Aula Prática 4- EXTRAÇÃO DE DNA Flashcards

1
Q

Que sentido segue o fluxo da informação genética?

A

DNA – RNA – proteínas.

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2
Q

Quais as unidades monoméricas dos ácidos nucleicos?

A

Os nucleótidos.

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3
Q

Quais os 3 componentes característicos de um nucleótido?

A
  • Base nitrogenada
  • Açúcar (Pentose)
  • Grupo fosfato (PO4-)
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4
Q

Que componente é responsável pela carga global negativa do DNA?

A

O grupo fosfato.

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5
Q

Quando o DNA estiver desenrolado, quem irá estabilizar a sua carga negativa?

A

Os iões Mg2+, pois as cargas positivas deste ião ligar-se-ão às cargas negativas do grupo fosfato.

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6
Q

Que bases nitrogenadas apresentam dois anéis?

A

A Guanina e a Adenina.

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7
Q

O que é a extração do DNA?

A

É o processo pelo qual o DNA é separado das proteínas, membranas e todo o restante material celular contido no interior da célula.

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8
Q

Que passos estão envolvidos na extração do DNA?

A

A extração de DNA normalmente envolve 3 passos: 1) lise celular, 2) separação do DNA dos restantes componentes celulares, 3) isolamento do DNA.

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9
Q

Porque é que este processo requer um maneio cuidadoso?

A

Para evitar a contaminação e o cruzamento de amostras.

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10
Q

Como pode ser feita a lise celular?

A

A disrupção da membrana celular pode ser realizada através de:
1) aumento da temperatura para que se aumente a fluidez membranar;
2) DTT (ditiotreitol), um agente redutor com capacidade para reduzir as ligações dissulfureto presentes nas proteínas membranares;
3) um detergente como o SDS (dodecil sulfato de sódio) com capacidade para quebrar a membrana celular.

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11
Q

A inativação das proteínas ocorre através do quê?

A

Da desnaturação pelo calor;
Digestão enzimática (por exemplo proteinase K).

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12
Q

Se quisermos que o DNA seja preservado, isto é não degradado, que cuidados deve se ter ao longo do procedimento?

A

A temperatura deverá ser mantida abaixo dos 60 ºC e os períodos de incubação não deverão exceder os 15-20 minutos.

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13
Q

De que duas maneiras se pode realizar a separação do DNA dos outros componentes celulares?

A

Por centrifugação ou através da adição de solventes orgânicos.

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14
Q

Se o DNA for separado recorrendo a solventes orgânicos que fases surgiram?

A

Duas fases distintas irão surgir:
uma fase orgânica no fundo do tubo;
uma fase aquosa no topo do tubo contendo o DNA.
Neste momento, o DNA pode ser simplesmente retirado com uma pipeta do topo do tubo.
Se for necessário, o DNA poderá ser filtrado e concentrado.

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15
Q

Em que comprimento de onda o DNA tem o seu máximo de absorção?

A

260 nm.

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16
Q

O que é verificado no final do processo de extração?

A

O rendimento do DNA obtido e a sua pureza.

17
Q

Como podemos saber o rendimento do DNA?

A

Através de leitura de absorvância (Abs) ou com uma eletroforese em gel de agarose.

18
Q

Para averiguar acerca da pureza do DNA é suficiente medir a sua absorvância nos 260 nm? Porquê?

A

Não, pois existem outras moléculas que também absorvem nesse comprimento de onda, como o RNA. E outras absorvem na gama do UV também, como proteínas, sais e outros.

19
Q

Que outras leituras adicionais deverão ser feitas no espectrofotômetro e a que comprimentos de onda?

A

A deteção de compostos orgânicos, a 230 nm, e a deteção de proteínas, a 280 nm, para que se possa ter uma estimativa mais correta do grau de pureza do DNA extraído.

20
Q

Para calcular a pureza do DNA após medir leituras adicionais, que cálculos devem ser feitos? E como analisá-los?

A

As razões de Abs 260/280 e 260/230 irão fornecer um resultado mais fiável relativamente à pureza da amostra. Assim, um DNA puro deverá apresentar os seguintes rácios:
Abs 260/280 = 1,8 – 2,0
Abs 260/230 > ou = 2,0

21
Q

Que valores demonstram contaminação da amostra por proteínas ou outras substâncias orgânicas?

A

Se as razões 260/280 e 260/230 forem inferiores aos valores no seguinte intervalo:
Abs 260/280 = 1,8 – 2,0
Abs 260/230 > ou = 2,0

22
Q

Neste procedimento foi efetuada uma eletroforese, que tipo de gel foi utilizado?

A

Gel de agarose.