1er parcial teoría Flashcards
1er nivel NUCLEOSOMA
Las histonas nucleosómicas (H2A, H2B, H3 y H4), se asocian para formar un octamero. Un segmento de DNA de 146 pb se enrolla dando 1.6 vueltas al octámero para formar el nucleosoma.
Material genético
Nivel 1: Unidades monoméricas: biomoléculas como proteínas, carbohidratos. Nivel 2: DNA, ácidos nucleicos, proteínas, lípidos. Nivel 3: pared celular, cromosomas, membrana plasmática Nivel 4: Célula y organelos.
Qué es el ADN
EL ADN es el componente principal de los cromosomas del núcleo de las células.
Células del cuerpo humano
23 pares de cromosomas.
Cariotipo
Estudio que se realiza para visualizar a los CROMOSOMAS y evaluar número y CALIDAD
inició en 1990 cuando el instituto nacional de salud y el departamento de energía de EUA se unieron a laboratorios y centros de investigación de todo el mundo para determinar la secuencia completa del genoma humano
El proyecto del Genoma Humano
A partir del proyecto del Genoma Humano se conoció que:
El genoma humano está constituido por 3 millones de pares de bases.
Existen 30 a 35 mil genes codificantes (actualmente 20000 codificantes y 23000 no codificantes).
La homología en la secuencia de ADN entre individuos es del 99.9%.
La especie más cercana filogenéticamente al ser humano es el chimpancé (99% de homología).
Aquellas secuencias del genoma que se transcribían a ARN y posteriormente eran traducidas a proteínas (necesariamente).
GEN (Inicialmente):
Aquellas moléculas de ADN que se transcriben a ARNs que llevan a cabo una función biológica, esencial o no (se encuentran genes de ARN no codificante). No terminan en proteína pero si tienen una función
GEN (actualmente)
Son polímeros formados por nucleótidos.
ACIDOS NUCLEICOS
Tipos de acidos nucleicos:
- ADN es el polinucleótido encargado de almacenar y trasmitir la info genética
- ARN es el polinucleótido que trasmite y expresa dicha información genética.
Compuestos heterocíclicos aromáticos derivados de la pirimidina o de la purina.
BASES NITROGENADAS
Derivadas de pirimidina (un ciclo) son:
Uracilo, Timina y citocina
Derivadas de purina (dos ciclos) son:
Adenina y guanina.
Pentosa (monosacárido) + base nitrogenada. Unidos mediante enlace N-glucosídico entre el átomo de carbono carbonílico de la pentosa (C 1´) y uno de los átomos de nitrógeno de la base nitrogenada, el de la posición 1 si esta es pirimídica o el de la posición 9 si esta es púrica.
NUCLEÓSIDOS
Si se agrega grupo fosfato se convierte en …
NUCLEÓTIDO
Si en el carbono no tiene OH entonces es
desoxirribosa
Si tiene OH en C2 es
RIBOSA
Pentosa + base nitrogenada + grupo fosfato. El grupo fosfato proviene del ácido fosfórico. Esta unión tiene lugar en el -OH en carbono 5.
NUCLEÓTIDO
Enlace éster
Une grupo fosfato con pentosa
Enlace glucosídico
Pentosa con base nitrogenada.
En el tercer enlace de fosfato se requiere…
más energía para almacenar
Si el grupo fosfato de un nucleótido (unidos a C5) reacciona con el grupo 3 OH de otro se obtiene un dinucleótido, y si se sigue uniendo otros nucleótidos se pueden formar polinucleótidos. Se une el nucleótido 1 del OH del C3 con el grupo fosfato de C5 del nucleótido 2.
POLINUCLEÓTIDOS
ENLACE FOSFODIESTER
Se une el fosfato de la posición 5´ con el OH en la posición 3´.
Se forma agua.
El oxígeno se junta con el fósforo.
Unión de dos nucleótidos.
ESTRUCTURA PRIMARIA
Corresponde a la secuencia de nucleótidos de polinucleótido linearizado.
Superenrollamiento del DNA
Torcimiento o giro de la doble hélice sobre sí misma.
