Biochimie exam 3 Flashcards
1
Q
Quels sont les 3 phases du cycle de krebs
A
- entrée du pyruvate dans la mitochondrie
- décarboxylation du pyruvate dans la mitochondrie
- oxydation du citrate
2
Q
Quel est le bilan énergétique du cycle de kreb
A
- 6 NADH
- 2 FADH ou QH2
- 2 ATP
3
Q
Où se produit le cycle de krebs
A
Matrice mitochondriale
4
Q
Quel sont les déchet métabolique du cycle de krebs
A
- H2O
- CO2
5
Q
Comment s’apelle le transporteur qui permet de faire passer le pyruvate de l’espace intermembranaire de la mitochondrie à la matrice mitochondriale
A
Translocase du pyruvate
6
Q
Comment est-ce-que le pyruvate entre-t-il dans l’espace intermembranaire de la mitochondrie
A
par une porine en transport passif
7
Q
Vrai ou faux
L’espace intermembranaire est chargé négativement
A
Faux, positifement
8
Q
Combien y-a-t’il de d’enzyme et de coenzyme dans le complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase
A
- 3 enzymes
- 5 co-enzymes
9
Q
Quel est l’avantage du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase
A
produit ne diffusent pas dans le millieu mais subissent la catalyse de l’enzyme suivant
10
Q
Quel est le désavantage du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase
A
pas de diffusion des intermédiaire
11
Q
Quel sont les 3 enzymes du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase
A
- Pyruvate décarboxylase
- Dihydrolipoyl transacetylase
- Dihydrolipoyl dehydrogenase
12
Q
Quels sont les 5 co-enzymes du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase
A
- Thiamine pyrophosphate
- Co-enzyme A
- FAD
- NAD
- Acide lipoic
13
Q
Comment d’ATP peut être créé grâce au cycle de krebs d’un acétyl-CoA
A
12 ATP
14
Q
Vrai ou Faux
le cycle de krebs ne nécessite pas d’O2 pour fonctionner
A
Faux
15
Q
Quels sont les étape pour passer du pyruvate à l’acétyl-CoA
A
pyruvate -> hydroxyéthyl TPP -> groupe hydroéthyl + acide lipoïque -> Acétyl-CoA
16
Q
Quel enzyme fait la réaction pyruvate -> hydroxyéthyl TPP
A
Pyruvate décarboxylase
17
Q
Quel enzyme fait la réaction hydroxyéthyl TPP -> groupe hydroéthyl + acide lipoïque
A
Dihydroliposyl transacétylase
18
Q
Quel enzyme fait la réaction groupe hydroéthyl + acide lipoïque -> Acétyl-CoA
A
Dihydroliposyl déhydrogénase
19
Q
Quel molécule inhibe la pyruvate déhydrogénase
A
- NAD+
- CoA-SH
20
Q
Quel molécule active la pyruvate déhydrogénase
A
- Acétyl-CoA
- NADH
21
Q
Quel enzyme fait la réaction pyruvate déhydrogénase -> PDH-P
A
PDH kinase
22
Q
Quel molécule active la PDH kinase
A
- NADH
- Acétyl-CoA
23
Q
Quel molécule inhibe la PDH kinase
A
pyruvate
24
Q
Quel enzyme fait la réaction PDH-P -> pyruvate déhydrogénase
A
PDH phosphatase
25
Quel molécule active la PDH phosphatase
Ca
26
Quels sont les 8 étapes du cycle de krebs
citrate -> isocitrate -> alpha-cétoglutarate -> succinul-CoA -> succinate -> fumarate -> Malate -> Oxaloacétate
27
Quel enzyme fait la réaction citrate -> isocitrate
aconitase
28
Quel enzyme fait la réaction isocitrate -> alpha-cétoglutarate
Isocitrate déshydrogénase
29
Quel enzyme fait la réaction succinul-CoA -> succinate
Succinyl CoA sunthetase
30
Quel enzyme fait la réaction alpha-cétoglutarate -> succinul-CoA
Complexe alpha-cétoglutarate déhydrogénase
31
Quel enzyme fait la réaction succinate -> fumarate
succinate déhydrogénase
32
Quel enzyme fait la réaction fumarate -> Malate
fumarase
33
Quel enzyme fait la réaction Malate -> Oxaloacétate
malate déshydrogénase
34
Quel enzyme fait la réaction oxaloacétate -> Citrate
citrate synthase
35
A quel étape du cycle de kreb y-a-t-il réduction de NAD+ en NADH+H
- isocitrate -> alpha-cétoglutarate
- alpha-cétoglutarate -> succinyl CoA
- Malate -> Oxaloacétate
36
