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BACTÉRIO-COURS 12 Flashcards

1
Q

Quelle signe permet de remarquer qu’il y a réparation dans un graphique ?

A

Courbe avec un coude signifie que cell capable de réparer des dommages à Adn jusqu’à un certain temps, après mort. Tandis que linéaire mort direct.

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2
Q

Quels sont les deux systèmes de réparation?

A

1) Les systèmes de réparation spécifiques: Ils reconnaissent des dommages spécifiques dans l’ADN
2) Les systèmes de réparation non-spécifiques (généraux): reconnaissent des distorsions dans la double-hélice, qui sont causées, entre autre, par des mauvais appariements de bases.

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3
Q

Quelle est la conséquence de la désamination des bases (système de réparation spécifique)?

A

de changer l’appariement entre les nucléotides, et causent des mutations ponctuelles de type transition.

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4
Q

Elles sont causé par quoi les désaminations?

A

désaminations surviennent de manière spontanée, spécialement lorsque la température de croissance est élevée, elles peuvent être induites par des agents désaminants.

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5
Q

La désamination de la cytosine donne quoi?

A

un uracil. c’est pour cela qu’il est absent dans l’ADN.

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6
Q

Comment se déroule la réparation de bases désaminées?
(type 1 réparation )

A

1-Glycolyse ADN : brise lien glycosyl entre base endommagée et sucre.
2-AP endonucléase (apurinique ou apyrimidinique) : coupe lien phosphodiester du coté 5’
3- polymérase ADN I: exonucléase et polymérase ajoute bon nucléotide.
ligase: lie tout

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7
Q

C’est quoi 5-méthylcytosines désaminées?
À quoi sert le 5-méthylcytosines?
Problématique?

A

5-méthylcytosines dans leur ADN à la place de cytosines. protègeraient l’ADN contre le phénomène de restriction.

5-méthylcytosines comme hot-spots pour la mutagénèse, puisque leur désamination fait apparaître des thymines, une base normale de l’ADN, qui ne sera pas reconnue par la N-glycosylase-uracil.
le système mismatch n’a aucun moyen de réparer ça.

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8
Q

Chez E.coli, qui est responsable de la méthylation du 2e C ( dans le consensus) ?

A

cytosine ADN méthylase (Dcm)

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9
Q

Comment se déroule la réparation chez E.coli du mauvais appariement TG?

A

Vsr endonucléase (VSR pour «very short patch repair») enlève le T de cette séquence.
ensuite réparé par la polymérase ADN I

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10
Q

Trouver l’énoncé qui est faux à propos de la désamination des bases.
A. Le système de réparation des bases désaminées est un système de réparation spécifique.
B. Une glycosylase spécifique à la base désaminée élimine cette dernière avant l’action d’une AP-endonucléase.
C. La désamination de la cytosine donne de l’uracile.
D. La désamination des cytosines peut survenir spontanément.
E. Aucune de ces réponses

A

C

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11
Q

Les dommages causés par l’oxygène réactif sont causé par quoi?

A

Réactions métabolique normales ou par des conditions environnementales

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12
Q

Quelles sont les enzymes qui permettent de contrer l’accumulation d’oxygène réactif?

A

superoxide dismutase, catalase, peroxydase

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13
Q

Quelle est une des lésions la plus mutagène causé par l’oxygène réactif?

A

le 8-oxoG. apparait chez ADN va s’apparier avec adénine. cause transversion G/C-T/A

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14
Q

Comment se déroule la réparation du 8-oxo-G?

A

1- mutT (phosphatase), converti 8-oxo-dGTP en dGMP= ne permet pas de s’incorporer dans ADN
2-mutY (glycosylase) enlève adénine incorporée en face du 8-oxo-G
3-mutM (glycosylase)=enlève le 8-oxoG incorporé dans ADN

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15
Q

Qu’est ce qui est affecté par les agents alkylants? Quel système de réparation est utilisé?

A

système de réparation spécifique. les bases et les phosphates dans l’ADN sont alkylés.

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16
Q

Quels sont les alkylants?

