Biochimie Ch.2 (métabolisme des glucides) Flashcards
Nucléotides des bases puriques
Adénine et guanine
Nucléotides des bases pyrimidiques
Cytosine, uracile, thymine
Comment l’ATP fournit-elle de l’énergie?
Une de ses deux liaisons riches en énergie (ATP = AMP-P-P) est hydrolysée
ATP + H2O –> ADP + Pi
Nommer les 4 mécanismes de régénération de l’ATP
1) Phosphorylation de l’ADP en ATP à partir de la créatine-phosphate qui possède un groupement phosphate à haut potentiel énergétique
2) Phosphorylation de l’ADP en ATP à partir de seulement l’ADP (ADP + (AMP-P) –> (ADP-P) +AMP
3) Phosphorylation au niveau du substrat (substrat : métabolites formés par les voies métaboliques utilisés pour le catabolisme de carburants)
4) Phosphorylation oxydative (énergie des électrons soustraits de métabolites de la glycolyse et du cycle de Krebs qui réagissent avec l’oxygène)
Décrire les deux fonctions de la créatine kinase
1) Utilise la liaison riche en énergie dans la créatine-phosphate pour former une liaison riche en énergie dans l’ATP
2) Mise en réserve de groupement phosphate à haut potentiel énergétique sous la forme de créatine-phosphate
Créatine-P + ADP ⇌ Créatine + ATP
Direct : effort (favorisée)
Indirect : repos
Ordre d’importance des carburants utilisés par le muscle cardiaque
acides gras > glucose > lactate > acides aminés (peu)
Nommer 2 réactions de la glycolyse où il y a consommation d’ATP
1) glucose + ATP → G-6-P + ADP (catalysé par hexokinase)
2) F-6-P + ATP → F-1,6-bisP + ADP (catalysé par phosphofructokinase (PFK))
Nommer une réaction de la glycolyse où il y a production d’ATP
PEP + ADP → pyruvate + ATP (catalysé par pyruvate kinase)
Pourquoi la glycolyse produit deux molécules de pyruvate à partir d’une molécule de glucose?
Glucose (6C) → F-1,6-bisP (6C) → glycéraldéhyde-3-P (3C) + dihydroxyacétone phosphate (3C) (interconvertibles) → 2 pyruvates
Bilan de la glycolyse (ATP)
4 ATP formés
2 ATP utilisés
Sans compter 6 ATP générés par oxydation des 2 NADH
Glycolyse : voie catabolique ou anabolique ?
Voie catabolique car part d’un composé complexe pour générer des composés simples ce qui produit de l’énergie
Nommer la coenzyme qui participe à la réaction d’oxydoréduction dans la glycolyse et donner sa fonction
Nicotinamide adénine dinucléotide (NAD+/NADH)
Fonction : transporter les électrons vers la chaine respiratoire de la mitochondrie
Réaction de la transformation du pyruvate en acétyl-CoA (et localisation et enzyme)
Dans la mitochondrie:
pyruvates + NAD+ + CoA-SH → Acétyl-CoA + NADH + CO2
Enzyme : pyruvate déshydrogénase (PDH)
Nommer les coenzymes du complexe PDH et les vitamines dont elles dérivent
NAD+/NADH : niacine CoA-SH : acide pantothénique FAD : riboflavine TPP : thiamine acide lipopoïque (pas issu d'une vitamine)
Nommer la voie métabolique responsable de l’oxydation complète de l’acétyl-CoA, identifier ses principaux métabolites
Le cycle de Krebs
Principaux métabolites : acétyl-CoA, citrate, a-cétoglutaratem succinyl-CoA, maltate, oxaloacétate
Nommer les 2 fonctions principales du cycle de Krebs
1) Carrefour métaboliques des glucides, lipides et acides aminés
2) Voie catabolique avec génération de CO2 + intermédiaires énergétiques (NADH/FADH2/GTP)
Réaction de synthèse du citrate
acétyl-CoA + oxaloacétate + H2O → citrate + CoA-SH
Enzyme : citrate synthase
Perte de la liaison riche en énergie de l’acétyl-CoA = réaction irréversible = point de contrôle du cycle
Réaction de synthèse du succinyl-CoA
a-cétoglutarate + CoA-SH + NAD+ → succinyl-CoA + CO2 + NADH
Enzyme : a-cétoglutarate déshydrogénase
Les mêmes coenzymes sont utilisés pour l’a-cétoglutarate désydrogénase et la pyruvate déshydrogénase
Réaction de synthèse de l’oxaloacétate
malate → oxaloacétate + NAD+ + NADH
Enzyme : malate déshydrogénase
Cheminement des électrons dans la chaîne respiratoire
Largage des électrons du NADH au complexe I (agent oxydant) → réduction de la coenzyme Q
Largage des électrons du FADH2 au complexe II → réduction de la coenzyme Q
Oxydation de la coenzyme Q par réduction de complexe III → oxydation complexe III par réduction cytochrome c → transport des électrons par cytochrome c au complexe IV → réduction de l’O2 pour former H2O
Comment et sous quelle forme est convertie l’énergie provenant de la réoxydation du NADH et du FADH2 dans le processus du transport des électrons dans la chaine respiratoire?
