Allmän virologi Flashcards
Vad är ett virus?
Liten biologisk enhet som måste infektera levande celler för att föröka sig.
Hur stora är virus jämfört med bakterier?
En tusendel av bakteriers storlek.
Kan man se de största virusen i ljusmikroskop?
Ja.
Vad skyddas virusets DNA av?
En kapsid.
Med vad binder viruset till cellen för att komma in?
Glykoprotein E.
Vad innebär en lytisk infektion?
Att ta kål på en cell så den spricker.
Vad innebär en latent infektion?
Att viruset ej dödar cellen utan bara utnyttjar dess maskineri och sedan lämnar cellen.
Vad sker under bakteriofagens “attachmentfas”?
Den attachar till en receptor hos värdcellen/bakterien.
Vad sker under (vissa) bakteriofagers “penetrationsfas”?
Kapsiden stannar på utsidan av cellen, medan genomet skjuts in i cytoplasman.
Vad sker under bakteriofagens “biosyntesfas”?
Viruset syntetiserar nya virusbeståndsdelar. Cellens nukleinsyra degraderar.
Vad sker under bakteriofagens “mognadsfas”?
Nya virus skapas från de nysyntetiserade kapsiderna och genomen.
Vad sker under bakteriofagens “releasefas”?
De nya virusen frisätts från värdcellen för att infektera närliggande celler och fortsätta att replikera sig.
Vad är plaque assay?
En metod för att räkna virus på en bakteriefylld agarplatta.
Vad innebär provirus?
När ett retrovirus integrerar sitt genom med värdcellens kallas detta genom för provirus.
Hur lyder virus taxonomiändelser med start från “hela virussläktet”, virales?
Familj: -viridae
Subfamilj: -virinae
Genus: Virus.
Var tror man att virus kommer ifrån?
Från RNA-proteinvärlden.
Vad kallas virus som har membran?
Enveloped virus.
Är virus med membran känsligare än virus utan?
Ja, de kan skadas med eter, uttorkning, kokning o.s.v.
När räknas viruset som dött?
Om membranet förstörs.
Vad har enveloped virus på membranet?
“Piggar” av glykoprotein.
Vad har helikala virus istället för en kapsid?
En s.k. nukleokapsid som ser ut som en spiral.
Har vissa virus ett enveloped core-DNA?
Ja.
Vad är sputnik virions?
Som små hjälparvirus som finns inuti ett virus.
Vad finns utanpå vissa virus kapsider (som inte är spikes, eller som åtminstone kan kallas något annat)?
Fibriller.
Har virusgenom introner?
Nej.
Vad är kännetecknande för virus läsramar?
De överlappar, vilket gör att de kan börja läsas av varsomhelst.
Vad gör panhandle-strukturer?
Så att ribosomen kan binda in och bli ett aktivt säte, varpå den kan öppna sig och translatera.
Hur många strukturella C,prM/M och E har Flavivirus?
3.
Hur många icke-strukturella NS1-NS5 har Flavivirus?
7.
Vad innebär Baltimore-klassificering?
7 grupper beroende på bildande av virus mRNA.
Hur kan virus klassificeras och vilken av dessa sätt ingår Baltimore-klassificeringen i?
1) Kliniskt (huruvida det är luftburet, dess tropism, sjukdomar det orsakar).
2) Biologiskt (storlek, fenotyp).
3) Genetiskt (t.ex. Baltimore).
Vad innebär konfluens?
Man täcker hela agarplattan med celler innan man låter viruset infektera cellerna och sedan räknar man placken som uppstår.
Vad innebär virustropism?
Platsen där ett specifikt virus föredrar att replikera, d.v.s. de platser som har flest receptorer som passar viruset i fråga.
På vilka två sätt kan penetrationen av ett enveloped virus gå till?
Fusion eller endocytos.
Hur sker fusion av ett enveloped virus?
Viruset binder till receptorn och smälter in med cellmembranet, varefter den släpper in kapsiden med sitt genom.
Hur sker endocytos av ett enveloped virus?
Viruset binder in, men invaginerar sig in i cellens membran och behåller således sitt eget membran, vilket bildar en endosom.
Vad sker med endosomen?
PH sänks något, vilket förändrar glykoproteinet och
konformationsändringen gör att kapsiden kan gå ut.
Vad innebär tvåstegssystemet för att penetrera?
- Viruset binder in till CD4-armen på T-lymfocyten, som känner av virusets gp120-envelopeprotein.
- Armen dras inåt till receptorn CCR5.
- Viruset förankrar sig med hjälp av gp41.
- HRr interagerar med HR2 och viruset kan fusera.
Vad sker under “avklädningen”/eklipsfasen?
Kapsiden plockas isär och genomet transporteras till delar av cellen där replikation och translation sker.
Varför innehåller RNA-virus RNA-dependent RNA-polymeras?
För att kunna syntetisera nya virusgenom i värdcellen.
Vad sker under ihopsättningsfasen?
Kapsid bildas runt RNA:t och skalet/”envelopet” bildas.
Vad sker under mognadsfasen?
Proteolytisk klyvning.
Vad sker under frisättningsfasen?
Virus med hölje knoppar ut vid cellmembranet eller släpps ut via exocytos.
Hur lämnar nakna virus cellen?
Genom cytolys (lytiska virus).
Var mognar vissa virus där de också blir “enveloped”?
Vid ER-membranet.
Vad gör “precursor membrane protein”?
Klyver membran vilket är signalen för att viruset är färdigt.
Till vad används furin?
Proteolytisk klyvning.
Hur designas antiviraler?
Så att de kan slå ut något av de 7 stegen i livscykeln.
Förmågan hos ett virus att orsaka sjukdom, dess virulens/patogenes, avgörs av …
- Typen av virus.
- Infektionsväg.
- Spridningsvägar i kroppen.
- Immunförsvaret.
Vilka är faserna i en virusinfektion?
- Invasion.
- Lokalspridning inklusive lymfkörtlar.
- Systemisk viremi.
- Sekundär infektion av målorgan.
- Immunopatologisk reaktion.
- Återhämntning.
Vilket är papillomavirus målorgan?
Skinn.
Vilka är influensavirus målorgan?
Lungor.
Vilket är neurotrofa virus målorgan?
Hjärnan.
Vad innebär pantropism?
Att viruset har ett brett tropismspektra.
Nämn tre av cellers försvar mot virusattack.
1) Apoptos.
2) Autofagocytos.
3) RNA-interferens (blockerar virusreplikation).
Nämn några patogena effekter av immunsystemets reaktioner mot virus.
Virusinfekterade celler dödas. Inflammatorisk reaktion. Cytokinstormar => illamående.
