Νουκλεϊκά οξέα και ροή της γενετικής πληροφορίας- Και άλλες μαλακίες γενετικής

Question 1

Από τι αποτελείται ένα νουκλεοτίδιο;

Answer 1

1) φωσφορική ομάδα
2) σάκχαρο
3) βάση

Question 2

Ποιες βάσεις είναι πουρίνες και ποιες πυριμιδίνες

Answer 2

Πουρίνες: Α,C

Πυριμιδίνες: Τ,G

Question 3

Τι είναι οι νουκλεοζίτες και ποια η σχέση τους με τα νουκλεοτίδια;

Answer 3

Νουκλεοζίτες = βάση+ σάκχαρο
Νουκλεοτίδιο = νουκλεοζίτης + μία ή περισσότερες φωσφορικές ομάδες

Question 4

Με ποιον τρόπο σταθεροποιείται η διπλή έλικα;

Answer 4

Με δεσμούς υδρογόνου και αλληλεπιδράσεις Van der Waals

Question 5

Με ποιον τρόπο ταξινομούνται οι βάσεις στο εσωτερικό της διπλής έλικας;

Answer 5

Στοιβάζονται η μία πάνω στην άλλη. Σταθεροποιούν περεταίρω την διπλή έλικα με υδροφοβικές αλληλεπιδράσεις και δεσμούς an der Waals

Question 6

Ποια η διαφορά του Α και του Β DNA; Ποιο συναντάται συχνότερα;

Answer 6

Οι Watson και Crick βάσισαν το μοντέλο τους σε Β-DNA. Η έλικα του Α-DNA είναι βραχύτερη και πλατύτερη αυτής του Β- DNA και τα ζβ έχουν κεκλιμένη και όχι κάθετη διάταξη ως προς τον άξονα της έλικας

Question 7

Ποια δομή DNA ευνοεί την αφυδάτωση;

Answer 7

Η Α, επειδή δεσμεύονται λιγότερα μόρια νερού

Question 8

Τι είναι το Ζ-DNA;

Answer 8

Ένας τύπος έλικας που έχει αριστερόστροφη αντί για δεξιόστροφη έλικα (όπως το Α και Β DNA). Ακάμα, οι φωσφορικές ομάδες του κορμού είναι σε μορφή ζιγκ- ζαγκ

Question 9

Ποιες δομές μπορούν να σχηματίσουν τα μονόκλωνα νουκλεϊκά οξέα;

Answer 9

1) Στέλεχος- Βρόχος (θηλιά): απλούστερη και συνηθέστερξη δομή
2) Πιο πολύπλοκες δομές (σε αυτές συχνά στηρίζεται η καταλυτική δράση του RNA)

Question 10

Με ποιους τρόπους μπορούν να σπάσουν οι ΔΥ που συγκρατούν την διπλή έλικα και τι είναι η θερμοκρασιά τήξης Τm;

Answer 10

Με θέρμανση ή προσθήκη οξέων ή βάσεων.

Θερμοκρασία τήξης είναι η θερμοκρασία όπου χάνεται η μισή ελικοειδής δομή

Question 11

Σε ποιες τεχνικές βασίζεται η πρόοδος της βιοτεχνολογίας;

Answer 11

1) ΠΕ (έχουν παλίνδρομη αλληλουχία!!)
2) Τεχνικές αποτύπωσης (διαχωρισμός και ταυτοποίηση αλληλουχιών DNA)
3) Αλληλούχιση DNA
4) Σύνθεση νουκλεϊκών οξέων σε στερεά φάση
5) PCR

Question 12

Με ποιον τρόπο είναι δυνατό να διαχωριστούν τα θραύσματα που προκύπτουν από πέψη με ΠΕ;

Answer 12

Ηλεκτροφόρηση (the smaller the further)

Question 13

Ποια αντιδραστήρια θα πρέπει να προστεθούν στο διάλυμα που περιέχει την αλληλουχία στόχο προκειμένου να γίνει PCR;

Answer 13

1) Ζεύγος εκκινητών που υβριδοποιούνται με τις παράπλευρες αλληλουχίες στόχου
2) Τα 4 τριφωσφορικά δεοξυριβονουκλεοτίδια
3) Θερμοανθεκτική DNA πολυμεράση

Question 14

Σε ποια επιμέρους στάδια χωρίζεται ο κάθε κύκλος PCR;

Answer 14

1) Διαχωρισμός αλυσίδων
2) Υβριδοποίηση εκκινητή
3) Σύνθεση DNA (72 βαθμοί κελσίου)

Question 15

Τι εκκινητή μπορούμε να χρησιμιοποιήσουμε για να δράσει η αντίστροφη μεταγραφάση;

Answer 15

Αλληλουχία καταλοίπων Τ. (ολιγο-Τ)

Question 16

Στην χρήση ποιων μορίων βασίζεται η μέθοδος Sanger; Περιγράψτε την συνοπτικά

Answer 16

Βασίζεται στην χρήση διδεοξυριβονουκλεοτιδίων.
Η αρχή λειτουργίας της ωασίζεταιο στον ελεγχόμενο τερματισμό της αντιφραφής του DNA
Μία DNA πολυμεράση χρησιμοποιείται για τη σύνθεση συμπληρωματικών τμημάτων ενός μονόκλωνου μορίου DNA. Προσθήκη κανονικών δεοξυριβονουκλεοτιδίων και λίγα 2,3 διδεοξυριβονουκλεοτίδια, ανάλογα καθενός δεοξυριβονουκλεοτιδίου. Αυτά τα ανάλογα σημαίνονται με φθορίζουσες. Η ενσωμάτωσή τους οδηγεί σε τερματισμό της σύνθεσης

Question 17

Πότε δύο μόρια λέγοντα ομόλογα;

Answer 17

Όταν έχουν προέλθει από κοινό πρόγονο

Question 18

Σε ποιες κατηγορές διαιρούνται τα ομόλογα και πού αναφέρεται η κάθε μία;

Answer 18

1) Παράλογα:Απαντώνται στο ίδιο είδος και συχνά διαφέρουν στις λεπτομέρειες
2) Ορθόλογα: Διαφορετικά είδη, παρόμοια λειτουργία

Question 19

Με ποια μέθοδο καθίσταται δυνατή η ανίχνευση ομολογιών; Πώς μπορούμε να κατασκευάσουμε εξελικτικά δέντρα;

Answer 19

Η στατιστική ανάλυση ορισμένων αλληλουχιών είναι σε θέση να ανιχνεύει ομολογίες.
Με βάση τα δεδομένα αλληλουχιών μπορούν να κατασκευαστούν εξελικτικά δέντρα

Question 20

Ποιες οι διαμορφώσεις των πουρινών και των πυριμιδινών;

Answer 20

1) Πουρίνες: Στερεοχημικά επιτρέπονται μόνο 2 διαμορφώσεις (cis και trans) σε σχέση με τις προσδεδεμένες μονάδες ριβόζης
2) Πυριμιδίνες: Έχουν γενικά trans διαμόρφωση

Question 21

Ποια εξαρτήματα χρειάζεται η RNA πολυμεράση για να μεταγράψει;

Answer 21

1) Εκμαγείο
2) Τριφωσφορικά νουκλεοτίδια
3) Δισθενές μεταλλικό ιόν (μαγνήσιο ή μαγγάνιο)