15ª Aula - Taxonomia Bacteriana

Question 1

o que é a taxonomia?

Answer 1

ciência da classificação biológica

Question 2

quais as 3 etapas da taxonomia?

Answer 2

1. classificação - arranjo dos microorganismos em grupos ou taxas que partilhem as mesmas caracteristicas
2. nomenclatura - designação por grupos taxonomicos
3. identificação - determina a que grupo pertence determinado microoganismo

Question 3

quais os 3 dominios que fazem parte da árvore filogenetica unievrsal?

Answer 3

bacteria
archaea
eucarya

Question 4

quem foi Carolus Linnaeus? Qual o seu contributo?

Answer 4

considerado pai da taxonomia moderna. implementou o sistema de nomeclatura binomial

Question 5

como funciona o sistema binomial?

Answer 5

1. género (letra maiscula)
2. espécie (letra miniscula)

ex: Staphylococcus aureus ou S. aureus

sempre em italico ou sublinhado quando escrito a mão

Question 6

O que significa Escherichia spp.?

Answer 6

todas as especies, quando não se quer especificar

Question 7

O que significa Escherichia sp?

Answer 7

1 espécie, quando não se quer especificar qual

Question 8

Qual o nome cientifico do nome comum Antraz?

Answer 8

Bacillus anthracis

Question 9

Qual o nome cientifico do nome comum Tuberculose

Answer 9

Mycobacterium tuberculosis

Question 10

Qual o nome cientifico do nome comum Febre tifóide

Answer 10

Salmonella typhi

Question 11

Qual o nome cientifico do nome comum gonorreia?

Answer 11

Neisseria

Question 12

Qual o nome cientifico do nome comum Meningite meningocócica?

Answer 12

Neisseria meningitidis

Question 13

Qual o nome cientifico do nome comum pneumonia?

Answer 13

Streptococcus pneumoniae

Question 14

quais os sistemas de classifciação?

Answer 14

1. classificação fenética
2. classificação genotípica
3. classificação filogenética

Question 15

como ocorre a classificação fenética?

Answer 15

Os microrganismos são agrupados com base em
similaridades em suas características fenotípicas.
Microrganismos que compartilham muitas
características formam uma única taxa

Question 16

como ocorre a classificação genotípica?

Answer 16

Procura comparar a semelhança genética entre os organismos.
Podem ser comparados genes individuais ou
genomas inteiros.

Question 17

como ocorre a classificação filogenética?

Answer 17

Os microorganismos são agrupados de acordo

com prováveis relações evolutivas.

Question 18

quais as propriedades utilizadas na classificação fenética?

Answer 18

• Morfológicas - forma bacteria
• Culturais - forma colonia
• Bioquímicas
• Serológicas - antigenios superficiais
• Ecológicas - habitat

Question 19

características morfológicas e estruturais utilizadas na classificação fenética?

Answer 19

• Forma células
• Tamanho células
• Tipo de agrupamento
• Reacção às colorações (Gram)
• flagelação
• Presença de cápsula
• Forma e localização dos esporos
• Inclusões celulares
• morfologia colónias

Question 20

Algumas características fisiológicas, bioquímicas e

ecológicas utilizadas na classificação fenética?

Answer 20

• Fontes de carbono e azoto
• Componentes da parede celular
• Comportamento face ao oxigénio
• metabolismo energético
• Temperatura de crescimento óptimo
• pH ótimo de crescimento
• Mobilidade
• Tolerância à pressão osmótica
• Síntese de pigmentos
• Necessidade e tolerância ao sal
• enzimas respiratórias (catalase e oxidase)
• Testes bioquímicos
• Sensibilidade a inibidores e a antibióticos

Question 21

que testes bioquimicos de identificação conhece?

Answer 21

API 2OE

Question 22

quais as vantagens e desvantagens do MALDI-TOF?

Answer 22

identificação rápida com pouca preparação e potencial economia de custos

baixa sensibilidade
só aplicavel a grandes quantidades

Question 23

quais as limitações dos métodos fenotípicos?

