6. RNA viry Flashcards
1
Q
ssRNA(+) viry - Picornaviridae - virion, genom, H, zástupci
A
- Pico RNA viridae = malé RNA viry
- nejmenší RNA viry
- VIRION : neobalený, ikosahedrální, 4 strukturní proteiny, průměr cca 30 nm
- GENOM: ssRNA(+), částečně ,,maskován’’ jako H mRNA, 3’ konec polyadenylován, 5’ konec s připojeným proteinem VPg
- translaci zahajuje IRES sekvence na 5’ konci
- obsahuje jeden velký otevřený čtecí rámec
- virová RNA je infekční sama o sobě
- infikují obratlovce - většinou jednoduché a krátké infekce (cca 2-3 dny) horních a dolních cest dýchacích, trávicí soustavy
- 12 rodů
- ZÁSTUPCI:
- > rod APHTHOVIRUS: virus kulhavky a slintavky
- > rod ENTEROVIRUS: Human rhinovirus, Polyovirus, Human enterovirus, Coxsackievirus
- > rod HEPATOVIRUS: virus hepatitidy A
2
Q
ssRNA(+) viry - Picornaviridae - Polyovirus (Poliomyelitida) - zdroj nákazy, přenos, patogeneze, vakcíny
A
= Přenosná dětská obrna
- vysoce nakažlivé virové onemocnění NS
- postihuje míchu, může způsobit celoživotní ochrnutí i smrt
- život ohrožující komplikací je obrna dýchacích a polykacích svalů
- ZDROJ NÁKAZY: člověk, u vzácných případů vakcinační poliomyelitidy i člověk nedávno očkovaný živou vakcínou
- PŘENOS: fekálně orální (ve stolici vylučován velmi dlouho), v menší míře je virus vylučován nasofaryngeálním sekretem (vylučován asi 10 dní)
- PATOGENEZE:
- > vstupní brána - TS, virus se pomnoží v lymfatické tkáni hltanu a střeva, pak vylučován se stolicí
- > V těžších případech virus proniká do krevního oběhu a v průběhu virémie se šíří do dalších orgánů, zejména CNS
- > Replikace viru v buňkách předních rohů míšních vede k jejich zániku a rozvoji chabé parézy až plegie příušních inervovaných svalů
- > Postižení horní krční a prodloužené míchy má za následek obrnu dýchacích svalů
- u dětí často bez symptomů, ale můžou šířit
3
Q
ssRNA(+) viry - Picornaviridae - Polyovirus (Poliomyelitida) - Vakcíny
A
- SABINOVA (OPV)
- > oslabený virus, 1962
- > VÝHODA: snadné podání - orálně, nízká cena
- > NEVÝHODA: ve vzácných případech může dojít ke zpětné mutaci, kdy se vyvine virulentnější virus, co způsobí onemocnění/symptomy onemocnění
- SALKOVA (IPV)
- > inaktivovaný virus, 1955
- > dražší, ale nejsou ta rizika jako u OPV - pokud si to stát může dovolit, používá tuto
- 1988: WHO vyhlásila cíl celosvětové eradikace dětské přenosné obrny, který byl splněn v evropském regionu (21.7.2002), v Africe (25.8.2020)
- ČR:
- > 1939 epidemie s vlnami po 3-5 letech až do 1956
- > onemocnělo asi 13 000 lidí, 1 159 zemřelo
- > 1957: očkování nejprve neživou, pak oslabenou vakcínou - od té doby bez výskytu
- dnes pouze ve dvou zemích dochází k přenosu: Pákistán a Afghánistán + v Africe (protože se tam masivně očkovalo oslabeným virem)
- díky masivnímu očkování se nejspíše vymýtí - WHO ale doporučuje před cestováním do daných zemí dodatečné očkování (booster) - 12 měsíců před
4
Q
ssRNA(+) viry - Picornaviridae - Virus Hepatitidy A - přenos, inkubační doba, symptomy, smrtnost, očkování, léčba
A
= Infekční virová žloutenka A
- v ČR nejčastější žloutenka, ale je málo škodlivá, bo není chronická