Enzimas (origen proteico) que regulan el superenrollamiento del DNA
Topoisomerasas
Tipo 1 de tropoisomerasas
Cortan solo UNA de las dos hebras del DNA, y permite que haya menos tensión en la molécula, permite el relajamiento progresivo de hélices superenrrolladas, después vuelven a ligar la hebra. Es energéticamente espontáneo (no requiere energía (ATP) para realizarlo) después del corte.
Tipo 2 de tropoisomerasas
Cortan ambas hebras; las mantienen estabilizadas y son capaces de inducir giros con intencionalidad al lado derecho (diestra) o al lado izquierdo (siniestra). No son energéticamente favorecidos; las enzimas requieren de la hidrólisis de ATP para llevar a cabo su función. Si requieren ATP.
Girasas
Una variante de las topoisomerasas tipo 2, propias de procariontes, torcen ambas hebras, cambian de posición las hebras sencillas, permitiendo la separación o engrosamiento de los DNA circulares durante la replicación.
Compactación plectonémica del ADN
Superenrollar la doble hélice, es decir, a través de nuevos giros inducir el repliegue de la molécula para disminuir su longitud.
La Compactación plectonémica del ADN predomina en:
procariontes
Compactación toroidal del ADN
Enredar la molécula de DNA sobre estructuras proteínicas (proteicas).
La Compactación toroidal del ADN predomina en:
eucariontes
compactación de ADN procarionte: genoma de bacterias
Representado por una molécula de DNA circular. Hasta dos moléculas de DNA circular y algunos plasmídicos (extras) circulares.
compactación de ADN procarionte: Nucleoide bacteriano
Moléculas de DNA circular procarionte compactado unas mil veces. Generalmente con superenrollamiento siniestroso y asociado a proteínas de compactación tipo histona.
E-coli
Compactación plectonémica y toroidal (no origina estructuras regulares como nucleosomas) en casi 50%.
COMPACTACIÓN DEL DNA EUCARIONTE
El DNA se halla constantemente interactuando con proteínas; forma cromatina (colorido con tinciones a base de anilinas para microscopio compuesto.
Ac. Nucleicos + proteínas = histonas / no histonas.
Conformada por secuencias altamente repetitivas, forma muy condensada al microscopio; varían en longitud, pero tienden a ser cortas. No suele estar activa.
Segmentos del cromosoma que se tiñen fuertemente y permanecen visibles, durante todo el ciclo celular. Hay pocos genes en estas regiones y baja actividad transcripcional. Regiones supercondensadas. Secuencias repetitivas de DNA, regiones no transcribibles en el genoma.
HETEROCROMATINA
Ligeramente compactada (< heterocromatina), con gran concentración de genes y a veces se encuentra en transcripción activa. Se encuentra en eucariotas y procariotas. Se transcribe constantemente. Segmentos del cromosoma que NO son visibles durante la telofase e interfase, solo en metafase. Regiones que se condensan y se descondensan.
EUCROMATINA
Conjunto de cromosomas y su morfología en metafase de una célula que se ordenan colocándolos por parejas de cromosomas homólogos.
CARIOTIPO
23 pares de cromosomas homólogos, 22 autosomas (crom no sexuales) y 1 sexuales. Mitad del padre, mitad de la madre. Diploide (parejas de cromosomas homólogos).
Cariotipo Humano
Las células del DNA está superenrollado, gracias a las topoisomerasas mediante un corte transitorio introducen un aumento (aveces reducción) del # de vueltas en la hélice.
CONDENSACIÓN DEL DNA
Superenrollamiento y empaquetamiento está presente en…
eucariontes
Superenrollamiento NEGATIVO
Mas fecuente en eucariontes, en zonas codificantes. Facilita la apertura de la hélice en la transcripción.
Superenrollamiento POSITIVO
Se encuentra transitoriamente en eucariontes durante la transcripción delante de la RNApol.
SEGUNDO NIVEL: FIBRA DE 30 nm
Las histonas H1 se unen y plegan a los nucleosomas en conformación zig-zag. 1 vuelta de la espiral que forma la fibra = Solenoide (6 nucleosomas).
TERCER NIVEL: FIBRA DE 300 nm.
Los Solenoides se enrollan en bucles de 300 nm, formando cronómetros. Se organiza en una serie de asas que contienen entre 50-150 kb. Están unidas en su base por proteínas específicas.
