Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

רשף- שיטות > אנליזה של דנ"א (שיטות ב) > Flashcards

אנליזה של דנ"א (שיטות ב) Flashcards

1
Q

מה יהיה בד”כ סוג הרצף בו יחתכו אנזימי רסטריקציה?

A

רצף פולינדרומי בן 4-8 בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

באיזה אופן אנזימי רסטריקציה חותכים את הרצף המזוהה על ידם?

2

A
  1. blunt

2. sticky ends

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

מהו ולמה משמש החומר
etidium bromid
באלקטרופורזה של חומצות גרעין?

A

חומר פלורוסנטי העובר אקסיטציה בתחום ה

UV, ומשמש לראות את הבנדים שנוצרו בהרצה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

עבור איזה גודל מולקולות נעשה שימוש בג’ל אגרוז באלקטרופורזה?

A

גדולות מ

500bp

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

עבור איזה גודל מולקולות נעשה שימוש בג’ל פוליאקרילאמיד באלקטרופורזה?

A

קטנות מ
500bp
(ג’ל צפוף)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

מה משפיע על מרחק הנדידה של חומצות גרעין באלקטרופורזה?

2

A
  • גודל

- טופולוגיה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

מהי השיטה

pulse field electrophoresis?

A

אלקטרופורזה של מולקולות דנ”א ארוכות מאוד בה מפעילים שדות חשמליים בכיוונים משתנים וכך מושכים אותה כלפי מטה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

למה משמש

digoxygenin?

A

סימון מולקולת דנ”א מאחר והוא מזוהה על ידי נוגדן, לו ניתן לצמד מולקולה פלורוסנטית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

מהו

clone?

A

מושבה של אורגניזמים שהם כולם צאצאי אב משותף

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

מהו וקטור?

A

אמצעי להעברת מידע גנטי חיצוני אל אורגניזם בהעברה ורטיקלית

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

מה וקטור חייב להכיל?

3

A
  1. מוצא שכפול המזוהה ע”י המארח
  2. מרקר סלקציה
  3. אתרי רסטריקציה ידועים
    (mcs/poly-linker)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

באיזה סוג של פלסמידים יש לעשות שימוש כאשר ה
insert
שלנו מאוד גדול?

A

BAC

עד כמליון בסיסים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מהו תהליך הטרנזפורמציה?

A

תהליך בו חיידקים מכניסים אליהם מקטעי דנ”א מהסביבה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

כיצד מייצרים וקטור רקומביננטי?

A

חותכים את המחדר ואת הפלסמיד באנזימי רסטריקציה זהים ומדגירים אותם ביחד עם ליגאז ו
ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

מה הסיכוי של מחדר להיכנז לפלסמיד?

A

כ-1 למליון

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

כיצד ניתן לייצר חיידקים קומפטטנטים לשם תהליך הטרנספורמציה?

2

A
  1. אלקטרופורציה (שדה חשמלי)
  2. heat shock
    וריכוז מלח גבוה
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מהי ספריה גנומית?

A

אוסף של עשרות אלפי מושבות שונות של חיידקים, כאשר כך מושבה מכילה חתיכה מגנום של אורגניזם

18
Q

כיצד מייצרים ספריה גנומית?

4

A
  1. חיתוך הגנום הרצוי
  2. החדרת כל חתיכה כ
    insert
    לוקטור אחר (בד”כ
    BAC)
  3. טראנספורמציה
  4. גידול המושבות
19
Q

מהי ספריית

cDNA?

A

ספריה המכילה את מקטעי הדנ”א המקודדים לחלבון בתא ספציפי של אורגניזם מסוים

20
Q

כיצד מכינים ספריית
cDNA?
(5)

A
  1. הפקת מרנ”א מתא נתון
  2. רברס טרנסקריפציה
  3. יצירת וקטורים רקומביננטים
  4. טראנספורמציה
  5. גידול מושבות
21
Q

כיצד מתבצע תהליך הרברס טרנסקריפיציה כחלק מהכנת ספריית ה
cDNA?
(4)

A 
- לאחר מיצוי המרנ"א מוסיפים פריימר פולי
T
- פעילות
RNA dependent DNA pol.
- RNaseH
מפרק לסירוגין את הרנ"א של ההיבריד שנוצר
- פעילות
RNA dependent DNA pol.
להשלמת דו-גדיל של דנ"א
22
Q

מדוע לא ניתן להכין ספריית
cDNA
לפרוקריוטים?