- virus vylučován ve stolici
- PŘENOS: fekálně orální
- > Přímo (znečištěné ruce či běžně používané předměty - ,,nemoc nečistých rukou’’)
- > Nepřímo - infikovanou vodou a potravinami
- INKUBAČNÍ DOBA: 15-50 dní, cca 4 týdny
- SYMPTOMY:
- > může zcela asymptomaticky
- > klinické projevy manifestované nemoci začínají jako chřipkové příznaky, zvýšená teplota, nauzea, tlaky v pravém podžebří, nechutenství, následný vznik žloutenky u části pacientů
- > délka trvání potíží je individuální a souvisí s rozsahem postižení jater, které vzniká na podkladě imunitní reakce
- SMRTNOST: 0,1 %, může být až 1,8 % např. u lidí 50 let <
- OČKOVÁNÍ: inaktivované vakcíny
- LÉČBA: symptomatická, důsledné dodržování pravidel osobní hygieny, kontrolní opatření (sledování a vyhledávání kontaktů a očkování osob vystavených riziku VHA)
- virus je stabilní:
- > vydrží kyselé prostředí
- > vydrží mimo organismus poměrně dlouho infekční
5
Q
ssRNA(+) viry - Togaviridae - obal, virion, genom, zástupci
A
- větší než picornaviridae
- OBAL: vzhled připomíná římský plášť (lat. toga)
- VIRION: obalený, 50-70 nm, dva transmembránové glykoproteiny E1-E2
- GENOM: ssRNA(+), 5’ methylguanosinová čepička, na 3’ polyA konec
- strukturní proteiny syntetizované jako polyprotein ze subgenomové RNA
- nestrukturní/replikační proteiny syntetizované jako polyprotein z genomové RNA
- po vstupu do cytosolu translace nejprve nestrukturních a replikačních proteinů
- ZÁSTUPCI:
- > rod ALFAVIRY - přenos krevsajícími členovci - spolu s nějakými flaviviry, bunyaviry a rhabdoviry tvoří skupinu tzv. ARBOVIRŮ (tj. viry přenášené členovci); virus Sindbis, Chikungunya virus
- > rod RUBIVIRY - Virus zarděnek
6
Q
ssRNA(+) viry - TOGAVIRIDAE - Alfavirus
A
- velmi rychlá replikace
- do buňky receptorem zprostředkované endocytózy -> nízké pH v endozomu -> fúze virového obalu s membránou endozomu -> nukleokapsid do cytoplasmy -> rozvolnění nukleokapsidu pomocí ribozomů -> uvolnění RNA -> translace nestrukturních proteinů -> ribozomální frameshift, kdy jsou translatované dva různě dlouhé polyproteiny - delší obsahuje protein nsP4 (virová RdRp) -> syntéza (-) řetězce a z něj subgenomické RNA -> z nich translace strukturních proteinů a genomické RNA -> ta zabalena -> pučení u membrány infikovaných buněk
7
Q
ssRNA(+) viry - TOGAVIRIDAE - Rubella virus (zarděnky) - Přenos, inkubační doba, symptomy, vakcinace, vrozený zarděnkový syndrom
A
= virus zarděnky
- onemocnění rozšířeno po celém světě, v ČR jen ojedinělé případy za rok
- PŘENOS: vzdušnou cestou prostřednictvím kapének nebo kontaktem s kontaminovanými předměty, v těhotenství možný přenos z maty na plod -> vznik vrozeného zarděnkového syndromu
- INKUBAČNÍ DOBA: 14-21 dnů, průměr 18 dní
- SYMPTOMY: drobně skvrnitá, růžová, nesplývající vyrážka (exantém), komplikací mohou být poruchy krve, zánět kloubů nebo mozku; 40 % asymptomatické infekce
- VAKCINACE: u nás zavedeno v roce 1982 u 12letých dívek, od 1986 se očkují všechny děti kombinovanou atenuovanou očkovaní látkou proti spalničkám, příušnicím a zarděnkám (MMR)
