נושא 2. 9-23 זיידר

Question 1

מאיזה תת יחידות מורכב הרנא פולימרז הפרוקריוטי? איזו יחידה נקשרת לדנא? איפה נמצאים הרצפים הקבועים אליו נקשר הפולימרז?

Answer 1

Question 2

מה זה

closed complex

open complex?

מתי הפולימרז הופך מצב אחד לשני? מהי היעילותשל התנתקות הפולימרז מהפרומוטר והתחלת השעתוק?

Answer 2

Question 3

מה זה אקטיבטור? מה זה רפרסור?

מה עושה האקטיבטור איפה הוא נקשר?

איפה נקשר הרפרסור?

Answer 3

Question 4

תארי את סוגי האקטיבציה הבאים:

class 1 activation

class 2 actication

class 3 activation

Answer 4

Question 5

תארי את סוגי הרפרסיה הבאים:

class 1 repression

class 2 repression

Answer 5

Question 6

תארי את תהליך טרמינציית סינתזת הרנא

Answer 6

Question 7

תארי את אופרון הלקטוז. איזה גנים הוא מכיל ומה תפקידם? איך הוא מבוקר? מה זה

CRP?

Answer 7

Question 8

איך מתבצעת הבקרה על שחרור הטוקסין של חיידק הדיפתריה?

Answer 8

אם תאכל מוט ברזל תחטוף דיפתריה

Question 9

מה זה סנסור ומה זה

tranducer?

Answer 9

Question 10

תארי את הבקרה על שחרור הטוקסין של החיידק ברודטלה פרטוסיס לפי עקרון הסנסור והטרנסדוסר

על איזה חומצה אמינית מזורחן הסנסור? על איזה חומצה אמינית מזורחן הטרנסדוסר?

Answer 10

כשהייתי ביוון לפעמים ביקשו ממני לפרט על הפסלים שם, ואמרו את זה ביוונית (פרטוסיס) ולא ידעתי עליהם כלום, אז הייתי מרגיש שהטמפרטורה של הגוף שלי עולה והייתי צריך משקה:

Bvg= beverage

Question 11

מהם

class 1-3 factors

ומה הקשר שלהם ל

BvgA?

Answer 11

Question 12

מה מבדיל ברמת הדנא בין ה

class 1-3 factors?

Answer 12

בקצרה, קשור לאפיניות של האופרטורים והרפרסורים של כל קלאס

Question 13

איזה רצף צריך להיות ב

mRNA

של חיידק אי קולי כדי שהריבוזום יתרגם אותו?

Answer 13

צריך גם

AUG

וגם

shine delgarno

המורכב מרצפים כמו

AGGA

רצפים אלו בעלי אפיניות לתת היחידה הקטנה של הריבוזום הפרוקריוטי. הריבוזום כאן לא סורק אלא נוחת על אתרים מסוימים.

Question 14

בחיידק ליסטריה, איך נקרא פקטור השעתוק היחיד שמבקר פקטורי אלימות? תארי את אופן הבקרה

Answer 14

אם אתה משתמש במי פה ליסטרין אתה חסין

proof

מפני חיידקים. ליסטרין מחמם לך את הפה עד שכל לולאה שהייתה לךבפה נפתחת

Question 15

תארי את תהליך הבקרה השלילית של

sRNA

על תרגום חלבונים, יחד עם

Hfq

איך הם קשורים זה לזה, מה עושה ה

sRNA

Answer 15

Question 16

תארי את תהליך הבקרה החיובית של

sRNA

על תרגום

Answer 16

Question 17

תארי את דרך חישת המניין של החיידק

Vibrio cholerae

איזה מטבוליט הוא מפריש כדי לקלוט כמה חיידקים יש בסביבתו?

תאר את הקסקדה עד שהחיידק מחליט להפריש רעלן

Answer 17

כשמישהו כולירה מדבר איתך הוא מסתכל לך בעיניים

Lux U in the eye

Question 18

מה זה ביופילם?

באיזה מקרים הוא בעייתי במיוחד?

Answer 18

Question 19

תארי את תהליך יצירת הביופילם. איזה שכבה הם מייצרים סביבם בהתחלה? מה קורה בסוף כשכבר יש ביופילם?

Answer 19

בשלב הראשון החיידקים מתיישבים על משטח, לאחר שיש מספיק מהם הם מייצרים סוכרים חוץ תאיים המייצרים שכבה חוץ תאית מגינה. הם מייצרים מבנים מרחביים המייצרים גבהים, עד לשלב בו יש הבשלה – מתחילים לשחרר חיידקים או להישבר. הסכנה בכך היא שהביופילם משחרר חתיכות וחיידקים אינדיבידואלים לזרם הדם שיוכלו להתיישב במקומות מרוחקים וליצור שם ביופילם חדש

Question 20

מה ההבדל בכמות העותקים מכל גן בין בן אדם לחיידק? מהם הפלסמידים? האם הם מתרבים עצמאית? מה זה

R plasmid

Answer 20

Question 21

איזה תיאוריה הצליחו להוכיח באמצעות מוטציות בחיידקים?

Answer 21

את התיאוריה של דרווין לפיה השונות היא רנדומלית ויש סלקציה חיובית למי שמשגשג

Question 22

מהו מבחן איימס? מה הוא בודק? איך מבצעים אותו?

Answer 22

Question 23

איך עובד מנגנון הטרנספורמציה? מה זה

pilus?

מה קורה לדנא הדו גדילי כשהוא יוצא מחוץ לחיידק? האם הדנא יוצא מחיידק חי או מת?

