9-Organification de l'azote Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que l’organification de l’azote?

A

L’ammoniac peut être organifié : Les réactions qui couplent l’ammoniac aux composés organiques, c’est-à-dire qui attachent l’azote aux atomes des carbones

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Q

Qu’est-ce qui fait de l’organification de l’azote une réaction importante?

A

la formation de glutamate et la formation de glutamine.

Rôle mineur pour l’asparagine et le carbamoyl-phosphate

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3
Q

Pourquoi l’ammoniac est important

A

source directe pour les composé azoté

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4
Q

Les composés primaires azotés participent à quoi?

A

synthèse de nombreux autres composés organiques
Ex:
-les autres acides aminés (via les aminotransférases)
-les produits dérivés (neurotransmetteurs, mélanine, etc.),
-les purines, les pyrimidines,
-les sucres,
-les lipides aminés, les porphyrines, le groupement hème, les vitamines, les alcaloïdes, etc.

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5
Q

l’assimilation de l’azote inorganique en forme d’ammoniac se passe où?

A

se passe plutôt chez les plantes et les organismes unicellulaires

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6
Q

Quels sont les 5 réactions pour organifier l’ammoniac

A
  1. Glutamine synthétase (tous les organismes)
  2. Glutamate synthase (chez les procaryotes et les plantes)
  3. Glutamate déshydrogénase (tous les organismes)
  4. Asparagine synthétase (voie secondaire)
  5. Carbamoyl-phosphate synthétase (tous les organismes)
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7
Q

Décrivez la réaction glutamine synthétase

A

ammoniac+ glutamate=>glutamine
la glutamine synthétase est l’enzyme et utilise l’ATP

Glufosinate: inhibiteur de la GS
Chez les mammifères l’enzyme sert à la neutralisation des ions NH3 toxiques
Transport de l’ammoniac vers le foie et les reins

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8
Q

Décrivez la réaction de la glutamate synthase.

A

Glutamine + α-cétoglutarate + NADPH + H+=>2 glutamates + NADP+

L’enzyme Glutamate Synthase produit 2 molécules de glutamate (1 et 2) à partir de la glutamine
Une molécule regénère le glutamate pour la réaction de la GS, l’autre est utilisée comme source d’azote pour former d’autres molécules azotées.

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9
Q

Quel est la différence entre la glutamate synthase et la glutamine synthétase (autre que la réaction)?

A

Synthétase= utilise ATP, synthase n’utilise pas ATP

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10
Q

Chez les bactéries, la GS est régulée pour assurer l’organification de l’azote selon les besoins pour la croissance bactérienne. Quels sont ces 3 mécanismes?

A

1) Rétro-inhibition par les produits de fin de réactions (9 différents)
2) Modification covalente par adénylation (addition d’AMP)
3) Contrôle génétique de l’expression de l’enzyme

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11
Q

Où se fait le régulation feed-back sur l’enzyme bactérienne?

A

L’enzyme bactérienne a 12 sous-unités, chacune avec un centre actif et des sites de liaison pour les régulateurs feedback.

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12
Q

Quel composé sont les inhibiteur de la GS?

A

des dérivés de la glutamine ou du glutamate

Ala,Gly,Ser,Trp,His
Glucosamine6-P, AMP,CTP, carbamoyl-P

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13
Q

Quand est-ce que l’enzyme (GS) est totalement inactive?

A

L’inhibition est cumulative selon le nombre d’inhibiteurs, mais la présence des neuf régulateurs allostériques est requise pour une inhibition complète.

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14
Q

Qu’arrive-t-il lorsque le GS est modifié par adénylation?

A

le site d’adénylation est dans le site actif**

elle est encore plus sensible aux inhibiteurs allostériques.

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15
Q

Décrivez la modification covalente par adénylation

A

Une enzyme, l’adénylyl transférase catalyse l’adénylation (inactivation) et déadénylation (activation) de la GS.

Quand les niveaux de Gln sont élevés, elle travaille dans la direction de l’adénylation et vice-versa.

*On inactive en ajoutant un AMP

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16
Q

Décrivez la Glutamate déshydrogénase ou GLUD

A

alpha-cétoglutarate + NH3 glutamate

Dans cette réaction le NADH ou NADPH agit comment agent réducteur.

La réaction est réversible alors le sens de la réaction est décidé par la concentration des réactifs et produits.

Chez les plantes, elle sert à l’assimilation de l’ammoniac quand les concentrations de NH3 sont élevées. (vers la droite)

Chez les animaux cette enzyme est utilisée plutôt pour éliminer l’excès d’azote. (vers la gauche)

Chez certains organismes, 2 enzymes distinctes (GLUD1 et GLUD2)

17
Q

Quel des 3 mécanismes (GS, GOGAT, GLUD) est le plus utilisé

A

La Km pour l’ammoniac est beaucoup plus faible pour la GS et GOGAT alors c’est la voie préférée.

La GLUD fonctionne seulement quand les concentrations d’ammoniac sont très élevées.