6.Recherche par comparaison de séquences Flashcards

1
Q

Que signifie Blast?

A

Basic Local Alignment Search Tool

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Q

Quel est l’utilité de Blast?

A

trouve des régions de similarités locales entre des séquences. Le programme compare des séquences nucléotidiques ou protéiques à des bases de données de séquences et calcule la significativité statistique des alignements.
BLAST utilise des heuristiques pour donner des résultats rapidement.

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Q

Qu’est ce que l’heuristique?

A

méthode de calcul qui fournit une solution rapidement réalisable, mais pas nécessairement optimale

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4
Q

Quelle recherche fait Blastn?

A

Nucléotide>Nucléotide

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5
Q

Quelle recherche fait Blastp?

A

Protéine>Protéine

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6
Q

Quelle recherche fait Blastx?

A

Nucléotide >Protéine

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7
Q

Quelle recherche fait tBlastn?

A

Protéine>Nucléotide

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