biokemija 1.kolokvij Flashcards

1
Q

Što je točno o sekundarnoj strkturi proteina

A

svi proteini imaju sekundarnu strukturu, razara se denaturalizacijom, mogu ju narušiti vrlo visoke temperature

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Što je točno o denaturalizaciji proteina

A

dolazi do prijelaza iz visokoorganiziranog u neorganizirano stanje, tj sačuvano klupko. gube se sve strukture osim primarne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Da bi se kalcij vezao na neke faktore koagulacije u procesu zgrušavanja krvi potrebno je da neke aminokiseline u njima budu modificirane, koja je to aminokiselina i kroz kakav šrpces mora proći?

A

AK glutamat i karboksilacija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Koja je aminokiselina svaka treća aminokiselina u kolagenu

A

glicin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Točno ili netočno, stanica mora reagirati na vanjski podražaj

A

točno

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

točno ili netočno, skundarni glasnik u prijenostu signala je AMP

A

netočno

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

točno ili netočno, sekundarni glasnik u prijenosu signala je cAMP

A

točno

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

točno ili netočno - u procesu prijenosa signala česta je fosforilacija kao regulacijski mehanizam

A

točno

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Kako se nazivaju enzimi koji razgrađuju kolagen

A

kolagenaza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Koja aminokiselina nema kiralni centar – aspartat, glutaminska kiselina, cistein, prolin, glicin, triptofan

A

glicin + prolin ima ali neki čudan

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Što je točno o kvarternoj strukturi proteina?

A

hemoglobin i mioglobin imaju kvarternu strukturu, imaju je samo oni proteini koji imaju više podjedinica

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

definicija Michaelsove konstante, koja je karakteristilna za stvaki enzim

A

supstratna koncentracija kod koje je brzina reakcije jednaka polovici maksimalne brzine reakcije. Manji Km, veći afinitet enzima – vR = vRmax/2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Koji su glavni tipovi sekundarne strukture proteina

A

alfa - helix i beta - ploča

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Koje su reakcije koje stabiliziraju tercijarnu strukturu proteina

A

hidrofobne, hidrogene, Van der Waalsove, elektrostatičke interakcije, disulfidne

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Što je točno o peptidnoj vezi

A

ima karakter parcijalne dvostruke veze, rigidna je tj kruta i ne omogućava reakciju. razgrađuje se peptidazama

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Koji su proteini koji pomažu drugim proteinima u postizanju pravilne konformacije

A

molekule šaperoni

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

kako se naziva veza između dvije aminokiseline u peptidima i proteinima

A

peptidna veza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Što je točno o strukturi proteina?

a. svi proteini imaju primarnu strukturu
b. svi proteini koji su denaturirani imaju primarnu strukturu
c. svi proteini imaju kvarternu strukturu
d. denaturacijom se gubi katalitička aktivnost enzima
e. mogu je narušti vrlo visoke temperature

A

svi proteini imaju primarnu strikturu, denaturacijom se gubi katalitička aktivnost enzima, mogu je narušiti vrlo visoke temperature, svi proteini koji su denaturirani imaju primarnu strukturu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Zašto se peptidna veza ne može rotirati u prostoru?

A

zbog parcijalnog dvostrukog karaktera veze između karboksilne skupine jedne aminokiseline i amino skupine druge aminokiseline

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Zašto samo glicin nema kiralni centar od svih aminokiselina

A

jer je njegov bočni lanac jednostavan vodik, za razliku od drugih AK koje imaju bočni lanac s dva ili više razlličitih atoma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hemoglobin se razgrađuje na globin i hem, koji se sastoji od protoporfirinskog prstena i ____________

A

centralnog željeznog iona

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Nabroji 5 uvjeta koji mogu prouzročiti denaturaciju proteina.

