Biologie et classification des virus Flashcards
Vrai ou Faux: les virus sont considérés comme étant vivants
Faux!
À défaut d’être vivants, les virus sont plutôt des… (3 éléments)
… parasites intracellulaires obligatoires
Les virus sont incapables de faire 2 choses très importantes, quelles sont ces 2 choses?
- Synthétiser des protéines
- Produire de l’énergie par eux-mêmes (en dehors d’une cellule)
Dans quelles conditions les virus peuvent-ils produire de l’énergie?
Lorsqu’ils sont à l’intérieur d’une cellule
Quels sont les 6 types d’organismes pouvant être infectés par des virus?
- Insectes
- Poissons
- Plantes
- Reptiles
- Mammifères
- Bactéries/bactériophages
Malgré qu’une grande variété d’organismes puissent être infectés par les virus, qu’y a-t-il de particulier quant à la transmission? (2 éléments qui se ressemblent énormément)
- Un humain ne donnera en général un virus qu’à un autre humain (et non à un animal, une plante…)
- Inversement, un virus qui touche une plante ou un poisson ne peut pas être attrapé par un humain
Que peut-on dire sur la taille des virus par rapport à celle des bactéries?
Ils ont une taille beaucoup plus petite que les bactéries (ils sont non visibles au microscope optique)
Les plus petits virus se nomment (1) et mesurent (2) nanomètres
- Parvovirus
2. 18
Les plus gros virus se nomment (1) et mesurent (2) nanomètres
- Poxvirus
2. 300
Comment pourrait-on résumer en bref le “rôle” d’un virus?
Dès qu’il sort d’une cellule qu’il a infecté, le virus doit rentrer dans une autre cellule pour l’infecter et se multiplier de proche en proche
Comment appelle-t-on la partie virale d’un virus?
Virion
De quoi est composé un virion (3 éléments)?
- Génome viral
- Capside
- Enveloppe (membrane), CERTAINS SEULEMENT
De quoi le génome viral est-il composé?
D’ADN ou d’ARN, mais pas les deux
Quelle est la composante d’un virus qui n’est pas “obligatoire” (donc que tous les virus ne possèdent pas nécessairement)?
Enveloppe (membrane)
Quelles sont les 3 composantes de l’enveloppe (membrane) d’un virus?
- Composante interne
- Composante externe
- Spikes, CERTAINS SEULEMENT
De quoi est composée la composante interne de l’enveloppe virale?
Protéines virales et structurales
De quoi est composée la composante externe de l’enveloppe virale?
Lipides
De quoi sont composés les spikes de l’enveloppe virale?
Glycoprotéines
D’où provient la composante interne de l’enveloppe virale?
Elle est générée par le virus lui-même
D’où provient la composante externe de l’enveloppe virale?
Elle provient de la cellule où le virus s’est multiplié
Quels seraient 3 exemples de virus possédant des spikes?
- Influenza (virus de la grippe)
- VIH
- COVID-19
Quels sont les 3 éléments de la structure d’un virus nu?
- Capside
- Génome d’ADN ou d’ARN
- Nucléocapside (capside et génome)
De quoi est composé la capside d’un virus?
De protéines
À quoi ressemblerait une représentation d’un virus nu? (L’objectif ici est de savoir identifier à quoi correspond le virion VS le nucléocapside)
Quels sont les 5 éléments de la structure d’un virus enveloppé?
- Capside
- Génome d’ADN ou d’ARN
- Nucléocapside (capside et génome)
- Enveloppe (composante interne + externe)
- Spikes de glycoprotéines
À quoi ressemblerait une représentation d’un virus enveloppé? (L’objectif ici est de savoir identifier à quoi correspond le virion VS le nucléocapside)
Un virus nu possède une forme…
… icosaédrique
Quel est le premier critère (le plus important) selon lequel on peut classer les virus
Leur génome
Quelles sont les 2 classes de virus selon le génome?
- ADN
- ARN
Quelles sont les 4 classes de virus selon la forme?
- Icosaèdre
- Sphérique
- Filamenteux
- Balle de fusil
Quel serait un exemple de virus icosaèdre?
Adénovirus
Quel serait un exemple de virus sphérique?
Coronavirus
Quel serait un exemple de virus balle de fusil?