GENOMA HUMANO:
Se puede dividir en función de su compartimentalización en:
nuclear: 3,300,000 kb en 23 moléculas lineales, 2 copias por células diploide, aprox 100,000 genes)
mitocondrial: 16.5 kb en una molécula circular, miles de copias por cpelula, 37 genes.
DNA de copia única:
Codificante: Estructural exones (codifica proteínas o RNAs), regulador (controla la expresión del gen). No codificante (función desconocida).
DNA: Repetitivo
Codificante: Agrupado (genes repetidos en tándem y familias multigénicas agrupadas). Y disperso (familias multigénicas agrupadas) No codificante: Agrupado (en regiones heterocromáticas y altamente repetitivo. Repeticiones en tándem DNA satélite. Y Disperso (por todo el genoma y moderadamente repetitivo). Tiene bloques dispersos de repeticiones en tándem; milisatélites y microsatélites; Repeticiones dispersas (SINE y LINE).
ESTRUCTURA DE LOS RNAs
Suele ser monocatenario
Contiene uracilo en lugar de timina.
La pentosa del nucleótido es ribosa.
Es 10 veces más abundante que el ADN.
ARN: NIVELES ESTRUCTURALES
- ESTRUCTURA PRIMARIA: Secuencia lineal de ribonucleótidos que se escriben en dirección 5’ – 3’.
- ESTRUCTURA SECUNDARIA: Doble hélice. Apareamiento de secuencias complementarias en la misma cadena de ARN o por asociaciones intercatenarias. Ej: Doble cadena de algunos virus.
Características: Antiparalela, complementaria, forma un giro y giro helicoidal. - ESTRUCTURA TERCIARIA: No siempre se forma, solo surge en ciertas condiciones que permiten interacción entre bases nitrogenadas.
ARNm (mensajero):
- ARNm (mensajero): Cadenas cortas y lineales (hasta 5000 n). Copia complementaria de un segmento de ADN, lleva la información desde el núcleo a los ribosomas para la síntesis de proteínas.
ARNr (ribosómico):
ARNr (ribosómico): Más abundantes, presentan zonas con estructura de doble hélice. Se encuentra en los ribosomas asociado a proteínas.
ARNt (de transferencia):
ARNt (de transferencia): Formados por 70 -90, presenta zonas con doble hélice, dan lugar a la estructura secundaria en “hoja de trébol”. Los que se encuentran en el citoplasma se encargan de recoger aminoácidos y transportarlos hasta los ribosomas.
ARNhn (heterogéneo nuclear):
Localizados en el núcleo. Diferentes tamaños. Precursor de ARNm, se transforman tras un proceso de maduración que implica la eliminación de secuencias de nucleótidos no codificantes.
ARNsn (pequeño nuclear):
Presente en el núcleo de eucariontes, está implicado en los procesos de maduració del ARNhm. Se asocia a proteínas formando ribonucleoproteínas pequeñas nucleares (RNPsn) que se encargan de eliminar intrones.
replicación
adn tiene que duplicarse y generar una copia
Transcripción
ocurre cuando va a haber una síntesis proteica
Traducción
aquel proceso en el cual el ARNm se lee en el ribosoma y se descodifica para pasarse del lenguajes de los ac. nucleicos al lenguaje de los aminoácidos
Compuestos heterociclicos (al menos un anillo y que ademas de tener carbono e hidrógeno tiene otros elementos) aromáticos (tiene que ver con los dobles enlaces, que los hace ser estables) derivados de la pirimidina (estructura de un solo anillo) o de la purina (estructura de dos anillos).
bases nitrogenadas
enlace glucosidico
carbono 1 de la pentosa se une con la base nitrogenada
reservorios de energia ejemplo: atp, guarda la energía en el tercer enlace del fosfato
difosfatos y trifosfatos
a través del grupo OH del carbono 3 del nucleótido 1 reacciona con el nucleotido 2 con su grupo fosfato y forma un enlace ….
fosfodiester
En la estructura del ADN, en la parte más externa se encuentran…
grupos fosfato = grupos hidrofilicos
En la estructura del ADN, en la parte de en medio se encuentran…
bases nitrogenadas apareadas y entre ellas es puente de hidrógeno
Mientras mas desdoblado este el adn, es decir con muchos puentes de hidrógeno…
el pico de la gráfica va a estar más elevado
desnaturalizaciones del 50% del adn
TM
más puentes de hidrógeno=
menos fácil desnaturalizarlo
Menos puentes de hidrógeno=
más facil desnaturalizar
TIPOS DE CONFORMACION DEL ADN
ADN-B
ADN-A
ADN-Z
ADN-B
Se transcribe + que el ADN A.
