Biologie - IV - A - Génétique - vocabulaire Flashcards
Génome
-Définition historique (->matière) : Ensemble des molécules d’ADN présentes dans une cellule ou un organisme
Etym: Gène+chromosome
- Nouvelle def (->information) : Ensemble de l’information génétique <i> (stable -> ADN et pas ARN) </i> d’une cellule/d’un organisme
- Programme : Ensemble des molécules d’ADN d’une cellule et de l’information génétique qu’elle porte
Métagénome
Génomes de l’organisme considéré et du microbiote associé (ex: vache + son microbiote)
Transcriptome
Ensemble des ARN présents à un moment donné dans une cellule
Parfois : juste les ARN informationnels –> messager, régulateur
Protéome
Ensemble des protéines présentes à un moment donné dans une cellule
Génotype
Combinaison particulière d’allèles spécifiques d’un individu
Souvent : on s’intéresse à un génome partiel
Gène
“Un gène, une protéine” –> “un gène, une protéine, mais pas que”
Unité d’information génétique héréditaire, portée par l’acide nucléique génomique, dont le support est:
- l’ensemble des séquences précises et ordonnées des nucléotides codant au moins une chaîne polypeptidique ou un ARN non traduit
- l’ensemble des séquences nécessaires à son expression
Allèle
Version alternative d’un gène
=version alternative d’une unité d’information génétique héréditaire, portée par l’acide nucléique génomique, dont le support est:
-l’ensemble des séquences précises et ordonnées des nucléotides codant au moins une chaîne polypeptidique ou un ARN non traduit
-l’ensemble des séquences nécessaires à son expression
Nucléoïde
Territoire limité du procaryote dans lequel est situé l’ADN -> microenvironnement fonctionnel du génome
L’ADN y est sous forme de boucles super enroulées
Mésosome
Contact entre la membrane plasmique et l’ADN chez un procaryote
Génome chromosomique (procaryotes)
Obligatoire
Génome sous forme de chromosomes, circulaires la plupart du temps/stabilisés aux extrémités quand linéaires (par des structure de type télomère)
Gènes vitaux
E.coli : un seul chromosome circulaire
Génome extrachromosomique (procaryotes)
Facultatif
-> <b> Plasmides </b> : Une molécule d’ADN double brin, circulaire ; monocopie ou multicopie
Comporte :
-Une <b> ORI </b> = origine de démarrage de la réplication
-Un gène/Une association moléculaire de gènes
-De 1000 nt à Mb
Gènes de :
- Résistance
- Toxicité (pour autres microorganismes)
- Fertilité
- Voies métaboliques particulières
Il existe des <b>mégaplasmides</b> qui codent des gènes vitaux
ORF = Phase ouverte de lecture
Succession de codons suffisamment longue (sans codon stop) pour laisser penser qu’une protéine pourrait être codée par la séquence
E.coli : on a identifié 4600 ORF dont :
- 54% fonction connue, dont 300 protéines de transport + 150 putatives
- 32 % fonction prédite in silico
- 14% inconnu
Gènes paralogues
Gènes appartenant à une même famille
Pseudogènes
Gène inactif au sein d’un génome
“gène fossile”
Opéron
Regroupement fonctionnel de gènes impliqués dans la même voie métabolique
Mise en commun des signaux : opérateur
L’ensemble de ces gènes est transcrit en bloc en un <b>ARNm polycistronique</b> -> lu par des ribosomes à partir du premier gène <i>(site de fixation -> forte affinité pour les ribosomes)</i>, se raccrochent au suivant (ou pas forcément)
Génome extranucléaire = extrachromosomique (eucaryotes)
Génome des mitochondries et des plastes
Il peut y avoir transfert de gènes horizontal
cf Théorie endosymbiotique
cf Théorie des Eve mitochondriales
Génome nucléaire (eucaryotes)
Génome dans le noyau (pdt l’interphase, sinon en vrac)
Chromosome
Support cellulaire du génome nucléaire
<i>Edifice supramoléculaire formé de :</i>
- 1 molécule linéaire d’ADN double brin/ 2 identiques entre elles
- Au moins une origine de réplication
- Les protéines associées à l’ADN : histones et PNH
- Un <b>centromère</b> et deux <b>télomères</b>
-> ADN + protéines : 1 ou 2 <b>chromatides</b>
</i>
Chromatide
Edifice supramoléculaire formé de :
- 1 molécule linéaire d’ADN double brin/ 2 identiques entre elles
- Au moins une origine de réplication
- Les protéines associées à l’ADN : histones et PNH
- Un <b>centromère</b> et deux <b>télomères</b>
-> ADN + protéines : 1 ou 2 <b>chromatides</b>
Chromatine
- Complexe présent dans le noyau des cellules eucaryotes, formé par l’ADN, les histones, les PNH, voire de l’ARN
- Matériau dont sont faits les chromosomes interphasiques
- Ensemble des chromosomes interphasiques, plus ou moins condensés
=Support cellulaire du génome nucléaire dans une cellule interphasique
Protéines histones
Protéines impliquées dans la compaction de l’ADN
H1 H2A H2B H3 H4
protéines basiques
N terminal : acides aminés modifiables -> sérines/thréonines acétylations, phosphorylations, méthylations
C terminal court non modifiable (sauf H1)
Valeur C
Taille du génome haploïde
Taille (en microm) du nucléoïde d’E.coli, d’étalé à enroulé
- Forme la plus étalée : boucle de 450 microm de diamètre
- organisation en domaines (environ une 50aine de domaines) : 50microm
- superenroulement des domaines : 1 microm