Énergie sous forme de gradient électrochimique (H+)
Le transport des électrons dans la chaine respiratoire sert à transférer les H+ dans l’espace intermembranaire mitochondriale
Complexes I, III et IV capables de pomper les H+
Expliquer la phosphorylation oxydative (processus de regénération de l’ATP)
Réactions des complexes I, III et IV → libération d’énergie → transport de H+ vers l’espace intermembranaire mitochonriale → gradient électrochimique (H+) → H+ reviennent dans la mitochondrie par ATP synthase → énergie → fusion de Pi + ADP → 3 ATP/NADH et 2 ATP/FADH2
L’ATP est produit dans les mitochondries mais utilisée dans le cytosol. L’ATP est une molécule grosse et chargée, ce qui fait qu’elle ne peut traverser la membrane mitochondriale interne. Quel moyen utilise la cellule afin d’acheminer l’ATP au cytosol?
Elle utilise la translocase de l’ATP et l’ADP.
Permet de façon passive mais spécifique la sortie de l’ATP et l’entrée d’ADP dans la mitochondrie
Au niveau de la glycolyse, quel est l’effet d’une variation du rapport ATP/ADP et quelle est l’enzyme dont l’activité est principalement contrôlée par cette variation?
Activité glycolyse = fonction inverse de la variation ATP/ADP
Enzyme : PFK
Quelles substances sont responsables du contrôle de l’activité de la PFK et quel est leur effet sur le contrôle de la glycolyse?
ATP : modulateur allostérique négatif
AMP : modulateur allostérique positif
Comment l’AMP se forme-t-elle?
Sa concentration augemente lorsque les besoins en ATP augmentent (concentration ATP diminue)
Utilisation ATP → augmentation concentration ADP → favorise la génération d’ATP donc AMP
car ADP + ADP → ATP + AMP
Quel est l’effet d’une augmentation des rapports NADH/NAD+ et ATP/ADP sur l’oxydation du pyruvate en acétyl-CoA et le cycle de Krebs?
Signal négatif sur l’activité de ces processus métaboliques
Augmentation NADH → diminution NAD+ → réactions utilisant NAD+ affectées
Avantage de rapport NADH/NAD+ et ATP/ADP élevé
niveau d’énergie cellulaire adéquat → Signal inhibiteur ATP → la cellule peut utiliser le glucose à d’autres fins (synthèse glycogène, acides gras)
Glycémie et rapports NAD+/NADH et ATP/ADP élevés ; sort du glucose?
Dirigé vers le glycogène car la glycolyse est diminuée, la réaction catalysée par la pyruvate déshydrogénase et le cycle de Krebs
2 effets d’un rapport ATP/ADP élevé sur l’activité de l’ATP synthase et la respiration mitochondriale
1) diminution de l’activité de l’ATP synthase car ADP limitant
2) diminution de l’activité de la chaine respiratoire car gradient H+ accroit (à cause de #1) et ralentit le transport des H+ par les complexes
Conséquence de l’hypoxie ou l’anoxie sur l’activité de la chaîne respiratoire
Diminution puis arrêt
L’accepteur final d’électrons (O2) plus disponible
Conséquence de l’hypoxie ou l’anoxie sur l’activité de l’ATP synthase
Diminution puis arrêt
Chaine respiratoire arrêtée = absence de gradient = protons ne reviennent plus dans la mitochondrie = n’empruntent plus la voie de l’ATP synthase
Conséquence de l’hypoxie ou l’anoxie sur la concentration du NADH mitochondrial
Augmentation
Chaine ne fonctionne plus = NADH ne peut plus être oxydé en NAD+
Conséquence de l’hypoxie ou l’anoxie sur l’activité du cycle de Krebs
Diminution puis arrêt
manque de transporteurs d’électrons (NAD+ et FAD)
Conséquence de l’hypoxie ou l’anoxie sur l’oxydation du pyruvate dans la mitochondrie
Diminution puis arrêt
NAD+ indisponible pour la pyruvate déshydrogénase
Conséquence de l’hypoxie ou l’anoxie sur la concentration d’ATP dans le cytosol
Diminuée car la principale source vient de l’ATP synthase