Hélice doble de 20 a de diametro con giro a la derecha, cada giro contiene 10 pares de bases y tiene una altura de 3.4 nanómetros. Se distinguen surcos (mayor de 22a y menor de 12a). Las cabes se orientan casi perpendicular al eje. Se distingue en EUCROMATINA.
ADN-A
Se forma con procesos de DESHIDRATACIÓN cercanos al 30/ Hélice doble con giro a la derecha, las bases no se orientan perpendicularmente por lo que es más compacta y casi desaparecen los surcos. Puede presentarse en híbridos ADN-ARN o en zonas de interacción de ciertas proteínas de ADN
ADN-Z
Descrito en secuencias alteradas de G y C. Hélice doble con giro a la IZQUIERDA y con forma de zig-zag, es una estructura delgada. Se favorece por METILACIÓN (regulación de la expresión génica).
No es muy estable, vulnerable al ataque químico. Luego regresa a la forma ADN-B.
si se modifica el contenido de sales se modifica la laxitud de la molécula de ADN, originando las formas..
A-E
Se generan híbridos ARN-ADN cuando…
está el proceso de transcripción, o en zonas en las que proteínas están en contacto con adn
produce levogiro, especie de felices zigzaguearas con forma de Z
zonas donde tenemos zonas alternadas de guaina y citocina
Forma P (P-DNA)
Es una forma superenrrollada de la doble hélice, cuya periocidad de giro se da cada 2.6 pb, por lo que es mucho más delgada y alrededor de 75% más larga que el B-DNA- Se presenta de forma transitoria durante la replicación y transcripción
H-DNA
Porciones del DNA con secuencias poli-Pi complementarias a poli-Pu, que se someten a un superenrrollamiento negativo (levógiro) o a un pH bajo, dan origen a la estructura denominada H-DNA. La doble hélice se destuerce en una porción poli-Pi/poli-Pu/poli-Pi.
Se ha observado que participan en la recombinación, transfección y regulación de algunos genes.
enzimas de restricción:
proteínas que rompen el enlace fosfodiester
Son aquellas regiones del DNA cuta secuencia es la misma en ambas hebras.
Las enzimas ENDONUCLEASAS reconocen los palíndromos.
Variaciones locales de la estructura secundaria: PALÍNDROMOS
Palíndromos: son muy comunes y se ha observado que tienen algunas funciones…
- sirven como blanco (diana) de las enzimas de restricción
- Son puntos de unión a FACTORES DE TRANSCRIPCCIÓN por lo que participan en la regulación de la expresión génica.
- Forman estructuras secundarias peculiares como HORQUILLAS
Cierre de leucina (leucine zipper o ZIP). consta de dos helices alfa (paralelas o antiparalelas). Cada hélice tiene 30 a 40 residuos de aminoácidos en los que hay 1 leucina cada 7 residuos.
especie de tijera que abre y cierra, en medio reconoce al adn para unirse
La región básica que contiene aproximadamente 30 reciduos es rica en arginina y lisina y es la responsable de…
unirse al surco mayor del DNA
REGLAS DE CHARGAFF.
1. A=T
2.G=C
para saber si las secuencias están completas.
- La cantidad de Adenina es la misma que la de timina
- La cantidad de guanina equivale a la de citosina
- La cantidad de bases púricas es igual a la de las bases pirimídica
1953 Watson y Crick
Idénticas, las bases nitrogenadas que quedan una frente a la otra se emparejan por medio de los puentes de hidrógeno
Se forma una curvatura uniforme, una hélice doble y es dextrógeno (que gira a la derecha)
Proteínas globulares, van a dar lugar a la formación del nucleosoma
estas historias se agrupan y sobre ellas y ahí se plega el adn
- nucleosomicas: forman octamero
- H1: une el octamero
Histonas
Son proteínas diferentes a las histonas, que forman parte de la cromatina.
