Biochimie exam 2 Flashcards
Définition d’un enzyme
protéine fabriquée par l’organisme qui permet l’activation ou l’accélération de réaction chimique
Quel est l’effet d’un enzyme
réduit l’énergie d’activation nécessaire pour démarrer la réaction
Définition de l’entropie
niveau de désorganisation de la matière
Quels sont les deux facteur d’une collision réussis entre des réactifs
- énergie suffisante des réactifs
- orientation adéquate des réactifs
Par quoi est définit le sens d’une réaction
la thermodynamique
Définition de l’état de transition
état où l’énergie est maximale dans le processus d’une réaction
Définition de l’état fondamentale
étape où l’énergie est le plus bas dans une réaction
Vrai ou Faux
Un catalyseur est efficace à 100% des réaction et donne toujours le bon produit
Vrai
Quels sont les propriétés des enzymes
- forte augmentation de la vitesse de réaction
- peut avoir une haute ou faible spécificité pour le substrat
- spécificité de réaction
- rendement de 100% -> aucun sous-produit
- ne produit pas de sous produit toxique
Vrai ou Faux
Une même réaction peut être utilisé pour déclencher des fonctions différentes sur des substrats différents
Vrai
Comment nomme-t-on un enzyme
substrat + ase
Quels sont les 6 classe principale d’enzyme basées sur le type de réaction catalysée
- oxydo-réductase
- Transférase
- Hydrolase
- Lyases
- Isomérase
- Ligase
Fonction d’une oxydo-réductase
ajoute ou enlève un électron d’un substrat
Fonctions d’une transférase
Transfère un groupement d’une molécule vers une autre molécule
Fonction de hydrolase
ajoute une molécule d’eau à un substrat pour créé une division de la molécule
Fonction d’une lyases
Catalysent le réactif d’élimination non hydrolytique et non oxydant et créent une double liaison. Dans le sens inverse, les lyases additionnent un groupement sur une double liaison
Fonction d’une ligases
catalyse la jonction de deux molécules par de nouvelles liaisons covalentes avec hydrolyse concomitante de l’ATP ou d’autres molécules similaires.
Comment est appelé un anticorps utilisé comme enzymes
Abzymes
Définition d’un centre actif
partie de l’enzyme responsable de l’activité catalytique
Comment est-ce-que le substrat se lie à l’enzyme
liaison faible comme liaison H, van der Waals, liasion ionique et parfois des interactions hydrophobes
Qu’est-ce-que une holoprotéine
constitué seulement d’acide aminé
Qu’est-ce-que une hétéroprotéine
apo-protéine + coenzyme
Qu’est-ce-que une holoenzyme
apo-enzyme + cofacteurs
Qu’est-ce-que une apoenzyme
une enzyme sans son coenzyme, c’est-à-dire la protéine à laquelle la coenzyme se liera pour produire une holoenzyme active
Qu’est-ce-que une apoprotéine
la partie protéique d’une molécule qui comporte une partie non protéique
Quels sont les types de coenzymes
- ions essentiels
- composés organique ( co-substrats, groupement prosthétique)
Quels sont les propriétés d’un coenzymes
- essentiel à l’activité de l’enzyme
- localisé dans le centre actif de l’enzyme
Quels sont les origine des coenzymes
- métabolites courants
- vitamines (hydrosolubles, liposolubles)
Quels sont les rôles des coenzymes
- transporteur d’hydrogène
- transporteur de groupement aminés
- transporteur de groupement carbonés
qu’est-ce-qu’un cofacteur
composé chimique non protéique mais qui est nécessaire à l’activité biologique d’une protéine
Vrai ou Faux
NADH est la forme oxydé du NAD
Faux, forme réduite
Quel est la différence en NAD et NADP
d’un groupement phosphate sur le second carbone du β-D-ribofurannose pour le NADP
Quel est la réaction catalysé du NAD et NADP
transfert de 2 e- et d’un H+
Qu’est-ce-que la vitamine B2
Vitamine sensible à la lumière contenant 2 phosphates
Quel est la réaction catalysé de la vitamine B2
Transfère un H+, un H- et 2e-
Qu’est-ce-que la coenzyme Q ubiquinone
vitamine liposolube
Quel est la réaction catalysé de la coenzyme Q ubiquinone
transfère de 2 e- et 2 H+
Quel sont les états d’oxydation de la coenzyme Q ubiquinone
- ubiquinone (Q)L oxydé
- semiquinone (GH+)
- ubiquinol (QH2): réduite
Fonction de la vitamine B6
métabolisme des a.a:
- transamination
- décarboxylation
- réaction d’élimination
- racémization
- réactions aldol
Quels sont les transporteurs de groupements carbonés
- biotine (VB8)
- Thiamine (VB1) et Thiamine pyrophosphate
- Acide pantothénique (VB3) et coenzyme A
- acide folique (VB6)
- acide lipoïque
- Vitamine B12
Fonctions de la biotine
- Transporteur du groupe carboxyl: carboxylation nécessite l’activation di bicarbonate avec 1 ATP pour former un carbonyl phosphate
Fonctions de Thiamine et du thiamine pyrophosphate
