biokemija kolokvij stare godine Flashcards
što je točno o proteinima
polipeptidi po strukturi i mutacija na DNA može prouzrokovati sintezu nefunkcionalnog proteina
protetska skupina je
neproteinska grupa u konjugiranim proteinima, proteinis bez prostetske skupine nazivaju se aproteinima i obilno imaju odlučujuču ulogu u funkciji samog proteina
ačfa heksa
vodikove veze su unutar jednog lanca
koje interakccije stabiliziraju tercijarnu strukturu proteina
vodikove veze, disulfidne veze, van der waalsove sile, elektrostatske sile i hidrofobne sile
ukoliko protein ne zauzme pravilnu trodimenzionalnu konformaciju
uklanja se djelovanjem oriteaza te ukoliko je konformacija rezistentna, može dovesti do razvoja bolesti
jedina aminokiselina koja nema kiralni centar je
glicin
u strukturi kolagena
svaka treća aminokiselina jeglicin, često se javlja hidroksiprolin i hidroksilizin te se modificiraju glikozilacijom i hidroksilacijom
funkcija proteina u organizmu
a.kataliza(enzimi)
b.strukturni proteini(kolagen)
c.kretanje(leukociti)
d.obrana(trombin, imunoglobulini)
e.regulacija procesa(hormoni)
f.transport(hemoglobin)
g.toksini
Da li je moguća renaturacija denaturiranog proteina? Zašto?
da, jer se sekvence denaturacijom ne mijenjaju što znači da primarna struktura proteina ostaje ista
dermatosparaksija
genski prenosiva bolest stoke, uzrokovana deficitom prokolagen peptidaze, N i C terminalna područja prekursorskih lanaca kolagena se ne odcjepljuju
hemoglobulin
samo fe2+ se može vezat na kisik, protoporfirin IX, osim hema sadrži 4 polipeptidna lanca 2 alfa i 2 beta, u različitim tipovima hemoglobina polipeptidni lanci se mogu razlikovat
Kod većine sisavaca DPG modulira reverzibilno vezanje kisika na hemoglobin. Kod
odraslih ptica je to:
inozitol pentafosfat
može li inhibicija kompetitivnim inhibitorom povećati dodavanjem pravog supstrata
ne inhibicija kompetitivnim inhibitorom može se smanjiti dodavanjem pravog supstrata
t ili n teski metali mogu ometati enzimske reakcije
t
Km najbržeg enzima je:
a.Km=103
b.Km=102
c.Km=10-2
d.Km=10-7
Km = 10 na -7
Jedinice u kojima se mjeri aktivnmost enzima su
U/L ili IU/L i katal
Koje su razlike izmođu hemoglobulina i mioglobulina
na hemoglobin se kisik veže kooperativno, na mioglobulin ne, afinitiet hemoglobulina prema kisiku određuju organski fosfati poput DPG te razlika u strukturi veznog mjesta za kisik
gdje se nalazi heksokinaza
svugdje
gdje se nalazi glukokinaza
samo u jetri
poveži pojmove sa heksokinaza i glukokinaza
a.nalazi se u jetri
b.zahtjeva ATP u reakciji
c.ima visoki Km za glukozu
d.nalazi se u nehepatičkim tkivima
e.inhibirana je glukoza 6-fosfatom
a. nalazi se u jetri - HK
b. zahtjeva ATP u reakciji - GK i HK
c. ima visok Km za glukozu - GK
d. nalazi se u nehepatičkim tkivima - HK
e. inhibirana je glukoza - 6 fosfatom - HK
primarna
linearni raspored AK
sekundarna
prostorni oblik AK
tercijarna
prostorni oblik AK i pobočnih lanaca
kvartarna
povezivanje oroteinskih podjedinica
Katabolizam hemoglobina
bilirubin nastaje iz hema i globin se razrjeđuje u aminokiseline
produkti metabolizma hemoglobina su
bilirubin i željezo
Da li dolazi do promjena u afinitetu hemoglobina za kisik i kakve su promjene.
da, kod deficita heksokinaze nenormalno je visok afinitet hemoglobina prema kisiku.
Za enzim glukokinazu vrijednost Km=10mM, dok je Km za hekoskinazu Km<0,1.Ovakve vrijednosti Km upućuju na slijedeće tvrdnje
glukokinaza je aktivna isključivo pri visokim koncentracijama glukoze
objasni ulogu vitamina K u procesu zgrušavanja krvi
vitamin k zaslužan je za sintezi protrombina te nekoliko drugih faktora zgrušavanja krvi, ako se inhibira djelovanje vitamina K, ne dolazi do karboksilacije glutaminske kiseline te se na nju ne može vezati Ca2+ zato krv ne može koagulirati i dolazi do krvarenja
uloga vitamina C
to je a karboksinska kiselina koja djeluje kao reducens u brojnim biološkim procesima, važan je za sintezu kolagena i karnitina te za metabolizam asnih kiselina, najjači antioksidans među vitaminima topljivima u vodi. djeluje kao reducens koji doržava Fe2+ u tome obliku, spriječavajuči oksidaciju u Fe3+- povećava otpornost organizma prema infekcijama, nedostatak vitamina c uzrokuje do teškog zarastanja rana, anemija, zbog nedovoljne hidroksilacije kolagena dolazi do krvarenja
t ili n - naboj AK određuje reaktivnost svojstva ak
točno
sastoje li se svi proteini od 20 AK samo u različitim omjerima
da
Ak nisu u proteinima vezane s polipeptidnim vezama
netočno, vezane su
u kojoj formi su AK u proteinima životinja
u L
koje aminokiseline mogu biti toksične za organizam
D aminokiseline
Hidrolizom polipeptida koji se sastoji od 9 AK nastaje
8 molekula vode
Objasni mehanizam trovanja dikumarolom (inhibitor vitamina K) uzevši u obzir modifikacije AK u faktorima koagulacije.
