5. Proyecto Genoma Humano Flashcards
Un poco de su historia…
* Inicio en 1990
* Termino en 2009
* Lo superviso National Institutes of Health, US Departament of Energy
* Multinacional - EUA, inglat, Franc, Aleman, Jap, Chin
* Resultados publicados en 2001 en Nature y Science
Duración del proyecto
13 años aunque estaba proyectado para 15 años
Cuanto se logro secuenciar
5% del genoma
Como realizaron la estandarización del protocolo
secuenciando el genoma de Drosophila melanogaster
Objetivos - HGP
- Conocer, caracterizar y clasificar la totalidad de genes en el genoma humano
- Determinar la secuencia de 3000 millones de nucleotidos
- Organizar y almacenar la info obtenida
- desarrollar tecnologías q permitieran secuenciar el ADN rápido y efectivo
- desarrollar herramientas para analizar rapido y preciso la info
- Leyes q regulen el uso de los datos obtenidos
Estudio de Drosophila Melanogaster
- Mosca de la fruta
- organismo de estudio de la genética
- tiempo 10 dias
- mantenimiento bajo costo
- 1915 - 85 mutantes diferentes encontrados
Etapas
- Obtención de muestras y métodos de secuenciación
- Estrategia y caracterización del ensamblaje del genoma
- Predicción y anotación de genes
- Estructuras del genoma
- Evolución del genoma
- Examinación a nivel genoma completo de las variaciones
- Predicción
Muestras biologicas
- de donadores
- 21 donadores
- muestras sangre y semen
- clones de esos fragmentos
Librerias
técnica de aislamiento de fragmentos de ADN fue la de BAC
Cuanto almacenan las librerias
ADN de 100 a 200kb para despues clonarlo
Ensamblaje
unión de los fragmentos superepuestos
como se le conoce tambien a esta metodologia de ensamblaje
BAC-based o clone by clone
método de secuenciación que utilizo
técnica de Sanger ABI PRISM 3700 ADN Analyzer
que contenia cada archivo
control de calidad
* longitud de secuencia 543bp
* especificidad 99.5%
* verificación de contaminación con E.Coli o ADN mitocondrial
que pasaba si no se identificaban errores
podrian reducir la efectividad del ensamblaje
cual fue el primer cromosoma que se secuencio completo
el cromosoma 22