A

EMS, MMS ET NTG

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17
Q

Quels groupes de la guanine et de l’adénine sont les plus sensibles aux agents alkylants ? Ils sont alkylés par quoi? Conséquences des modifications?

A

N7 ETN3. Par EMS ou MMS.
Altère l’appariement et cause des distorsion majeures dans la double-hélice.

18
Q

Le NTG attaque quoi de la guanine et de la thymine ?
Conséquence?

A

Attaque le O6 et O4.
très mutagène, car double hélice ne subit pas de distorsion assez importante pour etre reconnu.

19
Q

Par quoi les bases alkylées peuvent être éliminées? Qu’est ce qui peut enlever les groupes méthyls présent sur la O6 et O4?

A

Par glycosylase.
Par méthyltransférase.

20
Q

Par quoi sont causé les dommages causés par UV? Quel type de dommage crée?

A

causé par irradiation aux uv.
Forme un dimère de pyrimidine où les anneaux des deux pyrimidine à côtés sont fusionnés.

21
Q

Nom du système de réparation contre l’Anneau cyclobutane chez E.coli?

A

Photoréactivation.

22
Q

Comment se nomme l’enzyme responsable de la photoréactivation?
Mécanisme?

A

Photolyase, contient FADH, absorbe lumière qui lui donne de l’E et sépare les bases fusionnées.
Mais des glycosylases peuvent aussi enlever des dimères de pyrimidine.

23
Q

Trouver l’énoncé qui est vrai à propos des systèmes de réparation spécifiques
A. Le produit du gène mutT est une glycosylase qui convertit le 8-oxo-dGTP en 8-oxo-dGMP.
B. Le produit du gène mutY est une phosphatase qui peut enlever une adénine incorporée en face du 8-oxo-G.
C. La photolyase est activée par la lumière pour séparer les bases thymines fusionnées.
D. Les méthyltransférases empêchent la modification des bases par les agents alkylants.
E. Aucune de ces réponses

A

C

24
Q

Le système de réparation de mauvais appariements de bases dirigé par la méthylation («methyl-directed mismatch repairsystem») (type réparation non-spécifique), permet de réparer quoi?

A

correction des erreurs de réplication
distorsions mineures de la double-hélice, mauvais appariements de base, glissement cadre lecture, alkylation distorsions mineurs. Pas de distorsions importantes qui bloque réplication.

25
Q

Quelle fonction a la polymérase ADN ?

A

exonucléase 3’ vers 5’ qui leur permet d’enlever les nucléotides qui ont été incorrectement incorporés

26
Q

Comment fonctionne le système de réparation du mauvais appariement?

A

il est dégrade la région, puis la polymérase III met les bons nclt.

27
Q

Comment le système de réparation de mauvais appariements peut discriminer le brin nouveau et celui de la matrice?

A

brin matrice est méthylé et brin nouveau ne l’est pas

28
Q

Quels protéines sont utilisés et déroulement dans le système de mauvais appariements de bases?

A

Protéine: MutS, MutL et MutH.
1-MutS reconnait le mismatch
2-MutS(2) , MutL(2) et MutH complexe formé apres hydrolyse de l’ATP
3- coupure par MutH dans le brin nouveau dans séquence GATC non-méthylée
4-cassure transformé en trou (gap) par exos 5’-3’ ou inverse. direction est déterminé par UvrD.
5- re-synthèse fait par polIII (pas pol I)
Ligase lie tout

29
Q

Trouver l’énoncé qui est faux à propos de la réponse «methyl-directed mismatch repair».
A. Ce système de réparation peut corriger les erreurs de réplication.
B. La méthylation de l’adénine aux séquences GATC permet à ce système de déterminer le brin à réparer.
C. Contrairement aux autres systèmes de réparation, pol I et non pol III est utilisée pour ajouter les nucléotides manquants.
D. Ce système reconnait des distorsions mineures dans la double-hélice.
E. Aucune de ces réponses.