on je antagonist vitamina K, ako se inhibira djelovanje vitamina K, ne dolazi do karboksilacije glutaminske kiseline te se na nju može vezati Ca2+ te zato krv ne može koagulirati te dolazi do krvarenja
peptidiltransferaza
- enzim aminotransferaze,
- obavlja osnovne funkcije ribosoma
- katalizira translaciju genske informacije u ribosomima
peptidna veza
- ima planiranu i rezonantnu strukturu
- hidrolitički cijepanje je moguće
- ne razara se denaturacijom
aminokiseline koje se ne uklapaju u alfa heliks
glicin, prolin, glutamat, aspartat, triptofan
Što je točno o denaturaciji
gube se njegova biološka svojstva, promjena kemijskih i fizičkih svojstava, protein iz prirodne konfiguracije prelazi slulajno u klupko, denaturirane pretein proteaeze uklanjaju iz organizma
nalaze li se SH grupe na površini molekule
ne
kada je enzimna kataliza najbrža
pri pH optimumu
t ili n - aktivnost alosteričkih enzima nije podložna regulaciji
netočno
o čemu ovisi enzimna kataliza
o temperaturi
mogu li se enzimi s drugim enzimima razgraditi do AK
da, enzimi s drugim enzimima mogu se razgraditi do AK
razgradnja proteina
u citosolu protoezama
fagocitozom lizosomima
kompleksima protoelitičkim enzimima - ubikinon
enzimi su
po sastavu proteini, a po djelovanju biokatalizatiori –> snižavaju energiju aktivacije kataliziranih reakcija
što je michelisova konstanta
jednaka je onoj koncentraciji supstrata pri kojoj se postiže polovica maksimalne brzine katalizirane reakcije
Što je tolno o kompetitivnim inhibitorima
-vežu se za aktivni centar
- natječu se sa supstratom
što ima njabrži enzim
najmanju Km
gdje se vežu nekompetitivni inhibitori
izvan aktivnog centra enzima
kako se mođe smanjti inhibicija kompetitivnim inhibitorom
dodavanjem pravog supstrata
Utjecaj na Vmax
može se povećati dodavanjem supstrata
može se smanjiti dodatkom inhibitora
maksimalna brzina enzimske reakcije
enzimna indukcija
pojačana sinteza Ec kao odgovor na promjene metaboličkih uvjeta u kojima se stanica nalazi i metaboličkih zahtjeva stanice
enzimna represija
sinteza enzima može biti i specifično inhibirana
poveži pojmoje za protein kinazu i za proteinfosfatazu
-transferira fosfatnu skupinu sa ATP na hidroksilnu skupinu proteina
-reakcija se odvija na pobočnim lancima serina
-veže se na alosteričke pozicije:
-uklanja fosfat:
-transferira fosfatnu skupinu sa ATP na hidroksilnu skupinu proteina –> PK
-reakcija se odvija na pobočnim lancima serina –> PK i PFF
-veže se na alosteričke pozicije: none
-uklanja fosfat: PFF
Koje su predosti fosforilacije i defosforilacije proteina kao kontrolni mehanizam
brza je, ne zahtjeva sintezu novih, funkcionalnih proteina ili degradaciju starih, reverzibilna je
puno ime koenzima NAD+
nikotinamid adenin dinukleotid
napišite puno ime FAD+
flavin adenin dinukleotid
funkcije mioglobina i hemoglobina te gdje se nalaze
hemoglobin služi za transver kisika u eritrocitima, a mioglobin ima funkciju za prijenos kisika u stanice mišića
Strukturne i funkcionalne razlike između hemoglobina i mioglobina
-kisik se na Hb veže kooperativno, a na mioglobin ne
- afinitet Hb za kisik ovisi o pH i o pCO2, a afinitet Mb ne ovisi
-afinitet Hb za kisikom određuju i organski fosfati kao što je DPG
Nabroji i objasni vrste alosteričkih efekata koji se javljaju pri vezanju kisika na Hemoglobin
1.Kooperativnost-vezanje prve molekiule kisika na Hb potiče vezanje daljnjih
Molekula kisika na Hb molekulu
2.Bohrov efekt – afinitet Hb za kisik ovisi o pH i pCO2
3.Difosfoglicerat-afinitet Hb prema kisiku određuju i organski fosfati, poput Bisfosfoglicerata i smanjuju afinitet Hb za kisik
*-proximalni histidin povećava afinitet za kisik, a distalni smanjuje
fibrinoliza
aktivacija plazminogena u plazminu
kolagen—————-,
hidroksilacija——————
karboksilacija————–
kolagen - glikolizacija
hidroksilacija - vitamin c
karboksilacija - zgrušavanje, vitamin K