Rage
La réplication virale suit un phénomène de…
… clé-serrure (le virus doit trouver la serrure à sa clé)
Quelles sont les 6 étapes de réplication virale (mots-clés)?
- Attachement
- Pénétration du virus dans la cellule
- Décapsidation et libération du génome
- Transcription et réplication
- Assemblage
- Libération
Un virus peut-il s’attacher à n’importe quelle cellule (étape 1 de la réplication virale)?
Non!
Quels sont les 2 éléments nécessaire à l’attachement du virus à la cellule (étape 1 de la réplication virale)?
- Protéine d’attachement sur le virus
- Récepteur sur la cellule
Quel serait un synonyme imagé de “décapsidation”?
Déshabillement
Lors de la décapsidation (étape 3 de la réplication virale), le génome est libéré et il…
… prend le contrôle de la cellule mère
Lors de la transcription et réplication (étape 4 de la réplication virale), la cellule…
… obéit aux ordres que le virus lui donne (ex: faire des copies du génome viral)
Que se passe-t-il lors de l’assemblage (étape 5 de la réplication virale)?
Le virus se recouvre des protéines synthétisées par la cellule
Vrai ou Faux: plusieurs virus peuvent sortir à la fois lors de l’étape de libération (#6) de la réplication virale
Vrai, la cellule est une usine très productive qui fait sortir plus d’un virus à la fois
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #1 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
3
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #2 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
1
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #2’ est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
2
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #3 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
1
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #3’ est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
2
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #4 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
3
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #5 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
3
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #6 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
3
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #7 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
3
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #8 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
1
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape #8’ est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
2
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape 9 est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
1
Sur cette image représentant la réplication virale, l’étape 9’ est-elle performée par…
- Les virus nus uniquement
- Les virus enveloppés uniquement
- Autant les virus nus que les virus enveloppés
2
Quelle est la différence majeure quand à la manière dont un virus nu VS un virus enveloppé entre dans la cellule?
Le virus nu entre par invagination de la membrane de la cellule alors que le virus enveloppé le fait par fusion de sa membrane avec celle de la cellule
Quelle est la différence majeure quand à la manière dont un virus nu VS un virus enveloppé sort dans la cellule?
Un virus nu nécessaire que la cellule explose (lyse) pour pouvoir sortir) alors qu’un virus enveloppé peut sortir en douceur par exocytose sans faire de lyse
En général, les virus ARN se répliquent dans le (1) alors que les virus ADN se répliquent dans le (2)
- Cytoplasme
2. Noyau
Quel serait un exemple de rétrovirus?
VIH
De quel type de génome les rétrovirus sont-ils?
ARN
Quel élément crucial les rétrovirus possèdent ils?
Une transcriptase inverse
Que fait la transcriptase inverse d’un rétrovirus?
Elle permet de produire un brin d’ADN à partir de l’ARN viral (le virus transcrit son ARN, mais le transforme en ADN virale et l’intègre dans le génome humain)
Quel “super-pouvoir” la transcriptase inverse confère-t-elle aux rétrovirus et comment est-ce possible?
Elle permet de mettre le rétrovirus à l’abris du système immunitaire (lorsque l’ARN transcrit est transformé en ADN virale puis intégré dans le génome humain, on ne peut plus en guérir)
Quelles sont les 3 catégories d’hôtes selon lesquelles on peut classer les virus?
- Animal (humain, souris, oiseau)
- Plantes
- Bactéries
Comment appelle-t-on les virus des bactéries?
Bactériophages
Quelles sont les 4 façons de classer les virus en se basant sur la structure?
- Selon la taille
- Selon la morphologie
- Selon le génome/acide nucléique (ADN ou ARN)
- Nu ou enveloppé
Quels sont les 2 virus ADN enveloppés?
- Herpesviridae
- Hépatite B
Quels sont les 3 virus ADN nus?
- Virus du papillonne humain (VPH)
- Adénovirus
- Parvovirus B19
Quels sont les 8 virus ARN enveloppés?
- Virus respiratoire syncytial
- Coronavirus
- Virus de la rougeole
- Virus de l’influenza
- Virus de la rubéole
- VIrus des oreillons
- VIH
- Virus de l’hépatite C
Quels sont les 6 virus ARN nus?
