biokemija završni Flashcards
kod transvera signala za razgradnju masti koje je puno ime sekundarnog glasnika
ciklički adenozin monofosfat
kod transvera signala za razgradnju masti koje je ime enzima kojim se aktivira ciklički adenozin monofosfat
adenilat ciklaza
koji je naziv enzima koji razgrađuje masti
lipaza
Za što se koriste masne kiseline u beta oksidaciji
za dobivanje energije
Koji je nosač aktivirane masne kiseline kroz mitohondrijsku membranu
karnitin
Koja su dva završna produkta u jednok krugu beta oksidacije masnih kiselina
acetil koenzim i acilkoenzim
koji organi ne mogu metabolizirati ketonska tijela tj stanice bez mitohondrija ili aktiv Ec
eritrociti i jetra
Myastenia gravis je bolest koja je opisana kod foxterijera, španijela i Jack Russell terijera. Životinje imaju tešku mišićnu slabost, koja je posljedica nedostatka acetilkolina u mišićima.
U terapiji se može upotrijebiti
physostigmin, kompetitivni inhibitor acetilkolinestraze
što se događa povećanjem acetilkolina u mišićima
smanjuje se učinkovitost pshysostigmina
pshysostigmin je
strukturni analog pravom supstratu
Kada se Michaelsonova konstanta prividno povećava
nakon terapije
Koje su dvije isključivo ketogene aminokiseline
LEU, LYZ - leucin i lizin
. Aktivnost enzima ______________ se regulira interkonverzijom pomoću fosforilacije/defosforilacije, pri čemu je _______________. _________ u acetil CoA karboksilazi je mutacijom zamijenjen za ________. Koja je moguća posljedica takve mutacije?
acetil CoA karboksilaze, nefosforilirani enzim aktivan, Serin, alanin
Moguća posljedica nakon takve mutacije debljanje, alanin nije aminokiselina koja se fosforilira, fosforilacija znači prekid signala pošto je nefosforilirani enzim stalno aktivan, nema prekida signala time je kontinuirana aktivnost enzima koji sudjeluje u sintezi masti, nastaje nekontrolirana akumulacija masti i time debljanje
Visoka koncentracija beta-hidroksibutirata u serumu mliječnih krava znači da:
u energetskom metabolizmu dominira razgradnja masnih kiselina
mozak koristi ketonska tijela za svoje energetske potrebe
da se krave ne shrane sukladno sa povećanim energetskim potrebama u laktaciji
koji je enzim inhibiran malonatom
fumaraza
peptidna veza
karakter parcijalne dvostruke veze, jeigidna je i ne omogućava reakciju na tom mjestu, cjepaju je enzimi peptidaze
Omjer količina RNA/DNA za albumin je različit kod različitih vrsta životinja.
miš 4.45 štakor 3.05 krava 1.29 Koja od ove tri životinje ima najkraće poluvrijeme života albumina?
miš
koji su moguči načini oksidacije nadh u organizmu
aerobno laktatom i aerobno oskidativnom foaforilacijom
svojsttva methehemoglobina
Fe u oksidacijskom stanju 3+, histin na petoj koordinacijskoj poziciji Fe, voda na 6. koordinacijskoj poziciji
svojstva oksimioglobins
Fe u oksidacijskom stanju 2+, histin na 5. koordinacijskoj poziciji Fe, kisik vezan na 6. koordinacijskoj pozicji Fe
svojstva deoksihemoglobina
Fe u oksidacijskom stanju 2+,histin na 5. koordinacijskoj poziciji Fe, slobodna 6. koordinacijska pozicija
Heksokinaza i glukokinaza imaju neke sličnosti i različitosti. Ukoliko je tvrdnja točna za heksokinazu i/ili glukokinazu, upiši HK ili GK (ili oboje) kod odgovarajućeg navoda.
nalazi se u jetri
nalazi se u nehepatičkim tkivima
zahtijeva ATP u reakciji
ima visoki Km za glukozu
inhibirana je glukoza 6- fosfatom
nalazi se u jetri - GK
nalazi se u nehepatičkim tkivima- HK
zahtijeva ATP u reakciji - HK, GK
ima visoki Km za glukozu - GK
inhibirana je glukoza 6- fosfatom - HK
Prikaži na odgovarajućem mjestu odgovarajuće posttranslacijske modifikacije koje su neophodne za pravilno funkcioniranje kolagena
na prolinu se prvo odvija hidroksilacija, pa glikolizacija –> H- C- O - glukoza
rezultat glikolize ukoliko su uvjeti u
stanici anaerobn
laktat
enzim koji katalizira glikolizu
ldg - laktat dehidrogenaza
rezultat glikolize u aerobnom
acetil koenzim A
Navedi puni naziv enzima aerobnog puta metabolizma piruvata i navedi sve kofaktore i koenzime koji
sudjeluju u reakciji.