A

C

30
Q

Que fait la réparation par excision de nucléotides? (type 2)

A

non-spécifique
coupe les nclt . reconnait distorsion souble-hélice MAJEURES, qui bloque la progression d ‘une fourche de réplication (dimères de pyrimidines)
Réponds pas aux autres lésions

31
Q

Gènes et mécanisme de la réparation par excision de nclt?

A

uvrA, uvrB, uvrC, uvrD, polA et lig
1-UvrA et UvrB complexe se déplace le long de la double-Hélice. quand rencontre distorsion important il arrête. UvrA quitte et remplacé par UvrC
2- UvrC et UvrB stimule l’endonucléase UvrC qui coupe 4 nclt côté 3’ et 7 nclt côté 5’
3- Hélicase UvrD élimine nclt
Poly I re-synthèse le brin enlevé
Ligase colle tout

32
Q

Trouver l’énoncé qui est faux concernant la réparation par excision de nucléotides
A. L’inactivation de ce système peut mener à la mort cellulaire à cause de la fragilité des fourches de réplication arrêtées par différents obstacles (e.g. dimères de pyrimidines).
B. Pol I et non Pol III est impliquée dans ce système.
C. UvrD agit comme hélicase.
D. Le complexe UvrA(2)-UvrB se déplace le long de la double-hélice à la recherche de distorsions majeures dans la double-hélice.
E. Aucune de ces réponses.

A

E

33
Q

Qu’est ce qui réprime les gènes du régulon SOS (type 2)?

A

LexA

34
Q

À quoi sert la protéine RecA (fait partie du régulon SOS)?

A

Elle est activée quand elle interagit avec ADN simple-brin. Quand activé elle interagit avec LexA, ce qui stimule l’autoclivage de LexA.
Rec-A est co-protéase pour le clivage LexA. SI elle est inactivé régulon SOS est alors exprimée.

35
Q

Quels gènes ont retrouve dans le régulon SOS?
Fonction de sfiA?

A

uvrA, uvrB, recF et sfiA.
sfiA: inhibiteur de la division cellulaire, agit en inhibant la protéine Ftsz= cellule ne va pas se diviser.

36
Q

Quand dommages à l’ADN deviennent trop nombreux quels gènes sont utilisés (réponse SOS)? Comment fonctionne?

A

umuC et umuD
UmuD doit s’autocliver pour s’activer, elle demande une grande qt de RecA activée comme co-protéase.
UmuC et UmuD clivées=Poly V: fait des erreurs de réplication
Ajout RecA activé= frome mutasome PolV
mutasome polV passe par-dessus obstacles ADN, ajoute nclt au hasard . complète réplication ADN.

37
Q

Dans quelle situation la réponse SOS est induite?

A

quand stress importants= permettre synthèse de poly translésion incluant poly V =favorise apparition mutations adaptative.

38
Q

Quelles sont les polymérases translésion? Induite par? Quel molécule nécessaire pour leur activité?

A

Pol II, Pol IV et PolV
induites par la réponse SOS
β-clamp est nécessaire , car ne sont pas suffisamment processives pour passer au-dessus d’un dommage à l’ADN

39
Q

Les mutations adaptatives sont induites par quoi? Permettent de faire quoi?

A

Induite par stress.
Permettentl’accélération» de l’évolution pour permettre la survie et l’adaptation aux stress

40
Q

La mutagénèse adaptative dépendant de ?

A

La réponse SOS pour activer poly translésion
Rpos pour inhiber gene mutS (éviter réparer les mut induites par poly translésion, pour inhibition pol III
Réplication à partir de R-loops nécessaire pour induire apparition mut.
cassure double-brin dans ADN (réparés pas proly translésions)

41
Q

Trouver l’énoncé qui est vrai concernant la mutagénèse adaptative.
A. Elle requiert la réponse SOS pour l’inhibition de MutS.
B. Elle requiert la réponse au stress via RpoS pour inhiber MutS et pol III.
C. Elle requiert la réponse SOS pour la synthèse de UvrA, UvrB et UvrC.
D. Elle requiert la formation de R-loops car ils induisent directement des erreurs de réplication.
E. Aucune de ces réponses.

A

B

FINAL (6 decks)

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