Answer 23

• Alguns microorganismos patogénicos não são capazes de crescer com as metodologias correntes
• Os métodos dependentes da cultura por vezes são demasiado lentos
• Alguns fenótipos manifestados por um organismo podem variar em função das condições de cultura utilizadas no laboratório
• Uma determinada característica pode ser gerada por
microrganismos muito distintos do ponto de vista genético

Question 24

qual a hierarquia dos taxa?

Answer 24

domínio
filo
classe
família
género
espécie
estirpe = clone

cima para baixo. quanto mais para cima mais diversidade, quanto mais para baixo mais semelhança

Question 25

as estirpes da mesma espécie podem diferir em algumas características:

Answer 25

• Biovars ( diferem nas caracteristicas bioquímicas)
• Serovars (diferem na resposta a anticorpos- nos antigénios)
• Lisotipos (diferente imunidade a bacteriófagos)
• Genótipos (marcas genéticas). é o mais usado para distinguir estirpes

Question 26

Qual o alvo de análise para a classificação genética dos microrganismos?

Answer 26

ribossomas e rRNAS são bons marcadores filogenéticos

Question 27

quais as vantagens dos rRNAS serem bons marcadores filogenéticos?

Answer 27

• São de tamanho pequeno
• Encontram-se em todas as células
• Possuem regiões contínuas e descontínuas
• Existem muitas cópias de cada um deles por célula

Question 28

como é que o rRNA e aminoacidos ajudam a identificar microorganismos?

Answer 28

através das sequências de assinatura de rRNA e de aminoácidos

Question 29

As moléculas 16S e 23 S rRNA possuem informação suficiente para _____

Answer 29

permitir uma classificação filogenética

Question 30

o que são regiões conservadas?

Answer 30

Sequências de assinatura de oligonocleótidos

Question 31

o que é um Filótipo?

Answer 31

qualquer microrganismo não cultivável, identificado

apenas pela sua sequencia de ácidos nucleícos

Question 32

pode fazer-se identificação de microrganismos não cultiváveis por sequenciação do ___?

Answer 32

rRNA16S

Question 33

o rRNA 16S é extremamente útil na afiliação filogenética de bactérias em ________ , ____ , ____

Answer 33

espécies, geéneros e famílias

Question 34

quais os limites de sequenciação ro rRNA16S?

Answer 34

• Incapacidade de distinguir entre espécies
muito próximas ou complexo Mycobacterium tuberculosis

especies com mais de 70% de semlhança de DNA têm mais de 97% de identifdade de sequencia 16S

Question 35

como podemos fazer a comparação total do genoma?

Answer 35

A identidade média de nucleótidos
Hibridação DNA-DNA
Determinação do conteúdo de G+C

Question 36

na hibridação DNA-DNA A estabilidade do produto de hibridação é expressa em ______ e _______ a Temperatura de fusão
depende de ______

Answer 36

Concentração e tempo de DNA

2. Comprimento da fita de DNA
3. Conteúdo de GC

Question 37

o que é a temperatura de fusão do DNA?

Answer 37

temperatura à qual metade da sequencia de bases de DNA está desnaturada

Question 38

onde se usa a técnica % G+C?

Answer 38

A % G+C é útil na definição dos géneros bacterianos visto que uma variação dentro de um género é normalmente inferior a 10%

Question 39

como se pode fazer a identificação de estirpes e subespecies?

Answer 39

MLSA – Multilocus sequence analysis
SNPs – Single nucleotide polymorphisms
RFLP– Restriction Fragment Length Polymorphism

Question 40

em que consiste o MLSA?

Answer 40

O MLSA recolhe informação de múltiplos genes em todo

o genoma. e compara as sequencias de varios genes de manutenção conservados

Question 41

em que consiste SNPs?

Answer 41

compara sequências nucleotídicas,curtas, que abrangem todo o genoma para analisar uma fração grande do genoma

• identificados em genes específicos, regiões intergénicas ou em outras regiões não
codificantes

Question 42

como definir uma especie bacteriana?

Answer 42

O microrganismo deve ser fenotipicamente semelhante a outros dogrupo

a similaridade de todo o genoma, determinado pela hibridação DNADNA, deve ser de pelo menos 70%

a temperatura de fusão do DNA (um reflexo do conteúdo de G + C)
dentro de 5°C

divergência na sequência do gene rRNA de menos de 3%