נושא 3. 23-27 זיידר Flashcards
מהי החלוקה ההירכית של כל היצורים? מה הסדר עד שמגיעים ל
species?
domain, kingdom, phylum, class, order, family, genus, species
לא בטוח כמה זה משנה
מהם שלושת הדומיינים?
איובקטריה, ארכיבקטריה (ארכיאה), אאוקריוטים
איזה מהדומיינים הוא מסוג תא אאוקריוטי?
איזה מהדומיינים הוא מסוג תא פרוקריוטי?
רק לאאוקריוטים יש סוג תא אאוקריוטי. לאיובקטריות ולארכיאה יש סוג תא פרוקריוטי
ההבדלים בין אאוקריוטים איובקטריה וארכיאה:
לגבי על אחד מהקבוצות עני:
האם יש אברונים תאיים כמו גרעין?
האם בדופן יש פפטידוגליקן?
מהו סוג הקשר בו החומצות השומניות בממברנה מחוברות לגליצרול?
מהי החומצה אמינית ממנה מתחילה סינתזת החלבונים?
יש טעות בטבלה!
בשורה האחרונה, תחילת סינטזת החלבונים באאוקריוטים ובארכיאה הראשונה היא מתיונין.
באאובקטריה - פורמיל מתיונין
מהן ארבע הממלכות שקיימות באאוקריוטים?
animals, plants, fungs, protists
protists =
כולל הרבה ממלכות, חד תאיים
על סמך איזה רצף בגנום יוצרים את הטקסונומיה - החלוקה של החיידקים לקבוצות שונות על העץ האבולוציוני?
מדוע דווקא הוא נבחר?
הרצף שנבחר כמתאים ביותר הוא של הריבוזום – מורכב משקלית משני שליש
RNA
ושליש חלבוני.
יש רצפים גמישים יותר בדנא ורצפי ליבה. הרצף של הריבוזום הוא רצף ליבה ולכן הוא נבחר. הרצף בפועל של הריבוזום שמתמשים בו הוא הרצף
16S
OP2
ניתן בהרצאה כדוגמא למה?
לכך שאמצעות הריצופים מצאו כל מיני חיידקים שלא ניתן לגדל במעבדה, אלא רק בטבע. מסתבר שאת מרבית החיידקים בטבע לא ניתן לגדל במעבדה
איך נוכל להעלות את הרזולוציה של העץ האבולוציוני שאנו יוצרים? מה גילו כש”הגדילו” את הרזולוציה?
ניתן לקבוע את רצף החלבונים הריבוזומליים (בנוסף לרנא הריבוזומלי) ולקבל רזולוציה גבוהה יותר. כשבדקו את זה ראו שהארכיאה ואאוקריוטים “התקרבו” זה לזה.
מה דומה בין המיטוכונדריה באאוקריוטים לכלורופלסטים בצמחים. לאיזה תיאוריה לגבי התפתחות האאוקריוטים והתפתחות הצמחים זה הוביל?
המיטוכונדרי ה באאוקריוטים והכלורופלסטים בצמחים מכילים גנום משלהם אשר דומה לגנום של חיידקים, ולכן התיאוריה הנפוצה כיום היא שאאוקריוטים הם תולדה באבולוציה של סימביוזה של תא חיידק ארכיאובקטריה (קדום) שבלע לתוכו חיידק מסוג אאובקטריה. בצמחים יש כלורופלסט שהוא כנראה תולדה של בליעת חיידק סיאנובקטריה (חיידק בעל יכולת פוטוסינטתית)
למה לא ניתן לגדל מינים רבים של חיידקים במעבדה?
מה זה קונסרציום?
איך קובעים את הרכב המיקרובקטריה שיש לנו על העור או במעיים? מה זה
High throughput sequencing?
מה הבעיה בשיטה הזו? מהו הפתרון?
מה בכל זאת הבעיה? מה זה
binning?
מה זה
OTUs?
איך פלסמידים קשורים להפרדה בין מינים? איך מקטעי רסטריקציה קשורים?
מה אנזימיני רסטריקציה עושים, ואיך הם מסייעים לנו לזיהוי מיני החיידקים?
מהם טרנספוזונים, ואיך הם מסייעים להבדיל בין חיידקים?
איך מתבצע זיהוי החיידקים כיום? איזה רצף מרצפים?