A quel étape du cycle de kreb y-a-t-il réduction de FAD en FADH2
succinate -> fumarate
37
A quel étape du cycle de kreb y-a-t-il production d'ATP
succinyl CoA -> succinate
38
A quel étape du cycle de kreb y-a-t-il production d'H2O
fumarate -> malate
39
Quel enzyme du cycle de krebs sont des stéréoenzyme
aconitase et fumarase
40
Pourquoi le cycle de kreb fonctionne comme un enzyme
- augmente la vitesse de réaction sans subir de tranformation réelle
- dégrade l'acétyl-CoA
- les intermédiaires du cycle sont régénéré
- une petite quantité d'intermédiaire siffit pour métaboliser un grand nombre d'acétyl-CoA
41
De quoi dépend la vitesse de la dégradation de l'acétyl-CoA
de la concentration des intermédiaires donc de la concentration des enzymes
42
Quel sont les réaction anaplérotique du cycle de kreb
- glutamate -> alpha-cétoglutarate (transamination)
- oxaloacétate -> aspartate (transamination)
- pyruvate -> oxaloacétate (pyruvate décarboxylase)
43
Quel sont les deux types de modulation du cycle de krebs
- effecteurs allostérique
| - modification covalentes
44
Quel peut être le nombre de mitochondrie dans dans une cellule
1 à 500 000
45
Quel est la longueur et le diamètre de la mitochondrie
- longueur: 0,2 à 0,8 um
| - Diamètre: 0,5 à 1,5 um
46
Quel est l'origine des protéines mitochondriales
- minorité de l'ADN mitochondriale
| - majorité de l'ADN chromosomique
47
quel sont les structures de la mitochondrie
- 2 membranes
| - 1 matrice
48
Décrire la membrane mitochondriale externe
- pauvre en protéine
- perméable grâce à la porine
- petite surface de contact
49
Décrire la membrane mitochondriale interne
- riche en protéine
- imperméable aux ions et substances polaires
- transport actif
- formation d'un gradient
- permet la génération d'énergie
- grande surface de contact grâce aux crête
50
Que contient la matrice mitochondriales
- complexe de la pyruvate déshydrogénase
- enzymes du cycle du citrate
- enzymes d'oxydation des acides gras
51
Où se fait l'oxydation de NADH et FADH
chaine de transport des e- dans le membrane mitochondriale interne
52
Quels sont les 2 parties de la phosphorylation oxydative
- formation d'un gradient de concentration en proton
| - synthèse d'ATP par l'ATP synthase
53
Qu'est-ce-que un couple rédox
e- voyagent d'un élément très réducteur vers un agent très oxydant
54
Pourquoi le NADH créé 3 ATP
car il permet de pomper 3 électrons dans l'espace intermembranaire et chaque électron crée un ATP
55
Quels sont les 3 complexe de la chaine de transport d'e- du NADH
- complexe de NADH-ubiquinone réductase
- Complexe ubiquinol-cytochrome c réductase
- Complexe cytochrome c oxydase
56
Quel est l'intermédiaire entre le premier et le deuxième complexe de la chaine de transport d'e
ubiquinone
57
Quel est l'intermédiaire entre le deuxième et le troisième complexe de la chaine de transport d'e-
cytochrome C
58
Quel est l'accepteur final d'e- dans la phosphorilation oxydative
O2
59
Quel est le complexe qui permet l'oxydation de la FADH2
complexe succinate-ubiquinone réductase
60
Quels sont les deux type d'agent découplant de la respiration
- actificiel : 2,4-dinitrophénol
| - naturel: la thermogénine de la graisse brune des animaux hibernant
61
Expliquer le fonctionnement de la 2,4-dinitrophénol
transport facilement les H+ d'un côté à l'autre de la membrane et donc réduction de la phosphorylation oxydative
62
Expliquer le fonctionnement de la thermogénine
- sa synthèse est stimulé par l'adrénaline
| - le découplage provoqué par la thermogénine permet le dégagement de chaleur
63
Quel sont les 2 navette qui permette l'entré dans la mitochondrie du NADH
- navette du glycérol phosphate
