6. Genes codificantes de proteínas Flashcards
Estructura de ADN
- dos hebras de polinucleótidos - doble hélice
- esqueleto de fosfato y pentosa
- bases nitrogenadas interior de molécula
- antiparalela
- forma B - 10 pares de nucleotidos por vuelta
en muy baja humedad que sucede con la forma del ADN
la forma B cambia a forma A
que es la transcripción
copia de ADN — ARN
quien sirve de molde para la transcripción del ARN
la hebra antisentido o cebador
que es el transcrito (ARN)
es una copia exacta de la hebra sentido de ADN con excepción del Uracilo
definición de gen
secuencias de ácidos nucleicos
para que son necesarios la secuencia de ácidos nucleicos
la síntesis de un producto génico funcional (proteina o ARN)
cuales son las secuencias del gen
- codificantes y no codificantes
que compone al gen
- region promotora (50kb)
- regiones de control
- cap site
- exones, intrones
- cola poli A
- 5’ a 3’
ARNm tiene
- polimerización o adicion de bases en dirección 5’ a 3’
- Downstream
- Upstream
que es downstream
dirección del templado en la cual es transcrito el ADN (region +)
que es upstream
dirección contraria del downstream (region -)
que contienen las secuencias reguladoras
- Caja TATA
- Caja GC
- Islas CpG
- Caja CAAT
funcion caja TATA
secuencia de T, A repetidas 25-35 pb upstream (-25 a -35)
que dicen los estudios de mutagenesis de la caja TATA
con el cambio de una base, baja la tasa de transcripción de la POL II
función Caja GC
- elemento regulador secuencias GGGCGG
- en genes constitutivos
- 5’-3’ o 3’-5’
- se unen FT SP1, SP3 y SP4
que son y donde se encuentran los genes constitutivos
se encuentran en genes que no tienen caja TATA y realizan las mismas funciones en todas las células
islas CpG
- secuencias ricas en C, G
- 20-50 nucleotidos
- 100pb upstream
que indican las islas CpG
el inicio de la transcripción
Caja CAAT
- en -80
- 5’-3’ o 3’-5’
que son los potenciadores distantes
sitios de control que se encuentran muy lejos del sitio de transcripción
que son los Enhancers
potenciadores
localización de los enhancers
- reguladores tipo CIS
- 50kb upstr del promotor
- downstr intron
- downstr del último exón
- especificos segun el tipo celular
cuando se descubrio el primer enhancer
en el genoma del SV4O - virus de simio en 1981
que se pensaba de los sitios de regulación
trabajaban de manera independiente
que han demostrado los estudios de los sitios de regulación
que estos trabajan en conjunto
pasos de la transcripción de ADN a ARNm
son 7
paso 1 ADN - ARNm
polimerasa se une a secuencia promotora en ADN - complejo cerrado
paso 2 ADN-ARNm
polimerasa se funde cerca de las islas cpg - forma burbuja de transcripción - complejo abierto
paso 3 ADN-ARNm
polimerasa cataliza enlace fosfodiéster - 2 rNTPs
paso 4 ADN-ARNm
3’-5’, se añade INTP al ARN en crecimiento
paso 5 ADN-ARNm
sitio de detención de transcripción, la polimerasa libera el ARN completo y se disocia del ADN
cuando comienza la transcripcion
cuando la ARN polimerasa encuentra la secuencia promotora
cuando termina la transcripcion
cuando encuentra la señal de terminación
de que forma trabaja
de forma simultanea
que hace el ARNm
- modificaciones postranscripcionales
- adición de 5’ cap
- adición de cola de poli A (3’)
- splicing
q hace la adición de 5’ cap
- protege el ARN de degradación enzimática
- ayuda en el transporte de ARN al citoplasma
- sitio de unión de factor proteico usado en traducción
q hace la adición de cola de poli A (3’)
modifica donde se agregan adeninas, protege de degradación y facilita la eficiente traducción en ribosomas
que hace el splicing
elimina intrones de regiones no codificantes y une exones de regiones codificantes
como se le conoce al primer ARN sintetizado