piruvat dehidrogenaza, tiamin oirfosfat, koenzim a, liponska kiselina, flavin adenin dinukleotid, nikotinamin adenin dinukleotid
konverzija laktata u piruvat odvija se u
jetri gdje se laktat koristi za glukoneogenezu
Zašto je jetra jedini organ koji može otpustiti glukozu u krvotok
jer zadrži glukoza - 6 fosfatazu
Zašto je CLK isključivo aeroban kada kisik ne sudjeluje niti u jednoj reakciji ciklusa?
iako sam CLK ne koristi kisik, proces oksidacije acetil-koenzima A do CO2 i H2O, koji uključuje CLK i oksidativnu fosforilaciju, smatra se aerobnim jer ovisi o prisutnosti kisika kako bi se efikasno generirala
kompetitivni inhibitor akonitaze
fluoracetat
enzimi u CLK koji reduciraju koenzime pripadaju skupini
dehidrogenaza (alfa-ketoglutarat dehidrogenaza, izocutrat dehidrogenaza)
koji su kontrolni enzimi CLK
citrat sintetaza, izocitrat dehidrogeneza, alfa-ketoglutarat dehidrogeneza
intermedijer krebsovog ciklusa koji se koristi za glukoenogenezu u slučaju produljenog gladovanja, koji difundira iz mitohondrija u citosol
oksaloacetat
Koliko molekula atpa je moguće dobiti polovičnim (ako se lanac skrati za pola C atoma) sagorijevanjem masne kiseline sa 12 C atoma
12/2 -1 = 5 *2 = 10
ketonska tijela se sintetiziraju i troše u energetske svrhe u
jetri se sintetiziraju + mozak i mišići
Mitohondriji ____________(navedi ime organa) sadrže specijalizirane enzime za detoksifikaciju amonijaka
jetre
sinteza atpa
oksidiranih koenzima u aerobnim uvjetima, kreatin fosfat, gvanozin triofosfat i glukoze aerobno
ime enzima koji se u glukoneogenezi koristi kao alternativa heksokinazi
glukokinaza
glukoneogeneza
u gladovanju raste koncentracija masnih kiselina u cirkulaciji koje se koriste za sintezu glukoze, jetra glukoneogenezom održava normalne koncentracije glukoze u krvi tijekom gladovanja
terminalni akceptor elektrona u oksidativnoj fosforilaciji
molekularni kisik - dolazi do stvaranja gardijenta H+
rezultat oksidativne fosforilacije
nastajanje atpa transportnim sustavom elektrona, oslobođenje velike količine energije
kravlji, ovčji, zečji i mišji ljudski antirtombinij j+dijele između 84 i 89% identičnosti aminokiselinske sekvence. neke od aminokiselina tvore tri intramolekularne disulfidne veze. svi antitrombini imaju četiri potencijalna mjesta N-glikolizacije. Do formiranja disulfidnih veza i N-glikolizacije dolazi na pozicijama
asparat i aspargin te metionin i cistein
U molekuli deoksihemoglobina, željezo je vezano pomoću pet veza:
4 molekule dušika u hemu i proksimalni histidin globinskog lanca
produkt razgradnje hema
biliverdin koji se reducira u bilirubin
za izvor energije i sintezu atpa vrijedi
-jetra je organ u kojem se sintetiziraju i troše ketonska tijela u produljenom gladovanju,
-mišići proizvode laktat u anaerobnim uvjetima koristeći glukozu kao izvor energije, - - mišići imaju visoke koncentracije kreatin fosfata, dodatnog izvora energije
- u produljenom gladovanju mozak koristi masne kiseline
physostigmin je
kompetitivni inhibitor acetilkolinestraze
Što se događa s michaelsovom konstantom nakon terapije
povećava se
što je physostigmin
strukturni analog pravom supstratu i kompetitivni inhibitor acetilkolinestraze
kako utječe koncentracija acetilkolina u mišićima na učinkovitost physostigmina
povečanjem koncentracije acetilkolina u mišićima smanjuje se učinkovitost physostigmina
dvije isključivo ketogene aminokiseline su
leucin i lizin
koji enzim je inhibiran malanatom
sukcinat dehidrogenaza (po internetu) fumaraza ( po crnoji)
aminokiseline koje u molekuli funkcionalnog kolagena moraju biti hidroksilirani
prolin i lizin
koja aminokiselina nema optičku aktivnost
glicin
koje aminokiseline imaju regulacijska mjesta za protein kinaze
serin i treonin
koja aminokiselina je temelj kooperativnosti strukture hemoglobina
histidin
peptidna veza
ne može se rotirati, parcijalno je dvostrukog karaktera
bilirubin
metabolit hema, produkt raspada svih proteina koji imaju hem, uključujući cikrome je bilirubi
željezo
u strukturi citokroma se mora neorestano oksidirati i reducirati, da bi citokromi vršili funkciju, vitamin C sprječava oksidaciju željeza u prolil i lizil - hidroksilazi, ukoliko je oksidirano u hemoglobinu radi se o methemoglobinu
što je točno za hemoglobin ig il neki kurac s bolestima
mutacija samo jedne AK u proteinu može izazvati pojavu bolesti
zbog hidrofobnih interakcija valina sa leucinom drugog lanca javlja se agrregacija lanaca HbS
pojedinici sa HbS resistentni su na malariju
koja je uloga proksimalnog histina
vezan je za željezo (Fe) u središtu heme skupine u svakom podjedinici hemoglobina. Ova veza omogućuje željezu da ostane u feričnom stanju, što je važno za povećanje afiniteta hemoglobina prema kisiku.
