biokemija 1.kolokvij Flashcards
Što je točno o sekundarnoj strkturi proteina
svi proteini imaju sekundarnu strukturu, razara se denaturalizacijom, mogu ju narušiti vrlo visoke temperature
Što je točno o denaturalizaciji proteina
dolazi do prijelaza iz visokoorganiziranog u neorganizirano stanje, tj sačuvano klupko. gube se sve strukture osim primarne
Da bi se kalcij vezao na neke faktore koagulacije u procesu zgrušavanja krvi potrebno je da neke aminokiseline u njima budu modificirane, koja je to aminokiselina i kroz kakav šrpces mora proći?
AK glutamat i karboksilacija
Koja je aminokiselina svaka treća aminokiselina u kolagenu
glicin
Točno ili netočno, stanica mora reagirati na vanjski podražaj
točno
točno ili netočno, skundarni glasnik u prijenostu signala je AMP
netočno
točno ili netočno, sekundarni glasnik u prijenosu signala je cAMP
točno
točno ili netočno - u procesu prijenosa signala česta je fosforilacija kao regulacijski mehanizam
točno
Kako se nazivaju enzimi koji razgrađuju kolagen
kolagenaza
Koja aminokiselina nema kiralni centar – aspartat, glutaminska kiselina, cistein, prolin, glicin, triptofan
glicin + prolin ima ali neki čudan
Što je točno o kvarternoj strukturi proteina?
hemoglobin i mioglobin imaju kvarternu strukturu, imaju je samo oni proteini koji imaju više podjedinica
definicija Michaelsove konstante, koja je karakteristilna za stvaki enzim
supstratna koncentracija kod koje je brzina reakcije jednaka polovici maksimalne brzine reakcije. Manji Km, veći afinitet enzima – vR = vRmax/2
Koji su glavni tipovi sekundarne strukture proteina
alfa - helix i beta - ploča
Koje su reakcije koje stabiliziraju tercijarnu strukturu proteina
hidrofobne, hidrogene, Van der Waalsove, elektrostatičke interakcije, disulfidne
Što je točno o peptidnoj vezi
ima karakter parcijalne dvostruke veze, rigidna je tj kruta i ne omogućava reakciju. razgrađuje se peptidazama
Koji su proteini koji pomažu drugim proteinima u postizanju pravilne konformacije
molekule šaperoni
kako se naziva veza između dvije aminokiseline u peptidima i proteinima
peptidna veza
Što je točno o strukturi proteina?
a. svi proteini imaju primarnu strukturu
b. svi proteini koji su denaturirani imaju primarnu strukturu
c. svi proteini imaju kvarternu strukturu
d. denaturacijom se gubi katalitička aktivnost enzima
e. mogu je narušti vrlo visoke temperature
svi proteini imaju primarnu strikturu, denaturacijom se gubi katalitička aktivnost enzima, mogu je narušiti vrlo visoke temperature, svi proteini koji su denaturirani imaju primarnu strukturu
Zašto se peptidna veza ne može rotirati u prostoru?
zbog parcijalnog dvostrukog karaktera veze između karboksilne skupine jedne aminokiseline i amino skupine druge aminokiseline
Zašto samo glicin nema kiralni centar od svih aminokiselina
jer je njegov bočni lanac jednostavan vodik, za razliku od drugih AK koje imaju bočni lanac s dva ili više razlličitih atoma
Hemoglobin se razgrađuje na globin i hem, koji se sastoji od protoporfirinskog prstena i ____________
centralnog željeznog iona
Nabroji 5 uvjeta koji mogu prouzročiti denaturaciju proteina.
visoka temperatura, promjena pH vrijednosti, djelovanje kemijskih agenasa, djelovanje ultraljubičastog zračenja, mehanička destabilizacija
Što je točno ?
a. bilirubin ne nastaje metabolizmom mioglobina b. bilirubin konjugira jetra c. Fe iz hemoglobina se izlučuje urinom d. nosač nekonjugiranog bilirubina je albumin e. nosač serumskog Fe je transferin
bilirubin konjugira jetra, nosač nekonjugiranog bilirubina je albumin, nosač serumskog Fe je transferin
Što je točno o hemu?
