תרגום

Question 1

אתרים בריבוזום

Answer 1

אתר A- כניסה של הtRNA אל הריבוזום
אתר P- האתר בו הפפטיד נמצא עד מעבר לאתר A
אתר E- יציאה של הtRNA

Question 2

איניציאצית תרגום יוקריוטים

Answer 2

פקטורי איניציאציה: eIF1-6
א. תת היחידה הקטנה מתחברת בעזרת eIF2 לtRNA מתחיל (AUGהתחלה, מתיונין שלרוב עוזב בסוף)- מראש מגיע לאתר P
ב. הmRNA מגיע עם eIF4e שמזהה את ה5 קאפ, eIF4g מחבר את 4e לחלבוני PAB שקשורים לפוליA, ויחד עם eIF4a מקבלים eIF4f.
ג. היחידה הקטנה סורקת ליניארית תוך שימוש בATP את הmRNA עד הגעה לAUG. אז aIF2 (חלבון G) עושה הידרוליזה לGTP ועוזב
ד. תת היחידה הגדולה מתחברת ומתחיל התרגום

פרוקריוטים: 16SrRNA נקשר לרצף SD שיש בקצה 5 של הmRNA

Question 3

eIF2

Answer 3

פקטור איניציאציה
חלבון G. מביא את הtRNA מתחיל לתת היחידה הקטנה
באיתור הקודון הראשון הוא עושה הידרוליזה לGTP ועוזב

בקרה: זרחון של הaIF2 גורם לסיקווסטרינג שלו עם המשחלף aIF2B ובכך מונע חזרה לGTP ותרגום

Question 4

eIF4

Answer 4

פקטור איניציאציה
פקטור A
פקטור G מגשר בין הE לPAB על הפוליA - הופך את הmRNA למעגל שנפתח ונסגר
פקטור E- נקשר לקאפ
ביחד=F
(נשים F חיות AGE יותר)

בתרגום בשיטת IRES אין צורך בeIF4E

Question 5

אלונגצית תרגום פרוקריוטית

Answer 5

פקטורי אלונגציה: EFtu,ts,g
א. tRNA מגיע לאתר A, ובמידה והוא מתאים הפפטיד מאתר P עובר לח. אמינו שבאתר A
ב. תת היחידה הגדולה זזה קודון אחד ותת היחידה הקטנה עוקבת אחריה בעזרת EFg וGTP
ג. הtRNA עובר לאתר E ונפלט החוצה

החלבון מתורגם מקצה אמיני (קצה 5) לקצה קרבוקסילי

Question 6

EFtu

Answer 6

פקטור אלונגציה
חלבון G. מגיע יחד עם הtRNA, שבמידה ומתאים (נשאר מספיק זמן באתר A) תתבצע הידרוליזה של GTP שגורמת להטית הtRNA לאוריינטציה נכונה לקשר הפפטידי
המשחלף של EFtu: EFts
ביוקריוטים: eEF1. המשחלף- eEF1B

Question 7

16SrRNA

Answer 7

איניציאציה: דג את הmRNA בעזרת זיווג עם SD

אלונגציה: מזהה זיווג בסיסים טוב בין הקודון לאנטי קודון, מתהדק ומייצב את הtRNA באתר A

Question 8

EFg

Answer 8

פקטור אלונגציה
חלבון G, מזרז את הטרנסלוקציה של הריבוזום לקודון הבא. תנועת היחידה הקטנה מלווה בהידרוליזה של GTP
ביוקריוטים: eEF2.

Question 9

פפטידיל טרנספראז

Answer 9

זירוז יצירת הקשר הפפטידי בין האמין של הח.א החדשה ובין הקרבוקסיל של השרשרת הקיימת
23SrRNA בפרוקריוטים בתת יחידה הגדולה
פירוק קשר אסתרי (ATP לAMP ע”י הtRNA אמינו אציל טרנספראז) לקשר פפטידי

Question 10

טרמינצית תרגום

Answer 10

מגיע RF לאתר A
פקטור שחרור שמזרז מעבר של כל הפפטיד למולקולת מים שקשורה אליו. החלבון משתחרר והריבוזום מתפרק
תלוי GTP, EFg

Question 11

סלנוציסטאין

Answer 11

החומצה האמינת ה21, מוספת כחלק מתהליך התרגום- tRNA מחובר לסרין שעובר רק אח”כ שינוי לסלנוציסטאין שמזהה UGA בקונוטקסט של מבנה שניוני לולאה וגבעול אחריו, שמזוהה ע”י פקטור אלונגציה מיוחד לזיהוי הtRNA של הסלנוציסטאין

Question 12

NMD

Answer 12

פירוק mRNA תקול- עם אינטרון שלא יצא, שגורם לסטופ קודון באמצע הרצף
במהלך התרגום הריבוזום עובר EJC. במידה ויש אינטרון אין EJC והמרחק בין הסטופ קודון שנוצר לEJC גדול מידי וכו’ הריבוזום מתנתק והmRNA מתפרק ע”י UPF.