רפליקציה Flashcards
דנא פולימראז
מנתק קשר פוספו-אנהידרידי בין זרחן אלפא לבתא ומייצר קשר פוספודיאסטרי בין זרחן אלפא לO 3’
כיווניות: 5 ל-3 של הגדיל הנבנה
הגהה: 3 ל-5 אקסונוקלאז, MMR
סוגים:
אלפא- פריימר, בתא- תיקון דנ”א (בר), גמא- מיטוכונדריה, דלתא- גדיל מתעכב, אפסילון- גדיל מוביל
פרימאז
סנתוז פריימר רנ”א לטובת דנא פולימראז
יוקריוטים: דנא פולימראז אלפא, תת יחידה , pri. על הגדיל המוביל והמתעכב
פרוקריוטים: DNA-G
RNAseH
הסרת הפריימרים ביוקריוטים- מפרק רנ”א היברידי עם דנ”א
ליגאז
חיבור מקטעי דנ”א. משתמש בATP שמפורק לAMP
הליקאז
AAA-ATPase, פותח את הגדילים
הקסאמר
תופס חד גדיל (יוקריוטים: את המוביל, פרוקריוטים: את המתעכב), מפרק ATP לטובת שינוי מרחבי ומושך את חד הגדיל דרכו
יוקריוטים: MCM. פרוקריוטים: DNA-B
SSB
יושב על דנ”א חד גדילי, מונע שבירה שלו + מונע חזרה למצב של הליקס + מסדר את הבסיסים כך שיפנו לכיוון הדנ”א פולימראז
יוקריוטים: RPAs. בנויים מ3 יחידות ותופסים 8 בסיסים בצורה שיתופית- קשירה של אחד מקלה על השאר להיקשר
מצמד מחליק
מבנה טבעתי, תושבת של הדנ”א פולימראז על הדנ”א, מעלה את הפרוססיביות שלו.
יוקריוטים: PCNA
מטען המצמד: מושיב את המצמד על הדנ”א, משתמש בATP לשינוי קונפורמציה
מוצא שכפול
רצף בפרוקריוטים ובשמר, קונטקס חלבוני ביוקריוטים
עשיר בAT
פרוקריוטים: DNA-A, בתחילת השכפול עובר הידרוליזה של ATP שמונעת שכפול נוסף מיד
יוקריוטים: מזוהה ע”י ORC, זרחון מעכב אותו. מלווה ע”י Cdt1, CDC6
היסטונים בשכפול
H3-4: נשארים כטטרמר ומתחלקים שווה בשווה בשכפול (צ’פרון CAP1)
H2a-b: מתפרקים ומתחלקים כמונומרים שווה בשווה (צ’פרון NAP1)
טלומראז
סוג של RT.
סנתוז רצפי דנ”א חוזרים עשירים בG, הארכת הגדיל ההורי
התבנית: tel-RNA בתוך הטלומראז (RNP)
פעיל בעוברים ובתאי גזע
התקצרות טלומרים- הפעלת ATM/ATR קינאזות - הפעלת Chk1/2 - עליה בP53 - אפופטוזיס
t-loop
קצה הטלומראז, שלא מזווג, עושה לופ ומתחבר לגדיל המשלים בעזרת שלטרינים
MMR
מצומד לשכפול
א. mut S סורק את הדנא עד מציאת MM
ב. mut L מביא את הדנא לאתר של H
ג. mut H חותך- לא באזור ממותל- כלומר, את הגדיל החדש, לא קיים ביוקריוטים
אח”כ משכפלים את האזור מחדש ומחברים עם ליגאז
HNPCC- פגיעה במערכת MMR
טופואיזומראז 1
עושה שבר חד גדילי (רקומבינאז- טירוזין באתר הפעיל) זמני
שלב ביניים בו האנזים קשור קוולנטית לדנ”א
לא משתמש בATP
טופואיזומראז 2
עושה שבר דו גדילי, משתמש בATP לכל יצירת קשר