6. Genes codificantes de proteínas Flashcards
1
Q
Estructura de ADN
A
- dos hebras de polinucleótidos - doble hélice
- esqueleto de fosfato y pentosa
- bases nitrogenadas interior de molécula
- antiparalela
- forma B - 10 pares de nucleotidos por vuelta
2
Q
en muy baja humedad que sucede con la forma del ADN
A
la forma B cambia a forma A
3
Q
que es la transcripción
A
copia de ADN — ARN
4
Q
quien sirve de molde para la transcripción del ARN
A
la hebra antisentido o cebador
5
Q
que es el transcrito (ARN)
A
es una copia exacta de la hebra sentido de ADN con excepción del Uracilo
6
Q
definición de gen
A
secuencias de ácidos nucleicos
7
Q
para que son necesarios la secuencia de ácidos nucleicos
A
la síntesis de un producto génico funcional (proteina o ARN)
8
Q
cuales son las secuencias del gen
A
- codificantes y no codificantes
9
Q
que compone al gen
A
- region promotora (50kb)
- regiones de control
- cap site
- exones, intrones
- cola poli A
- 5’ a 3’
10
Q
ARNm tiene
A
- polimerización o adicion de bases en dirección 5’ a 3’
- Downstream
- Upstream
11
Q
que es downstream
A
dirección del templado en la cual es transcrito el ADN (region +)
12
Q
que es upstream
A
dirección contraria del downstream (region -)
13
Q
que contienen las secuencias reguladoras
A
- Caja TATA
- Caja GC
- Islas CpG
- Caja CAAT
14
Q
funcion caja TATA
A
secuencia de T, A repetidas 25-35 pb upstream (-25 a -35)
15
Q
que dicen los estudios de mutagenesis de la caja TATA
A
con el cambio de una base, baja la tasa de transcripción de la POL II
16
Q
función Caja GC
A
- elemento regulador secuencias GGGCGG
- en genes constitutivos
- 5’-3’ o 3’-5’
- se unen FT SP1, SP3 y SP4
17
Q
que son y donde se encuentran los genes constitutivos
A
se encuentran en genes que no tienen caja TATA y realizan las mismas funciones en todas las células
18
Q
islas CpG
A
- secuencias ricas en C, G
- 20-50 nucleotidos
- 100pb upstream
19
Q
que indican las islas CpG
A
el inicio de la transcripción
20
Q
Caja CAAT
A
- en -80
- 5’-3’ o 3’-5’
21
Q
que son los potenciadores distantes
A
sitios de control que se encuentran muy lejos del sitio de transcripción
22
Q
que son los Enhancers
A
potenciadores
23
Q
localización de los enhancers
A
- reguladores tipo CIS
- 50kb upstr del promotor
- downstr intron
- downstr del último exón
- especificos segun el tipo celular
24
Q
cuando se descubrio el primer enhancer
A
en el genoma del SV4O - virus de simio en 1981
25
que se pensaba de los sitios de regulación
trabajaban de manera independiente
26
que han demostrado los estudios de los sitios de regulación
que estos trabajan en conjunto
27
pasos de la transcripción de ADN a ARNm
son 7
28
paso 1 ADN - ARNm
polimerasa se une a secuencia promotora en ADN - complejo cerrado
29
paso 2 ADN-ARNm
polimerasa se funde cerca de las islas cpg - forma burbuja de transcripción - complejo abierto
30
paso 3 ADN-ARNm
polimerasa cataliza enlace fosfodiéster - 2 rNTPs
31
paso 4 ADN-ARNm
3'-5', se añade INTP al ARN en crecimiento
32
paso 5 ADN-ARNm
sitio de detención de transcripción, la polimerasa libera el ARN completo y se disocia del ADN
33
cuando comienza la transcripcion
cuando la ARN polimerasa encuentra la secuencia promotora
34
cuando termina la transcripcion
cuando encuentra la señal de terminación
35
de que forma trabaja
de forma simultanea
36
que hace el ARNm
* modificaciones postranscripcionales
* adición de 5' cap
* adición de cola de poli A (3')
* splicing
37
q hace la adición de 5' cap
1. protege el ARN de degradación enzimática
2. ayuda en el transporte de ARN al citoplasma
3. sitio de unión de factor proteico usado en traducción
38
q hace la adición de cola de poli A (3')
modifica donde se agregan adeninas, protege de degradación y facilita la eficiente traducción en ribosomas
39
que hace el splicing
elimina intrones de regiones no codificantes y une exones de regiones codificantes
40
