3D struktura proteina

Question 1

Šta su proteini po sastavu?

Answer 1

Polipeptidi, tj sastoje se od velikog broja aminokiselina tj od 100 do 1000

Question 2

Šta su to monomerni proteini?

Answer 2

Oni koji imaju samo jedan polipeptidni lanac

Question 3

Šta su to oligomerni proteini?

Answer 3

Oni koji se sastoje iz 2 ili vise lanaca

Question 4

Šta je N-kraj polipeptidnig lanca?

Answer 4

Kraj sa slobodnom NH2 grupom

Question 5

Šta je C-kraj polipeptidnog lanca ?

Answer 5

Kraj na kome je slobodna COOH grupa

Question 6

Kakva je struktura polipeptidnog lanca?

Answer 6

Primarna struktura izgeađena je od prostih kovaletnih veza oko kojih je moguća slobodna rotacija, tj konstanta promena konformacija, medjutim to nije tako.

Question 7

Šta je nativna komformacija?

Answer 7

Ona konformacija polipeptidnog lanca koja postoji pri normalnim biološkim uslovima gde je polipepdini lanac biološki aktivan tj vrši svoju funkciju, i najstabilniji je u termodinamičkom smislu.

Question 8

Koja 4 nivoa organizacije unutar strukture proteina razlikujemo?

Answer 8

Primarni
sekundarni
tercijarni
kvaternerni

Question 9

Šta je primarna struktura proteina?

Answer 9

Genetcki odredjen redosljed amino kiselina, ukoliko se promeni protein gubi svoju biološku funciju.

Question 10

Primer promene u primarnoj strukturi?

Answer 10

Srpasta anemija izazvana zamjenm glutamina valinom u beta-lancu hemoglobina.

Question 11

Šta je sekundarna struktura proteina?

Answer 11

Predstavlja pravilan red voodničnig veza koje drže sekundarnu strukturu proteina, one nastaju između N-H i C=O veza različitih pepridnih veza

Question 12

Šta predstavlja tercijarnu strukturu proteina?

Answer 12

Pravilno savijanje i uvijanje samog lanca u prostoru ponovo stabilizvanog vodoničnim ali i Intermolekulsim jonski, hidrofobinim i disulfatnim vezama funkcionalnih grupa bočnih nizova

Question 13

Šta predstavlja kvaternernu strukturu proteina?

Answer 13

Medjusobni odnosi i prosrorni raspored više polipeptidnih molekula u oligomernom proteinu, oblikuju je intermolekulske nekovaletne veze pojedinaca različitih tercijarnih struktura

Question 14

Šta je konformacija proteina?

Answer 14

Naziv za zajedničko označavanje sekundarne, tercijarne i kvaternerne strukture

Question 15

Kakva je polipeptidna veza aminokiselina unutar jednog polipeptidnog lanca?

Answer 15

40% kraća od iste veze slobodnih aminokiselina čime je ona i više kruta te je moguće da se C=O i N-H nalaze smo u trans konfiguraciji

Question 16

Čime se stabilizuje kruta peptidna veza?

Answer 16

Rezonancom, tj prelaskom slobodnih elektona sa N na C stvarajući dvostruku vezu, zbog čega O postaje negativno naelektrisan.

Question 17

Gdje je mogućna rotacija unutar polipeptidnog lanca?

Answer 17

Izmedju dvije pepidne veze

Question 18

Koje dvije konformacije su otkrivene?

Answer 18

alfa heliks i beta nabrana sutruktura

Question 19

Kako funkcioniše alfa heliks?

Answer 19

Lanac se uvija u smeru kazaljke na satu oko pokretnih vodoničnih veza N-H i C=O iz dva različita nivoa uvojka gde vaki uvojak ima 3,6 aminokiseline unutar sebe

Question 19

Zbog čega je alfa heliks struktura stabilna?

Answer 19

Jer u njoj u vodoničnim vezama učestvuju peptidne veze kojih ima veliki broj

Question 20

Kakvi prpteini imaju ovakvu strukturu alfa heliksa?

Answer 20

Fibrilni proteini poput alfa keratina kji ima 3 ili 7 ovakvih struktura unutar sebe

Question 21

Kako izgleda nabrana konformacija?

Answer 21

Paralelno vezani polipeptidni lanci koji su medjusobno povezani vodoničnim vezama

Question 22

Koje dvije nabrane strukture razlikujemo?

Answer 22

alfa paralelnu ili beta antiparalelnu

Question 23

Koja je razlika izmedju paralelne ili antiparalelne nabrane konfiguracije?

Answer 23

Polozaj C i N krajeva

Question 24

Od fibliralnih složeniji su ?

Answer 24

Globularni proteini

Question 25

Kako je riješena struktura globularnih proteina?

Answer 25

rengenskostrukturnom analizom

Question 26

STruktura kog proteina je prvo otkrivena?

Answer 26

Mioglobina, sadrži 153 poznata člana polipepttdog nia, medju njima i hem grupu kao hemoglobin i prenosi kiseonik unutar mišića

Question 27

Struktura mioglobina?

Answer 27

Alfa heliks tako uvijen da su hidrofobne grupe u unutrašnjosti molekula, a hidrofilnih na površini, čime se on može rastvarati u vodi, vodonične vezei hidrofobne reakcije drže crvstocu ovog molekula

Question 28

Hemoglobin?

Answer 28

kvartetna struktura 2 alfa ili beta anca i 4 hem grupe