- VROZENÝ ZARDĚNKOVÝ SYNDROM: vznik při onemocnění matky v těhotenství, v prvních 3 měsících takto může vést k potratu, k trvalé poruše psychomotorického vývoje, k vrozeným vadám srdce a postižení zraku a sluchu
- pomalejší replikace, asi protože pučí ven přes GA
8
Q
ssRNA(+) viry - FLAVIVIRIDAE - virion, genom, živ. cyklus, zástupci
A
- lat. ,,flavus’’ = žlutá
- VIRION: obalený , 40 - 60 nm, 2 a více povrchových glykoproteinů (E), kapsidový protein (C)
- GENOM: ssRNA (+)
- ŽIVOTNÍ CYKLUS: vstup do buněk - receptorem zprostředkovaná endocytóza -> nízké pH v endozomu -> fúze obalu s membránou endozomu -> genom RNA do cytoplazmy - má v rámci životního cyklu 3 samostatné role: jako mRNA pro translaci všech virových proteinů, jako templát během replikace RNA a jako genom zabalený do nových virových částic
- komáři a klíšťata se dostávají do vyšších nadmořských výšek + lidé víc v přírodě -> vyšší přenos
- ZÁSTUPCI:
- > FLAVIVIRUS - KOMÁŘI: Yellow fever virus (žlutá zimnice), Dengue virus, Japanese encephalitis virus, West Nile virus, Zika virus; KLÍŠŤATA: Virus klíšťové encefalitidy; HEPACIVIRUS: virus hepatitidy C
- > PESTIVIRUS
- > HEPACIVIRUS
- > PEGIVIRUS
9
Q
ssRNA(+) viry - FLAVIVIRIDAE - Yellow fever virus - kde, rezervoár, přenos, inkubační doba, příznaky, formy (3), smrtnost, prevence, vakcinace, léčba, historie
A
- endemický výskyt v tropických oblastech afrického a jihoamerického kontinentu + počátek 20. stol občasný výskyt v Evropě a v Sev. Americe, ale je tam A. aegypti, takže nebezpečí zavlečení
- akutní virové hemoragické onemocnění s různou závažností klinického průběhu
- REZERVOÁR: člověk, primáti (kočkodan, guaréza, malpa, chápan, vřešťan), jiní obratlovci a komáři rodu Aedes
- PŘENOS: komáři rodu Aedes - aegypti, africanus a simpsoni
- INKUBAČNÍ DOBA: 3-6 dní
- PŘÍZNAKY:
- > Lehčí průběh: horečka, únava, slabost, bolesti zad, zarudnutí na tvářích, překrvené spojivky, může se objevit zvracení, bolesti břicha, průjem, poruchy srdečního rytmu
- > Těžší průběh: poškození jater, žloutenka, mohou být postiženy ledviny, krvácení do kůže a sliznic - hemoragická horečka
- TŘI FORMY:
- > MĚSTSKÁ: celoroční - nezávislá na období dešťů, šíření mezi lidmi, komáři využívají jezírka, louže fontánky… -> množení, díky očkování nižší výskyt
- > DŽUNGLOVÁ: tzv. sylvatická, častější, ohniska šíření opicemi - vymírání
- > SAVANOVÁ: přechodná, jen v Africe, šíření pouze v období dešťů (leden-březen), opice -> komár -> člověk
- SMRTNOST: kolem 5 % u osob trvale žijících v endemických oblastech, u osob z neendemických oblastí až 20-50 %
- PREVENCE: očkování, repelenty
- VAKCINACE: atenuovaná vakcína, ojedinělé neurotoxické účinky u dospělých, povinné při cestování do zemí výskytu
- LÉČBA: symptomatická + případně dieta při ohrožení jater
- objevil se před 3-4 tisíci lety v Afrických pralesech, množení mezi opicemi -> adaptace na člověka
- > Obchod s otroky -> přenos do Ameriky - 1648 epidemie na Yucatanu -> adaptace v novém prostředí -> množení i v amerických primátech -> čas od času epidemie -> virus v Sev. Americe není trvale, komáři nepřežívají zimu -> ale rezervoár ve Střední Americe a na Kubě