A

visoka temperatura, promjena pH vrijednosti, djelovanje kemijskih agenasa, djelovanje ultraljubičastog zračenja, mehanička destabilizacija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Što je točno ?
a. bilirubin ne nastaje metabolizmom mioglobina b. bilirubin konjugira jetra c. Fe iz hemoglobina se izlučuje urinom d. nosač nekonjugiranog bilirubina je albumin e. nosač serumskog Fe je transferin

A

bilirubin konjugira jetra, nosač nekonjugiranog bilirubina je albumin, nosač serumskog Fe je transferin

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Što je točno o hemu?

a. atom Fe nije izravno vezan na His F8 (proksimalni) na 5. koordinacijskom mjestu
b vezno mjesto za O2 je u blizini distalnog His E7
c. atom Fe je oko 0,03 nm izvan ravnine porfirina
d. atom željeza ne pomiče se pri oksigenaciji prema ravnini skupine hema otprilike 0,02 nm

A

b i c

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Nabroji 5 funkcija proteina

A

enzimatska, strukturna, transportna, hormonska i imunološka

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Jedinice za mjerenje enzimske aktivnosti

A

katal (kat), IU

27
Q

Koji od navedenih proteina nema kvarternu strukturu?
a. hemoglobin b. mioglobin c. kolagen d. niti jedan od navedenih

A

kolagen

28
Q

Za pravilnu funkciju enzima u hidroksilaciji kolagena potreban je vitamin _____, a za karboksilaciju glutaminske kiseline u faktorima koagulacije krvi vitamin ______ .

A

vitamin C, vitamin K

29
Q

Nabroji 3 vrste tkiva koja izgrađuje kolagen

A

koža, kosti, tetive

30
Q

Koju valenciju mora imati molekula željeza u strukturi hemoglobina i prolil i lizil hidroksilaza da bi navedene molekule bile funkcionalne?

A

+2

31
Q

Kompetitivni inhibitori enzimske aktivnosti: 4b

a.mijenjaju Km tako da ga smanjuju
b.mijenjaju Km tako da ga povećavaju
c.ne djeluju na Km nego samo na Vmax, smanjujući ga
d.inhibiraju enzimsku reakciju, ali ne djeluju na Km niti na vmax
e.su vrsta reverzibilnih inhibitora
f. su vrsta ireverzibilnih inhibitora

A

kompetitivni inhibitori mijenjaju Km tako da ga povećaju, , vrsta su reverzibilnih inhibitora

32
Q

Označi sa T (točno) ili N (netočno) navode o alfa-helixu. 2b

opisuje tercijarnu strukturu proteina ___
opisuje primarnu strukturu proteina ____
razara se denaturacijom ____
vodikove veze nalaze se između različitih proteinskih lanaca ___
na mjestima gdje je prolin dolazi do prekida strukture heliksa ____
glicin je povoljan za građu helixa_____
na mjestima gdje je glicin dolazi do pucanja peptidnih veza _____

A

opisuje tercijarnu strukturu proteina ___ N
opisuje primarnu strukturu proteina ____ N
razara se denaturacijom ____ T
vodikove veze nalaze se između različitih proteinskih lanaca ___ N
na mjestima gdje je prolin dolazi do prekida strukture heliksa ____ T
glicin je povoljan za građu helixa_____ T
na mjestima gdje je glicin dolazi do pucanja peptidnih veza ____ N

33
Q

Fosfoprotein fosfataza i protein kinaza su česti kontrolni enzimi, koji modificiraju aktivnost drugih proteina ili enzima. Što je točno?:

a. oni prenose fosfatnu skupinu i tako modificiraju aktivnost enzima
b. oni gube denaturacijom svoje aktivnosti, ali im primarna struktura ostaje sačuvana
c. su enzimi koji ne mogu djelovati na druge enzime, nego samo na svoje supstrate 4b
d. su enzimi koji uvijek imaju iste aktivnosti

A

oni prenose fosfatnu skupinu i tako modificiraju aktivnost enzima, to su enzimi koji ne mogu djelovati na druge enzime, nego samo na svoje supstrate

34
Q

Kakav je međusobni odnos između Km nekog enzima i njegovog afiniteta za supstrat

A

manji Km je veći afinitet, veći Km manji afinitet

35
Q

Ukoliko je navod točan za protein kinaze, upiši PK, ukoliko je točan za protein fosfataze, upiši PF, ili oboje, ukoliko je navod točan za oba enzima.

a. katalizira uklanjanje fosfata sa proteina hidrolizom ____
b. reakcija se odvija na pobočnim lancima serina, treonina ili tirozina koji sadrže hidroksilne grupe ____
c. imaju primarnu, sekundarnu i tercijarnu strukturu ____
d. uvijek aktiviraju druge proteine ili enzime ____

A

a. pf - protein fosfataze, b. pf i pk - protein kenaze i protein fosfataze, c pk i pf, d pk i pf

36
Q

Što označava primarnu strukturu proteina?