a. atom Fe nije izravno vezan na His F8 (proksimalni) na 5. koordinacijskom mjestu
b vezno mjesto za O2 je u blizini distalnog His E7
c. atom Fe je oko 0,03 nm izvan ravnine porfirina
d. atom željeza ne pomiče se pri oksigenaciji prema ravnini skupine hema otprilike 0,02 nm
b i c
Nabroji 5 funkcija proteina
enzimatska, strukturna, transportna, hormonska i imunološka
Jedinice za mjerenje enzimske aktivnosti
katal (kat), IU
Koji od navedenih proteina nema kvarternu strukturu?
a. hemoglobin b. mioglobin c. kolagen d. niti jedan od navedenih
kolagen
Za pravilnu funkciju enzima u hidroksilaciji kolagena potreban je vitamin _____, a za karboksilaciju glutaminske kiseline u faktorima koagulacije krvi vitamin ______ .
vitamin C, vitamin K
Nabroji 3 vrste tkiva koja izgrađuje kolagen
koža, kosti, tetive
Koju valenciju mora imati molekula željeza u strukturi hemoglobina i prolil i lizil hidroksilaza da bi navedene molekule bile funkcionalne?
+2
Kompetitivni inhibitori enzimske aktivnosti: 4b
a.mijenjaju Km tako da ga smanjuju
b.mijenjaju Km tako da ga povećavaju
c.ne djeluju na Km nego samo na Vmax, smanjujući ga
d.inhibiraju enzimsku reakciju, ali ne djeluju na Km niti na vmax
e.su vrsta reverzibilnih inhibitora
f. su vrsta ireverzibilnih inhibitora
kompetitivni inhibitori mijenjaju Km tako da ga povećaju, , vrsta su reverzibilnih inhibitora
Označi sa T (točno) ili N (netočno) navode o alfa-helixu. 2b
opisuje tercijarnu strukturu proteina ___
opisuje primarnu strukturu proteina ____
razara se denaturacijom ____
vodikove veze nalaze se između različitih proteinskih lanaca ___
na mjestima gdje je prolin dolazi do prekida strukture heliksa ____
glicin je povoljan za građu helixa_____
na mjestima gdje je glicin dolazi do pucanja peptidnih veza _____
opisuje tercijarnu strukturu proteina ___ N
opisuje primarnu strukturu proteina ____ N
razara se denaturacijom ____ T
vodikove veze nalaze se između različitih proteinskih lanaca ___ N
na mjestima gdje je prolin dolazi do prekida strukture heliksa ____ T
glicin je povoljan za građu helixa_____ T
na mjestima gdje je glicin dolazi do pucanja peptidnih veza ____ N
Fosfoprotein fosfataza i protein kinaza su česti kontrolni enzimi, koji modificiraju aktivnost drugih proteina ili enzima. Što je točno?:
a. oni prenose fosfatnu skupinu i tako modificiraju aktivnost enzima
b. oni gube denaturacijom svoje aktivnosti, ali im primarna struktura ostaje sačuvana
c. su enzimi koji ne mogu djelovati na druge enzime, nego samo na svoje supstrate 4b
d. su enzimi koji uvijek imaju iste aktivnosti
oni prenose fosfatnu skupinu i tako modificiraju aktivnost enzima, to su enzimi koji ne mogu djelovati na druge enzime, nego samo na svoje supstrate
Kakav je međusobni odnos između Km nekog enzima i njegovog afiniteta za supstrat
manji Km je veći afinitet, veći Km manji afinitet
Ukoliko je navod točan za protein kinaze, upiši PK, ukoliko je točan za protein fosfataze, upiši PF, ili oboje, ukoliko je navod točan za oba enzima.
a. katalizira uklanjanje fosfata sa proteina hidrolizom ____
b. reakcija se odvija na pobočnim lancima serina, treonina ili tirozina koji sadrže hidroksilne grupe ____
c. imaju primarnu, sekundarnu i tercijarnu strukturu ____
d. uvijek aktiviraju druge proteine ili enzime ____
a. pf - protein fosfataze, b. pf i pk - protein kenaze i protein fosfataze, c pk i pf, d pk i pf
Što označava primarnu strukturu proteina?