10
Q
ssRNA(+) viry - FLAVIVIRIDAE - West Nile virus - rezervoár, přenos, symptomy, první izolace a výskyt
A
- neurotropní virus
- REZERVOÁR: ptáci různých druhů, jejichž infekce se projevuje hromadnými úhyny, kromě člověka citliví i jiní savci, hlavně koně
- PŘENOS: komáři rodu Culex
- SYMPTOMY: okolo 80% bezpříznakově, nejlehčí forma symptomatického průběhu - tzv. západonilská horečka objevující se cca u 20 % nakažených, pouze u < 1 % nakažených CNS a vyvolává onemocnění jako meningitida, těžší formou jsou meningoencefalitida, myelitida
- poprvé izolován v roce 1937 z krve člověka s horečnatým onemocněním na severu Ugandy, postupně se rozšířil na všechny kontinenty, lokální epidemie (různě, především ve Středomoří, v Africe, Izraeli, Rusku)
- 1999: zavlečení do USA
11
Q
ssRNA(+) viry - FLAVIVIRIDAE - Dengue virus (= horečka lámající kosti) - symptomy, přenos, výskyt
A
- jedna z nejčastějších tropických nemocí
- SYMPTOMY: horečky a nesnesitelné bolesti v kostech a svalech, někdy dochází ke krvácivé poruše a šokovému stavu
- PŘENOS: komáři rodu Aedes (A. aegypti, A. albopictus, A. polynesiensis), člověk nebo opice
- ročně postihuje až 100 milion lidí, 5 % umírá
- VÝSKYT: v tropických a subtropických oblastech po celém světě nejen v džunglích, ale i ve městech, nejrizikovější období je konec dešťové sezóny, kdy se komáři rozmnožují ve stojaté vodě
12
Q
ssRNA(+) viry - FLAVIVIRIDAE - Virus klíšťové encefalitidy - subtypy (3), rezervoár, přenos, inkubační doba, symptomy, vakcinace, léčba
A
= Thick borne encephalitis virus (TBEV)
- zánětlivé onemocnění mozku
- TŘI SUBTYPY: Evropský, sibiřský a dálnovýchodní
- REZERVOÁR: Zoonóza - hlodavci a lesní zvěř od kterých se klíště nakazí, vzácná cesta přenosu, např. při požití nedostatečně tepelně upraveného kravského, kozího nebo ovčího mléka
- PŘENOS: Klíšťata Ixodes riccinus a Ixodes persuucatus
- INKUBAČNÍ DOBA: obvykle 7-14 dní
- SYMPTOMY - Onemocnění má typicky 2 fáze:
- >
- fáze - tzv. chřipková fáze, cca 3-5 dní, podobná chřipce, někdy jen tato fáze, pak nastupuje tzv. období klidu (1-20 dní)
- >
- fáze - zpravidla světloplachost a velké bolesti hlavy, někdy spavost až kóma, poruchy hlavových nervů, bulbární syndrom, poruchy hybnosti svalů, nervová obrna, vysoké horečka, poruchy spánku a paměti, zvracení třesy - 2-3 týdny
- > po 2. fázi mohou nastat i trvalé následky - např. chronické bolesti hlavy, poruchy spánku, soustředění a rovnováhy, deprese, třes, obrny svalů; 1 % smrt
- > u dětí do 7 let většinou lehčí průběh, popř. i u dospělých bez příznaků
- VAKCINACE: 99% ochrana, není povinné, formaldehyden inaktivovaná čištěná suspenze viru
- LÉČBA: symptomatická
- ČR patří k zemím s nejvyšším výskytem v Evropě
13
Q
ssRNA(+) viry - FLAVIVIRIDAE - Virus hepatitidy C - Inkubační doba, symptomy, zásah do signálních drah buňky a IS, přenos, výskyt, vakcinace, léčba
A
- infekční virové onemocnění jater - tak se virus replikuje -> mechanismus poškození jaterních buněk virem hepatitidy C je pravděpodobně kombinací přímého cytopatického účinku virových proteinů a imunitních reakcí
- INKUBAČNÍ DOBA: 5-12 týdnů