como se le conoce al primer ARN sintetizado
* transcrito primerio
* ARN heterogeneo - hnRNA
* ARN precursor
41
conforma al hnRNA
* UTR
* 5' cap
* intrones
* exones
* cola de poli A
42
que es el splicing
unidad de transcripción formada por intrones y exones
43
que son los splice junctions
secuencias nucleotidicas especificas en las uniones de exones e intrones
44
que se pierde en el splicing
las regiones intrónicas
| arnm
45
que se fusiona en el splicing
los exones
| arnm
46
componen al splice junction
exon 1
* sitio donador - GU
* sitio ramificado - A
* sitio aceptor - AG
exon 2
| arnm
47
en el ARN no tenemos
promotor
48
Proceso splicing - splice junction
ataque nucleoficilo de GU
* sitio donador - GU se va a unir al sitio ramificado
* se forma UGA y se rompe union de intron exon
| arnm
49
# ARNm
que es el splicing alternativo
mecanismo de producción de diferentes isoformas de proteinas transcritas por un solo gen
- un mismo gen me puede crear diferentes proteinas
| arnm
50
donde son comunes los exones con splicing alternativo
en SN
| arnm
51
para que se usa el splicing alternativo en SN
son proteinas requeridas para el desarrollo y función del SN
| arnm
52
a quien se mantiene asociado el ARNm
a proteinas heterogeneas nucleares - hnRNP
53
ARNm + hnRNP forman
el complejo proteico mensajero nuclear - mRNP
53
generalidades transporte ARNm
cruza una bicapa lipidica impermeable
a traves de poros nucleares de membrana
54
de que esta fromado cada poro nuclear
por un complejo de poro nuclear - NCP - nucleoproteinas
55
ARNr generalidades
* abundante 80%
* transcripción y procesamiento en el nucleolo
* el mismo transcrito da lugar a los diferentes tipos de ARNr
56
tipos de ARNr
* 18S
* 28S
* 5.8S
* 5S
57
18S
subunidad ribo menor - 40s
POL I
58
28S
subunidad ribo mayor - 60s
POL I
59
5.8S
subunidad mayor - 60s
POL I
60
5S
subunidad ribo mayor - 60s
POL III
61
como inicia el proceso del ARNr
Gen -- ARNr -- pol -- 45s
habra cortes transcritos primarios
62
cortes transcritos primarios
45s -- 41s -- 20s y 32s
* 20s -- 18s
* 32s -- 5.8s y 28s
63
q hacen los ribosomas
sintetizan las proteinas
64
Polimerasas que usa cada ARN
* ARNm - POL II
* ARNt - POL III y 5s
* ARNr - POL I
* ARNr 5s - POL III
* ADN - POL I
65
mecanismo de transcripcion ARNr
* se realiza en el nucleolo
* para q *se una POL I* tiene q haber upstr de -155 a -60 y el sitio de transc abarque -40 a +5
* iniciación de POL I: UAF + upstr, fact trimérico + TBP, Rrn3p
66
Maduración pre-ARN
* desp de la síntesis (nucleolo) -- rARN naciente - pre-rRNP
* 80s -- 45s pre-ARNr = ARN maduro
67
quien reconoce las posiciones de corte en la maduracion del pre-ARN
el snoRNA - small nucleolar ARN
68
donde se completa el ensamblaje de maduración de pre-ARNr y que pasa desp
se completa en el nucleolo y se moviliza a traves de los NPC - complejo de poro nuclear
69
Subunidades de ARNr
* Mayor: 28s, 5.8s, 5s
Menor: 18s
70
como es la transcripción del ARNt
con la union de POL III
71
q hace o es la union de POL III
es la region promotora de los genes que codifican para ARNt y ARNr 5s
72
en que caja de la region promotora esta ARNt
Caja a y b
73
en que caja de la region promotora esta ARNr 5s
caja c
74
cuales son los Factores de Transcripcion - TF
* TFIIIA --- 5s-ARNr
* TFIIIB --- ARNt; 5s-ARNr - pol III
* TFIIIC --- ARNt; 5s-ARNr - pol III
75
cuantos nucleotidos tiene el pre-ARNt
75 - 80 nucleótidos
76
1 paso de la maduracion pre-ARNt
1. eliminacion de intron (14 nucl) splicing
77
2 paso de la maduracion pre-ARNt
2. secuencia 5' (16 nucl) eliminada por RNase P (ribonucl P)
78
3 paso de la maduracion pre-ARNt
3. residuo UU - 3' es reemplazado por ACC para sintesis de prot
79
4 paso de la maduracion pre-ARNt
distintas bases son modificadas en el proceso de maduración
80
formas hanituales de representar el ARNt
* Alanina + anticodon
* Alanina + Asa T + Asa anticodon + anticodon + Asa D