koja je uloga distalnog histina
nalazi se u blizini aktivnog mjesta vezanja kisika na heme skupini. On pomaže u stabilizaciji kisik-molekula vezanog za željezo, što olakšava otpuštanje kisika u tkiva tijekom prolaska kroz kapilare
što je točno o strukturi kolagena
̀̀̀̀̀̀ ̀̀̀̀̀̀̀̀̀̀̀-svaku treću ak u strukturi čini glicin
- ukoliko su prokolagen peptidaze ne funkcionačne kod goveda se razvija dermatospraksija
- ukoliko je vitamin C deficitaran, javlja se skorbut
- hidroksilacijska mjesta su važna jer se na njima odvija glikolizacija
- različite vrste kolagena razlikuju se po broju glukoznih jedinica
ako je pacijent alergičan na penicilinamin koja supstanca se koristi za terapiju cistinskih kamenaca
COO-CH2-NH-CO-CHCH3-SH
za razliku od većine vrsta životinja koje su ureotelne, amontelne životinje kao konačni produkt metabolizma proteina izlučuju ________-, dok urikotelne životinje izlučuju __________
amonijak, mokraćnu kiselinu
zašto je amonijak toksičan i u cirkulaciji se mora transportirati vezan za netoksične nosače
prolazi kroz hematoencefalnu barijeru i veže se za alfa KG u CLK mozga, pri čemu mozak ostaje bez energije zbog ometanja CLG, moguća koma
koji od ovih tvrdnja je točan:
a. prilikom razgradnje proteina, N atomi se prevode u ureu, a C atomi se mogu iskoristiti u dobivanju energije
b. iz C atoma aminokiselina nastaje urea, a N atomi se dalje koriste u sintezi novih proteina
c. C i N atomi koji su višak see izlučuju putem bubrega u urin
d. proteini su sastavljeni od aminokiselina, i većina ih se ne razgrađuje dok je životinja živa
prilikom razgradnje proteina, N atomi se prevode u ureu, a C atomi se mogu iskoristiti u dobivanju energije
C i N atomi koji su višak se izlučuju putem bubrega u urin
u kojem se organu odvija urea ciklus
jetra
koji je kontrolni enzim ciklusa uree
CPS - karbomil fosfat sintetaza
kako djeluju visoke koncentracije ATP-a na kontrolni enzim UC
nemaju djelovanja
U koji se metabolički ciklus uključuje fumarac
clk
produkti urea ciklusa su
1 molekula fumarata, 1 molekula uree, 1 molekula AMP i 2 molekule ADP
fluoracetat je izoliran iz nekih biljaka i metabolizira se u ________________, enzima clk
florocitrat, jaki kompetitivni inhibitor akonitaze
koji je inhibitor enzima tj produkt reakcije glukoza 6 fosfat dehidrogenaza
nadph
kooji enzim katalizira prvu reakciju oksidativnog ogranka pentoza fosfatnog pura
glukoza 6 fosfat dehidrogenaza
koji intermedijer u glikolizi povezijue glikolizu i afinitet hemoglobina za kisik
1,3 - bisfosfoglicerat
najvažniji protektivni tripeptid sa antioksidantnim svojstvima koji djeluje u zaštiti od ros-a je
glutation
citokromi
sadrže hem i Fe se mora neizmjenično reducirati i oksidirati ukoliko su citorkomi funkcionalni
Koenzim FADH u strukturi sadrži
riboflavin - B2
kako ide vjerojatni redoslijed u transferu elektrona - >NADH: - 0.32, FPB: - 0.62, CYT C:+ 0.22, FEROPROT: + 0.85, FPA: + 0.77, zašto kisik nije finalni aceptor u navedenom slučaju
prvi je onaj koji ima najmanji Eo, FPB NADH, CYT C, FPA, FEROPROT
kisik nije jer nema naveći redoks potencijal - kisik=+0.82V
Visoka koncentracija beta-hidroksibutirata u serumu mliječnih krava znači da
-u energetskom metabolizmu dominira -razgradnja masnih kiselina