A

primarnu strukturu proteina označava linearni niz aminokiselina koji čini polipeptidni lanac

37
Q

Što je točno o bilirubinu?
a. bilirubin ne nastaje metabolizmom mioglobina
b. bilirubin konjugira jetra
c. Fe iz hemoglobina se izlučuje urinom
d. nosač nekonjugiranog bilirubina je albumin
e. nosač serumskog Fe je transferin

A

bilirubin se konjugita u jetri, nosač nekonjugiranog bilirubina je u krvi albumin, nosač serumskog željeza je transferin

38
Q

Glavni fiziološki inhibitor trombina je _________________________(puno ime inhibitora), a njegov alosterički aktivator koji mu pojačava djelovanje i do 2000 puta je ____________________________(puno ime aktivatora).

A

antirtobin ili AT, njegov alosterički aktivator je heparin

39
Q

Spoji odgovarajuće navode:

                                        transferira fosfat sa ATP na hidroksilnu grupu proteina protein fosfataza
                                              enzimna reakcija odvija se na pobočnim lancima serina/ treonina                                             protein kinaza                                
                                             u svojoj strukturi ima peptidne veze

                                         katalizira defosforilaciju proteina

                             djelovanjem ovog enzima supstrat se uvijek pretvara u svoj aktivni oblik
A

protein kinaza - transferira fosfat sa atp na hidroksilnu grupu, enzimna reakcija odvija se na pobočnim lancima serina ili trenins, supstrat se uvijek pretvara z svoj aktivni oblik
protein fosfataza- u svojoj streukturi ima peptidne veze, katalizira defosforilaciju protein

40
Q

Glavni sekundarni glasnik u prijenosu signala je _____________(puno ime glasnika

A

ciklički adenozin monofosfat

41
Q

Niz aminokiselina koji se u strukturi kolagena vrlo često nalazi čine tri aminokiseline, ________________, ______________________ i ____________________(navedi imena tri aminokiseline). Za fiziollošku konformaciju ovog proteina neophodne su dvije posttranslacijske modifikacije aminokiselina, a to su ________________________ i _________________________

A

niz AK - glicin, prolin, Hyp hidroksiprolin, hidroksilacija i glikoksilacija

42
Q

U procesu koagulacije thrombin aktivira:

a. protrombin
b. fibrin
c. fibrinogen
d. faktor VIII

A

fibrogen, faktor VII

43
Q

Prikaži opću formulu aminokiselina u formi Zwitter-iona.

A

NH3+
I
R — C — COO-
I
H

44
Q

Proteini koji mogu imati nepravilnu konformaciju i uzrokovati da i drugi proteini zauzmu istu nepravilnu konformaciju, što ima za posljedicu agregaciju, što čini molekularnu osnovu za mnoge bolesti zovu se _______

A

prionski proteini

45
Q

Dva glavna proteina odgovorna za pokretanje mišića su _______ i ______

A

aktin i miozin

46
Q

Za postranslacijske modifikacije kolagena neophodan je vitamin ______

A

vitamin C

47
Q

U kojem organu se konjugira bilirubin? ___________

A

U jetri

48
Q

Što je točno ?

a. svi protein su konformirani tako da imaju minimum energije
b. neki proteini nisu na energetskom minimumu i oni se uvijek razgrađuju proteazama
c. neki neki proteini nisu na energetskom minimum i to je njihova nativna struktura 3b-1
d. chaperoni pomažu svim drugim proteinima u pravilnom konformiranju
e. chaperoni uvijek dovode protein u energetski minimum

A

neki proteini nisu na energetskom minimumu i to je njihova natina struktura, chaperoni pomažu svim drugim proteinima u pravilnom konformiranju

49
Q

Faktor II koagulacije naziva se punim imenom ______, a njegov neaktivni prethodnik _____.

A

trombin, protrombin

50
Q

Faktor I koagulacije naziva se punim imenom ______, a njegov neaktivni prethodnik _____.

