מדנ"א לרנ"א Flashcards
רנ”א פולימראז
לא דורש פריימר
פרוססיביות גבוהה
לא דורש הליקאז
עובד 5 ל3 של הגדיל הנבנה
snRNA
small nuclear RNA
נמצא בגרעין, מעורב בשחבור
snoRNA
small nucleolar RNA
נמצא בגרעינון, מעורב בעיבוד רנ”א ובניית ריבוזומים
piRNA
מגן מפני טרנספוזונים בגמטות
lncRNA
long non coding RNA
בקרת ביטוי גנים ע”י השפעה על מבנה הכרומטין
פרומוטר
dsDNA
מכתיב את כיוון השעתוק, את גדיל התבנית ואת הנוק’ הראשון
פרוקריוטי: רצף -10 עשיר בTA ורצף -35
יוקריוטי: TATA BOX ב-25, לפניו BRE ואחריו INR- נק. תחילת השעתוק. DPE ב+30. אין במשק בית TATA
סוגי רנא פולימראז של יוקריוטים
רנא פולימראז 1: משעתק rRNA חוץ מ5S
רנא פולימראז 2: משעתק את כל המקודדים לחלבון ועוד כל מיני
רנא פולימראז 3: משעתק tRNA, rRNA 5S ונוספים
פולימראז 2: דומה לפרוקריוטי, במקום סיגמא יש פקטורי שעתוק כלליים TFII
TFII
א. TFIID - TBP נקשר לTATA BOX דרך התעלה הקטנה עד הDPE, TAF נקשר לרצפים מסביב כדי לעזור לTBP להגיע למקום הנכון
ב. TFIIB - נקשר לרצף BRE במעלה הזרם לTATA
ג. TFIIF - מגייס את הפולימראז, הומולוגי לסיגמא. מגייס את TFIIE
ד. TFIIE - מגייס את H
ה. TFIIH - הליקאז לפתיחה ראשונית וקינאז שמזרחן את F וגם את זנב הCTD
דב עם פאה
TBP
נמצא בכל התחלת שעתוק
מונומר סימטרי
נקשר לTATA BOX דרך התעלה הקטנה
נעזר בTAF
CTD
זנב בקצה הקרבוקסילי של RPB1 ברנ”א פולימראז. בנוי מרצף חוזרני עשיר בסרין. מזורחן על ידי TFIIH
פיתולי על בהתקדמות רנ”א פולימראז
לפניו- פיתולים חיוביים, מאחוריו- שליליים.
פעילות של טופואיזומראזות ביוקריוטים, ובפרוקריוטים דנ”א ג’יראז שהומולוגי לטופואיזומראז 2
טופ 1: יוצר פיתול על חיובי 1
טופ 2: יוצר 2 פיתולי על שליליים ע”י ביטול פיתולים חיוביים
ג’יראז: יוצר פיתולי על שליליים
רוורס-ג’יראז: יוצר פיתולי על חיוביים בחיידקים תרמופיליים