-mozak korist ketonska tijela za energetske potrebe
-prehrana krava ne odgovara povećanim energetskim zahtjevima u laktaciji
jetra sintetizira ketonska tijela, ali ih ne koristi u energetske svrhe, zašto
nema enzim CoA transferazu
deficit karnitina može uzrokovati
usporednu beta oksidaciju masnih kiselina
Izračunaj broj molekula ATP-a koje je moguće dobiti iz jednog acetoacetata
2 AcCoA = 2 CLK = 2 x 12 ATP = 24 ATP – 1 ATP (activ.) = 23 ATP
kako ide redukcija NADH
anaerobno laktatom i aerobno prijenosom na kisik u clk
regulacija aktivnosti piruvat kinaze
niska koncentracija glukoze rezultira povišenim glukagonom, koji fosforilira pk i time je deaktivira
Navedi naziv posttranslacijske modifikacije kojom se regulira aktivnost enzima
fosforilacija
Koji enzim u citosolu djeluje na intermedijer CLK citrat? Koji produkti nastaju
citrat liaza, oksaloacetat + acetil koenzim A
Ukoliko se aplicira Soraphen A, što je točno?
sinteza masti je inhibirana, sinteza malonil-koenzima A je smanjena
Što je soraphen A
nanormalni inhibitor acetilkoenzim a karboksilaze koja ima krucijalnu ulogu u metabolizmu masti
Za sintezu masnih kiselina koristi se energija reduciranih koenzima, koji se generiraju u :
pentoza fosfatnom putu
U većini biokemijskih reakcija postoji osnovna razlika između NADH i NADPH:
nadph ima fosforilnu skupinu u adenozinskom dijelu molekule, a NADH nema
NADH se oksidira u respiracijskom lancu dajući ATP , dok NADPH služi kao donor vodika i elektrona u reduktivnoj biosintezi
Što je točno o aktivnosti pentoza fosfatnog puta u stanicama masnog tkiva sa intenzivnom sintezom masnih kiselina?
kao donor reduktivne E u sintezi masti potreban je NADPH
dominira oksidativni ogranak puta
glukoza - 6 fosfat dehidrogenaza je u tim stanicama aktivna
sve moguće načine oksidacije NADH u organizmu
aerobno laktatom i aerobno oksidativnom fosforilacijom
koji je primarni i dominantni izvor energije u gladovanju dugom 10 dana za mozak, mišiće i jetru
mozak - ketoni
mišići - ketoni (mk)
jetra - masne kiseline
kako inzulin djeluje na glikolizu, glikogenezu, sintezu proteina, proteolizu, ketogenezu, lipolizu, glukoneogenezu, glikoneogenezu
glikoliza, glikogeneza, sinteza proteina - aktivacija
proteoliza, ketogeneza, lipoliza, glukoneogeneza, glikogenoliza - inhibicija
opća formula svih aminokiselina je ista osim
glicin (prolin)
najzastupljenije u strukturi kolagena je
glicin i prolin
u skorbutu nije modificirana
prolin (lizin)
destabilizira linearno vezanje Fe i CO u hemu
histidin
prekurs adrenalina
tirozin
piruvat je razultat transaminacije sa enzimom alt
alanin
regulacijsko mjesto protein kinaza
serin, treonin (tirozin)
ekscitatorni neurotransmiter
glutamat
uzrokuje beta okret u strukturi heksa
glicin
prisutan u strukturi glutationa
glicin, cistein, glutamat
završni produkt metabolizma hema
bilirubin
Koliko je molekula ATP moguće dobiti u mišićim u anaerobnim uvjetima iz 2 molekule beta-hidroksibutirata
0 molekula atpa
direktna poveznica između clk i urea ciklusa
fumarat
pentoza fosfatni put se sastoji od
oksidativne faze - generira NADPH i R5P
neoksidativne faze - interkonverzija fosforiliranih šećera
rezultat alaninskog ciklusa
transport N iz mišića u jetru