- Calicivirus
- Virus de l’hépatite A
- Rhinovirus
- Astrovirus
- Rotavirus
- Entérovirus
Quels virus sont les plus nombreux entre les ARN et les ADN?
ARN
Quels virus sont les plus responsables des pandémies entre ARN et ADN?
ARN
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: VPH
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
2
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: rotavirus
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
4
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Hépatite B
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
1
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Parvovirus B19
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
2
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Coronavirus
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
3
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: virus des oreillons
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
3
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: VIH
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
3
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Herpesviridae
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
1
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Virus de l’hépatite C
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
3
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Astrovirus
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
4
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Calicivirus
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
4
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: virus de la rougeole
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
3
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: entérovirus
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
4
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Adénovirus
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
2
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: Virus de l’influenza
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
3
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: virus de la rubéole
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
3
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: rhinovirus
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
4
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: virus de l’hépatite A
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
4
De quelle catégorie de le virus suivant fait-il partie: virus respiratoire syncytial
- ADN enveloppé
- ADN nu
- ARN enveloppé
- ARN enveloppé
3
Caractéristiques des virus nus: sont-ils résistants?
Oui, ils sont très résistants
Caractéristiques des virus nus: on dit que les virus nus sont très résistants puisqu’ils sont (1), donc capables d’(2)
- Armés
2. Infecter les cellules plus longtemps
Caractéristiques des virus nus: quelles sont les 3 caractéristiques des virus nus qui démontrent leur grande résistance?
- Bonne survie dans l’environnement, même sur un objet inanimé (ex: comptoir)
- Résistance aux détergents
- Résistance au pH de l’estomac
Caractéristiques des virus nus: que peut-on dire sur les virus nus quant aux milieux de transport?
Les échantillons ne requièrent pas de milieux de transport spéciaux
Caractéristiques des virus nus: comment son-ils libérés de la cellule qu’ils infectent?
Lors de la lyse cellulaire (explosion de la cellule)
Caractéristiques des virus nus: quels sont les 4 modes de transmission possibles pour les virus nus?
- Contact direct
- Contact indirect (fomites)
- Gouttelettes
- Fécale-orale
Caractéristiques des virus enveloppés: quels sont déjà les 4 composantes de l’enveloppe de ces virus?
- Membrane
- Lipides
- Protéines
- Glycoprotéines
Caractéristiques des virus enveloppés: sont-ils résistants?
Non, leur membrane est fragile, ce qui les empêche d’être résistants aux conditions adverses de l’environnement
Caractéristiques des virus enveloppés: qu’arrive-t-il si la membrane d’un virus enveloppé est endommagée?
Le virus ne peut plus infecter une autre cellule
Caractéristiques des virus enveloppés: les virus enveloppés sont-ils sensibles à l’acidité gastrique?
Oui, ils sont facilement détruits par celle-ci
Caractéristiques des virus enveloppés: quels sont leurs 2 moyens de transmission principaux?
- Contact direct
- Goutelettes
Caractéristiques des virus enveloppés: comment les virus enveloppés sont-ils libérés de la cellule hôte? (2 options)
- Par bourgeonnement
- Lors de la lyse cellulaire
Caractéristiques des virus enveloppés: que peut-on dire sur les milieux de transport des virus enveloppés?
Il leur faut des milieux de transport pour préserver l’intégrité de l’enveloppe et permettre la culture virale en laboratoire
Qu’est-ce qu’un tropisme?
La tendance d’un virus à se multiplier (à croître) dans un tissu particulier
Quels sont les 3 types de virus ayant un tropisme particulier?
- Adénovirus
- Entérovirus
- Virus des hépatites A, B, C, D et E
Quel est le tropisme des adénovirus?
Adénoïdes
Quel est le tropisme des entérovirus?
Tractus digestif
Quel est le tropisme des virus des hépatites A, B, C, D et E?
Foie
Carte pas très importante: On peut aussi classer les virus selon leur capacité à être (1), ce qui donne les catégories (2) et (3)
- Cultivés en laboratoire
- Virus cultivables
- Virus non-cultivables
Une autre façon de classer sur les virus serait en se basant sur le… (#1)
… mode de transmission
Quel serait un exemple de catégorie de virus basée sur le mode de transmission (ainsi que le mode de transmission en question)?