primarnu strukturu proteina označava linearni niz aminokiselina koji čini polipeptidni lanac
Što je točno o bilirubinu?
a. bilirubin ne nastaje metabolizmom mioglobina
b. bilirubin konjugira jetra
c. Fe iz hemoglobina se izlučuje urinom
d. nosač nekonjugiranog bilirubina je albumin
e. nosač serumskog Fe je transferin
bilirubin se konjugita u jetri, nosač nekonjugiranog bilirubina je u krvi albumin, nosač serumskog željeza je transferin
Glavni fiziološki inhibitor trombina je _________________________(puno ime inhibitora), a njegov alosterički aktivator koji mu pojačava djelovanje i do 2000 puta je ____________________________(puno ime aktivatora).
antirtobin ili AT, njegov alosterički aktivator je heparin
Spoji odgovarajuće navode:
transferira fosfat sa ATP na hidroksilnu grupu proteina protein fosfataza
enzimna reakcija odvija se na pobočnim lancima serina/ treonina protein kinaza
u svojoj strukturi ima peptidne veze
katalizira defosforilaciju proteina
djelovanjem ovog enzima supstrat se uvijek pretvara u svoj aktivni oblik
protein kinaza - transferira fosfat sa atp na hidroksilnu grupu, enzimna reakcija odvija se na pobočnim lancima serina ili trenins, supstrat se uvijek pretvara z svoj aktivni oblik
protein fosfataza- u svojoj streukturi ima peptidne veze, katalizira defosforilaciju protein
Glavni sekundarni glasnik u prijenosu signala je _____________(puno ime glasnika
ciklički adenozin monofosfat
Niz aminokiselina koji se u strukturi kolagena vrlo često nalazi čine tri aminokiseline, ________________, ______________________ i ____________________(navedi imena tri aminokiseline). Za fiziollošku konformaciju ovog proteina neophodne su dvije posttranslacijske modifikacije aminokiselina, a to su ________________________ i _________________________
niz AK - glicin, prolin, Hyp hidroksiprolin, hidroksilacija i glikoksilacija
U procesu koagulacije thrombin aktivira:
a. protrombin
b. fibrin
c. fibrinogen
d. faktor VIII
fibrogen, faktor VII
Prikaži opću formulu aminokiselina u formi Zwitter-iona.
NH3+
I
R — C — COO-
I
H
Proteini koji mogu imati nepravilnu konformaciju i uzrokovati da i drugi proteini zauzmu istu nepravilnu konformaciju, što ima za posljedicu agregaciju, što čini molekularnu osnovu za mnoge bolesti zovu se _______
prionski proteini
Dva glavna proteina odgovorna za pokretanje mišića su _______ i ______
aktin i miozin
Za postranslacijske modifikacije kolagena neophodan je vitamin ______
vitamin C
U kojem organu se konjugira bilirubin? ___________
U jetri
Što je točno ?
a. svi protein su konformirani tako da imaju minimum energije
b. neki proteini nisu na energetskom minimumu i oni se uvijek razgrađuju proteazama
c. neki neki proteini nisu na energetskom minimum i to je njihova nativna struktura 3b-1
d. chaperoni pomažu svim drugim proteinima u pravilnom konformiranju
e. chaperoni uvijek dovode protein u energetski minimum
neki proteini nisu na energetskom minimumu i to je njihova natina struktura, chaperoni pomažu svim drugim proteinima u pravilnom konformiranju
Faktor II koagulacije naziva se punim imenom ______, a njegov neaktivni prethodnik _____.
trombin, protrombin
Faktor I koagulacije naziva se punim imenom ______, a njegov neaktivni prethodnik _____.
