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Bacteriologia > 14ª Aula - Genética Bacteriana > Flashcards

14ª Aula - Genética Bacteriana Flashcards

1
Q

o que é o processo de reparação SOS?

A

mecanismo de alarme, sem o qual morre. só é usado em procariontes.

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Q

qual o outro nome do regulão lexA?

A

regulão SOS

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3
Q

o que faz o regulão lexA?

A

é repressor de genes associados à reparação do DNA e inibidor da FtsZ. previne a passagem de erros às gerações futuras.

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4
Q

quais os vários passos deste mecanismo?

A
  1. danos DNA -> cadeia simples do DNA exposta
  2. Ativação proteína recA que se liga ao DNA
  3. LexA ativo inibe reparação por isso temos de desativá-lo
    3, clivagem LexA (forma inativa) -> não há impedimento transcrição
  4. ocorre expressão gene SOS
  5. reparação DNA
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5
Q

o que ocorre quando as proteínas RecA estão inativas?

A

acumulação LexA -> impede transcrição gene SOS -> não há reparação DNA

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6
Q

quais os métodos de transferências genéticas nas bactérias?

A

horizontal e vertical

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7
Q

de uma forma geral como é feita a transferência horizontal/recombinação?

A

material genético é transferido entre células da mesma geração

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8
Q

de uma forma geral como é feita a transferência vertical/replicação?

A

material genético é transferido entre diferentes gerações (mãe para filha)

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9
Q

o que ocorre exatamente na transefrencia horizontal/recombinação?

A

fragmento de DNA exógeno é colocado noutra célula (diz-se metaploide). após esta introdução podem ocorrer 4 situações:

  1. o DNA exógeno recombina-se com o DNA endógeno (recombinação homologa)
  2. DNA exogeno torna-se independente e replica-se autonomamente (replicação independente)
  3. DNA exogeno existe só na bacteria sem se replicar
  4. nucleases destroem DNA exogeno (restrição)
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10
Q

definição de recombinação

A

troca entre duas moleculas de DNA que resulta numa nova combinação de genes

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11
Q

características da recombinação homologa

A
    • comum
  • envolve troca recíproca entre um par de
    sequências homólogas de DNA, de origens diferentes.
  • em qualquer parte do genoma
  • resulta de um corte na cadeia de DNA por ação de uma endonuclease e posterior ligação, conduzindo aos “crossing-overs”
  • envolve a ação da proteína RecA
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12
Q

características recombinação alvo especifico

A
  • Não são necessárias sequências homólogas longas
  • Ocorre em locais específicos
  • Catalizada por recombinases
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13
Q

quais os 3 tipos de trocas genéticas que podem ocorrer nas bactérias?

A

transformação
transdução
conjugação

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14
Q

o que é a transformação?

A

DNA livre é incorporado numa célula receptora. exemplo: experiência de Griffith. quando misturou bacterias virulentas mortas e bacterias avirulentas o ratinho morru. o que significa que teve de haver um processo em que as avirulentas integraram o DNA das virulentas aka transformação

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15
Q

como ocorre a transformação de bactérias?

A

troca de 1 fragmento DNA da celula dadora com a a recetora

  1. célula dadora morre (lise)
  2. DNA sai em fragmentos
  3. 1 fragmento de DNA da bactéria dadora liga-se
    a proteínas de ligação ao DNA à superfíce de
    uma célula recetora viável e competente
  4. proteína RecA promove troca genética
    entre 1 fragmento de DNA da célula dadora
    e 1 fragmento de DNA da bactéria recetora
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16
Q

diga alguns exemplos de bactérias naturalmente competentes para receberem fragmentos de DNA dador

A 
Streptococcus
Bacillus
Neisseria
Acinetobacter
Pseudomonas
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17
Q

a transformação de bactérias pode ocorrer através da inserção de?

A

fragmentos de DNA ou plasmídeos

18
Q

a entrada de DNA na abcteria pode dar origem a:

A

inserção desse DNA no DNA recetor ou degradação do DNA dador

19
Q

artificialmente como se dá a transformação quimica?

A
  1. tratamento com calcio
  2. incubação
  3. choque térmico
  4. recuperação
  5. plasmideo entra
20
Q

artificialmente como se dá a transformação elétrica?

A
  1. célula eletrocompetente
  2. incubação
  3. choque elétrico
  4. recuperção
  5. plasmideo entra
21
Q

definição de transdução

A

transferência genética mediada por bacteriófagos

22
Q

que tipos de transdução existem?

A

Transdução Generalizada

Transdução Restrita

23
Q

Transdução Generalizada

A

qualquer gene pode ser transmitido. Encapsidação de qualquer parte do genoma
• Exemplos: Bacteriófago P1/ E.coli e Bacteriófago P22/ Salmonella

ocorre no ciclo lisogenico, o DNA bacteriano insere-se no fago que vai infetar outra bactérias com o DNA bacteriano

24
Q

Transdução Restrita

A

apenas são transmitidos genes especificos. associado ao ciclo lisogenico. fago tem DNA bacteriano e DNA fágico e ao infetar outra bacteria, estes 2 inserem-se no DNA da bactéria

25
Q

definição de conjugação

A

transferência direta horizontal que requer o contacto entre duas bactérias e o Plasmídeo F

26
Q

O que significa (F+)?

