6.Recherche par comparaison de séquences Flashcards
1
Q
Que signifie Blast?
A
Basic Local Alignment Search Tool
2
Q
Quel est l’utilité de Blast?
A
trouve des régions de similarités locales entre des séquences. Le programme compare des séquences nucléotidiques ou protéiques à des bases de données de séquences et calcule la significativité statistique des alignements.
BLAST utilise des heuristiques pour donner des résultats rapidement.
3
Q
Qu’est ce que l’heuristique?
A
méthode de calcul qui fournit une solution rapidement réalisable, mais pas nécessairement optimale
4
Q
Quelle recherche fait Blastn?
A
Nucléotide>Nucléotide
5
Q
Quelle recherche fait Blastp?
A
Protéine>Protéine
6
Q
Quelle recherche fait Blastx?
A
Nucléotide >Protéine
7
Q
Quelle recherche fait tBlastn?
A
Protéine>Nucléotide