[ARN Pol II] La Maturation De ARNm Flashcards
V/F: La coiffe est ajoutée à l’extrémité des ARNm dans le cytoplasme.
La maturation des ARN prémessager en ARN messager (ajout de la coiffe, épissage, polyadénylation) a lieu dans le noyau. L’ajout de la coiffe se fait rapidement après le début de la transcription, lorsque l’ARN prémessager en cours de synthèse fait 25 à 30 nt.
V/F : La coiffe est ajoutée par une enzyme “HAT”.
La coiffe (“cap” en anglais) n’est pas ajouté par “HAT” (qui est une enzyme acétylant les histones) mais par une guanylyl transférase.
Quels sont les ARN coiffés?
Les ARN trasncrits par l’ARN Polymérase II comme les ARNm et certains ARNsn sont coiffés. Les ARN transcrits par l’ARN Polymérase I ou III, comme les ARNt et ARNr ne sont pas coiffés.
La coiffe est ajoutée:
à l’extrémité 5’ des ARN
Structure et rôle de la coiffe
La coiffe est une [guanosine] liée à l’extrémité [5’] des ARNm par une liaison [5’‑5’] triphosphate. Cette [guanosine] sera [méthylée] en position [7] pour donner la coiffe de type [0].
Dans le noyau la coiffe est liée par le complexe [CBC ] et dans le cytoplasme par le complexe [eIF4F].
La présence d’une coiffe protège les ARN des dégradations par des [exonucléases], favorise l’[épissage] du premier intron, l’[export] nucléocytoplasmique et dans le cytoplasme l’initiation de la [traduction]
Les séquences importantes pour indiquer où doit se faire la polyadénylation:
Les séquences importantes pour indiquer où doit se faire la polyadénylation sont la séquence signal de polyadénylation AATAAA qui est suivie d’une séquence riche en G/T.
Après transcription la séquence AAUAAA sur l’ARN sera reconnue par CPSF et la séquence riche en G/U par CstF. Après formation du complexe de polyadénylation, il y aura clivage au “site de polyadénylation” (entre AAUAAA et G/U) et polymérisation d’une queue polyA à partir de la nouvelle extrémité 3’.
La polyAdénylation
La polyadénylation a lieu suite à la [transcription] d’une séquence signal de polyadénylation.
Les facteurs [CPSF ] et CstF associés au [CTD] de l’ARN Polymérase [ II] au cours de l’élongation se fixeront à l’ARN prémessager sur respectivement la séquence signal de polyadénylation [AAUAAA] et une séquence riche en [G/U] .
Ce changement dans le complexe d’élongation provoquera la [terminaison] de la transcription.
CFI, CFII, [PAP] rejoindront le complexe: il y aura alors [clivage] et polyadénylation de l’ARN prémessager.
La queue polyA est recouverte de [PABII] dans le noyau et de [PABI] dans le cytoplasme.
La présence d’une queue polyA facilite l’[export] nucléocytoplasmique et accroit la [demi‑vie] des ARN messagers.
Elle facilite l’initiation de la [traduction] en stabilisant la liaison du complexe de liaison à la coiffe grâce à une interaction PABI/[eIF4G] /eIF4E.
étapes de la polyadénylation
L’ARN Polymérase II transcrit la séquence signal de polyadénylation.
Le facteur CPSF se fixe sur l’ARN à la séquence signal de polyadénylation AAUAAA.
Le facteur CstF se fixe sur l’ARN à la séquence riche en G/U.
L’ARN forme une boucle suite à l’interaction entre CPSF et CstF.
CF1 et CF2 rejoignent et stabilise le complexe.
PAP rejoint le complexe.
L’ARN est clivé au site polyA, 10-35 nt après la séquence signal de polyadénylation.
CF1, CF2 et CstF sont relargués du complexe.
Le morceau d’ARN en 3’ du site de clivage est dégradé.
La PAP (PolyA-Polymérase) ajoute lentement une douzaine de A à la nouvelle extrémité 3’ de l’ARN.
Une première molécule de PABII se lie sur la dizaine de A polymérisé.
La PAP polymérise rapidement 200 à 250 A .
D’autres molécules de PABII recouvrent la queue polyA au fur et à mesure de sa synthèse.
PAP et CPSF s’en vont- les PABII restent sur la queue polyA.
V/F: L’épissage permet d’enlever les exons de relier les introns entre eux.
C’est l’inverse: L’épissage permet d’enlever les introns de relier les exons entre eux.
Le site 5’ d’épissage (ou 5’ss):
correspond à la jonction exon/intron, est aussi appelé site donneur, se situe à l’extrémité 5’ de l’intron à enlever, contient le dinucléotide invariant GU
Le site 3’ d’épissage (ou 3’ss):
correspond à la jonction intron/exon, est aussi appelé site accepteur, contient le point de branchement, contient une séquence riche en pyrimidines, se situe à l’extrémité 3’ de l’intron à enlever, contient le dinucléotide invariant AG
La réaction d’épissage, formation des liaisons
La réaction d’épissage se fait via deux réactions de [transestérifications]. La première relie [ l’adénine] du point de branchement à [la guanine] de l’extrémité [5’] de l’intron par une liaison [2’‑5’] . La deuxième relie les deux [exons] entre eux par une liaison [3’‑5’] .
Les UsnRNP
Les UsnRNP sont des particules formées de UsnRNA (petits ARN nucléaires riche en U), de protéines Sm qu’on retrouve dans toutes les particules et qui s’assemblent en anneau autour d’une séquence spécifique de l’ARN appelée site Sm et de protéines spécifiques à chaque particule.
Les snRNP U1, U2, U4, U5, U6 sont des constituants du splicéosome et catalysent l’épissage des ARN prémessager dans le noyau.
Les réponses correctes sont : sont localisées dans le noyau, sont composées d’ARN et de protéines, sont des constituants du splicéosome, contiennent des protéines Sm
U1snRNP
reconnait le site 5’
se fixe au site donneur (5’) via une interaction ARN/ARN entre le snRNA U1 et l’ARN prémessager.
U2AF
reconnait la séquence polypyrimidique, se fixe à la séquence polypyrimidique via une interaction Protéine/ARN.
U2AF est une protéine de liaison à l’ARN (“RNA Binding Protein”) qui possède un domaine de liaison à l’ARN (“RBD” pour “RNA Binding Domain”) de type RRM (“RNA Recognition Motif”).
U2AF permet le recrutement de la snRNP U2 au site de branchement avec lequel le snRNA U2 peut s’apparier selon la qualité de la séquence consensus.