Incluten proteínas que participan en la expresión génica y proteínas que intervienen en el mantenimiento de un alto orden estructural.
participan en la expresión fénica, por ejemplo los factores de transcripción
proteínas variadas: proteínas que contribuyen con su presencia a generar un ambiente en el que se favorece el nucleosoma
No histonas
Grupo de proteínas de alta movilidad (HMG o High-mobility-group):
HMG-1/2, se unen a DNA cruciforma y estimulan la transcripción, replicación, y reparación
HMG-14/17, se unen a ADN de cadena simple y no es clara su función
HMG-I/Y, se cree participan en la regulación génica
Protaminas
Desempeñan la función equivalente a las histonas en tipos celulares concretos (ej. espermas)
Son pequeñas (50 aa) con Arg, Ala y Ser, muy compactas
compactación plectonémica
consiste en superenrrollar la doble hélice; es decir, a través de nuevos giros inducir el repliegue de la molécula para disminuir su longitud
compactación toroidal
consiste en enredar la molécula de DNA sobre estructuras protéicas
Las moléculas de DNA circular procarionte se compacta unas 1000 veces para conformar lo que se le conoce como____
nucleoide bacteriano
La secuencia de bases de nucleótidos corresponde a un fragmento de una hebra de ácido nucleico:
3´… ATTAGCGAAGGAAGCGATTA…5´
- Ácido nucleico: ADN
- Hebra complementaria: 5´…TAATCGCCTTCGCTAAT…3´
- Extremo inicial donde se añaden nucleótidos: 5´- 3´
- Secuencia del transcrito que generaría: RNA: AUUAGCGAAGGAAGCGAUUA
- Porcentaje de guanina: 20%
- Porcentaje de citocina: 20%
- Si es B-ADN, ¿Cuántas vueltas alcanza a completar el segmento?: 2 vueltas (10 pares de base x vuelta).
- Tamaño del segmento:
- Altura del segmento:
Calcular porcentaje de adenina, guanina, citocina y timina.
% Guanina = % Citocina
% Timina = % Adenina
100% - ? (Ej: 40) Pares de base en total (hebra normal + hebra complementaria)
% Guaninas = # de guaninas en la hebra (Ej: 8 = 20%)
% Citocinas = % Guaninas = 20%
%G + %C = 40%
100% - 40% = 60%
60% / 2 (siempre)
%Timina= 30%
%Adenina= 30%
Se tiene una secuencia de ADN de 586 pb (Pares de bases).
- Vueltas: 10 pb/vuelta.
- Altura si es B-ADN: 58.6 vueltas (586 pb / 10 pb/vuelta)
- Si contiene 30% de G, ¿cuál sería el contenido de A?: (3.4 nm/ vuelta X 58.6 vueltas)
EXAMEN 1ER PARCIAL
EXAMEN 1ER PARCIAL
- La mitocondria es un organelo celular que
Contiene ADN propio doble cadena
- Si requiere identificar el genoma del semen de una violación con un sospechoso; indique el % de diferencia genética que se encontratá si la muestra obtenida del sospechoso son leucocitos de sangre periféroca, si el fuera el culpable:
50%
- La constitución total genética de un individuo o célula es considerada
Genoma
- En el descubrimiento de la estructura del ADN indique el orden de las siguientes contibuciones
Decubrimieento de Nucleina
- La muestra biológica menos invasiva para el estudio de ADN sería:
Leucocitos de sangre periférica
- Región donde se localizan el ADN satélite alfa
Centrómeros
- ¿Cuál de las siguientes secuencias es complementaria para la secuencia 5´- CAAGGTTTAACCTATAC -3´
3´GTTCCAAATTGGATATG - 5´
- La constitución total genética de un indiviuo o célula es considerada:
Genoma
- El nucleótido de ADN está formado por los siguientes componentes, EXCEPTO:
Ribosa.
- En el espectrofotómetro cual es el componente que ayuda a separar la longitud de onda deseada.
Monocromador.
- Científico que encuentra los factores que se expresan de manera dominante y recesiva
Mendel
- Indique que frase describe la estructura terciaria del ADN
Estructura cromosómica compacta que contiene
- El cromosoma pertenece a que nivel de estructura celular
Nivel de complejos supramoleculares
- Isomería clásica que presentan las bases nitrogenadas propuestas por Watson y Crick en su modelo de ADN
Ceto-enol
- El objetivo de la replicación está descrito en cual de las siguientes frases
Formar copias de ADN con la mínimas modificaciones.