Les arbovirus sont transmis via les arthropodes (piqûre de moustique)
Une autre façon de classer sur les virus serait en se basant sur les… (#2)
… manifestations cliniques qu’ils causent
Quelles seraient 4 catégories de classification des virus selon les manifestations cliniques?
- Jaunisse (ictère)
- Encéphalite (inflammation du cerveau)
- Diarrhée
- Virus exhanthémateux (éruption cutanée)
Quels seraient 2 types de virus causant la jaunisse (l’ictère)?
- Virus des hépatites A, B, C, D, E
- Virus de la fièvre jaune
Quels seraient 3 des symptômes associés à l’encéphalite?
- Perte de connaissance
- Perte de conscience
- Fièvre
Quels seraient 3 des symptômes associés aux virus exanthémateux (éruption cutanée)?
- Vésicules (cloches d’eau)
- Érythème ou macules (rougeurs plates sur la peau)
- Érythémato-papulaire ou macula-papulaire (rougeurs SURÉLEVÉES sur la peau)
Quels sont les 7 virus causant des éruptions de type rougeur?
- Virus de la rougeole
- Virus de la rubéole
- Virus herpès humain-6 (HHV-6) (roséole)
- Parvovirus B19 (5e maladie)
- EBV (mononucléose)
- Entérovirus
- VIH
Quels sont les 3 virus causant des éruptions de type vésicule?
- Virus varicella-zoster
- Virus herpès simplex
- Entérovirus
Quels sont les 4 outils diagnostics disponibles pour les infections virales?
- Culture virale
- Détection d’antigènes viraux
- Tests d’amplification d’acides nucléiques (TAAN)
- Sérologie virale
Quels sont les 4 éléments sur lesquels on peut performer une culture virale?
- Lésion cutanée (ex: vésicules)
- La partie rouge (érythème) d’une muqueuse (ex: gorge, vulve, col)
- Du liquide normalement stérile (ex: urine, LCR)
- Un tissu via une biopsie (ex: poumon, foie, rein)
Vrai ou faux: la culture virale s’applique à du sang?
Faux
Une fois l’échantillon prélevé et mis dans un milieu de transport (si nécessaire), quelles sont les 2 étapes de la culture virale?
- Déposer une partie de l’échantillon sur des CELLULES VIVANTES (et non des géloses) à 37ºC
- Examiner au microscope les cellules vivantes à chaque jour pendant 14 jours à la recherche d’une modification du tapis cellulaire révélant la présence d’un virus (effet cytopathique)
Dans une culture virale, qu’est-ce qu’un effet cytopahtique et que cela signifie-t-il?
Un effet cytopathique est lorsque les cellules de la culture se détachent et deviennent brillantes, révélant ainsi la présence d’un virus dans la culture
Vrai ou faux: la culture virale est une technique en plein essor
Faux! Il s’agit d’une technique en voie de disparition
Quelles sont les 6 raisons pour lesquelles la culture virale est une technique en voie de disparition?
- Peu disponible au Québec
- Long
- Coûteux
- Nécessité d’assurer les conditions de transport pour assurer la viabilité du virus présent dans l’échantillon
- Moins sensible que les TAAN
- Plusieurs virus ne sont pas cultivables dans les cellules de laboratoire
Pourquoi dit-on que la culture virale est une technique longue?
Il est très rare qu’un virus pousse en 2 jours comme l’herpès; d’habitude, cela prend plutôt aussi longtemps qu’un mois
Pourquoi dit-on que la culture virale est une technique coûteuse (2 raisons)?
- Besoin de technologistes spécialisés
- Besoin d’acheter des cellules vivantes
Quel serait un exemple de virus dont la détection se fait par recherche d’antigènes viraux?
Influenza
Quelle est la toute première étape de la technique de recherche d’antigènes viraux?
Le prélèvement
Lorsqu’on dispose d’un tel dispositif de test, quelles sont les 6 étapes d’une recherche d’antigènes viraux?
