בקרות לאחר שעתוק Flashcards
אטניואציה
הרנ”א שבתחילת השעתוק משפיע על המשך השעתוק. בHIV רק כאשר החלבון Tat נמצא בריכוז גבוה מתאפשרת בניה של הוירוס, עד אז אין סיום שעתוק.
מתרחש גם באופרון הטריפטופן- זיווג בסיסים בין רצפים מסויימים…
riboswitch
האזור הראשוני שמשועתק מתקפל למבנה שמשפיע על המשך השעתוק. באופרון ביוסינתזה של פורינים החלק ההתחלתי שמשועתק יכול לקשור פורין, והקשירה גורמת לS&L שעוצר את השעתוק
בקרה על אתר הביקוע של הרנ”א בתא B
מעבר בתא B מנוגדן ממברנאלי למסיס ומופרש
אקטיבציה של התא גורמת למעבר מאתר ביקוע חזק לאתר חלש שמשועתק קודם (ע”י ביטוי ביתר של CSTF) , וכך הביקוע קורה מוקדם יותר ללא החלק הממברנאלי
עריכת רנ”א
ביטוי ADAR- דהאמינציה של A שיוצרת I באינטרונים, משפיע על השחבור. באקסון יכול לשנות קודון (I=G) בחלבון של תעלת סידן חשובה בהתפתחות המוח
דהאמינציה מC לU יוצרת סטופ קודון והופכת ApoB100 בכבד ל48 במעי
טרנספורט של רנ”א
בHIV חלבון REV בריכוז גבוה נקשר לרצף RRE וכך אקספורטין נקשר ומוציא בכוח את הרנ”א מהגרעין
לוקליזציית mRNA בציטוזול
ביטוי באזור ספציפי
א. רצפים שיזוהו ע”י קינזינים/דיניינים
ב. העדפה לאזור בסמוך לממברנה
ג. מניעת ביטוי בציטוזול וייצוב שלו רק במקום ספציפי
השפעת UTR על התרגום
חשיפת רצף SD שנמצא בקצה 5 UTR - ע”י חלבון ממסך, טמפרטורה שכולאת את הרצף במבנה שניוני, ריבוסוויץ’ שמשפיע על המבנה השניוני
IRES
סיגנל של מבנה שניוני בתחילת הmRNA, מגייס את פקטורי האיניציאציה. לא צריך את eIF4E כי אין שימוש ב5 קאפ
וירוסים יכולים למנוע קישור בין eIF4G לE ובכך למנוע תרגום רגיל בתא ולשעבד את המערכת רק לתרגום דרך IRES
בקרה על מחצית חיים של mRNA
כשהפוליA קצר (25) אז ממשיכים לפרק / מגייסים חלבונים שמפרקים את ה5’cap וככה המולקולה מתפרקת משני הצדדים
גופיפי P
אזורי עיבוד בתא, שם תעבור פירוק. לפעמים הופכים לגרנולת סטרס- מוכנות לתרגום ומחכות לסיגנל.
השפעה על חלבוני איניציאציה
א. סיקווסטרינג של eIF2 עם המשחלף שלו eIF2B- גורם לו להיות תמיד עם GTP ולא מאפשר תחילת תרגום
ב. רמות שונות של eIF4F גורמות לבחירה של AUG שונים לתחילת התרגום (כשאין קוזאק, leaky scanning) וכך לחלבון שונה
ג. ברמות גבוהות של eIF2 ניתן לתרגם מסגרת קריאה הקודמת למסגרת של החלבון (uORF), מה שיכול למנוע את תרגום החלבון עצמו. דוג- החלבון Gcn4 גורם לביוסינתזת ח.א. כשיש מחסור ורמות הeIF2 נמוכות