A

מאחר והמרנ”א שלהם אינו מכיל זנב פולי

A

23
Q

מהי שיטת

FISH?

A

זיהוי רצפי דנ”א בתוך רקמה תוך שימוש בפרובים פלורוסנטים

24
Q

מהם שלושת שלבי שיטת ה

PCR?

A
  1. דה-נטורציה ב90 מעלות
  2. annealing-
    איחוי פריימרים בטמפ’ נמוכה יותר מתאימה
  3. אלונגציה ב72 מעלות
25
Q

כיצד מחושבת טמפרטורת ה
annealing
עבור שיטת ה
PCR?

A

לפי אורך הפריימר ואחוז GC/AT

הקיימים בו

26
Q

מה הטמפרטורה האידיאלית בו עובד

Taq polymerase?

A

72

מעלות

27
Q

מדוע עושים שימוש ב
taq polymerase
ב
PCR?

A

מכיוון שהוא שורד בטמפרטורה הגבוהה של שלב הדה-נטורציה

28
Q

מה צריך להכניס למבחנת ה
PCR?
(5)

A
  • תבנית
  • פריימרים
  • dNTPs
  • taq polymerase
  • בופר +יוני מגנזיום
29
Q

מתי לראשונה מתקבל תוצר בגודל הרצוי?

A

בסוף המחזור השלישי

30
Q

מהו רצף

STR?

A

short tandem repeats.

רצף חוזרני שכמות החזרות שבו מאוד וריאבילי בין פרטים שונים

31
Q

כיצד משמשים ב
PCR
לשם זיהוי פלילים?

A

מגבירים מספר רצפי
STR
שונים מהראיה הפורנזית ומהחשודים ובודקים התאמה

32
Q

כיצד מבצעים את שיטת סנגר?

A
  • ארבע מבחנות עם נוקלאוטידים רגילים וסוג אחד של
    ddNTPs
    בריכוז נמוך
  • לאחר מכן, מריצים בג’ל
33
Q

איזה גדיל מרוצף בשיטת סנגר?

A

הגדיל המשלים

34
Q

מהי שיטת

automated dideoxy sequencing?

A

שיטה משוכללת של סנגר בה כל
ddNTP
מסומן בצבע פלורוסנטי שונה (מבחנה אחת ומחשב שקורא)

35
Q

למה משמשת שיטת ה

shotgun sequencing?

A

ריצוף גנומים קטנים

36
Q

כיצד מבוצע ריצוף

shotgun?

A

חותכים את הגנום של אורגניזם בדרכים שונות מספר פעמים, מגבירים ומרצפים. לאחר מכן מחשב מבצע
allignment
לפי אזורי חפיפה שהתקבלו בחיתוכים השונים.

37
Q

כיצד עושים שימוש בשיטת
shotgun sequencing
לשם ריצוף גנומים גדולים?

A 
שוברים את הגנום הגדול ומכניסים ל
BACs
רבים. לאח"מ עושים
shotgun
עבור כל 
BAC
בנפרד ומחברים
38
Q

מה מיוחד ב
ddNTPs
של שיטת אילומינה?

A
  • כל אחד מסומן בפלורופור שונה הנקשר אליו באופן הפיך
  • ישנה מולקולה החוסמת את
    3’OH
    באופן הפיך
39
Q

מהם שלבי שיטת אילומינה?

5

A
  • PCR
    להגברת מקטעים המקובעים למצע קשיח
  • התארכות של הגדיל המשלים בנוקלאוטיד אחד הקשור לפלורופור ולמולקולה חוסמת
  • צילום
  • שטיפה הגורמת להסרת הפלורופור והמולקולה החוסמת
  • וחוזר חלילה
40
Q

על מה מבוססת שיטת

ion torrent?

A

על השינוי ב
pH
שנוצר כתוצאה מכניסת נוקלאוטיד לרצף המסונתז

41
Q

כיצד מבוצעת
ion torrent?
(4)

A
  • אמפליפיקציה של מקטע יחיד על כל ביד (המון בידים)
  • כל ביד מוכנס לבארית משלו
  • שטיפה בכל אחד מהנוקלאוטידים ומדידת ה
    pH
  • רישום הנוקלאוטיד עבורו התרחש שינוי וחוזר חלילה
42
Q

מה יכילו
expression vectors
בנוסף למה שכל וקטור צריך?
(2)

A
  • פרומוטור חזר בסמוך למחדר המרנ”א שיוכנס
  • בד”כ,
    tag
    שישמש לבידוד החלבון בסוף התהליך

רשף- שיטות (8 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions