15ª Aula - Taxonomia Bacteriana Flashcards
o que é a taxonomia?
ciência da classificação biológica
quais as 3 etapas da taxonomia?
- classificação - arranjo dos microorganismos em grupos ou taxas que partilhem as mesmas caracteristicas
- nomenclatura - designação por grupos taxonomicos
- identificação - determina a que grupo pertence determinado microoganismo
quais os 3 dominios que fazem parte da árvore filogenetica unievrsal?
bacteria
archaea
eucarya
quem foi Carolus Linnaeus? Qual o seu contributo?
considerado pai da taxonomia moderna. implementou o sistema de nomeclatura binomial
como funciona o sistema binomial?
- género (letra maiscula)
- espécie (letra miniscula)
ex: Staphylococcus aureus ou S. aureus
sempre em italico ou sublinhado quando escrito a mão
O que significa Escherichia spp.?
todas as especies, quando não se quer especificar
O que significa Escherichia sp?
1 espécie, quando não se quer especificar qual
Qual o nome cientifico do nome comum Antraz?
Bacillus anthracis
Qual o nome cientifico do nome comum Tuberculose
Mycobacterium tuberculosis
Qual o nome cientifico do nome comum Febre tifóide
Salmonella typhi
Qual o nome cientifico do nome comum gonorreia?
Neisseria
Qual o nome cientifico do nome comum Meningite meningocócica?
Neisseria meningitidis
Qual o nome cientifico do nome comum pneumonia?
Streptococcus pneumoniae
quais os sistemas de classifciação?
- classificação fenética
- classificação genotípica
- classificação filogenética
como ocorre a classificação fenética?
Os microrganismos são agrupados com base em
similaridades em suas características fenotípicas.
Microrganismos que compartilham muitas
características formam uma única taxa
como ocorre a classificação genotípica?
Procura comparar a semelhança genética entre os organismos.
Podem ser comparados genes individuais ou
genomas inteiros.
como ocorre a classificação filogenética?
Os microorganismos são agrupados de acordo
com prováveis relações evolutivas.
quais as propriedades utilizadas na classificação fenética?
- Morfológicas - forma bacteria
- Culturais - forma colonia
- Bioquímicas
- Serológicas - antigenios superficiais
- Ecológicas - habitat
características morfológicas e estruturais utilizadas na classificação fenética?
- Forma células
- Tamanho células
- Tipo de agrupamento
- Reacção às colorações (Gram)
- flagelação
- Presença de cápsula
- Forma e localização dos esporos
- Inclusões celulares
- morfologia colónias
Algumas características fisiológicas, bioquímicas e
ecológicas utilizadas na classificação fenética?
- Fontes de carbono e azoto
- Componentes da parede celular
- Comportamento face ao oxigénio
- metabolismo energético
- Temperatura de crescimento óptimo
- pH ótimo de crescimento
- Mobilidade
- Tolerância à pressão osmótica
- Síntese de pigmentos
- Necessidade e tolerância ao sal
- enzimas respiratórias (catalase e oxidase)
- Testes bioquímicos
- Sensibilidade a inibidores e a antibióticos
que testes bioquimicos de identificação conhece?
API 2OE
quais as vantagens e desvantagens do MALDI-TOF?
identificação rápida com pouca preparação e potencial economia de custos
baixa sensibilidade
só aplicavel a grandes quantidades
quais as limitações dos métodos fenotípicos?
• Alguns microorganismos patogénicos não são capazes de crescer com as metodologias correntes
• Os métodos dependentes da cultura por vezes são demasiado lentos
• Alguns fenótipos manifestados por um organismo podem variar em função das condições de cultura utilizadas no laboratório
• Uma determinada característica pode ser gerada por
microrganismos muito distintos do ponto de vista genético
qual a hierarquia dos taxa?
domínio filo classe família género espécie estirpe = clone
cima para baixo. quanto mais para cima mais diversidade, quanto mais para baixo mais semelhança
as estirpes da mesma espécie podem diferir em algumas características:
- Biovars ( diferem nas caracteristicas bioquímicas)
- Serovars (diferem na resposta a anticorpos- nos antigénios)
- Lisotipos (diferente imunidade a bacteriófagos)
- Genótipos (marcas genéticas). é o mais usado para distinguir estirpes
Qual o alvo de análise para a classificação genética dos microrganismos?
ribossomas e rRNAS são bons marcadores filogenéticos
quais as vantagens dos rRNAS serem bons marcadores filogenéticos?
- São de tamanho pequeno
- Encontram-se em todas as células
- Possuem regiões contínuas e descontínuas
- Existem muitas cópias de cada um deles por célula
como é que o rRNA e aminoacidos ajudam a identificar microorganismos?
através das sequências de assinatura de rRNA e de aminoácidos
As moléculas 16S e 23 S rRNA possuem informação suficiente para _____
permitir uma classificação filogenética
o que são regiões conservadas?
Sequências de assinatura de oligonocleótidos
o que é um Filótipo?
qualquer microrganismo não cultivável, identificado
apenas pela sua sequencia de ácidos nucleícos
pode fazer-se identificação de microrganismos não cultiváveis por sequenciação do ___?
rRNA16S
o rRNA 16S é extremamente útil na afiliação filogenética de bactérias em ________ , ____ , ____
espécies, geéneros e famílias
quais os limites de sequenciação ro rRNA16S?
• Incapacidade de distinguir entre espécies
muito próximas ou complexo Mycobacterium tuberculosis
especies com mais de 70% de semlhança de DNA têm mais de 97% de identifdade de sequencia 16S
como podemos fazer a comparação total do genoma?
A identidade média de nucleótidos
Hibridação DNA-DNA
Determinação do conteúdo de G+C
na hibridação DNA-DNA A estabilidade do produto de hibridação é expressa em ______ e _______ a Temperatura de fusão
depende de ______
Concentração e tempo de DNA
- Comprimento da fita de DNA
- Conteúdo de GC
o que é a temperatura de fusão do DNA?
temperatura à qual metade da sequencia de bases de DNA está desnaturada
onde se usa a técnica % G+C?
A % G+C é útil na definição dos géneros bacterianos visto que uma variação dentro de um género é normalmente inferior a 10%
como se pode fazer a identificação de estirpes e subespecies?
MLSA – Multilocus sequence analysis
SNPs – Single nucleotide polymorphisms
RFLP– Restriction Fragment Length Polymorphism
em que consiste o MLSA?
O MLSA recolhe informação de múltiplos genes em todo
o genoma. e compara as sequencias de varios genes de manutenção conservados
em que consiste SNPs?
compara sequências nucleotídicas,curtas, que abrangem todo o genoma para analisar uma fração grande do genoma
• identificados em genes específicos, regiões intergénicas ou em outras regiões não
codificantes
como definir uma especie bacteriana?
O microrganismo deve ser fenotipicamente semelhante a outros dogrupo
a similaridade de todo o genoma, determinado pela hibridação DNADNA, deve ser de pelo menos 70%
a temperatura de fusão do DNA (um reflexo do conteúdo de G + C)
dentro de 5°C
divergência na sequência do gene rRNA de menos de 3%