Answer 23

תוספת שאין בתמונה:

מנגנון זה עובד מחיידק מת לתא מקבל בתנאי שהוא קומפוטנטי לטרנספורמציה. יש חיידקים קומפוטנטים באופן טבעי, ויש כאלה שיהיו קומפוטנטים רק אם הם מרגישים שיש חיידקים שדומים להם באיזור (ואז הדנא באיזור מתאים לשלהם)

Question 24

קוניוגציה:

מהו ה

F factor?

מהו

Hfr?

מדוע בעבר המפות הגנטיות בחיידקים היו ביחידות של דקות?

Answer 24

Question 25

מה זה פאג’? מה זה בקטריופאג’?

Answer 25

פאג’ הוא נגיף שתוקף חיידקים. בקטריופאג’ גורם לליזיס של חיידקים

Question 26

האם ניתן לרפא חולים במחלות זיהומיות ע”י פאג’ים?

Answer 26

באופן כללי כן, זה אפשרי, אבל במערב לא עושים את זה כל כך ומעדיפים להשתמש באנטיביוטיקה. מתחילים אולי להשתמש בזה יותר בגלל שחיידקים רבים נהיים עמידים לאנטיביוטיקה

Question 27

איך קורא שפאג’ מכיל דנא של חיידק? כלומר, למה שהוא יחזיק דנא של חיידק ויעביר אותו לחיידק אחר? מה ההבדל בין פאג’ים וירולנטים לפאג’ים ליזוגנים?

מה זה

את הסוף התמונה לא הבנתי ולכן איני יודע מה לשאול

Answer 27

Question 28

מה השימוש של פאג’ים בקליניקה?

איך הם משמשים לאבחון?

מה הקשר בין פקטורי אלימות של חיידקים אלימים לפאג’ים?

Answer 28

Question 29

מה זה

Crispr?

מה מנגנון הפעולה של זה? כדי לתאר את הקסקדת פעולה השתמשי במושגים הבאים:

Crispr locus

crRNA (guide)

CAS9

Answer 29

Question 30

אם כל כך קל לחיידקים להעביר את הדנא שלהם מתא לתא, כיצד נמנע מעבר של דנא בין מינים שונים, כך שנקבל מוזאיקות - פסיפסים של חתיכות דנא ממקורות שונים בתוך אותו החיידק, ולא ניתן יהיה להגדיר מין של חיידק? מהם שלושת המנגנונים שמונעים את זה?

Answer 30

זה לא קורה, יש מנגנונים שמונעים את זה. שם המנגנונים:

Restriction/ modification system 1

לחיידקים יש אנזימי רסטריקציה, שיודעים לחתוך רק דנא של בני מינים על פי מודיפיקציות שיש על הגנום. כשיגיע דנא מחיידק אחר אנזימי הרסטריקציה יזהו אותו כזר וידעו לחתוך אותו.

2. רקומבינציה הומולוגית

דנא צריך לעבור רקומבינציה כדי לעבור אינטגרציה לגנום. מנגנונים של רקומבינציה משווים בין רצפי דנא רק אם הזהות גדולה מ 99.5% היא תתרחש. זה מונע מדנא זר שאין לו רצף הומולוגי, לעבור אינטגרציה. לפאג’ים יש אנזים מיוחד אשר עושים רקומבינציה לא הומולוגית.

3. Selective DNA uptake

החיידק יודע לזהות רצפים ספציפיים חוזרים התואמים לחיידק עצמו, אחרת הוא לא יכניס את הדנא.

Question 31

מה הם

Transposable genetic elements?

מהו התהליך טרנספוזיזציה?

מהם

insertion sequence?

Answer 31

Question 32

ישנם שני סוגים של טרנספוזיציה

replicative

non replicative

מה זה כל אחד מהם? מה הקשר של טרנספוזיציה לעמידות לאנטיביוטיקה?

Answer 32

Question 33

מה זה

conjugated transposition?

Answer 33

Question 34

מה הם

Pathogenicity Islands

מה המאפיין העיקרי שלהם?

Answer 34

שורה של גנים המעורבים בתהליך מסוים שנמצאים מקובצים באזור מסוים על הכרומוזום החיידקי. האיים האלו נמצאים בכל החיידקים, נמצאים לרוב בגזע פתוגני ולא בגזע לא-פתוגני של אותו החיידק. היחס בין צימודי

GC-AT

באיזורים אלו שונה לעומת שאר החיידק. למשל אם בחיידק יש 60 אחוז

GC

ו40 אחוז

AT

באיזור הזה היחס יהיה שונה. העובדה הזו מצביעה על מקור אחר של מקטע זה לעומת שאר הגנום

Question 35

מה הם

islands?

האם האיים יהיו בכל החיידקים מאותו מין של חיידק?

Answer 35

Question 36

הגדירי את המושגים הבאים:

גנום ליבה

גנום גמיש

pan genome

Answer 36

Question 37

מה זה וריאציה אנטיגנית בבקטריה?

Answer 37

מדובר בשינויים גנומים בתוך התא עצמו, שכן לעתים מבחינה אבולוציונית עדיף שיהיה שוני בתכונות האוכלוסייה

Question 38

מהי הדוגמא לוריאציה אנטיגנית בבקטריה שניתנה בחיידק הסלמונלה?

Answer 38

תקציר: לחיידק יש שני סוגים של שוטונים והוא מחליף ביניהם אחת לכמה דורות. כך, אם מערכת החיסון למדה שוטון אחד, לשוטון החדש היא כבר לא מוכנה

אסוציאציה: כשגוני האכילה את ג’ינג’ר בסלמון היא כל פעם גיוונה בין מטוגן למבושל

Question 39

מהו

pilin?

איך הוא קשור לעקרון וריאציה אנטיגנית בבקטריה?

Answer 39

Question 40

מה הם

opacity genes

ואיך הם תורמים לוריאציה אנטיגנית?

Answer 40