impliqué dans le métabolisme des hydrate de carbones: catalyse les décarboxylation des alpha céto-acides, la formation et le cleavage des alpha-hydroxycétone
Fonction de acide pantothénique
Constituant du CoA et des protéines transporteuses des radicaux acyles (ACP) ou acétyle
Qu’est-ce-que l’acide folique (V B9)
composé de la ptérine, de l’acide p-aminobenzoïque et du glutamate
Fonction de l’acide folique (V B9)
-Tranfert des groupes monocarbonés
- Synthèse de la méthionine, homocystéine, purine et thymine
-
Quel est la différence entre la PABA et la sulfanilamide
subtitution du carbone supra-benzénique par un sulfure et un groupement NH2 ainsi de perte d’un H+
Fonction des acide lipoïque
- pas une vitamine
- ressemble à la biotine
- porteur de groupe acyl
- retrouvé dans le pyruvate déshydrogénase et dans l’alpha-cétoglutarate déshydrogénase
Fonction de la vitamine B12
- convertie en deux coenzyme: 5-désoxyadénosylcobalamine et méthylcobalamine
- Catalyse de 3 type de réactions:
1. réarrangement intramoléculaire
2. réduction de ribonucléotides en désoxyribonucléotide
3. Transfert du groupe méthyl dans la synthèse de la méthionine - Synthétisée uniquement par quelques espèces bactérienne
Quels sont les 3 formes de la vitamine A
- Rétinol
- Esters de rétinol
- Rétinal
Quel est la source de la vitamine A
végétale ou synthétisés à partir du beta-carotène
Quel type de molécule est la vitamine A
molécule isoprénique lyposoluble
Fonction de la vitamine A
Affecte la croissance et la différentiation
Comment est-ce-que la vitamine A est capté
Grâce aux sels biliaires, esters de rétinol dans les canaux chylifères
- Transport au foie ou aux cône et bâtonnets grâce aux rétinol-binding protéin
- Conversion du rétinol en rétinal dans la rétine et lié à l’opsine pour former la rhodopsine
Quels sont les 2 types Vitamine D
- Ergocalciférol (VD2)
- Cholécalciférol (VD3)
Fonction de la vitamine D
- rôle dans l’homéostasie du phosphore
- régularise l’homéostasie du calcium
Quel est la forme active de la vitamine D
1,25-dihydroxycholecalciférol
Quel est la forme majeur de la vitamine D
25-hydroxycholecalciférol
Comment est absorber la vitamine D
la 7-déshydrocholestérol est converti dans la peau par l’action des UV en cholécalciférol
Qu’est-ce-que la Vitamine E
puissants antioxydants qui préviennent l’oxydation des membranes
La vitamine K est essentiel à quel fonction du métabolisme
coagulation
Quel est l’effet de l’augmentation de la température dans une réaction
augmente l’énergie initial ce qui fait qu’il est plus facile de faire une réaction
Quel est l’effet de l’addition d’un catalyseur dans un réaction
Réduit l’énergie d’activation de la réaction ce qui fait qu’il est plus facile de faire la réaction
Quel est l’équation de vitesse d’un réaction d’ordre 0
V=K
Quel est l’équation de vitesse d’un réaction d’ordre 1
v= k(A)
Quel est l’équation de vitesse d’un réaction d’ordre 2
v= k(A)(B)
Vrai ou Faux
Un réaction qui ne contient qu’un seul substrat ne peut être d’ordre 2
Vrai
Quels sont les 2 option lorsqu’une enzyme et un substrat entre en collision
- L’enzyme transforme le substrat en produit
- Liaison entre l’enzyme et du substrat et se détache
À quoi sert l’équation de Michaelis-Menten
détermination de la vitesse pour différence concentration de substrat
Quel est l’équation de Michaelis-Menten
v= Vmax(S)/ (Km + (s)) ou Km est la concentration à la Vmax/2
À quoi ressemble l’enzyme lorsque la réaction est rapide
semble libre car il est constamment utilisé
À quoi ressemble l’enzyme lorsque la réaction est lente
semble toujours occupé
Quel est le turnover d’une enzyme
nombre de molécule de substrat transformées par unité de temps par un seul molécule enzymatique ou par un seul site enzymatique, lorsque la concentration de l’enzyme est le seul facteur limitant de la vitesse et à une température et à un pH déterminés
Qu’est-ce-que l’unité enzymatique
la quantité d’enzyme capable de transformer 1 umol de substrat par min à 25 degrés celsius dans des conditions optimales de pH et de coenzymes
Quels sont les effets de la température sur les activités enzymatiques
basse température = moins de collision
haute température = plus de dénaturation
Quels sont les effets du pH sur les activités enzymatiques
- variation de la structure et des charges du site actif
- à pH extrême: dénaturation de l’enzyme et du substrat
Quels peut-être les modulateurs de l’activité des enzymes
- accumulation du produit
- contrôle génétique : induction et répression
- Inhibiteurs
- Modulation covalentes réversibles
- Modulation allostérique (cinétique non michalienne)
- Zymogènes : tripsine non-active