fibrin, fibrinogen
Faktor koji aktivira konverziju fibrinogena u fibrin zove se ______
trombin
Glavni fiziološki inhibitor trombina je ________
antitrombin 3
Inaktivni prekursori (prethodnici) enzima koji se konvertiraju u aktivne enzime proteolizom su:
a. kofaktori
b. koenzimi
c. inhibitori
d. aktivatori
e. proenzimi
f. izoenzimi
proenzimi i koenzimi
Enzimi koji kataliziraju iste biokemijske reakcije, ali zbog malih razlika u sekvenci imaju različita svojstva, npr. različitu Michaelisovu konstantu su:
g. kofaktori
h. koenzimi
i. inhibitori
j. aktivatori
k. proenzimi
l. izoenzimi
proenzimi i izoenzimi
Glavni fibrinolitički enzim je:
a. fibrin
b. trombin
c. heparin
d. plazmin
e. antitrombin III
plazmin
Koji od sljedećih receptora plazmatske membrane aktiviraju signalne putove stvaranjem molekularnih dimera koji rezultiraju reakcijama fosforilacije proteina nakon vezanja njihovog specifičnog liganda?
a) Receptori steroidnih hormona
b) Receptorske tirozin kinaze
c) Ionski kanali upravljani ligandom
d) G protein spregnuti receptori
receptorske triozin kinaze
Prikazan je signalni put:
adrenalin → receptor povezan sa G proteinom → G protein → adenilil ciklaza → cAMP.
Zaokružite sekundarnog glasnika:
A) cAMP
B) G protein
C) GTP
D) adenilil ciklaza
E) G protein-vezani receptor
cAMP
Koja je od tvrdnji o enzimima točna?
a) Enzimi su proteini koji djeluju kao katalizatori.
b) Enzimi su specifični.
c) Enzimi daju aktivacijsku energiju reakcijama.
d) Aktivnost enzima se može regulirati.
e) Enzimi se mogu koristiti više puta za određenu reakciju.
enzimi su proteini koji dijeluju kao katalizatori, enzimi su specifični, aktivnost enzima se može regulirat, enzimi se mogu koristti više puta za reakciju
Prijelazno stanje katalizirane reakcije je
a) visoko naseljeni intermedijer na reakcijskom putu.
b) ima veću energiju od one nekatalizirane reakcije.
c) niža energija od energije nekatalizirane reakcije.
d) manje energije od reakcijskog supstrata.
e) vrlo slabo vezan za katalizator.
visoko naseljeni intermedijer na reakcijskom putu, ima veću energiju od one nekatalizirane reakcije
Jedan od enzima uključenih u glikolizu, aldolaza, zahtijeva Zn2+ za katalizu.
U uvjetima nedostatka cinka, kada enzimu može nedostajati cink, to bi se nazivalo:
A) apoenzim.
B) koenzim.
C) holoenzim.
D) protetička skupina.
E) supstrat.
apoenzim
Enzimi su efektivni biokatalizatori jer::
A) troše se u reakcijama koje kataliziraju.
B) vrlo su specifični i mogu spriječiti pretvorbu proizvoda natrag u supstrate.
C) dovode reakcije do završetka dok drugi katalizatori dovode reakcije do ravnoteže.
D) povećavaju konstante ravnoteže za reakcije koje kataliziraju.
E) smanjuju aktivacijsku energiju za reakcije koje kataliziraju
vrlo su specifični i mogu spriječiti pretvorbu proizvoda natrag u supstrate, smanjuju aktivacijsku energiju za reakcije koje kataliziraju
Sljedeći podaci dobiveni su u studiji enzima za koji je poznato da slijedi Michaelis-Menten kinetiku:
V0S ubstrate added (mol/min) (mmol/L)
217 0.8
325 2
433 4
488 6
647 1,000
Km za taj enzim je:: A) 1 mM. B) 1000 mM. C) 2 mM. D) 4 mM. E) 6 mM.
2mM
Broj molekula supstrata koje je jedna molekula enzima pri zasićenju pretvorila u produkt u određenoj jedinici vremena naziva se:
A) konstanta disocijacije.
B) konstanta poluzasićenja.
C) maksimalna brzina.
D) Michaelis-Mentenov broj.
michaelis - mentenov broj