- transcrito primerio
- ARN heterogeneo - hnRNA
- ARN precursor
conforma al hnRNA
- UTR
- 5’ cap
- intrones
- exones
- cola de poli A
que es el splicing
unidad de transcripción formada por intrones y exones
que son los splice junctions
secuencias nucleotidicas especificas en las uniones de exones e intrones
que se pierde en el splicing
las regiones intrónicas
arnm
que se fusiona en el splicing
los exones
arnm
componen al splice junction
exon 1
* sitio donador - GU
* sitio ramificado - A
* sitio aceptor - AG
exon 2
arnm
en el ARN no tenemos
promotor
Proceso splicing - splice junction
ataque nucleoficilo de GU
* sitio donador - GU se va a unir al sitio ramificado
* se forma UGA y se rompe union de intron exon
arnm
ARNm
que es el splicing alternativo
mecanismo de producción de diferentes isoformas de proteinas transcritas por un solo gen
- un mismo gen me puede crear diferentes proteinas
arnm
donde son comunes los exones con splicing alternativo
en SN
arnm
para que se usa el splicing alternativo en SN
son proteinas requeridas para el desarrollo y función del SN
arnm
a quien se mantiene asociado el ARNm
a proteinas heterogeneas nucleares - hnRNP
ARNm + hnRNP forman
el complejo proteico mensajero nuclear - mRNP
generalidades transporte ARNm
cruza una bicapa lipidica impermeable
a traves de poros nucleares de membrana
de que esta fromado cada poro nuclear
por un complejo de poro nuclear - NCP - nucleoproteinas
ARNr generalidades
- abundante 80%
- transcripción y procesamiento en el nucleolo
- el mismo transcrito da lugar a los diferentes tipos de ARNr
tipos de ARNr
- 18S
- 28S
- 5.8S
- 5S
18S
subunidad ribo menor - 40s
POL I
28S
subunidad ribo mayor - 60s
POL I
5.8S
subunidad mayor - 60s
POL I
5S
subunidad ribo mayor - 60s
POL III
como inicia el proceso del ARNr
Gen – ARNr – pol – 45s
habra cortes transcritos primarios
cortes transcritos primarios
45s – 41s – 20s y 32s
* 20s – 18s
* 32s – 5.8s y 28s
q hacen los ribosomas
sintetizan las proteinas
Polimerasas que usa cada ARN
- ARNm - POL II
- ARNt - POL III y 5s
- ARNr - POL I
- ARNr 5s - POL III
- ADN - POL I
mecanismo de transcripcion ARNr
- se realiza en el nucleolo
- para q se una POL I tiene q haber upstr de -155 a -60 y el sitio de transc abarque -40 a +5
- iniciación de POL I: UAF + upstr, fact trimérico + TBP, Rrn3p
Maduración pre-ARN
- desp de la síntesis (nucleolo) – rARN naciente - pre-rRNP
- 80s – 45s pre-ARNr = ARN maduro
quien reconoce las posiciones de corte en la maduracion del pre-ARN
el snoRNA - small nucleolar ARN
donde se completa el ensamblaje de maduración de pre-ARNr y que pasa desp
se completa en el nucleolo y se moviliza a traves de los NPC - complejo de poro nuclear
Subunidades de ARNr
- Mayor: 28s, 5.8s, 5s
Menor: 18s
como es la transcripción del ARNt
con la union de POL III
q hace o es la union de POL III
es la region promotora de los genes que codifican para ARNt y ARNr 5s
en que caja de la region promotora esta ARNt
Caja a y b
en que caja de la region promotora esta ARNr 5s
caja c
cuales son los Factores de Transcripcion - TF
- TFIIIA — 5s-ARNr
- TFIIIB — ARNt; 5s-ARNr - pol III
- TFIIIC — ARNt; 5s-ARNr - pol III
cuantos nucleotidos tiene el pre-ARNt
75 - 80 nucleótidos
1 paso de la maduracion pre-ARNt
- eliminacion de intron (14 nucl) splicing
2 paso de la maduracion pre-ARNt
- secuencia 5’ (16 nucl) eliminada por RNase P (ribonucl P)
3 paso de la maduracion pre-ARNt
- residuo UU - 3’ es reemplazado por ACC para sintesis de prot
4 paso de la maduracion pre-ARNt
distintas bases son modificadas en el proceso de maduración
formas hanituales de representar el ARNt
- Alanina + anticodon
- Alanina + Asa T + Asa anticodon + anticodon + Asa D
