BACTÉRIO-COURS 12 Flashcards
Quelle signe permet de remarquer qu’il y a réparation dans un graphique ?
Courbe avec un coude signifie que cell capable de réparer des dommages à Adn jusqu’à un certain temps, après mort. Tandis que linéaire mort direct.
Quels sont les deux systèmes de réparation?
1) Les systèmes de réparation spécifiques: Ils reconnaissent des dommages spécifiques dans l’ADN
2) Les systèmes de réparation non-spécifiques (généraux): reconnaissent des distorsions dans la double-hélice, qui sont causées, entre autre, par des mauvais appariements de bases.
Quelle est la conséquence de la désamination des bases (système de réparation spécifique)?
de changer l’appariement entre les nucléotides, et causent des mutations ponctuelles de type transition.
Elles sont causé par quoi les désaminations?
désaminations surviennent de manière spontanée, spécialement lorsque la température de croissance est élevée, elles peuvent être induites par des agents désaminants.
La désamination de la cytosine donne quoi?
un uracil. c’est pour cela qu’il est absent dans l’ADN.
Comment se déroule la réparation de bases désaminées?
(type 1 réparation )
1-Glycolyse ADN : brise lien glycosyl entre base endommagée et sucre.
2-AP endonucléase (apurinique ou apyrimidinique) : coupe lien phosphodiester du coté 5’
3- polymérase ADN I: exonucléase et polymérase ajoute bon nucléotide.
ligase: lie tout
C’est quoi 5-méthylcytosines désaminées?
À quoi sert le 5-méthylcytosines?
Problématique?
5-méthylcytosines dans leur ADN à la place de cytosines. protègeraient l’ADN contre le phénomène de restriction.
5-méthylcytosines comme hot-spots pour la mutagénèse, puisque leur désamination fait apparaître des thymines, une base normale de l’ADN, qui ne sera pas reconnue par la N-glycosylase-uracil.
le système mismatch n’a aucun moyen de réparer ça.
Chez E.coli, qui est responsable de la méthylation du 2e C ( dans le consensus) ?
cytosine ADN méthylase (Dcm)
Comment se déroule la réparation chez E.coli du mauvais appariement TG?
Vsr endonucléase (VSR pour «very short patch repair») enlève le T de cette séquence.
ensuite réparé par la polymérase ADN I
Trouver l’énoncé qui est faux à propos de la désamination des bases.
A. Le système de réparation des bases désaminées est un système de réparation spécifique.
B. Une glycosylase spécifique à la base désaminée élimine cette dernière avant l’action d’une AP-endonucléase.
C. La désamination de la cytosine donne de l’uracile.
D. La désamination des cytosines peut survenir spontanément.
E. Aucune de ces réponses
C
Les dommages causés par l’oxygène réactif sont causé par quoi?
Réactions métabolique normales ou par des conditions environnementales
Quelles sont les enzymes qui permettent de contrer l’accumulation d’oxygène réactif?
superoxide dismutase, catalase, peroxydase
Quelle est une des lésions la plus mutagène causé par l’oxygène réactif?
le 8-oxoG. apparait chez ADN va s’apparier avec adénine. cause transversion G/C-T/A
Comment se déroule la réparation du 8-oxo-G?
1- mutT (phosphatase), converti 8-oxo-dGTP en dGMP= ne permet pas de s’incorporer dans ADN
2-mutY (glycosylase) enlève adénine incorporée en face du 8-oxo-G
3-mutM (glycosylase)=enlève le 8-oxoG incorporé dans ADN
Qu’est ce qui est affecté par les agents alkylants? Quel système de réparation est utilisé?
système de réparation spécifique. les bases et les phosphates dans l’ADN sont alkylés.
Quels sont les alkylants?
EMS, MMS ET NTG
Quels groupes de la guanine et de l’adénine sont les plus sensibles aux agents alkylants ? Ils sont alkylés par quoi? Conséquences des modifications?
N7 ETN3. Par EMS ou MMS.
Altère l’appariement et cause des distorsion majeures dans la double-hélice.
Le NTG attaque quoi de la guanine et de la thymine ?
Conséquence?
Attaque le O6 et O4.
très mutagène, car double hélice ne subit pas de distorsion assez importante pour etre reconnu.
Par quoi les bases alkylées peuvent être éliminées? Qu’est ce qui peut enlever les groupes méthyls présent sur la O6 et O4?
Par glycosylase.
Par méthyltransférase.
Par quoi sont causé les dommages causés par UV? Quel type de dommage crée?
causé par irradiation aux uv.
Forme un dimère de pyrimidine où les anneaux des deux pyrimidine à côtés sont fusionnés.
Nom du système de réparation contre l’Anneau cyclobutane chez E.coli?
Photoréactivation.
Comment se nomme l’enzyme responsable de la photoréactivation?
Mécanisme?
Photolyase, contient FADH, absorbe lumière qui lui donne de l’E et sépare les bases fusionnées.
Mais des glycosylases peuvent aussi enlever des dimères de pyrimidine.
Trouver l’énoncé qui est vrai à propos des systèmes de réparation spécifiques
A. Le produit du gène mutT est une glycosylase qui convertit le 8-oxo-dGTP en 8-oxo-dGMP.
B. Le produit du gène mutY est une phosphatase qui peut enlever une adénine incorporée en face du 8-oxo-G.
C. La photolyase est activée par la lumière pour séparer les bases thymines fusionnées.
D. Les méthyltransférases empêchent la modification des bases par les agents alkylants.
E. Aucune de ces réponses
C
Le système de réparation de mauvais appariements de bases dirigé par la méthylation («methyl-directed mismatch repairsystem») (type réparation non-spécifique), permet de réparer quoi?
correction des erreurs de réplication
distorsions mineures de la double-hélice, mauvais appariements de base, glissement cadre lecture, alkylation distorsions mineurs. Pas de distorsions importantes qui bloque réplication.
