine doğru sıralanması

A

Alkan > Alkol > Aldehid/Keton > Karboksilli Asit > Karbondioksit

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Nükleofiller

A
Çekirdek seven
Elektronca zengindirler ve bu elektronları verme eğilimleri vardır
Oksijen radikalleri 
Sülfür iyonu
Karbanyon
Yüksüz amino grubu
İmidazol
Hidroksil iyonu
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Elektrofiller

A
Elektron seven
Elektronca fakirdirler ve elektron elde etmeye çalışırlar
Karboksil grubu karbon atomu
Protone imino grubu
Fosfat grubundaki fosfor
Proton
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Sitrik asit siklusuna katılan molekül

A

Asetil Coa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Yağ asitleri hangi olayla Asetil Coa’ya dönüşür

A

B-oksidasyon

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

ATP’nin işe karıştığı reaksiyonları hangi enzimler katalizler

A

Kinaz enzimleri

Kofaktörü Mg+2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Yüksek enerjili bileşikler

A
Pirofosfatlar
Enolfosfatlar
Acilfosfatlar
Tiyolfosfatlar
Guanido fosfatlar veya fosfojenler
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Pirofosfatlar

A

Enerjili bağ “asit anhidrit bağı”dır
Asit gruplarının (genelde fosforik asit) birleşmesiyle oluşurlar
ATP ve pirofosfat

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Enolfosfatlar

A

Enolfosfat bağı taşır
Hem OH- grubu hem de çift bağ taşır
Fosfoenolpiruvat
ATPden daha yüksek enerji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Acilfosfatlar

A

Karboksil grubuna fosfat bağlanmasıyla oluşur
Glikoliz ara ürünleri 1,3 bifosfogliserat
Üre siklusundaki karbamoil fosfat
ATPden daha yüksek enerji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Tiyolfosfatlar

A

Yüksek enerjili fosfat bağı yerine tiyoester bağı vardır
Bu bağ tiyol (-SH) ile karboksil grubu arasındadır
Asetil Coa

26
Q

Guanido Fosfatlar veya Fosfojenler

A

Guanidofosfat bağı vardır
Fosfat grubu guanido grubuna bağlanır
Fosfokreatin

27
Q

Yüksek enerjili bileşikler

A
Fosfat bileşikleri
Fosfoenolpiruvat
Karbamoil fosfat
1,3 bifosfogliserat
Kreatin fosfat
    Kükürtlü bileşikler
Coa türevleri
28
Q

Düşük enerjili bileşikler

A
Glikoz-1-fosfat
Fruktoz-6-fosfat
Glukoz-6-fosfat
Gliserol-3-fosfat
Pirofosfat
29
Q

ATPnin kısa süreli depolanmasını sağlayan molekül

A

Fosfojen
Kreatin fosfat
Arjinin fosfat (omurgasızlar)

30
Q

Adenilat kinaz (miyokinaz)

A

Adenin nükleotitleri birbirine dönüştüren enzim

örn. ATP + AMP > 2ADP

31
Q

ATPnin AMPye dönüşümü

A

Yağ asidinin aktivasyonunda görülür

2 ATP kullanıldığı kabul edilir

32
Q

Yağ asidi aktivasyonu

A

2 ATP kullanılır
Sitoplazmada gerçekleşir
Tiyokinaz enzimi tarafından katalize edilir

33
Q

Nükleozid difosfokinaz

A

ATP dışındaki nükleozid trifosfatların oluşumunu katalize eder
örn. ATP + UDP > ADP + UTP

34
Q

Perimitokondriyel boşluk

A

Mitokondri membranları arası boşluk

Yüksek proton konsantrasyonuna sahip

35
Q

Mitokondri iç membranı

A

En yüksek protein oranına sahip membran %70

36
Q

Mitokondri iç membranın geçirgenliğini kısıtlayan molekül

A

Kardiolipin

37
Q

Mitokondrinin görevleri

A

Oksidatif fosforilasyon (ATP üretimi)
Hücresel solunum (ETZ)
Sitrik asit siklusu (TCA)
Porfirin metabolizmasının ilk ve son üç tepkimesi
Karaciğerde üre siklusunun ilk iki basamağı
Yağ asitlerinin başlıca yıkımı olan B-oksidasyon
Karaciğerde keton cisim sentezi
Karaciğer dışı dokularda keton cisim yıkımı

