הפרדה וטיהור חלבונים (שיטות א) Flashcards

1
Q

מהי משוואת בר-למברט?

A

log (i0/i) = epsilon *C *l

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

מה אומר חוק בר-למברט?

במילים

A

יחס ישר בין יכולת הבליעה של חומר מסוים לריכוז שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

למה משמשת שיטת ספקטרופוטומטריה?

A

מדידת ריכוז חומר מסוים/חלבון בתמיסה לפי יכולת הבליעה שלו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

אלו שיטות קיימות ליצירת ליזאט תאים?

3

A
  • הומוגנציה
  • סוניקציה
  • שימוש בדטרגנט
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

מהי שיטת הומוגינציה?

A

שיטה ליצירת ליזאט העושה שימוש בכוח פיזי לשם שבירת ממברנות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

הומוגנציה נחשבת לשיטה טובה ליצירת ליזאט מאחר והיא משמרת את רב אברוני התא. אלו אברונים לא משתמרים בה בהכרח?
(2)

A
  1. הממברנה הפלמטית

2. ER

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מהם מיקרוזומים?

A

וזיקולות של ממברנת ה
ER
ומרכיביו הנוצרות כתוצאה מפירוקו בתהליך יצירת הליזאט

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

אלו שתי פאזות של מיקרוזומים נקבל ביצירת ליזאט?

A
  1. sER

2. rER

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

האם שימוש בדטרגנט לשם הכנת ליזאט מצליח לשמר אברונים? מתי נעשה בו שימוש?

A
  • לא

- כאשר נרצה להפיק חלבונים ממברנאלים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

באלו שיטות ניתן להשתמש ע”מ להפריד ליזאט נתון לפרקציות?

2

A
  • צנטריפוגה

- velocity sedimentation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

כיצד נקרא התרחיף שנוצר משימוש בצנטריפוגה?

A

sup

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

כיצד נקרא החלק ששוקע בשימוש בצנטריפוגה?

A

pellet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מהי שיטת

velocity sedimentation?

A

שימוש במבחנה עם גרדיאנט סוכרוז/קלציום כלוריד, המאפשרת הפרדת מרכיבי הליזאט לפי מסה, צפיפות ומבנה מרחבי של המולקולות

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

למה משמשת שיטת הדיאליזה?

A

הפרדה גסה ואיטית בין חלבונים גדולים וקטנים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

כיצד עובדת שיטת הדיאליזה?

A

תמצית חלבונים מוכנסת לשקית עם חרירים בגודל ידוע ובעזרת כוח הדיפוזיה חלקיקים קטנים יוצאים ממנה עד להשוואת ריכוזים בעד חלקיקים גדולים לא

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

מהי שיטת ה
size exclusion?
(ג’ל פילטרציה)

A

שיטה כומוטוגרפית המאפשרת הפרדה לפי גודל החלקיקים השונים ע”י שימוש בבידים עם חרירים בגודל מסוים

17
Q

מתי יצאו חלבונים גדולים ומתי יצאו חלבונים קטנים בשימוש בג’ל פילטרציה?

A
  • גדולים יצאו בנפח אילוציה נמוך

- קטנים יצאו בנפח אילוציה גבוה

18
Q

כיצד ניתן לקבוע מסה של חלבון חדש ע”י שימוש בשיטת ג’ל פילטרציה?

A

מכינים עקומת כיול של logMw
לפי נפח אילוציה, עבור לפחות 3 חלבונים ידועים. לאחר מכן בודקים את נפח האילוציה של החלבון החדש ומוציאים את המסה המולארית שלו לפי עקומת הכיול.

19
Q

מהי כומוטוגרפיית מחליף יונים?

A

כרומוטוגרפיה בה הבידים טעונים במטען הפוך ממטען חלבון המטרה

20
Q

כיצד משוחררים החלקיקים שנקשרו לבידים בכומוטוגרפיית מחליף יונים?

A

ע”י שימוש בריכוזי מלח גדלים

21
Q

מתי נשתמש במחליף אניונים?

A

כאשר נקצה לבודד חלבונים בעלי מטען שלילי

הבידים חיוביים

22
Q

מתי נשתמש במחליף קטיונים?

A

כאשר החלבונים שנרצה לבודד בעלי מטען חיובי

הבידים שליליים

23
Q

מהי כרומוטוגרפיית אפיניוט?

A

כרומוטוגרפיה בה הבידים מכילים חומר הידוע לקשור ספציפית את חלבון המטרה.

24
Q

כיצד משחררים את חלבון המטרה מהבידים בקולונת אפיניוט?

3

A
  • שימוש בסובסראט חלופי שיתחרה איתו על הקישור לביד
  • שימוש בריכוזי מלח גדולים
  • שינוי ב
    pH
    (עלול להשפיע על טיב החלבון בצורה לא הפיכה)
25
Q

מהי שיטת

HPLC?

A

שיטה להגברת יעילות הכרומוטוגרפיה המשתמשת במשאבה המעבירה את התמיסה במהירות גבוהה יותר המאפשרת הפרדה טובה ויעילה יותר

26
Q

כיצד מבוצעת שיטת
immunopercipitation?
(4)

A
  • הכנסת נוגדן כנגד חלבון המטרה בתמיסה
  • בעת הצורך, הכנסת ביד/נוגדן שניוני שיקשר לנוגדן להעלאת מסת הקומפלקס שנוצר
  • צנטריפוגה להשקעת הקומפלקס
  • זריקת ה
    sup
27
Q

למה משמשת שיטת

immunopercipitation?

A

בידוד חלבון מטרה מתוך תמיסה נתונה

28
Q

למה משמשת שיטת
CO-IP?
כיצד היא מבוצעת?

A
  • מציאת אינטראקציות חלבון-חלבון

- מבוצעת כמו אימונופרסיפיטציה עם נוגדן כנגד חלבון ידוע מהקומפלקס

29
Q

למה משמש הוספת
epitope tag
לחלבון המטרה?

A

לבידוד חלבון המטרה בעזרת הטאג הכללי במקום אפיטופ ספציפי

הוזלת עלויות

30
Q

His Tag

הינו טאג אפיטופי נפוץ. מה יש לחבר לבידים בכרומטוגרפיית אפיניוט בעת שימוש בו?

A

ניקל

31
Q

למה משמשת השיטה

florescence anisotropy?

A

מציאת
Kd
של רצפטור-ליגנד

32
Q

מהם שלבי השיטה

florescence anosotropy?

A
  • קשירת הליגנד למולקולה פלורוסנטית
  • הפלורוסנציה תלויה מכמות הליגנד ומה
    tumbling
    (סיבוביות)
  • הוספת הרצפטור וקשירתו את הליגנד גורמת לירידה ב
    tumbling
    ובהתאם לירידה בפלורוסנציה
  • ריכוז הרצפטור שגורם לדעיכת הפלורוסנציה ל50% הוא קבוע הדיסוציאציה
33
Q

למה משמשת השיטה

salting in/out?

A

הפרדת חלבונים

34
Q

על מה מבוססת שיטת

salting in/out?

A

מבוססת על העקרון שלכל חלבון יש ריכוז מלח אידיאלי עבור מסיסות

35
Q

מה זה

salting in?

A

המעבר של חלבון ממצב לא מסיס בריכוזי מלח נמוכים מאוד למצב מסיס

36
Q

מה זה

salting out?

A

המעבר של חלבון ממצב מסיס בריכוזי מלח מתאימים למצב לא מסיס בריכוזי מלח גבוהים הגורמים ליצירת אגרגטים שלו ולשקיעתו