הרצאה 1 Flashcards
מהם שלושת הדברים המרכיבים את הנוקלאוטידים? באיזו נקודה נוקלאוטיד אחד מתחבר לאחר? מה מבדיל דנא מרנא? מה המטען של הדנא?
איזה בסיסים חנקניים יש? מה שמם?
A-adenine
G-guanine
T-thymine
U-uracil
C-cytosine
what is purine? what is pyrimidine?
פורין- מכילה שתי טבעות חנקניות
A,G
פירמידין- מכילה טבעת חנקנית אחת. מכילה ארבעה פחמנים ושני חנקנים
C,U,T
Adenine
thymine
guanine
cytosine
uracil
כיצד נקרא הקשר הכימי שנוצר בין שני נוקלאוטידים?
מה מתחבר למה?
מה אפשר לומר על הכיווניות של הדנא? איך גדיל אחד ביחס לששני מבחינת כיווניות? באיזה כיוון קוראים את הדנא? מה המאפיין של כל קצה (למה הוא קשור?) כל כמה בסיסים יש סיבוב של 360 מעלות? לאיזה כיוון הסיבוב של הדנא?
ברנא יש בסיס אחד ששונא מהדנא ומקביל אליו, באיזה בסיס מדובר ובמי הוא מתחלף?
מי יותר יציב, רנא או דנא?
האם הרנא רגיש לחומציות או לבסיסיות? הוא ימצא בגרעין או בציטופלזמה?
איזה סוגים של רנא יש? למה כל אחד מהם משמש?
מיהו הכרומוזום הקטן ביותר בגנום האנושי?
כרומוזום 22
האם המושג “גן” מכיל בתוכו גם את האיזורים הרגולטוריים שלו?
מהו אקסון? מהו אינטרון? מה זה שחבור?
כמה נוקלאוטידים מכיל הגנום האנושי? כמה מהם מקודדים לחלבון?
מכיל שלושה מיליארד נוקלאוטידים.
1.5 אחוז מתוכם מקודדים לחלבון
מהם גנים פסאודו גנים?
מהם
LINES
מהם
SINES?
מהם
Alu sequences?
כמה הם מהווים מהגנום?
מהו טלומר?
מהו צנטרומר?
מהו
origin of replication?
למה כל אחד מהם משמש?
איך ארוז הדנא? מהם היסטונים? מהו נוקלאוזום? מהו לינקר דנא? כמה בסיסים נמצאים בלינקר דנא? למה הוא משמש?
ממה מורכבים ההיסטונים? מה המטען שלהם? מדוע זה המטען שלהם?
מה מבדיל בין ההסיטונים? איך ההבדל הזה קשור בייצוב ודחיסת הנוקלאוזום?
מהו איזור הטרוכרומטין? איזה חלקים בכרומוזום הם הטרוכרומטין באופן קבוע?
האיזור הדחוס בכרומטין, לא מתבצע בו שיעתוק. הטלומר והצנטרומר הם תמיד הטרוכרומטין
מה זה יוכרומטין?
האיזור הפחות דחוס בכרומטין שעובר שעתוק
מה זה
chromatin remodeling complex?
מה הם
histone chaperones?
מחליפים תת יחידות של היסטונים באמצעות שימוש באתפ
אילו מודיפיקציות היסטונים יכולים לעבור? מה המשמעות של כל מודיפיקציה?
למה יש מודיפיקציות בהיסטונים בעיקר על ליזינים?
כי יש לחומצה אמינית הזו מטען חיובי, לכן כשנעשה מודיפיקציה עליה נוכל לבטל לה את המטען ולפתוח את הדנא מההיסטון
כמה מודיפיקציות שונות ניתן לבצע על נוקלאוזום? מה המשמעות של המודיפיקציות?
ניתן לבצע כמות עצומה של מודיפיקציות שונות. המשמעות שלהן היא הנחיה של התא מה לעשות עם הדנא- לדחוס, לפתוח, לתקן וכ’ו.
מדובר בשינויים אפיגנטיים
מהו קוד ההיסטונים?
האם המודיפיקציות הפיכות?
למה בדרך כלל גורמת מתילציה על דנא (לא על היסטון)?
קוד ההיסטונים הוק הקונספט שלכל רצף מסויים של מודיפיקציות על היסטונים תהיה משמעות שונה.
המודיפיקציות אכן הפיכות
מתילציות בדנא בד”כ גורמות לפחות ביטוי של הגן
עוד הסברים בתמונה
what are reader proteins? what are writer proteins? what are barrier sequence proteins?
what are Cis regulatory elements? (CRE)s?
מה זה
barrier sequence?
מהם הסוגים שיש?
איך כל אחד מהם עובד?
באיזה איזור בגרעין נמצא ההטרוכרומטין ואיפה נמצא היוכרומטין?
ההטרוכרומטין בקצוות ליד ה
nuclear pores
היוכרומטין יותר במרכז הגרעין
איפה לרוב יהיו רצפי
Alu
בהטרוכרומטין או יוכרומטין? מה הסיבה לכך?
מקור הרצפים הללו הוא בוירוסים. הם לא נמחקו מהגנום במהלך האבולוציה. לכן אפשר למצור את הרצפים הללו בעיקר ביוכרומטין, שכן לאיזורים האלה היה קל לדנא לחדור.
האם מודיפיקציות על היסטונים עוברות מתא אב לתא בת? הם המודיפיקציות הללו עוברות בהורשה בין דורית?
כן עובר לתא בת
לא עובר בין דורית
