2.2.Principales bases de données protéiques

Question 1

Quelles sont les deux bases de données protéiques les plus importantes?

Answer 1

SwissProt et PIR/NBRF

Question 2

Qu’est ce que SwissProt? (date, …)

Answer 2

1986, banque manuellement annotée et nettoyée, maintenant incluse dans UNIPROT (regroupant SwissProt et trEMBL)

Question 3

Qu’est ce que PIR/NBRF? (date, …)

Answer 3

(1984) banque américaine fournissant une classification des protéines basée sur la similarité́ entre les séquences.

Question 4

Que trouve on dans SwissProt?(7)

Answer 4

Données corrigées et validées par des experts. Haut niveau d’annotation
Description de la fonction (références associées)
Localisation des domaines fonctionnels
Modifications post-traductionnelles
Existence de variants, …
Redondance minimale
Nombreux liens vers d’autres banques (60 bases environ selon les origines)

Question 5

Que trouve on dans TrEMBL?

Answer 5

Entrées supplémentaires à SwissProt (pas encore annotées)
Traduction automatique de l’ENA

Question 6

Faire le schéma des baes protéiques

Answer 6

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