| - navette malate-aspartate
64
Où est active la navette du glycérol phosphate
- cerveau
- tissu adipeux brun
- muscle du vol chez les insectes
65
Où est active la navette malate-aspartate
- foie
| - coeur
66
Vrai ou Faux
| les e- ne sont transféré à l'O2 que losque l'ADP est phosphorylé de façon concomitante en ATP
Vrai, en d'autre mot plus il y a d'ADP plus la phosphorylation oxydative fonctionne
67
Vrai ou Faux
| Chez les euraryotes, il y a de multiples origine et terminaison
Vrai
68
Quel ADN polymérase est impliqué dans la réplication de l'ADN
- ADN polymérase I
| - ADN polymérase III
69
Quel ADN polymérase est impliqué dans la réparation de l'ADN
- ADN polymérase I
| - ADN polymérase II
70
Vrai ou Faux
| L'ADN polymérase III est un dimère d'holoenzyme
Vrai
71
Fonctionnement des ADN polymérases
- appariement correct du dNTP
- attaque nucléophile du phosphore alpha du dNTP par l'hydroxyle 3' libre
- formation d'un lien phosphodiester et élimination du groupe pyrophosphate
- l'enzyme saute au nucléotide suivant
72
Caractéristiques de l'ADN polymérase III
- nécessite une matrice et une amorce avec une extrémité OH en 3'
- est une enzyme processive
- a une activité polymérase 5'-3'
- a une activité exonucléase 3'-5'
73
Quel est l'avantage que l'ADN polymérase est une enzyme processive
- il suffit d'un petit nombre d'enzyme processive pour copier l'entièreté du génome
74
Description d'un génome
dépositaire de l'information génétique
75
Vrai ou Faux
| Les acides nucléique sont des polymère de nucléotides
Vrai
76
De quoi est composé un nucléotide
- sucre à 5 carbone
- base azoté
- un groupe phosphoryle
77
Quels sont les 2 types de nucléotide
- ribonucléotide
| - désoxyribonucléotide
78
Quels sont les 2 types de base azotée
- les pyramidines
| - les purines
79
Quels base azoté fait partie des pyramidine
- uracile
- thymine
- cytosine
80
Quels base azoté fait partie des purines
- adénine
| - guanine
81
Vrai ou Faux
| la liaison phospho-anhydeidw fournie l'énergie nécessaire aux réaction énergétique
Vrai
82
Quel est la règle de Chargaff
A/T = G/C = 1
83
Combien y-a-t'il de lien hydrogène entre A et T
2 pont H
84
Combien y-a-t'il de lien hydrogène entre C et G
3 pont H
85
Vrai ou Faux
| l'ADN est un polymère linéaire de désoxyribonucléotides unis par des liaisons phosphodiester 5'-3'
Faux, 3'-5'
86
Caractéristiques de la double hélice
- sens de la polymérisation 5'-3'
- extrémité 5' = phosphate
- extrémité 3' = OH
- à pH neutre, les polyanions sont complexés avec le Mg2+ ou les protéines cationiques
- association antiparallèle de l'ADN en double hélice
- brins sont complémentaires
- la torsion est engendré par les noyau hydrophobe
- présence d'un petit sillon et d'un grand sillon
87
Quels sont les force qui stabilise la double hélice
- les forces hydrophobes
- les forces de Van der Waals
- les liaisons hydrogène
- les interactions électrostatiques entre les groupes phosphate et Mg2+ ou les protéine cationiques
88
Vrai ou Faux
| L'ADN monocaténaire est plus stable que lADN bicaténaire
Faux, c'est l'inverse
89
Quels sont les agents causals in vivo de la dénaturation de l'ADN
- la réplication
| - la transcription
90
Quels sont les agents causals in vitro de la dénaturation de l'ADN
- augmentation de la température
| - agents chaotropes
91
Quels sont les différentes conformations de l'ADN
- ADN-B: ADN classique
- ADN-A: ADN plus tordue, plus serré
- ADN-Z: ADN gauche (tiré)
92
Quels sont les différents types d'ADN
- ADN génomique
- ADN mitochondrial
- ADN chloroplaste
93
Quels sont les particularité de l'ARN
- Sucre = ribose
- T est remplacé par U
- Brin monocaténaire qui peut s'apparier et former des régions bicaténaires appelées duplex