SYMPTOMY: - akutní i chronická infekce:
- Asymptomatická, mírná asymptomatická
- Akutní hepatitida
-> nevede k život ohrožujícímu onemocnění, přibližně 30 % infikovaných osob spontánně vyčistí virus během 6 měsíců od infekce bez jakékoli léčby - Chronická:
-> 70 %, může vést k cirhóze jater, pak maligní transformace na hepatocelulární karcinom
-> Mechanismus: přímý onkogenní účinek virových proteinů a nepřímý onkogenní účinek chronického zánětu, fibrogeneze a dysfunkční imunity
-> přesně mechanismus není známý, ale jde o čas - perzistence viru v organismu - není ho totiž schopný eliminovat, vir IS uniká
-> ustavení perzistentní infekce - virové proteiny zasahují do buněčných signálních drah a imunitních mechanismů:
=> Aktivuje tvorbu interferonů, ale NS3/4A proteáza tuto dráhu záhy blokuje, nestrukturální protein NS5A je schopen zabránit aktivaci proteinkinázy
=> Inhibuje NK buňky a jejich počet je celkově snížen
=> Inhibuje i dendritické buňky - nedozrávají, nejsou schopny poskytnout potřebné signály T a B buňkám
=> V séru chronicky infikovaných pacientů se nachází protilátky, nemají ale ochranný charakter
=> Blokování apoptózy hepatocytů - 6 různých genotypů a několik desítek subtypů, celosvětově i u nás nejčastější infekce subtypem 1b
- PŘENOS: krví, možná sexuálně?, z matky na dítě (NE kojením!)
- VÝSKYT: celosvětově infikováno asi 170 milionů osob, více než 3/4 o tom neví, ČR je země s nízkým výskytem
- VAKCINACE: neexistuje
- LÉČBA: Akutní - symptomaticky; Chronická:
-> dříve: IFN alpha, pegynilovaný IFN a kombinace s ribavirinem -> nežádoucí účinky
-> dnes: kombinace přímo působících perorálních virostatik
-> Sofosbuvir - nukleotidový inhibitor NS5B polymerázy HCV
-> Ledipasvir - působí jako inhibitor komplexu NS5A
14
Q
ssRNA(+) viry - CORONAVIRIDAE
A
- název díky struktuře povrchových glykoproteinu (koruna)
- VIRION: obalený, 60-140 nm
- > S protein (Spikes) - receptor, fúze
- > M protein - transmembránový, spojení s RNA, skládání, tvar viru)
- > E protein - skládání virionu a uvolnění
- GENOM: ssRNA(+), velikost 30 000 pb (hodně velký na RNA vir), 5’ čepička, 3’ polyA
- do buněk proniká receptorem zprostředkovanou fúzí - s PM nebo s membránou endozomu
- ZÁSTUPCI:
- > Infikují pouze SAVCE: Alphacoronaviry, Betacoronaviry
- > Infikují PTÁKY i SAVCE: Gammacoronaviry, Deltacoronaviry
- dosud známo 7 druhů lidských koronavirů
- vyvolávají onemocnění DS a TS u lidí a zvířat, různý klinický obraz, od běžného nachlazení až po závažné respirační syndromy
15
Q
ssRNA(+) viry - CORONAVIRIDAE - SARS-CoV-1 - kdy, kolik nakaženo, rezervoár, přenos, inkubační doba, symptomy
A
= Severe Acute Respiratory Syndrome
- v listopadu 2002 první případy ve Fushan-Čína -> postupně do dalších států
- celkem nakaženo 8 096 lidí, 774 mrtvých - mortalita 10 %
- genom poprvé identifikován v dubnu 2003
- REZERVOÁR: netopýři přes MH cibetky (náhodný MH), změna ve vlastnostech S proteinu - rozeznání lidského receptoru; receptor: Angiotensin-converting enzyme 2
- PŘENOS: mezi lidmi nejčastěji kontaktem s kapénkami
- INKUBAČNÍ DOBA: 2-12 dní
- SYMPTOMY: jako chřipka