A

Uma célula dadora, que tem o plasmídeo e (F+) têm pilus sexual

27
Q

O que significa (F-)?

A

Uma célula receptora (F-)

28
Q

o que são plasmídeos?

A

Pequenas moléculas de DNA, extracromossomais, habitualmente circulares, que se replicam de uma forma independente do genoma bacteriano (têm a sua própria origem de replicação) e codificam para a
sua própria replicação e para sua manutenção nas células em divisão

29
Q

quais os principais plasmideos?

A

fator F

30
Q

quais as características do plasmideo F?

A

Desempenha o papel principal nos processos de conjugação
• Contém os genes responsáveis pela interação, e pela transferência do plasmídeo (operão tra), com a bactéria recetora.
• Contém sequências de inserção que participam na integração no cromossoma da célula hospedeira.
• OriV origem de replicação
• OriT início da transferência

31
Q

como se dá a conjugaçao F+ x F-

A
  1. A célula dadora contacta com a célula recetora através do seu pilus.
  2. Uma das cadeias do DNA plasmídico é transferida para a célula recetora à medida que o DNA é replicado por mecanismo de “rolling circle”
  3. A célula recetora sintetiza a cadeia complementar tornando-se F+; a célula dadora sintetiza a
    cadeia complementar restaurando o plasmídeo
32
Q

o que são estirpes Hfr?

A

(high frequency of recombination): células que possuem um plasmídeo F integrado no genoma

33
Q

Conjugação Hfr x F

A

São transferidos genes do genoma da célula receptora. No final: Hfr e célula recombinante F-

34
Q

O factor F pode integrar-se em _____ locais do cromossoma e promover a transferência de genes a partir de cada um desses locais. O sentido da transferência depende da _____ com que o factor F foi integrado.

A

O factor F pode integrar-se em vários locais do cromossoma e promover a transferência de genes a partir de cada um desses locais. O sentido da transferência depende da orientação com que o factor F foi integrado.

35
Q

o que são elementos de transposição?

A
  • São elementos genéticos móveis que se podem inserir num ou mais locais de um genoma
  • Podem deslocar-se entre o genoma bacteriano e um plasmídeo
  • Não possuiem origem de replicação
  • Encontram-se inseridos noutras moléculas de DNA (Ex: plasmideos)
  • Deslocam-se por Transposição
36
Q

exemplos de elementos de transposição?

A

Tipos de elementos de transposição:
v Sequências de inserção
v Transposões

37
Q

o que são sequencias de inserção?

A

São os elementos de transposição mais simples
• ~1000 bp
• Sequências de repetição invertidas (IR): 10 a 50 bp
• Transposase
• Encontram-se em plasmídeos de Bactérias e Archaea
• Encontram-se em Bacterófago

38
Q

o que são transposões?

A

Maiores que as ISs
• Transposase
• Sequências de repetição invertidas
• Inclui outros genes; Ex Resistência a antibióticos
As sequências de repetição invertidas e a transposase são essenciais para a Transposição

39
Q

efeitos da transposição

A 
Alteração da estrutura do gene - Mutação “knock out”
• Rearranjos de DNA:
– delecções,
– amplificações,
– inversões
• Activação de genes
40
Q

aplicações

A 
Usados para construir mutantes:
• Transposões com genes de resistência
aos antibióticos
• A maioria das inserções comprometem
a função de proteínas
41
Q

o que são integrões?

A

Elementos Genéticos Móveis que podem capturar “Gene Cassettes”(DNA móvel
contendo um local de recombinação).
• Contêm uma integrase
• Uma região de recombinação att a jusante de uma região promotora
Os integrões podem receber e dar genes móveis

42
Q

Ilha de Patogenicidade (PAIs)

A

Cluster de genes envolvidos nos processos de patogenia presentes nas estirpes patogénicas e
ausentes nas estirpes não patogénicas de uma mesma espécie
• Contêm genes que codificam factores de adesão, invasão e secreção e frequentemente toxinas
• Regiões de DNA habitualmente de composição em G+C diferente do resto do genoma o que
sugere que tenham origem em transferências horizontais de genes
• São flanqueadas por sequências de repetição directa (DR) o que indica que foram geradas via
recombinação alvo específica
• Estão muitas vezes associadas com genes de t-RNA (locais habituais de integração de DNA
vindo do exterior)
• Transportam genes que codificam factores de mobilidade tais como integrase, transposases e
IS, sistemas de secrecção de proteínas (T3SS)
• Não são segmentos de DNA homogéneos, mas são antes compostos por módulos de
sequências geradas por processos em múltiplas etapas
• Representam regiões instáveis de ADN

Bacteriologia (22 decks)

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