94
Quels sont les types d'ARN et leurs fonctions
- ARNr: intégré aux ribosomes
- ARNt: transporte l'aa jusqu'au ribosome
- ARNm: résultat de la transcription de l'ADN codant pour une séquence d'aa
- petits ARN: activité catalytique
95
Quels sont les 3 stades de compression de l'ADN nucléaire
- le collier de perles
- le solénoïde
- les boucles de chromatine associées à des protéines non-histoniques
96
Quels sont les différents type d'histone
- H1
- H2A
- H2B
- H3
- H4
97
Fonctionnement de la synthèse des fragments Okazaki
- synthèse d'une amorce d'ARN par la primase du complexe du primosome
- synhèse d'un ADN par l'ADN polymérase III
98
Quels sont les propriétés enzymatiques de l'ADN polymérase I
- activité exonucléase 5'-3' (élimination de l'amorce)
- activité exonucléase 3'-5' (lecture d'épreuve)
- activité polymérase 5'-3' (synthèse d'ADN)
99
Condition de fonctionnement de l'ADN ligase
- ADN avec une extrémité 3'OH
- ADN avec une extrémité 5'P
- de l'énergie ATP chez les eucaryotes et les bactériophages
100
Quels sont les problème de la fourche de réplication
- synthèse du brin retardé
- déroulement de l'ADN entraîne des torsions en aval
- évitement des boucles à épingle à cheveux
- une fourche avec 2 ADN polymérase III qui vont dans le même sens
101
Quels est la solution de la synthèse du brin retardé
- Les fragment d' Okazaki
- L'élimination de l'amorce d'ADN par l'ADN polymérase I
- L'éliminaiton des brèches par l'ADN ligase
102
Quel est la solution au déroulement de l'ADN qui entraine des torsions en aval
- détorsion par l'hélicase: la vitesse de distorsion est couplée à la vitesse de polymérisation
103
Quel est la solution pour éviter la formation d'épingle à cheveux
SSBP se fixant sur les brin monocaténaire empêche l'ADN de se réapparier
104
Propriété de SSBP
- fixation coopérative
| - est un tétramère
105
Solution à la fourche avec 2 ADN polymérase III qui vont dans le même sens
-formation d'un bouche de la matrice du brin retardé
106
Vrai ou Faux
| Les histones sont responsable de la lenteur de la réplication, car ils reste fixés à l'ADN pendant la réplication
Vrai
107
Conséquence d'une mutation chez une organisme unicellulaire
- mort de l'organisme
| - gêne se transmet à la descendance
108
Conséquence d'une mutation chez une organisme pluricellulaire
- croissance anarchique d'une cellule
- perte de fonction avec une mort cellulaire
- pas de transmisson à la descendance sauf si elle touche le génome d'une cellule germinale
109
Quels sont les causes de modifications chimiques de l'ADN
- rayons UV
- radiation ionisantes
- substances chimiques
110
Quels sont les types de modification chimique
- méthylation
- désamination
- dépurination
- dépyrimidination
111
Quels sont les mécanismes de réparation de l'ADN
- réparation par mécanisme général d'excision-réparation
- réparation des dimires de thymine
- réparation d'une désamination d'une cytosine
112
Par quels molécule est fait la réparation par mécanisme général d'excision-réparation
- endo et exonucléase
- DNA plymérase I
- ADN ligase
113
Par quels molécule est fait la réparation des dimires de thymine
-enzyme photoactivatrice
114
Par quels molécule est fait la réparation d'une désamination d'une cytosine
- uracile N-glycosylase
- endonucléase
- ADN polymérase I
- ADN ligase
115
définition d'un gène
séquence d'ADN transcrite
116
Quels sont les gènes
- gène d'entretien
- gène qui ne s'expriment que dans des circonstances particulières
- gène exprimés dans certaines cellule
117
Quels sont les gènes d'entretine
- ARNr
- ARNt
- protéine via les ARNm
118
Qu'est-ce-que le transcripteur contient