- Déposer l’échantillon du patient dans les cupules du bas
- À gauche, déposer le réactif A qui contient es Ac anti-influenza A couplés à une enzyme
- À droite, déposer le réactif B qui contient es Ac anti-influenza B couplés à une enzyme
- Lavage
- Déposer le réactif C qui contient le substrat de l’enzyme
- Observer la réaction (recherche d’une 2e bande rose sur le T, le C étant “contrôle”)
La recherche d’antigènes est très utile dans le diagnostic de (1), de (2) et de (3)
- Certains parasites
- Certaines bactéries
- Plusieurs mycoses
Quels sont 2 exemples de parasites pour lesquels la recherche d’antigènes est très utile?
- Malaria
- Trichomonas vaginalis
Quel serait un exemple de bactérie pour lequel la recherche d’antigènes est très utile?
Legionella
Quels seraient 2 exemples d’échantillons prélevés sur lesquels ont peut faire une recherche d’antigènes?
- Sérum
- Nez/nasopharynx/gorge
Quels seraient 2 virus qu’on pourrait rechercher via recherche d’antigènes sur sérum?
- AgHBs (virus de l’hépatite B)
- Ag p24 du VIH
Quel serait un exemple de virus qu’on pourrait rechercher via recherche d’antigènes sur échantillon nasal/gorge/nasopharyngé?
SRAS-CoV-2 (COVID-19)
Vrai ou faux: la recherche d’antigènes viraux est une technique en plein essor
Faux
Quelles sont les 2 raisons pour lesquelles la recherche d’antigènes viraux est une technique en voie de disparition?
- Moins sensible que les TAAN
- Applicable à peu de virus
Exemple de la recherche d’antigènes viraux pour SARS-CoV-2: au Québec, qui sont les seuls à pouvoir en bénéficier?
Personnes symptomatiques
Exemple de la recherche d’antigènes viraux pour SARS-CoV-2: si on compare la recherche d’antigènes avec un TAAN, quels sont les 2 avantages attribuables au TAAN?
- Plus sensible (moins de faux négatifs)
- Plus spécifique (moins de faux positifs)
Quelles sont les 2 exceptions de virus pour lesquelles la recherche d’antigènes viraux est très efficace et n’est pas en voie de disparition?
Les virus que l’on recherche via le sérum:
- Hépatite B (AgHBs)
- Ag p24 du VIH
Vrai ou faux: les TAAN sont une technique de détection en plein essor
Vrai
Vrai ou faux: les TAAN sont applicables à tous les virus
Faux, ils s’appliquent à beaucoup de virus, mais pas tous
Les TAAN sont-ils coûteux?
Oui
Les TAAN s’effectuent-ils rapidement?
Techniquement, oui (en moins de 24h), mais…
- Il n’existe que quelques laboratoires désignés par le MSSS (CHUSJ, CHUM…)
- Le transport vers ces laboratoires peut être long
- Il faut du personnel très spécialisé (technicien et biologiste moléculaire) qui ne sont pas toujours disponibles
- Le matériel peut être lent
… donc non, ce n’est pas très rapide
En quoi consiste la sérologie virale en tant que telle?
La recherche d’anticorps (ou d’antigènes) dans le sérum des patients
Cinétique de la production d’anticorps: quels Ig apparaissent en premier et pendant combien de temps sont-ils présents?
Les IgM apparaissent en premier et sont présents de façon transitoire
Cinétique de la production d’anticorps: quels Ig sont présents lors de la première exposition?
- Les IgM forment un pic de présence lors de la première exposition
- Les IgG augmentent tranquillement à partir de la première exposition
Cinétique de la production d’anticorps: comment nomme-t-on les Ig qui sont présents à long terme?
Les IgG apparaissent un peu plus tardivement mais persistent après la guérison
Si, lors d’une sérologie virale, on détecte un résultat Ac IgM +, que cela signifie-t-il?
L’infection est récente
Quels sont les 8 virus pour lesquels une sérologie IgM est disponible dans les laboratoires hospitaliers? (HH, RRO, CMVEBV B19)
- Cytomégalovirus (CMV)
- Virus Epstein-Barr (EBV)
- Virus des oreillons
- Virus de la rougeole
- VIrus de la rubéole
- Parvovirus B19
- Virus de l’hépatite A
- Virus de l’hépatite B (anti–HBc IgM)