38
Q

Permeaz

A

Zarda maddelerin taşınmasını sağlayan transport proteinleri

39
Q

Oksidasyon (Yükseltgenme)

A

Elektron kaybı
Hidrojen kaybı
Oksijen ilavesi
Dehidrojenasyon da denir

40
Q

Redüksiyon (İndirgenme)

A

Elektron kazancı

41
Q

Redüktan

A

Elektron verici

İndirgen

42
Q

Oksidan

A

Elektron alıcı

Yükseltgen

43
Q

Standart indirgenme potansiyeli

A

25 derecede pH=7de redoks çiftlerinin 1M konsantrasyonlu çözeltilerinin ölçülen potansiyel farkı
Hidrojene göre elektron ilgisi fazla olanların standart indirgenme potansiyeli pozitiftir

44
Q

NADH + H+

A

1 hidrojeni hidrür olarak alır diğer hidrojeni H+ olarak verir

45
Q

NADH ve NADPH özellikleri

A

Dehidrojenaz enzimlerinin koenzimleridir
Reaktif kısmı nikotinamid kısmıdır
Suda çözünür
Enzime gevşek bağlıdır
Aldıkları iki H atomundan birini Hidrür olarak alır diğerini H+ olarak ortama verir
NADH katabolik, NADPH anabolik reaksiyonlarda elektron taşır

46
Q

NAD+ ve NADP+ yı koenzim olarak kullanan enzim

A

Glutamate dehidrogenaz

47
Q

FMN ve FAD özellikleri

A

Flavinli dehidrogenazlar tarafından koenzim olarak kullanılırlar
Enzime sıkıca bağlıdır
Suda çözünürler
Reaktif kısmı izoalloksazin halkasıdır
H atomu şeklinde bir veya iki elektron transferi yapabilirler

48
Q

Ubikinon (koenzim Q) özellikleri

A

Yağda çözünür

Küçük ve hidrofobik olduğu için mitokondri membranından kolayca geçebilir

49
Q

Sitokromların özellikleri

A

Prostetik grup olarak demir-porfirin bileşiği olan hem içeren elektron taşıyıcı proteinlerdir
Membranlara ve birbirlerine sıkıca bağlıdırlar
Sitokrom C mitokondrial iç membranın dış kısmına gevşek olarak bağlıdır
Bir elektron taşırlar
Sitokrom oksidaz bakır içerir

50
Q

Antioksidan enzimler

A

Süperoksit dismutaz
Katalaz
Glutatyon peroksidaz

51
Q

Oksidoredüktaz enzimler

A

Oksidazlar
Oksijenazlar
Dehidrogenazlar
Hidroperoksidazlar

52
Q

Hangi maddenin varlığında oksidasyon devam ederken ATP sentezi yavaşlar veya durur

A

Dinitrofenol

53
Q

Bir hücrede ATP/ADP ve NAHDH/NAD+ oranları yüksek ise hangi olaylar gerçekleşir

A

ATP sentezi azalır
Yağ asitlerinin Asetil-Coa’ya dönüşümü (b-oksidasyon) yavaşlar
Piruvatın, oksaloasetata dönüşümü hızlanır
İzositratın, a-ketoglutarata dönüşümü yavaşlar

54
Q

Kompleks 1’den Koenzim Q’ya (ubikinon) elektron akışını inhibe eden madde

A

Rotenon

55
Q

H pompalamayan kompleks hangisi

A

Kompleks 2

56
Q

Süksinat dehidrogenazın (kompleks 2) yarışmalı inhibitörü

A

Malonat

57
Q

Kompleks III inhibitörü

A

BAL, antimisin A

58
Q

Kompleks IV inhibitörü

A

Siyanür
Karbonmonoksit
Hidrojen sülfür

59
Q

Kompleks V inhibitörü

A

Oligomisin

60
Q

Elektron taşıma zinciri sırası

A
NADH
Koenzim Q
Sitb
Sitc
Sitaa3
Oksijen
61
Q

ΔG < 0 ise

A

Tepkime kendiliğinden yürür