- Indique que frase describe mejor a los ribosomas:
Complejo supramolecular constituido de proteínas.
- Isomería clásica que presentan las bases nitrogenadas propuestas por Watson y Crick en su modelo de AGN
Ceto-amino.
- Son características del ADN mitocondrial, EXCEPTO:
Tiene intrones.
- Análogo estructural de la Guanina que se usa como retroviral
Aciclovir
- El objetivo de la replicación esta descrito en cual de las siguientes frases
Formar copias del ADN originar para crear propia
- El gel de poliacrilamida genera poros
Altamente homogéneos
- EN los genes únicos del genoma nucelar se condifica para lo siguiente, EXCEPTO;
Proteínas de traducción
- Indique la secuencia de los procesos extracción de ADN nuclear
- Degradación de membranas biológicas.
- Pérdida de la estructura cuaternaria de las histonas.
- Lavado de ADN para quitar moléculas celulares contaminantes.
- Degradación de DNAasas.
- El paso de ribonucleótidos a desoxirribonucleótidos es:
Transcripción
- Se desea estudiar la cantidad y la expresión de la proteína de insulina, indique que tipo de material genético estudiaría.
ARN de leucocitos.
- Se tiene una muestra de ARN de la cual se determinó en el espectofotómetro la absorbancia a 260 nm y fue de 0.654. Indique la concentración de la muestra en la celda.
- En la cámara electroforética el ADN correrá para electrodo:
Cátodo.
28.Se tiene una muestra de ADN cadena doble que se utilizará en un estudio de polimorfismo; la muestra se analiza en el espectofotómetro dando los siguientes valores:
A) Absorbacia de 0.984 a 260 nm.
B) Absorbacia de 0.490 a 280 nm.
En base a sus resultados que decisión tomaría;
Se debe volver a purificar la muestra
- Cuando en el laboratorio se tiene una muestra de ADN en un ependor y a perdido la humedad en un 20% la estructura del ADN que se encontrará tendrá las siguientes características:
ADN de 11 pb de base dextrogiro ***
- Indique que tipo de ADN es utilizado para la determinación de las secuencias polimórficas que causan la variabilidad entre individuos no relacionados
Minisatélite.
- Se requiere la realización de una prueba genética de paternidad para lo cual requerimos separar e identificar los distintos fragmentos del ADN, ¿qué técnica utilizaría usted?
Electroforesis.
- Paciente masculino de 15 años de edad que presenta temblores, calambres musculares, espasmos musculares, fatiga y dificultad para hablar. Se le diagnostica enfermedad de Kennedy. ¿Cuál de los siguientes tipo de mutación es responsable de esta enfermedad?
Error en el corte y empalme de cromosoma X.
- Nucleótido utilizado en la glucogenogénesis:
ATP
- El ADN nuclear de una neurona tiene todas las características, EXCEPTO:
Contiene intrones.
- Se requiere la realización de una prueba genética de paternidad para separar e identificar los distintos fragmentos del ADN, ¿Qué técnica utilizarías?
PCR
- Indique que frase describe la estructura terciaria del ADN
Alfa hélice de doble cadena complementaria
En cada una de las células hijas se conserva una de las cadenas originales.
Esperimentos de Meselson y Stahl, 1957. Utilizaron N15 y N14 para diferenciar la forma en que se replicaba el ADN.
SEMICONSERVADORA
A partir del sitio de origen, se sintetizan dos cadenas en ambos sentidos, con dos puntos de crecimiento que forman una horquilla de replicación.
En eucariontes la replicación es MULTIFOCAL (con múltiples ARS).
- ORI: Origen de replicación autónoma en PROCARIONTES (ricos en A y T), sirve para que se rompan los puentes de hidrógeno. Con uno solo se puede replicar en una sola vaz.
- ARS: Origen de replicación en EUCARIONTES (secuencias de replicación autónoma). Requiere varios para replicarse.
Horquillas de replicación: orilla del hoyo
Burbuja de replicación: hoyo
BIDIRECCIONAL
Son puntos fijos a partir de los cuales se lleva a cabo la replicación, que avanza de forma secuencial formando estructuras con forma de horquilla.