- l'ARN polymérase responsable de la synthèse de l'ARN
- des facteurs de transcription
- des protéines qui détordent partiellement l'ADN
119
Quels sont les 3 types d'ARN polymérase
- ARN polymérase I transcrit les grands ARNr
- ARN polymérase II transcrit les ARMm
- ARN polymérase III trancrit les ARNt et les petits ARNr
120
Vrai ou Faux
Tous les ARN polymérase dérivent donc d'un ancêtre commun
121
Quels sont les différences entre les ADN polymérase et les ARN polymérase
- ADN pol à une amorce
| - les nucléotide sont différents
122
Quels sont les 3 étapes de la transcription
- initiation de la transcription
- étape de l'élongation de la transcription
- terminaison de la transcription
123
Qu'est-ce-qu'il est nécessaire à l'initiation de la transcription
- facteurs de transcription
| - séquences promotrices
124
Quel est la différence entre un promoteur puissant et un promoteur faible
- promoteur puissant: séquences consensus conservées
| - promoteur faibles: séquences consensus dégénérées
125
Vrai ou Faux
| Si la cellule se divise, il y a une diminution du taux de transcription des gènes ribosomaux
- faux, augmentation
126
Comment fonctionne l'initiation de la transcription
- recherche des séquences promotrices par l'ARN polymérase
- fixation de l'ARN polymérase sur la séquence promontrice
- ouverture de la double hélice
- arrivée du ribonucléotide 3P par diffusion
- catalyse de la liaison phosphodiester
127
Fonctionnement de l,élongation de la transcription
- l'ADN polymérase reste verrouillé à l'ADN
- sigma quitte l'ARN polymérase
- arrivée de Nus A
128
Quels sont les sites de terminaison de la transcription
- richesse en G ou C
- site palindromique
- Enroulement de l'ARN transcrit autour de la protéine Rho
129
décrire un promonteur puissant
- permet la synthèse de protéine demandées en grande quantité
130
Propriété des répresseurs de promoteur puissants
- s'attachent à des séquences particulières
- n'interagissent par nécessairement directement avec l'ARN polymérase
- sont souvent des protéines allostérique qui peuvent être activées par de petite molécules
131
Comment est-ce-que les répresseurs inhibe-t-il l'ARN pol
- empêche l'ARN polymérase de se fixer sur le promoteur
- inhibent l'étape de l'initiation
- bloquent l'avancement de l'ARN polymérase
132
Propriétés des activateurs de promoteurs faibles
- s'attachent aux séquences consensus particulières situées près du promoteur
- interagissent directement avec l'ARN polymérase
- sont souvent des protéines allostérique qui peuvent être activées par de petites molécules
133
3 types de remaniements
- soustraction de nucléotides
- addition de nucléotides non codés par le gène
- modification covalente de certaines bases
134
But du remaniements des transcrits primaires
- rendre les ARN plus stables, les protéger contre les nucléases
- rendre les ARN plus aptes à remplir leur rôle biologique
135
Par quoi est fait la maturation des précurseurs commun de l'ARNt et ARNr des ARNt
- par la ribonucléase P
- par la ribonucléase D
- par l'ARNt nucléotidyl transférase
- par des modification covalente des bases
136
Vrai ou Faux
| La maturation de l'ARNr est toujours couplée à l'assemblage des ribosomes dans le nucléole
Vrai
137
Par quoi est fait la maturation des précurseurs commun de l'ARNt et ARNr des ARNr
- ribonucléase III
138
Quels sont les étapes de la maturation de l'ARNm chez les eucaryotes
- capping en 5'
- polyadénylation en 3'
- épissasge des introns dans le noyau
139
Expliquer la polyadénylation en 3'
- séquence de polyadénylation à l'extrémité 3'
- coupure par une endonucléase en aval de la séquence de polyadénylation
- ajout d'une queue de poly A