A

fibrin, fibrinogen

51
Q

Faktor koji aktivira konverziju fibrinogena u fibrin zove se ______

A

trombin

52
Q

Glavni fiziološki inhibitor trombina je ________

A

antitrombin 3

53
Q

Inaktivni prekursori (prethodnici) enzima koji se konvertiraju u aktivne enzime proteolizom su:

a. kofaktori
b. koenzimi
c. inhibitori
d. aktivatori
e. proenzimi
f. izoenzimi

A

proenzimi i koenzimi

54
Q

Enzimi koji kataliziraju iste biokemijske reakcije, ali zbog malih razlika u sekvenci imaju različita svojstva, npr. različitu Michaelisovu konstantu su:

g. kofaktori
h. koenzimi
i. inhibitori
j. aktivatori
k. proenzimi
l. izoenzimi

A

proenzimi i izoenzimi

55
Q

Glavni fibrinolitički enzim je:

a. fibrin
b. trombin
c. heparin
d. plazmin
e. antitrombin III

A

plazmin

56
Q

Koji od sljedećih receptora plazmatske membrane aktiviraju signalne putove stvaranjem molekularnih dimera koji rezultiraju reakcijama fosforilacije proteina nakon vezanja njihovog specifičnog liganda?

a) Receptori steroidnih hormona
b) Receptorske tirozin kinaze
c) Ionski kanali upravljani ligandom
d) G protein spregnuti receptori

A

receptorske triozin kinaze

57
Q

Prikazan je signalni put:

adrenalin → receptor povezan sa G proteinom → G protein → adenilil ciklaza → cAMP.

Zaokružite sekundarnog glasnika:

A) cAMP
B) G protein
C) GTP
D) adenilil ciklaza
E) G protein-vezani receptor

A

cAMP

58
Q

Koja je od tvrdnji o enzimima točna?

a) Enzimi su proteini koji djeluju kao katalizatori.
b) Enzimi su specifični.
c) Enzimi daju aktivacijsku energiju reakcijama.
d) Aktivnost enzima se može regulirati.
e) Enzimi se mogu koristiti više puta za određenu reakciju.

A

enzimi su proteini koji dijeluju kao katalizatori, enzimi su specifični, aktivnost enzima se može regulirat, enzimi se mogu koristti više puta za reakciju

59
Q

Prijelazno stanje katalizirane reakcije je

a) visoko naseljeni intermedijer na reakcijskom putu.
b) ima veću energiju od one nekatalizirane reakcije.
c) niža energija od energije nekatalizirane reakcije.
d) manje energije od reakcijskog supstrata.
e) vrlo slabo vezan za katalizator.

A

visoko naseljeni intermedijer na reakcijskom putu, ima veću energiju od one nekatalizirane reakcije

60
Q

Jedan od enzima uključenih u glikolizu, aldolaza, zahtijeva Zn2+ za katalizu.
U uvjetima nedostatka cinka, kada enzimu može nedostajati cink, to bi se nazivalo:

A) apoenzim.
B) koenzim.
C) holoenzim.
D) protetička skupina.
E) supstrat.

A

apoenzim

61
Q

Enzimi su efektivni biokatalizatori jer::

A) troše se u reakcijama koje kataliziraju.
B) vrlo su specifični i mogu spriječiti pretvorbu proizvoda natrag u supstrate.
C) dovode reakcije do završetka dok drugi katalizatori dovode reakcije do ravnoteže.
D) povećavaju konstante ravnoteže za reakcije koje kataliziraju.
E) smanjuju aktivacijsku energiju za reakcije koje kataliziraju

A

vrlo su specifični i mogu spriječiti pretvorbu proizvoda natrag u supstrate, smanjuju aktivacijsku energiju za reakcije koje kataliziraju

62
Q

Sljedeći podaci dobiveni su u studiji enzima za koji je poznato da slijedi Michaelis-Menten kinetiku:

V0S ubstrate added (mol/min) (mmol/L)

217 0.8
325 2
433 4
488 6
647 1,000

            Km za taj enzim je::   A) 1 mM. B) 1000 mM. C) 2 mM. D) 4 mM. E) 6 mM.
A

2mM

63
Q

Broj molekula supstrata koje je jedna molekula enzima pri zasićenju pretvorila u produkt u određenoj jedinici vremena naziva se:

A) konstanta disocijacije.
B) konstanta poluzasićenja.
C) maksimalna brzina.
D) Michaelis-Mentenov broj.

A

michaelis - mentenov broj