- REPLICÓN o UNIDAD FUNCIONAL DE REPLICACIÓN: La cantidad de DNA que se puede sintetizar a partir de un origen único de replicación.
ORIGENES DE REPLICACIÓN
Es un replicón único circular, la replicación es monofocal.
GENOMA BACTERIANO
En organismos eucarióticos, la replicación del DNA se inicia en múltiples orígenes a la vez (hay uno cada 20 kb aproximadamente), es decir, hay multitud de replicones, la replicación es multifocal.
GENOMA EUCARIOTES
La replicación siempre se realiza en dirección 5´- 3’ y el extremo 3´ -OH que ocurre la elongación.
Una de las cadenas (cadena retrasada) se sintetiza por segmentos, llamado FRAGMENTOS de OKAZAKI (100-400 nucleótidos).
Por la continuación de la polimeraza que avanza de 5´a 3´.
PC: Punto de crecimiento (Horquilla de replicación).
DISCONTINUA
INICIACIÓN:
- Los ARS (Ricos en adenina y timina) son reconocidos por las proteínas de reconocimiento del sitio de origen.
- La helicasa hidroliza puentes de hidrógeno para abrir la doble hélice.
- Las RPA se unen a una hebra sencilla para estabilizar.
INICIACIÓN
ELONGACION:
-La polimerasa se une e incorpora nucleotidos en forma complementaria a la cadena molde a partir del cebador con ayuda de la PCNA.
ELONGACION
Diferencias entre ADN y ARN
Ambas compuestas por nucleótidos
ARN:
- Pentosa: ribosa.
- Bases púricas: A y G.
- Bases pirimídicas
- Monocatenario, pero No siempre, ej. el ARN de transferencia que es bicatenario.
- Se encuentra en transcripción y traducción.
ADN:
- Pentosa: desoxirribosa.
- Bases púricas: A y G.
- Bases pirimídicas: C y T.
- Bicatenario.
- estable.
- Tiempo de vida más larga. Está durante toda la vida de la célula.
- Se hereda una de las hebras.
EMPAREJAMIENTO de las BASES
x Puentes de Hidrógeno.
Las helicasas los rompen.
Bases CANÓNICAS: Pueden poseer un grupo CETONA o AMINA sobre los carbonos que rodean al átomo de nitrógeno más ALEJADO del ENLACE GLUCOSIDICO, lo que les permite emparejase por medio de PUENTES DE HIDRÓGENO.
- Bases NO CANÓNICAS: Se emparejan gracias a efectos HIDROFÓBICOS: 2,4- digluorotolueno (F, análogo de T) o 4-metilbenzimidazzol (Z análogo de A).
- Bases X: Tienen un anillo BENCÉNICO. Estas bases expandidas pueden aparear con las bases canónicas.
DESNATURALIZACIÓN del ADN
La fusión de una molécula de ADN aumenta la absorción de luz ultravioleta (260 nm).
La Tm > para DNA con > contenido % de pares de bases GC.
GENOMA HUMANO
- Genoma nuclear
Proteínas que se ocupan para el metabolísmo y fisiología celular.
A - Genoma mitocondrial
SISTEMAS ORTÓLOGOS.
XENOBIOLOGÍA
Disciplina a caballo entre la química, biología y la astrobiología cuyo objetivo es estudiar las posibles formas alternativas de vida con base a las condiciones físicos-químicos que se hubieran dado en nuestro pasado prebiótico y/o en otros planetas.
Niveles de empaquetamiento del DNA
PRIMER NIVEL: NUCLEOSOMA.
Las histonas nucleosómicas (H2A, H2B, H3, y H4), se asocian para formar un octámero. Un segmento de DNA de 146 pb se enrolla dando 1.6 vueltas al octámero para formar el NUCLEOSOMA.
Niveles de empaquetamiento del DNA
CUARTO NIVEL: CROMOSOMA
- Centrómeros: Regiones repetitivas de DNA (150-171 pb)n. Constituyen el sitio de unión de las fibras del huso mitótitco. Componen del 1%- 3% de la secuencia del genóma. Su posición varía en los distintos cromosomas.
- Telómeros: Se encuentran en los extremos de los cromosomas. Se Requieren para la replicación y estabilidad de los cromosomas. Son secuencias repetidas de DNA, en humanos. TAGGG, que se repite entre 250-1500 veces.
